能源所建立拉曼介導靶向元基因組技術研究海洋固碳機制
作為海洋中數量最豐富的細菌類群,Pelagibacter spp.是否在海洋中原位固定二氧化碳,業界一直眾說紛紜。這一工作為該重大問題的回答貢獻了嶄新的證據,并提出了相應的分子機制。同時,RGM技術的建立為在各種時空尺度探討海洋微生物組“Genome-Phenome”關聯機制,奠定了方法學基礎。 上述工作由英國牛津大學工程系黃巍和中科院青島能源所單細胞中心徐健合作指導完成,獲得了國家自然科學基金委和中科院微生物組計劃等項目的支持。 論文信息:Jing Xiaoyan, Gou Honglei, Gong Yanhai, Su Xiaolu, Xu La, Ji Yuetong, Song Yizhi, Thompson Ian, Xu Jian, Huang Wei. Raman-activated cell sorting and metagenomic sequencing revealing carbon-......閱讀全文
能源所建立拉曼介導靶向元基因組技術研究海洋固碳機制
作為海洋中數量最豐富的細菌類群,Pelagibacter spp.是否在海洋中原位固定二氧化碳,業界一直眾說紛紜。這一工作為該重大問題的回答貢獻了嶄新的證據,并提出了相應的分子機制。同時,RGM技術的建立為在各種時空尺度探討海洋微生物組“Genome-Phenome”關聯機制,奠定了方法學基礎。
拉曼介導靶向單細胞基因組原創技術研發成功
? 單細胞精度的海洋微生物組功能靶向性拉曼分選與測序技術(scRACS-Seq)? 劉陽供圖 海洋是地球上最大的活躍碳庫,海洋微生物在全球碳循環中起著至關重要的作用,然而由于大部分海洋微生物尚難以培養、原位代謝功能難以測量等技術瓶頸,業界對于海洋微生物光合固碳的原位功能機制等重要問題,仍然存在爭議
拉曼介導靶向單細胞基因組原創技術研發成功
? 單細胞精度的海洋微生物組功能靶向性拉曼分選與測序技術(scRACS-Seq)? 劉陽供圖 海洋是地球上最大的活躍碳庫,海洋微生物在全球碳循環中起著至關重要的作用,然而由于大部分海洋微生物尚難以培養、原位代謝功能難以測量等技術瓶頸,業界對于海洋微生物光合固碳的原位功能機制等重要
青島能源所單細胞拉曼流式分選技術研究獲進展
日前,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心在基于微流控的單細胞拉曼流式分選技術研究中取得新進展,相關成果于2月5日在線發表在Analytical Chemistry (Zhang PR, et al, Anal Chem, 2015)。 單細胞拉曼分選(RACS)是一種極具潛力的活
科學家開發出物種代謝雙靶向的微生物細胞及酶資源挖掘新技術
微生物及其合成的各種酶支撐著生物圈中較多關鍵的生態過程。在環境中高效識別與挖掘具有特定原位代謝功能的細胞和酶是微生物組科學與產業的熱點。近日,中國科學院青島生物能源與過程研究所聯合自然資源部第一海洋研究所、山東大學等,開發了熒光原位雜交介導的拉曼激活單細胞分選與測序(FISH-scRACS-seq)
青島能源所建立工業產油微藻基因組編輯技術
自然界的一些真核微藻能夠通過光合作用固定二氧化碳,并將其轉化和存儲為油脂。因此,作為一種潛在可規模化的清潔能源生產和固碳減排方案,微藻能源近年來受到了廣泛關注。然而,高效遺傳工具的匱乏,極大限制了工業產油微藻的機制研究和分子育種。近日,中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心以微擬球藻為
蘇州醫工所:高靈敏增強拉曼傳感技術研究
高靈敏微量氣體傳感在環境污染研究、人體揮發性有機物(VOCs)檢測中具有重要的現實意義。迄今為止,已有多種分析技術用于氣體檢測,但多存在成本高、操作復雜、分析過程耗時等缺點。表面增強拉曼散射(SERS)作為有力的痕量分子檢測工具,可利用基底的表面等離子體共振和電荷轉移效應大幅增強目標分子的拉曼散
基于拉曼組的單細胞快檢技術可同時定量檢測
通過光合作用固定的二氧化碳與太陽能在生物體內有三種主要的存儲形式:多糖、油脂和蛋白質,共同構成了生物碳存儲與生物能源產業的物質基礎。目前,對細胞中這三類高含能儲碳分子的識別、表征和定量極為繁瑣,通常難以在單個細胞精度測量,這限制了光合固碳細胞工廠的篩選與改造效率。中國科學院青島生物能源與過程研究
拉曼組有望成為普適性的新一代細胞功能測試儀器平臺
通過光合作用固定的二氧化碳與太陽能在生物體內有三種主要的存儲形式:多糖、油脂和蛋白質,共同構成了生物碳存儲與生物能源產業的物質基礎。目前,對細胞中這三類高含能儲碳分子的識別、表征和定量極為繁瑣,通常難以在單個細胞精度測量,這限制了光合固碳細胞工廠的篩選與改造效率。中國科學院青島生物能源與過程研究
海洋光學拉曼光譜SERS基底的優勢
海洋光學SERS基底的優勢高靈敏性。經過與同類基底進行對比測試,該基底具有很好的性能并且對一系列分析物都表現出了較高的靈敏性。高穩定性。 高穩定性基底無需特殊處理便可在室溫下儲藏。可靠的重現性。 可高度重現性和容易進行大規模生產,使得能以實惠的價格實現靈敏測量。個性化的外形。 獨特的生產技術可實現定
科學家建立工業產油微藻基因敲低技術
微藻通過光合作用將二氧化碳、光和水轉化為油脂,因此,作為一種潛在的清潔能源生產和二氧化碳高值化方案,工業產油微藻受到了廣泛關注。然而,藻類高效遺傳工具的匱乏,一直是工業產油微藻分子育種和光驅固碳合成生物技術的重要瓶頸之一。近日,中國科學院青島生物能源與過程研究所與中國科學院水生生物研究所合作,以
單細胞拉曼結合靶向宏基因組揭示土壤活性抗生素耐藥組
抗生素耐藥性(AMR)在人類、環境和動植物間的傳播,加劇全球“One Health”的負擔。土壤是“One Health”的關鍵環節之一,所攜帶的抗生素耐藥性可通過食物鏈等方式轉移至人類而帶來健康威脅。土壤中棲息著地球上最豐富多樣的微生物,其中活性耐藥菌在驅動土壤耐藥性傳播中具有關鍵作用。然而,
拉曼光譜儀等海洋科研裝備助力我國海洋科考
16世紀人類進入海洋,21世紀人類深入海洋。 經過長期努力,特別是黨的十八大以來,以“蛟龍”號載人潛水器、“科學”號科考船投入應用為代表,我國快速挺入“國際深海俱樂部”。一批批海洋科考的“神工巧匠”前赴后繼、齊心勠力,駕馭著各式國產“神器”,將一幕幕深海“神奇”呈現在世人面前…… “
物理所建立新的拉曼散射理論
超高靈敏度探測和超高空間分辨率成像是所有光學探測和成像工具的終極奮斗目標,將二者結合起來將成為揭示微觀世界物理和化學現象及其本源機理的強大武器。拉曼光譜通過光與分子的非彈性散射光譜信息揭示分子內部的轉動和振動形態,是識別分子化學結構的有效手段,也是研究分子結構變化的重要工具,已經廣泛應用于自然科
基于拉曼組與機器學習的微藻種質挖掘新技術
微藻是地球上代謝功能較為多樣化的生物類群,在全球碳循環中發揮關鍵作用,也是生物技術產業中重要的一類光合細胞工廠。但微藻的種質鑒定和代謝功能檢測繁瑣,且自然界大部分微藻難以培養。近日,中國科學院青島能源研究所單細胞中心發表了首個微藻拉曼組數據庫,并結合機器學習示范了單細胞精度、快速的微藻種類鑒定和
海洋光學擴大整合拉曼(Raman)生產線
從模塊化到系統整合 微型光纖光譜儀先驅海洋光學( 海洋光學- www.OceanOptics.com )已擴大整合了原有的拉曼生產線,增加了用于手持、實驗室和教育方面的應用支持,某些型號的拉曼分析儀零售價下幅達40%。與532nm激光、785nm激光相配套的模塊化、一鍵啟動和應用套
我國首臺活體單細胞拉曼分選儀成功問世
我國首臺活體單細胞拉曼分選儀成功問世 將廣泛應用于生物技術、食品檢測和藥物研究等 近日,中科院青島生物能源與過程研究所功能基因組團隊與北京惟馨雨生物科技公司聯合承擔的科技部創新方法工作專項——“拉曼光鉗篩選新方法在活體單細胞高通量分離中的應用”通過了評審驗收,這標志著全球首臺活體單細胞拉曼分選儀
中科院海洋所:首套深海多通道拉曼光譜探測系統
近日,Deep-Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers在線發表了題為Development and deployment of lander-based multi-channel Raman spectroscopy for in-
青島能源所新一代元基因組平臺建設取得進展
元基因組是指一定環境下整個微生物群落中的所有遺傳信息的總和。元基因組數據的收集與分析克服了傳統分離培養方法僅局限于群落中可培養組分(一般僅占1%)的缺陷,使挖掘、認識與利用不可培養的組分(即另外之99%)成為可能,為全面研究自然狀況下微生物群落的結構與功能提供了新途徑。 元基
北京基因組所揭示共轉錄m6A修飾建立機制及功能
4月2日,中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)任捷團隊和楊運桂團隊,在《分子細胞》(Molecular?Cell)上在線發表了題為DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription
青島能源所基于pDEPRADS推出首臺高通量流式拉曼分選儀
單個細胞是生命活動的基本單元,也是生物進化的基本單位。因此單細胞技術正在推動生命起源、細胞功能異質性機制、生命暗物質挖掘與利用等領域的一系列重大突破。單細胞拉曼光譜(SCRS)能非標記、非侵入性、無損、全景式地揭示細胞代謝狀態,因此基于拉曼光譜的單細胞分選(Raman-Activated Cel
青島能源所元基因組計算方法學研究取得新進展
近日,在科技部863計劃、國家自然科學基金等項目的支持下,中國科學院青島生物能源與過程所功能基因組團隊在元基因組計算方法學取得了系列進展。 纖維素降解、沼氣生成等生物能源過程均由復雜微生物群落完成。元基因組學可克服自然界中大部分微生物難以培養的問題,通過直接測定、分析微生物群落
對抗進口-國產科研儀器產業面臨多重考驗
科研儀器是學科發展的重要“引擎”。但在中國,科研卻常常苦于被儀器卡住“脖子”。 曾在美國華盛頓大學基因組研究院任教、現任山東省能源生物遺傳資源重點實驗室主任徐健深有體會。 2008年,徐健回國后便與同事組建中科院青島生物能源與過程所公共儀器平臺,但讓他頗感無奈的是,研究所需要的高端生
喀斯特地區固碳機制研究獲進展
日前,中科院亞熱帶生態所在喀斯特峰叢洼地典型生態系統土壤團聚體固碳機制研究方面取得新進展,該研究對全球氣候變化背景下正確評價我國西南喀斯特石灰土固碳現狀和潛力、制定區域生態系統碳匯管理措施具有重要意義。相關成果分別在《應用生態學報》、《植物營養與肥料學報》和《西北植物學報》上發表。 土壤有
紫外拉曼與共振拉曼原理
熒光干擾問題和靈敏度較低嚴重阻礙了常規拉曼光譜的廣泛應用。但近年來發展起來的紫外拉曼光譜技術有效地解決了上述問題。紫外拉曼光譜技術的出現和發展大大地擴展了拉曼光譜的應用范圍。右圖是紫外拉曼光譜避開熒光干擾的原理圖。熒光往往出現在300nm-700nm區域,或者更長波長區域。而在紫外區
紫外拉曼與共振拉曼原理
熒光干擾問題和靈敏度較低嚴重阻礙了常規拉曼光譜的廣泛應用。但近年來發展起來的紫外拉曼光譜技術有效地解決了上述問題。紫外拉曼光譜技術的出現和發展大大地擴展了拉曼光譜的應用范圍。右圖是紫外拉曼光譜避開熒光干擾的原理圖。熒光往往出現在300nm-700nm區域,或者更長波長區域。而在紫外區的某個波
紫外拉曼與共振拉曼原理
熒光干擾問題和靈敏度較低嚴重阻礙了常規拉曼光譜的廣泛應用。但近年來發展起來的紫外拉曼光譜技術有效地解決了上述問題。紫外拉曼光譜技術的出現和發展大大地擴展了拉曼光譜的應用范圍。右圖是紫外拉曼光譜避開熒光干擾的原理圖。熒光往往出現在300nm-700nm區域,或者更長波長區域。而在紫外區的某個波 紫外
焦念志代表:建立海洋碳匯標準迫在眉睫
“目前,在海洋生態系統儲碳能力估算方法方面,國內外還沒有統一的規范和標準。而我國涉海科研單位眾多,針對海洋碳循環的研究水平參差不齊,所用的檢測手段和檢測指標各不相同,導致科研成果交流存在障礙,很難相互借鑒。這在一定程度上會導致科研資金的重復投入,造成科研人力、物力、財力的浪費。”中國科
上海師范大學實現國家級重大科研項目立項新突破
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515401.shtm 近日,科技部公布“十四五”國家重點研發計劃“合成生物學”重點專項2023年度項目立項名單。我校生命科學學院馬為民教授作為項目首席科學家牽頭申報的“C3作物高效固碳模塊的人工設計與
青島能源所與比利時弗拉芒技術研究院簽署合作備忘錄
3月15日,比利時弗拉芒技術研究院(VITO)院長Dirk Fransaer及VITO中國首席代表毛德彬訪問中國科學院青島生物能源與過程研究所。 研究所副所長呂雪峰對比利時客人的到來表示歡迎。隨后,Dirk Fransaer作了題為CO2 capture–game changer climat