黃超蘭、高福團隊《自然通訊》發文,登TOP50熱文榜
北大醫學部精準醫療多組學研究中心主任黃超蘭團隊,與中國科學院院士高福團隊在Nature Communications(《自然通訊》)期刊線上發表《Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease》一文。 摘要: 新冠肺炎疫情已經成為全球大流行。這種傳染病的發病機制以及它與其他肺炎驅動因素的區別尚不清楚。本研究采用定量蛋白質組學方法對COVID-19感染病例、健康供體和非COVID-19肺炎病例的尿液樣本進行分析。 分子變化顯示COVID-19感染早期出現免疫抑制和緊密連接損傷。將COVID-19患者進一步劃分為中度和重度類型表明,重癥患者出現活化免疫反應。我們提出了這一不尋常的病毒感染的兩階段發病機制。 我們的數據促進了我們對COVID-19感染臨床特征的理解,并為未來的機制和治療研究提供了資源。 原文鏈接:https://www.nature.co......閱讀全文
定量蛋白質組學的誕生
在現代研究技術,如熒光顯微鏡,流式細胞儀和蛋白質芯片技術中,抗體仍然扮演著非常重要的角色。但依賴于抗體的蛋白質檢測存在一些缺點,其中最大的限制就是,抗體的可用性和質量差別很大。一些大規模項目,比如人類蛋白質圖譜(Human Protein Atlas),Antibodypedia,以及美國NIH
定量蛋白質組學方法分類
1 背景和意義從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質表達水平變化的研究,識別功能模塊和路徑,監控疾病的生物標志物,這些研究都
定量蛋白質組學方法分類介紹
【蛋白研究系列專題】-4丨定量蛋白質組學方法,您值得擁有 1 背景和意義 從生命活動的直接執行者——蛋白質的角度研究生命現象和規律(特別是疾病防治和病理研究)已成為研究生命科學的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織或器官中含有蛋白質種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下
定量蛋白質組學的研究內容
1.蛋白質鑒定:可以利用一維電泳和二維電泳并結合Western等技術,利用蛋白質芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術對蛋白質進行鑒定研究。 2.翻譯后修飾:很多mRNA表達產生的蛋白質要經歷翻譯后修飾如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻譯后修飾是蛋白質調節功能的重要方式,因此對蛋白質翻譯后修飾的研究對
《自然方法學》:可視蛋白質組學
瑞士聯邦技術學院的研究人員開發出一種在問號鉤端螺旋體(Leptospira interrogans)這種病原體中定位蛋白復合物的新方法,稱為“可視蛋白質組學”。文章發表在本期的《自然-方法學》上。 活細胞中的生化進程分為多個功能單元,它們在細胞內有著特定的時間和空間分布。一般來說,這些單元
安捷倫科技資助定量蛋白質組學研究
安捷倫科技通過都柏林國立大學 Newman 獎學金計劃 資助定量蛋白質組學研究 2010 年 5 月 12 日,加利福尼亞州圣克拉拉市和愛爾蘭都柏林市 — 安捷倫科技公司(紐約證交所:A)和都柏林國立大學(University College Dublin, UCD)今日宣布 Ben
定量蛋白質組學的優勢有哪些?
質譜方法比抗體方法更先進的一個原因,就是已經開發出了一種新的定向分析技術,比生產一個新的抗體要快得多,并大大減少了檢測特異性方面的問題(抗體方法存在交叉反應的問題)。 雖然抗體方法在低豐度蛋白的檢測方面更加靈敏,但是質譜技術的一個明顯優勢就是能在單個實驗中檢測多種蛋白,比如說,系統生物學研究人
定量蛋白質組學的技術發展
以質譜為基礎的定向蛋白質組學研究領域的發展歷程并不短,早在上個世紀70年,三重四極桿質譜儀就已經出現,并在80年代首次在發表的文章中,證明可以被用來檢測肽段。 過去幾年間,更廣泛的范圍內定向質譜技術的應用迅速攀升,而且新方法,新工具,新資源和新一代方法,也令更多研究領域的科學家們能利用到這項技
蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀
上期分享的蛋白組學內容,是不是有些小伙伴還繞在云里霧里呀?這次,小編用實例說話,幫您梳理清楚。 一、Label-free定量 Label-free定量,顧名思義就是不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化
定量定性蛋白質組學新工具亮相ASMS
賽默飛世爾科技在ASMS 2010展示定量定性蛋白質組學工具 美國猶他州鹽湖城(2010年5月25日)– 全球服務科學領域的領導者賽默飛世爾科技,今日公布了其在蛋白質組學工具方面的重大進步,并表示這些進步將推動定量和定性蛋白質組學研究取得突破性的進展。這些新產品與賽默飛世爾科技其它的試劑和耗材
“鳥槍法(shotgun)”定量蛋白質組學技術
1999年,Yates研究組提出“鳥槍法”(shotgun),其基本技術路線是針對液體或SDS-PAGE條帶的復雜混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物,然后對肽混合物進行多維毛細管液相色譜分離和串聯質譜分析以及數據庫檢索,從而確定蛋白質的種類,可同時鑒定成百上千種蛋白質。他們把這種思路稱
蛋白質組與蛋白質組學簡介1
一、蛋白質組概念:一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表
蛋白質組與蛋白質組學簡介2
3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白
2025蛋白質組學大會之蛋白質組學新技術
2025年10月13日上午,蛋白質組學新技術(Emerging proteomics technologies)專題分論壇順利召開。本場會議由本領域學者陸豪杰教授、王初教授、譚敏佳教授、秦偉捷教授和Yasushi Ishihama教授共同召集和組織。來自海內外的多位知名學者圍繞該領域的前沿進展,分享
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(四)
無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決
蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀(一)
一、Label-free定量Label-free定量,顧名思義就是不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。Label-free技術又可分為基于譜圖數(Spectra Co
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(二)
同步母離子選擇(Synchronous precursor selection, SPS)技術的出現徹底解決了MS3 響應弱的問題。SPS 技術利用多頻切跡的選擇波形電壓(MultiNotch) [27] ,在線性離子阱中實現一次選擇同時獲得多個離子,最多可同時選擇15 個(圖2A)。利用這一原理,
定量蛋白質組學揭開巨噬細胞活化的秘密
巨噬細胞活化是許多疾病發展過程中的關鍵步驟,包括動脈疾病。最近,布萊根婦女醫院和哈佛醫學院的研究人員通過蛋白質組學及其他分析,強調了PARP9和PARP14在調節巨噬細胞活化中的作用。這項成果發表在《Nature Communications》上。布萊根婦女醫院的Masanori Aikawa及其同
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(三)
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀(二)
經典案例題目:A tumour suppressor network relying on the polyamine-hypusine axis(一種基于多胺Hypusine軸(Polyamine-hypusine axis)的新型腫瘤抑制網絡)期刊:Nature主要技術:iTRAQ定量文章摘要:
蛋白質組學幾種定量方法的案例解讀(三)
經典案例題目:Proteome-wide Mapping of Cholesterol-Interacting Proteins in Mammalian Cells(采用甾醇探針結合SILAC定量技術在哺乳動物細胞中分析膽固醇-蛋白質相互作用)期刊:Nat Methods主要技術:SILAC定量文
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(一)
摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋
蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
2025蛋白質組學大會之農業蛋白質組
2025年10月14日10:10-12:10,由AOHUPO, AOAPO, π-HuB和CNHUPO四會聯辦的農業蛋白質組分論壇在廣州成功舉辦。論壇由CNHUPO植物蛋白質組工作組和中國遺傳學會農業蛋白質組分會負責召集。來自日本福井工業大學、美國密西西比大學、奧地利維也納大學、武漢大學、中國科
2025蛋白質組學大會之蛋白質組動態
2025年10月14日14點在廣州白云國際會議中心國際會堂珠水廳,第12屆AOHUPO大會暨第8屆AOAPO大會暨π-HuB國際大科學計劃第三屆全球峰會暨第13屆CNHUPO大會“Proteome Dynamics”分論壇順利拉開帷幕。本論壇由中國科學院大連化學物理研究所張麗華研究員、南京大學劉
2025蛋白質組學大會之體液蛋白質組
2025年10月14日,由AOHUPO, AOAPO, π-HuB和CNHUPO四會聯辦的體液蛋白質組分論壇在廣州成功舉辦。來自北京師范大學、復旦大學、南方醫科大學中國醫學科學院基礎醫學研究所、深圳灣實驗室、首都醫科大學附屬北京地壇醫院、北京青蓮百奧生物科技有限公司、香港科技大學、Nationa
2025蛋白質組學大會之單細胞蛋白質組學研究
2025年10月13日上午10:10,第12屆AOHUPO大會暨第8屆AOAPO大會、π-HuB國際大科學計劃第三屆全球峰會暨第13屆CNHUPO大會“Single Cell Proteomics”分論壇在廣州白云國際會議中心汕頭廳(Shantou Hall)成功舉行。 本場論壇由浙江大學方群
2025蛋白質組學大會之微生物蛋白質組學
2025年10月14日下午,聚焦于微生物蛋白質組學領域的專題分會場在廣州白云國際會議中心107會議室正式拉開帷幕。會議由王恒樑、馬慶偉、劉小云、李樂園四位教授召集,現場由劉小云、Paola Roncada教授主持。來自意大利卡坦扎羅“大希臘”大學、比利時根特大學、復旦大學、西湖大學、國家蛋白質科學中