DNA搜索引擎MetaGraph研發成功
瑞士蘇黎世聯邦理工學院科學家在最新一期《自然》雜志上發表論文稱，他們開發出一款名為MetaGraph的DNA搜索引擎，能快速、高效地檢索公共生物學數據庫中的海量信息，為研究生命科學提供了強大的專業工具。MetaGraph索引及大量DNA、RNA和蛋白質序列檔案。圖片來源：《自然》網站MetaGraph的研發，源于科學界對日益龐大的基因測序數據“用不好、找不著”的現實困境。過去幾十年來，各類生物學數據庫規模呈爆炸式增長，然而原始測序數據往往碎片化、噪聲多、體量龐大，科學家難以直接從中高效提取有用信息。MetaGraph的核心突破在于采用數學中的“圖結構”，將相互重疊的DNA片段智能聯結。其原理類似于圖書索引中將含有相同關鍵詞的句子關聯起來，形成知識網絡。研究團隊整合了7個公共資助數據庫，構建出一個跨越病毒、細菌、真菌、植物、動物乃至人類的生命全譜系索引。該索引共涵蓋1880萬個獨特的DNA與RNA序列集，以及2100億個氨基酸序列......閱讀全文
DNA搜索引擎MetaGraph研發成功
瑞士蘇黎世聯邦理工學院科學家在最新一期《自然》雜志上發表論文稱，他們開發出一款名為MetaGraph的DNA搜索引擎，能快速、高效地檢索公共生物學數據庫中的海量信息，為研究生命科學提供了強大的專業工具。MetaGraph索引及大量DNA、RNA和蛋白質序列檔案。圖片來源：《自然》網站MetaGrap
新工具可輕松搜索世界已知10％的基因
一種功能類似于谷歌搜索的計算工具已經證明了它的前景——可以廉價且容易地搜索生物序列數據。開發該工具的瑞士團隊表示，在一項原理驗證研究中，他們利用該工具成功索引了10%世界已知DNA、RNA和蛋白質序列，同樣的方法也可以用于完成其余部分。日前，該進展在預印本平臺bioRxiv上公布。這款名為MetaG
新工具可輕松搜索世界已知10％的基因
一種功能類似于谷歌搜索的計算工具已經證明了它的前景——可以廉價且容易地搜索生物序列數據。開發該工具的瑞士團隊表示，在一項原理驗證研究中，他們利用該工具成功索引了10%世界已知DNA、RNA和蛋白質序列，同樣的方法也可以用于完成其余部分。 日前，該進展在預印本平臺bioRxiv上公布。這款名為M
谷歌向23對染色體進軍－DNA搜索引擎暗暗轟鳴
網易探索4月23日訊，網絡搜索巨頭谷歌日前啟動基因搜索研究和投資計劃，有朝一日，也許網絡的觸角會伸向我們每一個人的身體。 你體內的DNA現在也成了“世界信息”的一部分，而谷歌正開始著手制定關于這些信息的游戲規則。2007年，谷歌頂著巨大壓力向基因檢測公司“23andMe”投資了440萬美元。而這家
美國推出“材料計劃”網絡搜索引擎
據美國物理學家組織網近日報道，美國能源部勞倫斯伯克利國家實驗室和麻省理工學院聯合推出了一項名為“材料計劃”的最新網絡引擎，專門用于搜索查找各種材料的性質，能讓來自大學、國家實驗室和私人企業的科學家共享信息，以促進新材料和關鍵材料的研發。 “加速新材料的研發，能促進在清潔能源和公共消費產品領
振動篩與網絡搜索引擎優化
近期在振動篩行業有許多號稱專業優化網絡公司的出現，直接影響和考驗著搜索引擎的公平與合理性，不管你的振動篩站點是否，不管你的振動篩企業內容是否健全，不管你是否能提供給振動篩客戶zui佳的產品，也不管你的企業是否有一定實力，只要你愿意出資金，便有大量的網絡優化公司為你提供振動篩的排名服務。優化是網絡行業
綜合搜索引擎網站市場群雄逐鹿
根據中國互聯網數據中心統計表明，中國綜合搜索引擎格局正在發生深刻變化：搜索引擎市場第一陣營與第二陣營之間差距正在縮小，第二陣營兩大競爭對手谷歌和搜搜不相伯仲。雖然谷歌仍以微弱優勢領先，但騰訊搜搜以其較強大的用戶群為基礎，結合各種有效的網絡推廣方式，正在有力擴張用戶市場份額。?今年第一季度，百度以較為
人工智能大舉“入侵”科學搜索引擎
當前，互聯網搜索引擎中出現了越來越多的人工智能（AI）聊天機器人，如谷歌的Bard、微軟的Bing等。這似乎將要改變科學搜索引擎。 據《自然》報道，8月1日，荷蘭出版業巨頭愛思唯爾向其Scopus數據庫的部分用戶發布了一個基于ChatGPT的AI界面。當天，英國數字科學公司（Digital S
人工智能工具大舉“入侵”科學搜索引擎
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505983.shtm
全球微生物組大數據搜索引擎上線
日前，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心正式發布首個微生物組大數據搜索引擎——MSE（Microbiome Search Engine； http://mse.single-cell.cn），使得以整個微生物組為分析單元的智能搜索和大數據挖掘成為現實。 微生物組，又稱“菌群”。
類似Google的蛋白功能搜索引擎研究進展
細胞通過成千上萬控制其生長和分化的蛋白相互協作而發揮功能，關鍵蛋白功能失常常會導致疾病。目前已經有許多關于探索所有人類蛋白功能的大規模研究項目。最近，de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)研究所Benoit Coulombe博士率領的研究小組新發展了一套
加強互聯網銷售藥品監管－重點監測搜索引擎
國家食品藥品監管局、工業和信息化部、公安部、國家工商總局日前就進一步嚴厲打擊利用互聯網發布虛假藥品信息和非法銷售藥品聯合發出通知，明確從6個方面，加強對已審批的互聯網藥品信息服務和交易服務網站的日常監管。 通知指出，動態監測集中針對發布治療糖尿病、高血壓、腎病、風濕、痛風、性功能障礙、皮膚病等
百度、360搜索大戰升級－搜索引擎市場或變局
?? 8月中旬，周鴻祎宣布推出綜合搜索業務后，搜索引擎市場領頭羊百度的“太平”日子即將終結。 28日晚，百度低調反擊360，趁夜“圍堵”其搜索業務。昨天下午4點多，奇虎360發聲明稱要建設一個安全、干凈、有效競爭的互聯網搜索市場。百度有關負責人接
Enveda獲6800萬美元B輪融資，開發藥物發現搜索引擎
? ? 近日，Enveda Biosciences宣布完成6800萬美元的股權和債權融資。本輪融資由Dimension領投，多家新機構投資者的參與，包括FPV，Jazz Venture Partners，Level Ventures，Amino Collective，Allen & Co和Possi
類似－ChatGPT－的人工智能即將出現在主要科學搜索引擎中
人工智能驅動的會話式聊天機器人已經出現在互聯網搜索引擎中，例如谷歌的 Bard 和微軟的 Bing，看起來也將越來越多地改變科學文獻搜索方式。8 月 1 日，荷蘭出版巨頭 Elsevier 為其 Scopus 數據庫的部分用戶發布了由 ChatGPT 支持的 AI 界面，而英國公司 Digita
OpenAI推出人工智能搜索引擎，和多家新聞出版商合作
人工智能開發機構OpenAI終于進入搜索引擎市場，正在推出由AI驅動的搜索引擎SearchGPT的測試版，可實時訪問互聯網上的信息。該產品引用的信息來源將包括新聞集團、美聯社、《大西洋》月刊和Vox Media等商業合作伙伴的新聞。隨著OpenAI的快速發展，該公司的運營成本也在不斷增加。美國科技媒
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定3
2．利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下，末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端，如果作為底物的核苷酸經過修飾（如ddNTP），則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段，亦存在DNA的兩側均被標記問題，可通過上述同
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定2
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法（雙脫氧鏈終止法）和Maxam（1977）提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都同樣生成相互獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸，每組核苷酸都有共同的起點，卻隨機終止于一種（或多種）特定的殘基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，選用合適的DNA聚合酶進行測序反應也是保證測序質量的重要因素之一。常用于雙脫氧末端終止法測序的有幾種不同的酶： 1．大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger測序的酶。但通常會有兩個問題：①Klenow片段的持續合成能力較
DNA重組技術(DNA－Recombination)
一、DNA 的酶切與連接（1）酶切反應：同質粒DNA 的鑒定，只不過是質粒DNA 換為載體DNA 。若大量酶切，則成比例增加。（2）加2倍體積的預冷無水乙醇和1/10體積的3mol/l NaAc混勻，-20℃2h以上。（3）15000rpm離心15min，棄上清。（4）加入75%乙醇洗滌2次，離心棄
百度退位！百度已不是中國第一大桌面搜索引擎
長久以來，百度不只是一個名詞，它早已成為人們搜索內容時使用的動詞，可見其影響力之大。不過，根據5月22日StatCounter的數據顯示，百度已不是中國最大的桌面搜索引擎了。根據數據，到2023年4月，微軟必應的份額再次創出歷史新高，達到了37.4%，而百度的份額為26.32%。微軟必應、搜狗、Ya
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定2
（1）CaCl2處理以后的轉化: 當細菌處于0℃、二價陽離子（如Ca2+、Mg2+等）低滲溶液中時，細菌細胞膨脹成球形，處于感受態；此時轉化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羥基-鈣磷酸復合物粘附于細胞表面，重組DNA在42℃短時間熱沖擊后吸附在細胞表面，在豐富培養基中生長數小時后，球狀細胞恢復原
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定3
當多克隆位點有外源DNA片段插入時，破壞此酶的N端閱讀框架，產生無α互補功能的N端片段，因此在帶有外源DNA片段的細菌在含有IPTG/X-gal的培養基上呈白色，見圖7-11 。如果外源DNA插入片段相當短，不破壞β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的閱讀框，有時產生的重組體菌落不呈白色而是呈淺藍色。4
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體1
載體（vector）是攜帶靶DNA（目的DNA）片段進入宿主細胞進行擴增和表達的運載工具。常用的載體是通過改造天然的細菌質粒、噬菌體和病毒等構建而成。目前已構建成的載體主要有質粒載體、噬菌體載體、病毒載體和人工染色體等多種類型，亦可根據其用途不同分為克隆載體和表達載體二類。載體的構建和選擇應考慮以下
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體2
二、噬菌體載體作為細菌寄生物的噬菌體，大多數具有編碼多種蛋白質的基因，能利用宿主細胞的蛋白質合成體系，進行生長和增殖。構建的噬菌體載體，以λ噬菌體、M13和粘粒最為常用。㈠ λ噬菌體載體野生型λDNA是一種基因組為4.8 kb的線性雙鏈DNA，全部序列已知，共編碼50多個基因。其中約一半基因參與
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體3
在作為載體時，這些噬菌體有一個很大的優點，即克隆到M13mp載體的外源DNA片段（雙鏈），在子代噬菌體便成為了單鏈形式。故應用M13mp進行克隆，可方便地分離到大量含有外源DNA某一單鏈的DNA分子。這種單鏈DNA可在下列工作中作模板：①主要用作雙脫氧鏈終止法進行DNA序列測定的模板；②制備僅有一條
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定1
重組DNA是在體外用限制性內切酶，將不同來源的DNA分子進行特異地切割，獲得的目的基因或DNA片段與載體重新連接，從而組成一個新的DNA雜合分子。重組的DNA分子能夠通過一定的方式進入相應的宿主細胞，在宿主細胞中進行無性增殖，獲得大量的目的基因或DNA片段，此過程稱基因克隆。重組的DNA分子也能夠在
DNA編碼化合物庫技術的學習和追蹤“神器”——DELFinder
實際應用案例 近日，Scott E. Wolkenberg博士團隊利用藥明康德HitS事業部自主開發并運維的DELFinder搜索引擎和DELopen平臺，順利完成DEL相關領域論文的檢索工作，并成功在《ACS Medicinal Chemistry Letters》雜志上發表論文。 近年來
DNA合成（DNA－synthesis－）技術介紹
蛋白質概念提出：DNA多肽合成（DNA synthesis ）：按照預定核苷酸的順序，將脫氧核苷酸逐個進行人工連接合成DNA鏈的方法。目前多是采用固相合成法，即是在多聚體支持物上從3′端延伸核苷酸，可自動化操作。)目前，oligo DNA合成一般都采用固相亞磷酰胺三酯法合成DNA片段，此方法具有高效
數據標注優秀案例集之四十七－|－云藏搜索引擎藏文信息處理數據標注
云藏搜索引擎藏文信息處理數據標注 申報單位：海南藏族自治州藏文信息技術研究中心 推薦單位：青海省數據局 一、案例簡介 藏文信息處理面臨語言結構復雜、標注標準缺失、數字化資源不足等問題。本案例通過系統化數據標注技術，構建高質量藏文語料庫，賦能藏文信息化行業，推動藏文自然語言處理技術的進步和實用