非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫？
據相關介紹表明非靶向代謝組學的研究成果為眾多的藥物靶學、疾病機理研究以及疾病診斷提供有力依據。它還推動了免疫組化以及免疫熒光等技術的發展，事實上長期供應非靶向代謝組學更是由此迅速推進了研究步伐，現在就非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫作簡要闡述：1.HMDB非靶向代謝組學的代謝通路必須借助多類不同的數據庫進行準確分析。比如進行動物糞便代謝產物分析時，若是沒有有力的數據庫進行源數據對比分析，那么便難以確定動物糞便代謝產物中包括哪些未知成分，而HMDB數據庫已收集了大量適用于鑒定體內內源性代謝物的參考數據。2.KEGGKEGG是集合了眾多大型分子數據集生成的基因組測序的實用程序數據庫資源，選用這個數據庫里面的資源對于提升非靶向代謝組學研究效率具有巨大的幫助。KEGG有助于幫助分析人員篩別動物糞便代謝的生物學信息、基因和蛋白質信息，從而便于提升代謝組學研究的準確性。3.Reactome非靶向代謝組學還適宜選用Reactom......閱讀全文
代謝組學：未來新方向
加拿大阿伯特大學生命科學與計算科學教授David Wishart說，我們自身其實就是一大組生化反應，“因此，基因組和蛋白質組不斷進化來支持代謝組，而不是相反的路徑。” Wishart說，有別于其他組學方法，代謝組學提供了一種更加直接的生理狀態檢測方式。代謝組反應營養、脅迫或者疾病狀態的速度比轉
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為：“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”，兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度的穩定性、重現
如何看待代謝組學的前景
是不錯的，但是代謝組本身還是一個發展中的新型學科，一些關鍵性技術還有待突破，如果你只想使用代謝組學而不去深入的研究它的話就應該沒問題，如果想要進一步研究代謝組學方法就需要有相當的分析化學知識。現在世界前十的藥廠都在使用代謝組學進行藥學研究，所以它在里面的前景肯定是不會差的。隨著技術的發展肯定會越來越
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為：“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”，兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度
如何看待代謝組學的前景
是不錯的，但是代謝組本身還是一個發展中的新型學科，一些關鍵性技術還有待突破，如果你只想使用代謝組學而不去深入的研究它的話就應該沒問題，如果想要進一步研究代謝組學方法就需要有相當的分析化學知識。現在世界前十的藥廠都在使用代謝組學進行藥學研究，所以它在里面的前景肯定是不會差的。隨著技術的發展肯定會越來越
代謝組學——腫瘤研究的利器
細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的，代謝物更多地反映了細胞所處的環境，比如細胞現在是不是健康？藥物是否起效？環境污染物是不是正在傷害細胞？等等。由此，20世紀90年代，衍生出了一門新學科：代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題：細胞到底發生了什么？ 1、腫瘤與代謝組學 腫瘤
進入前景光明的代謝組學
內容概要： 一、代謝組學在藥物研發中的應用 二、SiDMAP技術在疾病診斷中的應用 三、儀器公司的研究開發：ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研發分析代謝物的更為靈敏的檢測方法，而Bio-Rad公司正在發展用Holly Grail作
Bruker在ASMS－2016上推出最新代謝組學數據庫
新型MetaboBASE Personal Library提高分析人員深入進行代謝物鑒定的信心 分析測試百科網訊 2016年6月6日—在ASMS 2016會議上，Bruker推出最新質譜數據庫，被稱為Bruker MetaboBASE Personal Library?，該數
中藥基礎物質、代謝及代謝組學研究方案
中藥組成成分復雜、作用環節多樣，中藥藥效物質基礎以及臨床療效機理的闡明，已成為中醫藥現代化研究的重要內容。如何快速地從海量的質譜數據中獲取有價值的信息，減輕繁重的數據處理工作量，成為廣大中醫藥研究工作者的心聲。 賽默飛的Compound Discoverer軟件針對中藥成分鑒定、體內代謝轉化和
代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用（一）
在疫情逐步可控的情形下，一線的醫務工作者和科研人員將有更多精力和時間對冠狀病毒進行更深一步的研究和認識。我們此次調研了基于Orbitrap超高分辨的代謝組學，脂質組學，以及藥物治療在病毒學研究中的應用。致敬白衣天使和深耕醫學研究的學者。?目前的研究顯示，新型病毒進入細胞的路徑與SARS冠狀病毒一樣，
代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用（二）
案例三基于代謝組學技術挖掘病毒感染宿主后代謝動態變化情況2019年發表在Viruses雜志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶標和靶標代謝組學方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆蟲Bm5細胞后宿主代謝的動態變化情況。研究人員發現，CrPV
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料SIMCA - P 多變量統計軟件試劑、試劑盒[ 1H ] - NMR 抽提劑儀器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波譜儀實驗步驟本章描述的方法最適合于分析小麥精白面，但改進后也適用于全面粉、麥麩或其他組織，如葉和根。在開展實質等同性代謝組學實驗前，如其他任何田間試驗或溫室
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料 SIMCA - P 多變量統計軟件試劑、試劑盒 [ 1H ] - NMR 抽提劑儀器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波譜儀實驗步驟 本章描述的方法最適合于分析小麥精白面，但改進后也適用于全面粉、麥麩或其他組織，如葉和根。在開展實質等同性代謝組學實驗前，如其他任何田間試
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料：SIMCA - P 多變量統計軟件 ?? 試劑、試劑盒：[ 1H ] - NMR 抽提劑 ? ? ?儀器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?NMR 管 ? ?
臨床代謝組學研究常見問題
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。Q：如何設置驗證集和測試集？A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這幾個數據集概念，通常
代謝組學全流程解決方案
賽默飛基于其超高分辨的靜電場軌道阱（Orbitrap）質譜平臺結合其功能強大的軟件平臺，提供代謝組學全流程解決方案。該方案不僅覆蓋從極性代謝物到非極性代謝物的全面檢測、峰提取與定量、統計學分析與可視化作圖、代謝產物的全面鑒定、代謝通路分析等全流程的要求，而且還整合了從非靶標生物標記物發現到靶標生物標
質譜儀在代謝組學和代謝研究中有著杰出表現
質譜儀以離子源、質量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過多的能量會進一步碎裂成較小質量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場作用下獲取具有相同能量的平均動能而進入質量分析器。質量分析器是將同時進入其中的不同質量的離子，按質荷比m/e大小分
【JOAT劉虎威編者按】專題：代謝組學和脂質組學
劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編。 近日，劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編進行了約稿審稿工作，并撰寫了題為“專題：代謝組學和脂質組學”的編者按。 代謝
首篇梅毒患者血清的非靶代謝組學研究發表
梅毒是世界范圍內一種常見的性傳播疾病，致病病原體是梅毒螺旋體，2017年，中國疾控中心報告梅毒新發病例47.5860萬例，死亡45人，在所有乙類傳染病中排名第三位。今天小編要為各位老師解讀一篇APT客戶廈門大學附屬中山醫院楊天賜課題組最近發表的文獻，是首篇對梅毒患者進行代謝組學研究的文章，并篩選到了
代謝組學：一項艱巨的任務
學生化的孩子真是傷不起。糖代謝、脂代謝、核酸代謝，一系列代謝通路，一大堆代謝產物，簡直讓人頭暈眼花。然而，這又不能跳過。畢竟，DNA編碼蛋白質，而蛋白質在小分子上發揮其魔力。但很多時候，科學界對這些分子一無所知。 “如果你測定一滴血中的小分子，大約60% 所檢測到的峰都無法與任何代謝物相匹配，
臨床代謝組學研究常見問題（一）
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。 Q：如何設置驗證集和測試集？ A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這
臨床代謝組學研究常見問題（一）
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AFADESI空間代謝組學高級研修班
為做好AFADESI空間代謝組學技術服務工作，由中國科學院高能物理研究所測試中心和中國科學院-香港大學金屬組學與健康和環境聯合實驗室共同承辦的“AFADESI空間代謝組學高級研修班”將于2023年4月26日-4月27日在京召開。在這里，我們將竭誠為您提供豐富的前沿應用信息和與專家零距離交流的平臺
綜述：代謝組學在疾病中的應用
代謝組學經歷了迅猛的技術演化在過去二十年。尤其是廣泛靶向代謝組學技術的新起，實現一次性檢測堅定上千種物質，同時能夠定量。整合了非靶向和靶向代謝物檢測技術的優點，創造性實現了高通量、高靈敏度靶向代謝物檢測，為定性、定量檢測大批量、低豐度代謝物提供了高效的方法。 應用代謝組學的定義事件的預測生
利用精確血漿代謝組學方法揭示衰老相關代謝特征
過去二十年里，代謝（脂質）組學研究得到了迅速發展。液相色譜與高分辨質譜聯用（LC-HRMS）技術是目前內源性代謝物最常用的手段，然而困擾LC-HRMS技術的分析精度和結構鑒定的瓶頸問題仍然存在。尤其是血漿樣本，其組分化學性質各異，同時復雜的基質會顯著減低代謝物定性與定量結果的準確性，導致生物學信
安捷倫使用代謝組學方法研究胚胎大腦發育的新型毒性通路
安捷倫科技聯手約翰霍普金斯大學使用代謝組學方法研究胚胎大腦發育的新型毒性通路 ??? 2010 年 8 月 23 日，北京 — 安捷倫科技公司（NYSE：A）和安捷倫基金會今日宣布，Thomas Hartung 博士榮獲安捷倫思想領袖獎，該獎項肯定了 Thomas Hartung
Cell提出一個新“組學”：蛋白質代謝小分子互動組學
科學家們提出了一個新的“組學”——一個處理蛋白質和小分子之間相互作用的互動組學（protein-metabolite interactomics）。此前系統生物學家專注于基因組學或蛋白質組學，現在他們日益發現了蛋白質-代謝小分子之間相互作用的重要性。 基因組學針對的是生物體基因的系統分析，而蛋
將領域知識引入神經網絡，MIT團隊用光譜Transformer研究非靶向代謝組學圖譜
代謝組學研究已經確定了介導細胞信號傳導、競爭和疾病病理學的小分子，部分原因是大規模社區努力測量數千種代謝物標準品的串聯質譜。然而，在臨床樣品中觀察到的大多數光譜不能與已知結構明確匹配。令人驚訝的是，用于闡明小分子結構的深度學習方法無法與經典統計方法相媲美，科學家認為這可能是由于缺乏納入當前神經網絡架
Agilent與Stemina－宣布代謝組學領域的合作
Agilent與Stemina 生物標記物發現公司宣布共同促進 Stemina 的代謝組學研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷倫科技公司(紐約證交所：A)與 Stemina 生物標記物發現公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，兩家公司