北京大學湯富酬等團隊發布單細胞測序技術最新研究成果
基于第三代測序（TGS）平臺的單細胞RNA-seq技術的進步加速了生物學研究。自2016年以來，已經開發了幾種基于TGS平臺的單細胞RNA-seq方法。由于受到低準確度和靈敏度的限制，它們要么結合基于NGS平臺的方法降低錯誤率，要么通過犧牲通量來提高檢測率。 2023年1月11日，北京大學湯富酬等團隊合作在《Cell Discovery》在線發表題為“High-throughput and high-sensitivity full-length single-cell RNA-seq analysis on third-generation sequencing platform”的研究論文，該研究在第三代測序平臺上進行了高通量、高靈敏度的全長單細胞RNA-seq分析。 研究概述 為了克服上面的問題，研究人員開發了SCAN-seq2一種基于TGS平臺的高通量，高靈敏度的全長RNA-seq方法。研究對來自九個細胞系的總......閱讀全文
湯富酬最新綜述：單細胞測序與干細胞
干細胞能夠分化成為機體內任何類型的細胞，既是研究人體早期發育的理想工具，也是細胞治療的寶貴資源。細胞間差異和異質性是干細胞群體固有的基本特性。如果我們對一群細胞進行組學分析，這些關鍵的信息就會被掩蓋。 單細胞測序技術是近幾年備受關注的強大工具，可以在同種干細胞中全面剖析細胞異質性，鑒定不同表型
北京大學湯富酬等團隊發布單細胞測序技術最新研究成果
基于第三代測序（TGS）平臺的單細胞RNA-seq技術的進步加速了生物學研究。自2016年以來，已經開發了幾種基于TGS平臺的單細胞RNA-seq方法。由于受到低準確度和靈敏度的限制，它們要么結合基于NGS平臺的方法降低錯誤率，要么通過犧牲通量來提高檢測率。 2023年1月11日，北京大學湯富
2018單細胞測序盤點：北大湯富酬教授連發11篇論文
單細胞RNA測序技術隨著近幾年的迅速發展，已在多個領域，從早期胚胎發育到組織和器官發育、以及免疫學和腫瘤學開花結果。 2018年，這一領域國內外成果不斷，比如北京大學的湯富酬課題組就接連發表了11篇文章，獲得了單細胞測序領域的接連重要成果。 3月，這一研究組與中國科學院生物物理研究所王曉群課
北大湯富酬課題組發表單細胞表觀多組學測序技術新成果
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
北大湯富酬等人揭示人類胚胎發育機制
基因表達圖 近日，北京大學研究團隊采用先進的單細胞 RNA-Seq 轉錄組測序技術繪制出了完整的人類植入前胚胎和胚胎干細胞的轉錄組圖譜，這一重要的研究成果發表在9月的《自然結構與分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)雜志上。 由
北大湯富酬發表表觀基因組新成果
表觀遺傳學修飾可以在不改變DNA序列的情況下調控基因的活性。基因表達在時間和空間上的表觀遺傳學調控，對于人類發育是至關重要的。近年來，表觀基因組已經成為了生物醫學領域的一大研究熱點。 北京大學的研究團隊對早期人類胚胎進行深入研究，獲得了胎兒大腦、心臟和肝臟的表觀基因組景觀。這一成果發表在十二月
北大湯富酬團隊首次在單細胞水平上從頭組裝人類基因組
基因組組裝受益于具有更高準確性和更高連續性的長讀長測序技術。然而，大多數人類基因組組裝需要來自同質細胞系的大量 DNA，而不會保持細胞異質性，因為細胞異質性會嚴重影響單倍型組裝結果。 2022年7月12日，北京大學湯富酬團隊在Nucleic Acids Research （IF=19）在線發表
北大科學家解析小鼠著床前胚胎中的單堿基分辨率5fC譜圖
2017年3月23日，北京大學BIOPIC中心湯富酬課題組與生命科學學院伊成器課題組合作在《Cell Stem Cell》雜志上發表了題為“Single-Cell 5-Formylcytosine Landscapes of Mammalian Early Embryos and ESCs at
北大喬杰、湯富酬、黃巖誼發表環狀RNA新成果
早在幾十年前，生物學家們就發現了環狀RNA。與線性RNA相比，環狀RNA受到的關注比較少，一直被認為是剪切過程中發生的錯誤。隨著二代測序的發展，近幾年人們意識到環狀RNA其實是非常普遍的。這些分子廣泛存在于多種生物的細胞中（從古生菌、酵母、小鼠到人類），能夠通過不同途徑影響基因表達，很可能在細胞
北大湯富酬Cell－Stem－Cell點評重編程研究成果
將體細胞重編程為誘導多能干細胞的iPS技術有著廣闊的應用前景。但目前人們對iPS體細胞重編程的分子機制還知之甚少。這主要是因為目前iPS重編程的效率比較低，得到的細胞存在很大的異質性。 北京大學生物動態光學成像中心BIOPIC的研究員湯富酬和助理研究員文路在Cell Stem Cell雜志上
人類胚胎著床過程首次被解析
一枚受精卵長成一個嬰兒，需在發育的第7天左右著床才能存活，這期間的人胚胎細胞無法獲取，難以解析。22日，《自然》雜志登載了我國北京大學湯富酬與北醫三院喬杰聯合團隊研究的最新突破，他們利用體外模擬人類著床策略和高精度單細胞測序技術，展現了“黑盒子”中的乾坤。 “臨床上，著床失敗是導致早期流產的重
Nature2015最佳評論文章：湯富酬、文路、馬曉婭入選
Nature雜志近日展開了一年一度的年終大盤點，評出了2015年的最佳評論文章。本次盤點選入了三名中國學者的兩篇文章，他們分別是北京大學的研究員湯富酬和研究員文路，以及云南大學的研究員馬曉婭。 湯富酬和文路在這篇文章中重點介紹了Grün等人開發的RaceID的算法，該算法能夠在復雜的細胞混合物
《自然—方法學》年度方法：單細胞測序
2014年1月《自然—方法學》(Nature Methods)上發表年度特別報道，將“單細胞測序”(Singled out for sequencing)的應用列為2013年度最重要的方法學進展。 近幾年來，基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展，其成果有望為一些重
北大團隊發展最新單細胞多重組學測序技術
單細胞三重組學測序技術（scTrio-seq）單細胞中三種組學之間的對應關系癌癥中兩個細胞亞群的DNA拷貝數差異 2016年2月23日，《細胞研究》（Cell Research）雜志在線發表了北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組、黃巖誼研究組和首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院暨北京大
成功避免單基因遺傳病試管嬰兒誕生
日前，世界首例經MALBAC基因組擴增高通量測序進行單基因遺傳病篩查的試管嬰兒，在北京大學第三醫院誕生。這標志著我國胚胎植入前遺傳診斷技術已處于世界領先水平。 嬰兒父親所患的單基因遺傳病是指由基因組DNA上一個或一對等位基因突變所導致。大部分單基因病具有致死性、致殘性或致畸性，除部分可以通過
湯富酬－喬杰再發文：繪制人類心臟高精度發育細胞圖譜
人類胚胎發育是一個極其復雜的過程，從一個單細胞的受精卵開始，首先經過著床前胚胎發育產生胚內和胚外組織，再到著床后原腸胚階段三個胚層的特化，進而到器官發生、分化、成熟，及至新生命的誕生。整個兩百八十天的胚胎發育過程從一個單細胞受精卵增殖發育形成含有上萬億個細胞的嬰兒，期間基因表達受到嚴密、精準的調
北大湯富酬、喬杰團隊Cell－Res表觀遺傳學新成果
生物通報道：2016年11月8日，國際著名期刊《Cell Research》在線發表了北京大學湯富酬、喬杰團隊題為“DNA methylation and chromatin accessibility profiling of mouse and human fetal germ cells”
中國科學家系統揭示人類消化道“發育細胞圖譜”
人類消化道有多少種細胞類型？它們“長”什么樣？經過多年聯合攻關，我國科學家近日在國際上首次全面、系統地闡明了食道、胃、小腸和大腸4種器官在人類胚胎發育過程中的基因表達圖譜及其信號調控機制，為消化道生物學研究領域提供了全面、翔實的發育細胞圖譜數據。 由北京未來基因診斷高精尖創新中心（ICG）、北
科學家開發單細胞全轉錄組測序新技術
北京大學生物動態光學成像中心黃巖誼、湯富酬課題組在《美國科學院院刊》（PNAS）上發表題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的論文。該研究利用微流控芯片技術實現了高質量單細胞的全轉錄組測序樣品準備，全面提高了單細胞全
研究人員通過單細胞測序技術揭示骨關節炎發病機制
骨關節炎是目前世界上廣泛發生的軟骨退變疾病。我國研究人員近期通過單細胞轉錄組測序技術，發現了與骨關節炎軟骨退變有關的新的細胞亞型及其分子標志物。據悉，這一研究有助于揭示骨關節炎軟骨退變發病機制，將為骨關節炎的診斷和治療提供重要參考。 這一由北京大學生命科學院湯富酬課題組和中國人民解放軍總醫院王
研究人員通過單細胞測序技術揭示骨關節炎發病機制
骨關節炎是目前世界上廣泛發生的軟骨退變疾病。我國研究人員近期通過單細胞轉錄組測序技術，發現了與骨關節炎軟骨退變有關的新的細胞亞型及其分子標志物。據悉，這一研究有助于揭示骨關節炎軟骨退變發病機制，將為骨關節炎的診斷和治療提供重要參考。 這一由北京大學生命科學院湯富酬課題組和中國人民解放軍總醫院王
北大湯富酬、喬杰、付衛Science發表結直腸癌新成果
結直腸癌是胃腸道中常見的惡性腫瘤。基因組不穩定性、表觀遺傳異常以及基因表達失調是結直腸癌的典型分子特征。以往的單細胞研究只能分別檢測基因組、甲基化組或轉錄組，而不能以單細胞分辨率同時開展多組學研究。 為了更好地了解結直腸癌的發展，北京大學的研究團隊開發出一種單細胞測序方法，不僅能夠分析單細胞的
湯富酬Nature－Cell－Biology發文－揭示人類消化道發育細胞圖譜
人類胚胎發育過程中食道、胃、小腸、大腸的細胞類型圖譜及其關鍵生物學特征。 消化系統是人體中最重要的器官系統之一，而消化道作為消化系統最重要的組成部分，其在食物消化、營養吸收、廢物排泄、抵抗微生物入侵等多個方面起著極其重要的作用。消化道主要由食道、胃、小腸、大腸組成。揭示這四種器官在人類胚胎發育
華人學者Nature－Methods發布單細胞測序重要工具
新一代測序技術（NGS）大大增進了我們對疾病（比如癌癥）的理解。不過NGS的研究對象是細胞群體，會掩蓋細胞之間的異質性。正因如此，單細胞測序（SCS）技術受到了越來越多的關注。 德克薩斯大學MD安德森癌癥中心的研究人員開發了首個用于單細胞DNA測序的突變檢出程序，Monovar。這一重要成果發
世界首例MALBAC全基因組擴增測序試管嬰兒誕生
2014年9月19日，由北京大學第三醫院喬杰教授團隊、北京大學生物動態光學成像中心(BIOPIC)的謝曉亮教授團隊以及湯富酬教授團隊合作完成了世界首例經MALBAC(multiple annealing and looping-based amplification cycles，是目前最先進的
Nature－Methods－：北大湯富酬團隊揭示單個細胞內高階染色質結構
調控基因組元件的高階三維(3D)組織為基因調控提供了拓撲基礎，但尚不清楚哺乳動物基因組中的多個調控元件如何在單個細胞內相互作用。 2023年8月28日，北京大學湯富酬團隊在Nature Methods （IF=48）在線發表題為“scNanoHi-C: a single-cell long-r
單細胞測序揭示了人類胚胎DNA甲基化動態
2017年12月19日，北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心、生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組和北京大學第三醫院喬杰研究組合作在國際知名學術期刊《自然遺傳學》上在線發表題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimpla
北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準
北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術
來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章，開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法，這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異，提高單細胞全轉錄組分析的準
中外牛人眼中的生物技術前沿
今年三月Nature Biotechnology就滿二十了。該雜志近日推出周年特刊對生物技術領域的發展進行了回顧和展望，還邀請相關領域的五十名杰出研究者，分享他們眼中最激動人心的前沿研究以及最受期待的技術。 秦鈞（Jun Qin）：蛋白質組學最激動人心的前沿是，從穿刺活檢樣本鑒定一組蛋白，在3