利用計算機來協助克隆 基因,稱為“電子”基因克隆 (sillcon cloning),是與定位克隆 、定位候選克隆 策略并列的方法之一,即采用生物信息學的方法延伸EST序列,以獲得基因部分乃至全長的cDNA序列。EST數據庫的迅速擴張,已經并將繼續導致識別與克隆 新基因策略發生革命性變化。1 EST序列的獲取利用計算機來協助克隆的第一步是必須獲得感興趣的EST,在dbEST數據庫中找出EST的最有途徑是尋找同源序列,標準:長度≥100bp,同源性50%以上、85%以下。可通過數個萬維網界而使用BLAST檢索程度實現,其中最常用的如NCBI(National center for Biotechnology Information)的eneBank、意大利Tigem的ESTmachine(包括EST提取者和EST組裝機器)、THC(Tentative human Consensus Sequences)數據庫、......閱讀全文
第二軍醫大學細胞生物學教研室;上海200433 何志穎;姚玉成(綜述);胡以平(審校)關鍵詞:EST技術;“電子”基因克隆;生物信息學;基因摘要: 隨著人類基因組計劃的順利進行,EST技術被廣泛應用于基因識別、繪制基因表達圖譜、尋找新基因等研究領域。利用人類基因組研究不斷產生的數據,從ES