科學家破解整合酶的三維結構
英國和美國研究人員在1月31日的《自然》雜志上報告說，他們合作進行的一項最新研究模擬出整合酶的三維結構。整合酶在包括艾滋病病毒等逆轉錄酶病毒中可以找到，并且充當了艾滋病病毒在人體內復制時的“幫兇”。這項重大突破有助于科學家解決困擾了艾滋病研究領域長達20年的一個難題，從而找到更好的治療艾滋病的方法。 當艾滋病病毒感染人體時，通常會利用整合酶當工具，將病毒的遺傳信息“復制粘貼”到其DNA中，并將病毒DNA與人體DNA整合。很多科學家都曾嘗試破解這種與病毒DNA綁定的整合酶的三維結構，結果都無功而返。新的抗逆轉錄酶病毒藥物很多是利用抑制整合酶的功能來達到治療艾滋病的目的，但科學家們并沒有確切了解這些藥物發揮作用的機制以及增進藥效的機理。 由于只有通過獲取質量較多的晶體才能確定整合酶的結構，在此次研究中，帝國理工學院和哈佛大學的研究人員聯手，從一種被稱為原型泡沫病毒(PFV)的逆轉錄病毒中“借”來了整合酶，并用其來制造......閱讀全文
基因組的三維結構
摘要： 闡明染色質復雜結構的技術有染色質構象捕獲(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技術4C、5C，這些提供了長距離的染色質相互作用，但不能擴展到整個染色質相互反應組。在2009年末，兩種新方法的迸發，有望繪出全基因組范圍的相互作用圖譜。
Science：解析出嗜熱棲熱菌V/AATP酶的三維結構
細胞依賴于稱為ATP合酶（ATP synthase）或ATP酶（ATPase）的蛋白復合物來滿足它們的能量需求。三磷酸腺苷（ATP）分子為維持生命的大部分過程提供能量。在一項新的研究中，奧地利科學技術研究所的結構生物學者Leonid Sazanov和博士后研究員Long Zhou如今解析出V/A
吉大解析金黃色葡萄球菌噬菌體裂解酶三維結構
日前，吉林大學韓文瑜課題組與中國科學院生物物理研究所劉志杰課題組合作，解析了首個金黃色葡萄球菌噬菌體裂解酶(LysGH15)的三維結構，并揭示了其裂解金黃色葡萄球菌的分子機制。 目前，金黃色葡萄球菌的耐藥性日益嚴重，尤其是“超級耐藥菌株”(MRSA)的出現，給臨床治療帶來了巨大的困難。噬菌體
Nature－Medicine：三維細胞培養助力腫瘤研究
惡性腫瘤已成為我國主要致死病因之一，而對腫瘤的早期診斷和有效治療已成為各國生命科學研究的重點。學術期刊Nature Medicine不久前刊登了文獻介紹使用三維細胞培養技術從胰腺癌癥病人組織中擴增和培養原代癌細胞類器官的成果。該項技術使得研究者有望直接使用病人的組織進行有針對性的研究和快速而經濟
Nature子刊：一種三維代謝模型
盧森堡系統生物醫學研究中心（LCSB）的研究人員開發出了第一個人體代謝過程三維計算機模擬模型。 這一研究成果公布在Nature Biotechnology雜志上。 研究人員將已有的4,000多種代謝產物的三維結構以及近13,000種蛋白質整合到現有的計算機模型中，他們還為模擬運行的模型增加了
Nature：我國科學家解析出人GLP1R的高清三維結構圖
在一項新的研究中，來自中國上海科技大學iHuman研究所和復旦大學藥學院的研究人員解析出人胰高血糖素樣肽-1受體（glucagon-like peptide-1 receptor, GLP-1R）的分子結構。相關研究結果于2017年5月17日在線發表在Nature期刊上，論文標題為“Human
德國破解新冠病毒主要蛋白酶三維結構－有助抑制劑研發
新冠疫情在全球蔓延，對于新冠病毒本身的研究也在不斷取得新的突破。德國就破解了新冠病毒主要蛋白酶的三維結構，有望用于新藥物的研發。 根據德國科研人員在美國《科學》雜志上發表的最新論文，Mpro是新冠病毒中的主要蛋白酶，在病毒復制過程中起著關鍵的作用。 借助高強度的X射線，科研人員解碼了Mpro
Nature－Communications：整合素可使T細胞不再產生免疫應答
??????? 近日研究發現，當整合素釋放它們的配體和樹突細胞內的肌動蛋白細胞骨架時，另一個細胞表面受體gm? -csf的活性就會增強，增強的信號誘導樹突狀細胞刺激淋巴結激活T細胞。 整合素是一種粘附分子并能夠在細胞表面進行表達。它們在細胞“整合”的外部與細胞內部細胞骨架中起著非常重要的作用。
新型整合酶抑制劑高通量篩選方法
隨著HIV-1病毒耐藥性的不斷升級，抗艾滋病藥物的研發遠遠滯后，抗HIV-1藥物新靶點的發現和創新藥物的研發已成為燃眉之急。HIV-1整合酶催化病毒cDNA與宿主細胞基因組的整合，是HIV病毒復制周期中必需的關鍵酶。人體內無整合酶功能類似物。因此，整合酶是抗艾滋病藥物研發的理想靶點。近年來，北京工業
重要癌癥靶標三維結構獲解析
上海科技大學iHuman研究所徐菲課題組與復旦大學、美國南加州大學和斯克瑞普斯研究所等單位合作，解析了重要癌癥靶標人源Smoothened受體的多結構域晶體結構，分辨率達到2.9埃（1埃=10-10米），相關成果日前在線發表于《自然—通訊》。 Smoothened受體是Hedgehog信號通路
Nature刷新對逆轉錄病毒的認識
逆轉錄病毒會將自己的遺傳學物質插入被感染細胞，通過這種方式利用細胞的蛋白生產機器，生產病毒蛋白并裝配出新的病毒顆粒。這些新的病毒顆粒隨后又去感染其他細胞。當前最受矚目的逆轉錄病毒無疑是能夠引起艾滋病的HIV。HIV病毒的傳染性很強，其病毒基因會整合到人類免疫細胞并最終將其殺死。 逆轉錄病毒把D
非核糖體肽合成酶三維結構有助深入認識抗生素合成
在一項新的研究中，來自加拿大麥吉爾大學的研究人員在理解在產生抗生素和其他治療性藥物中起著不可或缺作用的酶的功能方面取得了重要的進步。相關研究結果發表在2019年11月8日的Science期刊上，論文標題為“Structures of a dimodular nonribosomal peptid
饒子和、楊海濤團隊成功解析新冠病毒主蛋白酶三維結構
由上海科技大學饒子和/楊海濤團隊與合作者組成的“抗新冠病毒攻關聯盟”，率先在國際上成功解析新型冠狀病毒關鍵藥物靶點——主蛋白酶（Mpro）的高分辨率三維空間結構，并綜合利用3種不同的藥物發現策略，找到針對新冠病毒的潛在藥物。 北京時間4月9日下午5點，經《自然》雜志邀請投稿，上述團隊在該期刊上
血栓形成關鍵受體三維結構被揭示
中科院上海藥物所趙強研究組與美國國立衛生研究院等機構合作，揭示了血栓形成過程中關鍵受體——嘌呤能受體P2Y12R的三維結構。5月1日，兩篇獨立的研究論文同時發表于《自然》雜志。據悉，這是中國科研人員極其罕見地在頂級學術期刊上“背靠背”同期發表科研論文，第一作者為藥物所的張凱華和張進。 據介紹，
三維離子阱的結構特點及介紹
三維離子阱，由一對環形電極（ring electrod）和兩個呈雙曲面形的端蓋電極（end cap electrode）組成。在環形電極上加射頻電壓或再加直流電壓，上下兩個端蓋電極接地。逐漸增大射頻電壓的最高值，離子進入不穩定區，由端蓋極上的小孔排出。因此，當射頻電壓的最高值逐漸增高時，質荷比從小到
研究測定血栓形成關鍵因子三維結構
記者日前從中科院上海藥物所獲悉，該所科學家在嘌呤能受體P2Y1R結構生物學領域再次取得突破性進展，首次測定了該受體蛋白的高分辨率三維結構，并揭示了P2Y1R抑制劑分子的作用機理，為研究治療血栓性疾病新藥提供了重要依據，同時將開啟G蛋白偶聯受體（GPCR）藥物研發的新方向。相關成果以長文形式在線發
Nature子刊：測定了血栓素A2受體結合的高分辨率三維結構
前列腺素在人體內發揮極為重要的生物學功能，介導細胞增殖、分化和凋亡等重要的生理活動。 中國科學院上海藥物研究所在抗心血管疾病藥物靶點的結構和功能研究方面取得重要進展——首次測定了血栓素A2受體TP分別與兩種抑制劑結合的高分辨率三維結構，揭示了該受體與多種藥物分子的相互作用機制，為治療心血管疾病
Nature：中國科學家揭示SARSCoV2主要蛋白酶的結構
一種新的冠狀病毒(SARS-CoV-2)被鑒定為COVID-19病毒，它是引起2020年初COVID-19全球大流行的罪魁禍首。但是目前還沒有針對性的治療方法，且有效的治療選擇仍然非常有限。 為了快速發現用于臨床的先導化合物，來自上海科技大學的饒子和/楊海濤課題組與上海藥物所的蔣華良課題組及其
我國學者首次闡述糜蛋白酶環酯肽類化合物三維結構
華南植物園農業及資源植物研究中心科研人員從鼎湖山土壤來源的一株放線菌Streptomyces sp. SC0581代謝產物中，獲得了4個具有顯著糜蛋白酶選擇性抑制活性的環酯肽類化合物（Dinghupeptins A-D），首次運用量子化學DFT理論計算闡明了這些化合物的三維結構，并通過酶動力學分
A型流感病毒RNA聚合酶復合體的三維冷凍電鏡結構被揭示
1月22日，Molecular Cell 雜志在線發表了題目為Cryo-EM Structure of Influenza Virus RNA Polymerase Complex at 4.3 ? Resolution 的流感病毒RNA聚合酶復合體的結構和功能研究方面的研究成果。 流感病毒屬
折疊酶的結構
LIFs的結構由三部分組成N-末端跨膜疏水結構域，中間一段富含脯氨酸和丙氨酸的高度可變的中間鉸鏈區與C-末端催化結構域。LIFs通過N-末端的疏水跨膜結構域錨定在內膜上，使Q-末端的活性結構域游離于周質中。N-末端的疏水跨膜結構域對其折疊活性沒有影響，主要是負責將LIFs錨定在內膜上，防止其與脂肪酶
Cell：重磅！首次破解人cGAS的三維結構
人體是為生存而建造的。人體中的每一個細胞都受到一組免疫蛋白的嚴密保護，而且這些免疫蛋白裝備了幾乎萬無一失的雷達來檢測外來的或受損的DNA。 人細胞中的一個最為關鍵的哨兵是一種被稱作cGAS的“第一響應者”蛋白，它檢測外來的和發生癌變的DNA的存在，并啟動一種信號級聯反應，從而觸發身體防御。
Science：從結構上揭示INSTI藥物結合HIV整合體機制
在一項新的研究中，來自美國國家糖尿病與消化疾病研究所、美國國家癌癥研究所、沙克生物研究所和斯克里普斯研究所的研究人員發現了一類強大的HIV藥物如何結合HIV整合體（intasome）的一個關鍵部分。通過首次解析出這種整合體與不同藥物結合在一起時的三維結構，他們發現了是什么讓這類藥物如此有效。這項
復旦大學修發賢Nature：發現三維量子霍爾效應！
量子霍爾效應研究的重要性 量子霍爾效應是20世紀以來凝聚態物理領域最重要的科學發現之一，迄今已有四個諾貝爾獎與其直接相關。但一百多年來，科學家們對量子霍爾效應的研究仍停留于二維體系，從未涉足三維領域。 給電子“定規矩”三維量子霍爾效應真的存在嗎？ 農貿市場往往熱鬧非凡，熙熙攘攘的人群四處擁
Nature－Methods－|－深度學習：二維圖片到三維的變換
熒光顯微鏡在生命科學等學科中有重要作用。通過激發樣本的特異性熒光標記，熒光顯微鏡可以準確揭示生物內部特定的組織，結構和活動。 2019年11月4日，來自UCLA的Aydogan Ozcan教授科研團隊在Nature Methods上發表題為“Three-dimensional virtual
《Nature》肌肉研究里程碑：首個高清粗肌絲三維組織
心房顫動、心力衰竭和中風——肥厚性心肌病可導致許多嚴重的健康狀況，是35歲以下人群心臟性猝死的主要原因。心肌是人體的中樞引擎。當然，如果你知道一個壞了的引擎是如何制造和運作的，那么修理它就容易多了。在我們肌肉研究的開始，我們已經成功地可視化了基本肌肉構建塊的結構，以及它們如何使用電子冷凍顯微鏡相互作
Nature發布酶功能研究重要成果
盡管科學家們已對近6,900種生物的基因組進行了測序，然而到目前為止卻還只知道大約一半蛋白質編碼基因的功能。現在來自三個研究機構的15名科學家通過大規模跨學科研究合作，開始逐步解答這一謎題。他們確定了一個細菌蛋白質的功能以及它影響的一條生物化學通路，這一研究工作還將幫助鑒別成百上千其他蛋白質的功
人整合素αVβ3（ITG－αⅤβ3）酶聯免疫分析（ELISA）
人整合素αVβ3（ITG?αⅤβ3）酶聯免疫分析（ELISA）試劑盒使用說明書本試劑僅供研究使用???????目的：本試劑盒用于測定人血清，血漿及相關液體樣本中整合素αVβ3（ITG?αⅤβ3）的含量。實驗原理：本試劑盒應用雙抗體夾心法測定標本中人整合素αVβ3（ITG?αⅤβ3）水平。用純化的抗體
一種新型整合酶抑制劑高通量篩選方法
隨著HIV-1病毒耐藥性的不斷升級,抗艾滋病藥物的研發遠遠滯后,抗HIV-1藥物新靶點的發現和創新藥物的研發已成為燃眉之急。HIV-1整合酶催化病毒cDNA與宿主細胞基因組的整合,是HIV病毒復制周期中必需的關鍵酶。人體內無整合酶功能類似物。因此,整合酶是抗艾滋病藥物研發的理想靶點。 近年來,
位點特異性重組的整合酶和IHF的介紹
在att上都有特定的結合位點，體外實驗也證明這兩種蛋白質結合在attDNA的特定位點上。每一次重組過程需要20－40個整合酶分子及約70個IHF分子。故可能這兩種蛋白質不僅是作為酶（發揮催化作用），而且在每次重組中都要形成某種復合物結構。通過缺失實驗，證明attP至少要約250bp長，太短將使其