布魯克發布全新空間單細胞代謝組學研究策略
摘要 * 創新的無偏原位空間單細胞代謝組學（SSCM）能夠以單細胞分辨率實現高通量代謝組織樣本表征； * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技術可在大視場內提供幾乎無偽影的小分子圖像； * 創新的 4D-代謝組學可通過 CCS-Predict Pro AI/DL 功能預測分子碰撞橫截面（CCS），進一步豐富脂質、代謝物和糖苷的數據庫. 2022年6月21日西班牙瓦倫西亞 --在第 18 屆代謝組學學會國際會議上，布魯克公司（納斯達克股票代碼：BRKR）宣布了空間多組學的關鍵創新是無偏空間單細胞代謝組學（SSCM），它被用于探測基于組織和單細胞代謝特征的差異細胞表型。 SSCM 與最近發布的 MALDI HiPLEX-IHC 工作流程相結合，可用于原位單細胞免疫代謝組學研究，從而實現了將基于代謝組學的免疫重編程與靶向蛋白質組學的整合。這種單細胞多組學工作流程......閱讀全文
中藥基礎物質、代謝及代謝組學研究方案
中藥組成成分復雜、作用環節多樣，中藥藥效物質基礎以及臨床療效機理的闡明，已成為中醫藥現代化研究的重要內容。如何快速地從海量的質譜數據中獲取有價值的信息，減輕繁重的數據處理工作量，成為廣大中醫藥研究工作者的心聲。 賽默飛的Compound Discoverer軟件針對中藥成分鑒定、體內代謝轉化和
代謝組學－|－腫瘤治療之靶向葡萄糖代謝
能量代謝重編程是腫瘤的十大特征之一，其中葡萄糖代謝異常是腫瘤代謝最突出的特征。在氧氣充足的情況下，腫瘤細胞依然傾向于進行糖酵解，將葡萄糖代謝為乳酸。腫瘤細胞有氧糖酵解能力是正常細胞的20 ～ 30倍，為腫瘤代謝提供 大量能量和中間產物。因此，靶向糖酵解等異常環節的代謝酶是抗腫瘤治療的重點。一些研
代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用（一）
在疫情逐步可控的情形下，一線的醫務工作者和科研人員將有更多精力和時間對冠狀病毒進行更深一步的研究和認識。我們此次調研了基于Orbitrap超高分辨的代謝組學，脂質組學，以及藥物治療在病毒學研究中的應用。致敬白衣天使和深耕醫學研究的學者。?目前的研究顯示，新型病毒進入細胞的路徑與SARS冠狀病毒一樣，
代謝組學、脂質組學在病毒研究中的應用（二）
案例三基于代謝組學技術挖掘病毒感染宿主后代謝動態變化情況2019年發表在Viruses雜志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶標和靶標代謝組學方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆蟲Bm5細胞后宿主代謝的動態變化情況。研究人員發現，CrPV
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料：SIMCA - P 多變量統計軟件 ?? 試劑、試劑盒：[ 1H ] - NMR 抽提劑 ? ? ?儀器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?NMR 管 ? ?
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料SIMCA - P 多變量統計軟件試劑、試劑盒[ 1H ] - NMR 抽提劑儀器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波譜儀實驗步驟本章描述的方法最適合于分析小麥精白面，但改進后也適用于全面粉、麥麩或其他組織，如葉和根。在開展實質等同性代謝組學實驗前，如其他任何田間試驗或溫室
臨床代謝組學研究常見問題
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。Q：如何設置驗證集和測試集？A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這幾個數據集概念，通常
實質等同性（代謝組學）實驗
實驗材料 SIMCA - P 多變量統計軟件試劑、試劑盒 [ 1H ] - NMR 抽提劑儀器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波譜儀實驗步驟 本章描述的方法最適合于分析小麥精白面，但改進后也適用于全面粉、麥麩或其他組織，如葉和根。在開展實質等同性代謝組學實驗前，如其他任何田間試
合作成果丨靶向代謝組學
?????本文內容非商業廣告，僅供專業人士參考。關于島津? ? ? 島津企業管理（中國）有限公司是（株）島津制作所于1999年100%出資，在中國設立的現地法人公司，在中國全境擁有13個分公司，事業規模不斷擴大。其下設有北京、上海、廣州、沈陽、成都分析中心，并擁有覆蓋全國30個省的銷售代理 ????
代謝組學全流程解決方案
賽默飛基于其超高分辨的靜電場軌道阱（Orbitrap）質譜平臺結合其功能強大的軟件平臺，提供代謝組學全流程解決方案。該方案不僅覆蓋從極性代謝物到非極性代謝物的全面檢測、峰提取與定量、統計學分析與可視化作圖、代謝產物的全面鑒定、代謝通路分析等全流程的要求，而且還整合了從非靶標生物標記物發現到靶標生物標
單細胞表觀組學：單細胞ChIPseq解碼細胞命運決定機制
在國家重點研發計劃“干細胞及轉化”重點專項（批準號：2017YFA0103402）等資助下，北京大學分子醫學研究所、北大-清華生命科學聯合中心何愛彬課題組近期突破單細胞表觀遺傳研究的瓶頸，開發了兩種具有普適性、操作簡單、風格迥異的單細胞ChIP-seq技術，可適應于不同課題研究需要，解析發育與疾
布魯克質譜：拓展多組學研究邊界－推動臨床轉化
--布魯克中國區經理何磊先生專訪 分析測試百科網訊，自2017年推出timsTOF以來，布魯克每年都在為科學家們帶來創新的產品，今年六月就推出了第二代timsTOF Pro 2和單細胞蛋白質組研究平臺timsTOF SCP。布魯克質譜中國區業務快速增長，不僅來源于創新的產品，也同中國團隊的努力
【JOAT劉虎威編者按】專題：代謝組學和脂質組學
劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編。 近日，劉虎威教授擔任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主編進行了約稿審稿工作，并撰寫了題為“專題：代謝組學和脂質組學”的編者按。 代謝
質譜儀在代謝組學和代謝研究中有著杰出表現
質譜儀以離子源、質量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過多的能量會進一步碎裂成較小質量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場作用下獲取具有相同能量的平均動能而進入質量分析器。質量分析器是將同時進入其中的不同質量的離子，按質荷比m/e大小分
Nature發布單細胞基因組學新技術
胚胎是如何形成我們肺臟、肌肉、神經和其他組織中的細胞的?一種新的方法可以解碼使得胚胎萬能細胞能夠增殖并轉變為機體許多特化細胞類型的遺傳指令。 一開始是一團相同的細胞，隨著增殖不斷地改變形狀和功能，最終變為我們肺臟、肌肉、神經和機體所有其他特化組織中的細胞。胚胎擁有這種創造奇跡的能力。
單細胞脂質組學技術的機制及意義
5月17日，清華大學精密儀器系質譜研究團隊發文報道基于質譜的單細胞脂質組精細結構表征技術，實現了哺乳動物單細胞內脂質的大規模精細結構分析，解決了單細胞質譜領域長期面臨的關鍵技術挑戰。基于單細胞內多種類型脂質異構體的鑒定與相對定量，該團隊實現了野生型非小細胞肺癌（HCC827）細胞群體中耐藥細胞的
單細胞和空間組學技術在肝臟領域應用
近期，中國科學院上海營養與健康研究所李虹研究組在《肝臟病學雜志》（Journal of Hepatology）上，發表了題為Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的綜述文章。該文章闡述了前沿的單細胞
代謝組學：一項艱巨的任務
學生化的孩子真是傷不起。糖代謝、脂代謝、核酸代謝，一系列代謝通路，一大堆代謝產物，簡直讓人頭暈眼花。然而，這又不能跳過。畢竟，DNA編碼蛋白質，而蛋白質在小分子上發揮其魔力。但很多時候，科學界對這些分子一無所知。 “如果你測定一滴血中的小分子，大約60% 所檢測到的峰都無法與任何代謝物相匹配，
臨床代謝組學研究常見問題（一）
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。 Q：如何設置驗證集和測試集？ A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這
AFADESI空間代謝組學高級研修班
為做好AFADESI空間代謝組學技術服務工作，由中國科學院高能物理研究所測試中心和中國科學院-香港大學金屬組學與健康和環境聯合實驗室共同承辦的“AFADESI空間代謝組學高級研修班”將于2023年4月26日-4月27日在京召開。在這里，我們將竭誠為您提供豐富的前沿應用信息和與專家零距離交流的平臺
臨床代謝組學研究常見問題（一）
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。 Q：如何設置驗證集和測試集？ A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這
綜述：代謝組學在疾病中的應用
代謝組學經歷了迅猛的技術演化在過去二十年。尤其是廣泛靶向代謝組學技術的新起，實現一次性檢測堅定上千種物質，同時能夠定量。整合了非靶向和靶向代謝物檢測技術的優點，創造性實現了高通量、高靈敏度靶向代謝物檢測，為定性、定量檢測大批量、低豐度代謝物提供了高效的方法。 應用代謝組學的定義事件的預測生
代謝組學常使用的數據庫
代謝組主要是對小分子代謝物（一般50-1500 Da）進行高通量定性和定量分析，代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據，方便后續的代謝組學數據分析，揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD
利用精確血漿代謝組學方法揭示衰老相關代謝特征
過去二十年里，代謝（脂質）組學研究得到了迅速發展。液相色譜與高分辨質譜聯用（LC-HRMS）技術是目前內源性代謝物最常用的手段，然而困擾LC-HRMS技術的分析精度和結構鑒定的瓶頸問題仍然存在。尤其是血漿樣本，其組分化學性質各異，同時復雜的基質會顯著減低代謝物定性與定量結果的準確性，導致生物學信
重磅！布魯克宣布收購IP2蛋白質組學軟件
2020年9月30日，布魯克對外宣布最近收購了IP2（Integrated Proteomics Pipeline）搜索引擎和蛋白質組學工作流程軟件平臺。IP2搜索引擎由美國Scripps研究所John Yates III教授與Robin Park、Tao Xu博士共同創立Integrated
總裁專訪－|－單細胞蛋白質組分析成為現實
多組學發展的兩大趨勢是大隊列高通量分析和單細胞多組學高靈敏度分析。近年來單細胞測序的基因組學成為熱點，而蛋白無法如基因般擴增，單細胞蛋白質組學更具挑戰。去年Matthias Mann教授團隊首次展示了單細胞蛋白質組學的成果，布魯克今年就為科學家們推出了timsTOF SCP質譜，同時推出在大隊列
Cell提出一個新“組學”：蛋白質代謝小分子互動組學
科學家們提出了一個新的“組學”——一個處理蛋白質和小分子之間相互作用的互動組學（protein-metabolite interactomics）。此前系統生物學家專注于基因組學或蛋白質組學，現在他們日益發現了蛋白質-代謝小分子之間相互作用的重要性。 基因組學針對的是生物體基因的系統分析，而蛋
單細胞和空間組學技術在肝臟領域的應用
近期，中國科學院上海營養與健康研究所李虹研究組在《肝臟病學雜志》（Journal of Hepatology）上，發表了題為Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的綜述文章。該文章闡述了前沿的單細胞
我國在單細胞蛋白質組學研究獲突破
浙江大學化學系微分析系統研究所方群教授團隊，聯合北京大學醫學部精準醫療多組學研究中心主任黃超蘭教授團隊，在單細胞蛋白質組學分析研究領域取得突破性進展。研究論文近日在線發表在美國《分析化學》雜志上。 黃超蘭介紹，近年來，基于細胞群體內的蛋白質組學研究，已越來越難以滿足對生命功能深入探究的需要。從
非靶向代謝組學中鑒定代謝產物適宜選用哪些分析方法
據相關科技要聞解讀表明非靶向代謝組學已逐步成為研究生命活動的重要基礎。它可高清呈現代謝產物的變化規律以及代謝種類，特別是那些評價高的非靶向代謝組學更是揭開了研究集體生命活動發生和發展的本質，現在就非靶向代謝組學中鑒定代謝產物更適宜選用哪些分析方法作簡要闡述：1.主成分分析（PCA）非靶向代謝組學中鑒