北大、加大等聯手探索斑馬魚全基因組突變新技術
來自北京大學生命科學學院、美國國立人類基因組研究所和加州大學生物系的研究人員，最近在利用逆轉錄病毒插入法引發斑馬魚全基因組范圍內基因突變的研究中取得重大進展。文章刊登于7月18日在線版《PNAS》。 研究人員采用其研制的一組技術，用假性逆轉錄病毒（pseudotyped retroviruses）感染斑馬魚胚胎，并且繪制了F1代斑馬魚基因組中前病毒整合（retroviral integrations）的遺傳位點。研究人員在F1斑馬魚中找到代表993個逆轉錄病毒整合的2045個序列。共599個整合位于現有的遺傳集合 (Zv6)中，233個整合定位于基因內。 通過培育25個基因中攜帶前病毒整合的斑馬魚，研究人員證實，在接近一半的基因“點擊率”中，mRNA轉錄水平下降了70％以上，整合出現在外顯子或者第一個內含子中時突變的可能性最大。根據這些數據，將近1/5的整合會出現逆轉錄病毒的突變。另外，當鼠類白血病病毒特異整合到基因的第一個......閱讀全文
北大、加大等聯手探索斑馬魚全基因組突變新技術
來自北京大學生命科學學院、美國國立人類基因組研究所和加州大學生物系的研究人員，最近在利用逆轉錄病毒插入法引發斑馬魚全基因組范圍內基因突變的研究中取得重大進展。文章刊登于7月18日在線版《PNAS》。 研究人員采用其研制的一組技術，用假性逆轉錄病毒（pseudotyped retroviruses）
除了小鼠，斑馬魚也被盯上了－|－PNAS
植有人類腫瘤細胞（紅色）的斑馬魚胚胎，這一模型有望幫助醫生快速篩選癌癥患者最佳的治療方案（圖片來源：Rita Fior團隊） 最新一期《PNAS》在線發表了一篇題為“Single-cell functional and chemosensitive profiling of combinato
斑馬魚
一、概述斑馬魚是生長在印度、巴基斯坦淡水河流中的一種硬骨魚（鯉魚），成年魚全身僅長4－5厘米，因全身橫向分布著一道一道褐色的斑馬線而得名。斑馬魚很容易在實驗室飼養，一般3個月就可以達到生殖成熟期，雌魚每次產卵200枚左右，一生可產卵數千枚，斑馬魚所產之卵經24小時即可胚胎發育成熟，仔魚期只有1個月。
Nature：系統解析斑馬魚參考基因組
斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點，近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。 近日，英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
平生醫療Micro－CT小動物成像在斑馬魚基因突變個體觀察...
平生醫療Micro CT小動物成像在斑馬魚基因突變個體觀察的應用前言?斑馬魚與哺乳動物基因組和蛋白調控機制有高度同源性，而且個體小、生殖周期短、繁殖能力強、易于飼養、體外受精、胚胎透明且發育迅速等諸多方面的優點，被廣泛應用于藥物篩選、毒性檢測和發育研究等科學領域。由于硬骨魚和人類在骨骼發育過程中的基
北大近年來首篇NatureMethods文章
Nature Methods雜志是Nature出版社旗下的著名期刊之一，也是方法學領域的權威刊物，主要刊載具有創新性的技術進展，在去年之前，大陸學者在此刊物上發表的技術文章僅有3篇。近期來自北京大學生科院，加州大學洛杉磯分校的研究人員在這一著名期刊上發表了題為“TALEN-mediated
斑馬魚出生就識數！
意大利科學家發現，斑馬魚幼魚在孵化后96小時里可以識別不同數量的黑條，研究者表示這一發現表明數字能力可能在新生斑馬魚中是與生俱來的。相關研究3月24日發表于《通訊—生物學》。 過去的研究表明，人類新生兒和新孵化的孔雀魚、小雞（孵化時腦已經高度發育的物種）具有數學能力。但在此之前，人們對新生時處
斑馬魚基礎研究
近期，我們收到了很多小伙伴提交的文獻獎勵申請，其中，有2篇成功吸引了小編的注意，這2篇文章的內容都是斑馬魚研究相關的。我們都知道，斑馬魚是一種常見的模式生物，但是市面上針對斑馬魚的抗體卻非常少，我們不僅有一百多種斑馬魚抗體，而且還可以根據客戶需求來進行定制生產。下面來看看這2篇文章吧。01標題：Sa
斑馬魚顯微CT實驗
斑馬魚作為傳統的脊椎動物模型已經廣泛應用于人類疾病和胚胎發育過程的研究，斑馬魚全基因已經完全清楚，與人類基因組有85%同源性，這意味著在斑馬魚身上進行的實驗，其結果很多都適用于人類。斑馬魚與其他實驗常用動物相比，具有較高的繁殖率和生長速率，并且其胚胎發育過程是在體外進行的，科研人員通過顯微鏡直接觀察
深受科學家的熱愛斑馬魚基因編輯技術介紹
斑馬魚又叫藍條魚，因為其體表有暗藍色和銀色的類似于斑馬一樣的條紋而命名。斑馬魚屬于鯉科魚類，同屬鯉科的還有我們十分熟悉的鯉魚、鯽魚等。斑馬魚的體型較小，成魚體長約4-6厘米，而且成魚常年產卵且產卵量大，可達300-1000粒，還是體外受精并發育，因此十分適合進行實驗室的大規模養殖與篩選。
斑馬魚基因編輯技術介紹
斑馬魚又叫藍條魚，因為其體表有暗藍色和銀色的類似于斑馬一樣的條紋而命名。斑馬魚屬于鯉科魚類，同屬鯉科的還有我們十分熟悉的鯉魚、鯽魚等。斑馬魚的體型較小，成魚體長約4-6厘米，而且成魚常年產卵且產卵量大，可達300-1000粒，還是體外受精并發育，因此十分適合進行實驗室的大規模養殖與篩選。斑馬魚這種原
深受科學家的熱愛斑馬魚基因編輯技術介紹
斑馬魚又叫藍條魚，因為其體表有暗藍色和銀色的類似于斑馬一樣的條紋而命名。斑馬魚屬于鯉科魚類，同屬鯉科的還有我們十分熟悉的鯉魚、鯽魚等。斑馬魚的體型較小，成魚體長約4-6厘米，而且成魚常年產卵且產卵量大，可達300-1000粒，還是體外受精并發育，因此十分適合進行實驗室的大規模養殖與篩選。
關于肝損傷修復及其分子調控機制
利用 CRISPR/Cas9 技術，針對靶基因序列設計 sgRNA， 指導 Cas9 蛋白在特定基因位點引起 DNA 雙鏈斷裂，在非同源性末端接合修復斷裂 DNA 的過程中，靶基因堿基突變或缺失被引入到斑馬魚基因組中，最終導致靶基因無法正常轉錄翻譯，達到基因敲除的目的。目前我們利用 CRISPR
斑馬魚的基因敲除定制（Cas9KO）法介紹
利用 CRISPR/Cas9 技術，針對靶基因序列設計 sgRNA， 指導 Cas9 蛋白在特定基因位點引起 DNA 雙鏈斷裂，在非同源性末端接合修復斷裂 DNA 的過程中，靶基因堿基突變或缺失被引入到斑馬魚基因組中，最終導致靶基因無法正常轉錄翻譯，達到基因敲除的目的。目前我們利用 CRISPR
斑馬魚的基因敲除定制（Cas9KO）法介紹
利用 CRISPR/Cas9 技術，針對靶基因序列設計 sgRNA，?指導 Cas9 蛋白在特定基因位點引起 DNA 雙鏈斷裂，在非同源性末端接合修復斷裂 DNA 的過程中，靶基因堿基突變或缺失被引入到斑馬魚基因組中，最終導致靶基因無法正常轉錄翻譯，達到基因敲除的目的。目前我們利用 CRIS
基因組學突破性成果：斑馬魚序列解析
人類發育，生理功能及疾病發生的過程涉及到成千上萬的基因和其變異體，但是大部分的基因和其變異體的功能依然是未知的。過去的20年里，斑馬魚逐漸成為研究人類基因功能的重要模式動物。在《自然》雜志網站發表的兩篇文章里1,2，報道了斑馬魚參考基因組序列和完成超過10,000個蛋白編碼基因的斷裂性突變體的鑒
斑馬魚胚胎DNA的制備
材料和試劑1.????????蛋白酶K（羅氏03115836001）2.??????? 1M的Tris，pH值8.33.??????? 氯化鉀4.??????? 吐溫20（10％，EMD4 biosciences，655207）5.??????? NP40（10％，Merck，492018）設備1.
斑馬魚胚胎細胞的培養
成纖維細胞飼養層 原代培養 細胞系 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化
轉基因斑馬魚的構建
實驗概要本實驗對斑馬魚導入含 EGFP的質粒，觀察其在動物體內的表達情況，在斑馬魚體內，綠色熒光蛋白從原腸胚到出苗期均能在熒光顯微鏡下觀察到綠色熒光。主要試劑EGFP、綠色熒光蛋白基因、pEGFP-N2載體、E.coli主要設備試管、試管架、可調式微量加樣器、電泳儀、電泳槽、染色缸、42℃恒溫水浴箱
水生所發布高質量AB品系斑馬魚參考基因組
斑馬魚是生命科學、健康科學和環境科學等研究領域的重要模式生物之一。常見的兩種實驗室斑馬魚品系分別是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑馬魚被國內外很多實驗室作為研究對象。然而，卻缺乏一個高質量的AB品系斑馬魚參考基因組。 由于不同品系斑馬魚來源不同，各品系之間存在著大量基因序列上的
水生生物所等公布斑馬魚1號染色體全基因敲除研究成果
斑馬魚是開展生命科學、健康科學、環境科學等研究的重要模式動物。在斑馬魚研究歷史上，歐美學者發起過幾次大規模的隨機誘變突變體庫，開展基于“從表型到基因型”的正向遺傳學篩選，奠定了斑馬魚作為國際公認模式動物的重要基礎。 隨著斑馬魚全基因組測序的完成和CRISPR/Cas9等基因組編輯技術的成熟，規
水生所關于斑馬魚基因捕獲與插入突變的研究取得突破
脊椎動物后基因組時代的主要任務是解讀基因的功能，而基因捕獲和插入突變是揭示基因功能的重要手段。斑馬魚具有易于飼養、繁育周期短、產卵量大、體外受精與發育等優點，已成為發育和遺傳學研究的理想模式動物，但尚缺乏胚胎干細胞和基于胚胎干細胞的基因敲除技術。轉座子介導的基因捕獲和突變研究為大規模篩選斑馬魚突
Cell：新研究開啟自閉癥基因治療時代
自閉癥（別稱“雨人”）是受基因和環境因素影響，由大腦神經系統失調導致的發育障礙，其病征表現為社交能力、溝通能力、興趣和行為模式出現異常。從第一例自閉癥患者——美國男孩唐納德于1943年被確診開始，人們就開始了針對自閉癥的研究。然而，不管治療方式怎樣“更新換代”，自閉癥的病因卻一直是科學界無法達成
首個CRISPR/Cas9靶序列數據庫
近期，來自美國國立衛生研究院和瑞典烏普薩拉大學的研究人員，在國際著名學術期刊《Nucleic Acids Research》上發表的一項研究中，首次提出了一個已在斑馬魚中經過實驗驗證的CRISPR/Cas9靶序列數據庫。 CRISPR及CRISPR相關蛋白（Cas9），是在古細菌和細菌中發現的
基因組學研究成果讓斑馬魚研究“快馬加鞭”
基因組學研究成果讓斑馬魚研究快馬加鞭（Genomics: Zebrafish earns its stripes）作者：謝訓衛人類發育，生理功能及疾病發生的過程涉及到成千上萬的基因和其變異體，但是大部分的基因和其變異體的功能依然是未知的。過去的20年里，斑馬魚逐漸成為研究人類基因功能的重要模式動物。
斑馬魚人類疾病模型的構建
斑馬魚是唯一的經過大規模遺傳篩選的脊椎動物物種。許多斑馬魚的哺乳動物同源基因已經被克隆，并且發現有相似的功能，證實了斑馬魚作為人類疾病模型的可行性。通過Tol2轉座子技術、基因突變（插入誘變、ENU化學誘變）、基因敲除（TALEN,CRISPER）等技術，構建在特點靶點標記熒光蛋白的轉基因品系及
斑馬魚色素細胞如何形成條帶
一項研究發現，斑馬魚的特征條帶反映了這種動物的皮膚上的色素細胞的運動和它們之間的相互作用。盡管科研人員長久以來就注意到了數學模型可以準確地重現動物界的許多特征條帶和斑點，動物圖案背后的生物過程在很大程度上尚未得到解釋。為了更好地理解這些過程，Hiroaki Yamanaka 和Shigeru
Nat.－Comm.：CRISPR基因編輯會導致可遺傳的基因組結構突變
CRISPR-Cas9是對微生物、動植物，以及人類基因組進行修飾的強有力工具。在醫療保健領域，CRISPR-Cas9基因編輯為治愈遺傳病、癌癥，乃至心臟病等重大疾病帶來了前所未有的希望。但這一切的前提是DNA被正確的修飾，而沒有產生意外的變化。 在進行CRISPR基因編輯時，脫靶性是一個重點關
利用斑馬魚模型首次揭示干擾素λ受體突變導致臨床遺...
利用斑馬魚模型首次揭示干擾素λ受體突變導致臨床遺傳性耳聾2月16日（正月初一），國際醫學遺傳學期刊?Journal of Medical Genetics?在線發表了解放軍總醫院的科研成果“Mutation of IFNLR1, an interferon lambda receptor 1,
北京大學Cell－Res基因編輯研究新成果
來自北京大學的研究人員報告稱，他們利用一種RNA導向的Cas9核酸酶在哺乳動物細胞和斑馬魚胚胎中有效實現了位點特異性基因編輯。相關論文“Genome editing with RNA-guided Cas9 nuclease in Zebrafish embryos”發表在3月26日的《細胞