研究AtoIRNA編輯位點在后生動物中的分布和演化驅動力
2021年5月17日，北京大學生命科學學院陸劍研究員課題組在WIREs RNA發表題為“Evolutionary driving forces of A-to-I editing in metazoans”的綜述論文。 由ADAR（adenosine deaminase acting on RNA）蛋白介導的腺嘌呤到次黃嘌呤（A-to-I）的RNA編輯是后生動物中廣泛存在的轉錄后修飾。由于I會被識別為G，因此A-to-I RNA編輯在不改變基因組序列的情況下，時空特異性地增加了轉錄組和蛋白組的多樣性。陸劍課題組之前的工作已經報道了在果蠅中存在大量改變氨基酸的非同義RNA編輯位點（Nonsyn），這些編輯位點呈現出適應性信號，受到正向自然選擇（Duan et al., 2017, PLoS Genetics），并且這些成簇分布的、具有適應性的非同義RNA編輯事件傾向于連鎖在相同mRNA分子上，同時被編輯（Duan et al......閱讀全文
大腦RNA編輯位點“辭典”發布
美國西奈山伊坎醫學院研究人員對大腦中的數千個位點進行了編目，在這些位點中，RNA在整個人類生命周期中被修飾，這個過程被稱為腺苷到肌苷（A-to-I）編輯，其為理解大腦發育的細胞和分子機制以及它們如何影響健康和疾病提供了重要的新途徑。在《細胞報告》上發表的論文中，研究團隊描述了大腦中RNA編輯的速率如
CRISPR新工具開辟更多可編輯基因組位點
據最新一期《科學進展》報道，美國麻省理工學院（MIT）研究人員發現了一種可靶向幾乎一半基因組位點的Cas9酶，從而極大地擴展了基因編輯工具的適用范圍。 盡管基因編輯工具近年來取得了相當大的成功，但CRISPR-Cas9在基因組上可訪問的位點數量仍然有限。這是因為CRISPR需要在基因組靶向位點
Nature子刊：最大、最精確的RNA編輯位點列表
由布朗大學領導的一個研究小組編譯出了一份最大型、經最嚴格驗證的果蠅RNA編輯位點列表。該研究生成了關于這一模式生物基礎生物學的一些新見解，研究結果發表在9月29日的《自然結構和分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)雜志上。 這一“主列
核酶切割 RNA 專一位點
?? ? ? 核酶切割 RNA 專一位點 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 合成的核酶分子 切割底物RNA 試劑、試劑盒
核酶切割 RNA 專一位點
實驗材料 合成的核酶分子切割底物RNA試劑、試劑盒 Tris-HClMgCl2實驗步驟 一、材料與設備1)500 mmol/LTris-HCl(pH7.4)2)100 mmol/LMgCl23) 合成的核酶分子4) 切割底物 RNA二、操作方法1) 制備切割混合構：不超過 l0 pmol 底物 RN
脫氧核酶切割 RNA 專一位點
? ? ? ? ? ? 實驗材料 脫氧核酶 無RNA酶的DMA酶 切割底物RNA 試劑、試劑盒 5X反應緩沖液
3.7 核酶切割 RNA 專一位點
核酶是獲得長片段 RNA 特定位點切割產物的有用工具，可用于研究 RNA 修飾，修飾位點分析，以及獲得具布不間長度末端的 RNA 轉錄產物。實驗材料合成的核酶分子切割底物RNA試劑、試劑盒Tris-HClMgCl2實驗步驟一、材料與設備1)500 mmol/LTris-HCl(pH7.4)2)100
脫氧核酶切割 RNA 專一位點
實驗材料 脫氧核酶無RNA酶的DMA酶切割底物RNA試劑、試劑盒 5X反應緩沖液5X乙酸鎂或氯化鎂無水乙醇水飽和酚實驗步驟 一、材料與設備1) 脫氧核酶 (其設計與制格參見脫氧核酶相關章節）2)5X 反應緩沖液：750Tnmol/LNaCl，200 mmol/LTris-HCl (pH8.0)3)5
RNA甲基化位點分析新方法
繼上次QB期刊給大家推薦了WendyV. Gilbert教授的《關于pre-mRNA存在的修飾形式及其對剪接的影響》綜述后，小編看到讀者們的熱情度特別高。借此機會，再給大家推薦一篇來自德克薩斯大學西南醫學中心，QBRC、BICF中心主任謝陽教授實驗室在QB期刊上發表的最新關于分析MeRIP-Se
3.8 脫氧核酶切割 RNA 專一位點
脫氧核酶是一類由三十幾個脫氧核苷酸構成的寡聚脫氧核糖核苷酸，制備容易，使用方便，是體外在特定位點切割 RNA 的有效方法。常用于體外切割 RNA 底物的脫氧核酶是「10~23」型脫氧核酶。實驗材料脫氧核酶無RNA酶的DMA酶切割底物RNA試劑、試劑盒5X反應緩沖液5X乙酸鎂或氯化鎂無水乙醇水飽和酚實