9月18日《自然》雜志精選

　　麗魚科魚基因組適應性輻射的標志

　　在非洲大裂谷的湖泊和河流中發現的2000種左右的麗魚科魚，是適應性輻射的經典例子。這一大規模國際合作項目，對5個截然不同世系的非洲麗魚科魚的基因組和轉錄組進行了測序和分析。所獲數據顯示，與其他魚種相比，它們的基因復制過多。存在大量非編碼要素分化、加速的編碼序列演變、直系同源基因對中與可轉座要素插入相關的表達分化以及由新穎miRNA進行的調控。對來自6個密切相關的維多利亞湖魚種的60個個體所做的測序數據，指向麗魚科魚與對編碼變體和調控變體的全基因組分化選擇相關的迅速物種形成，同時也說明古代純化選擇放松的時期使得既有變異能夠累積，后者在促進分化中可能起重要作用。

　　結腸直腸腫瘤的蛋白質組 / 基因組研究

　　來自“臨床蛋白質組學腫瘤分析聯合體”的一個研究小組，現在對以前被“癌癥基因圖譜”項目表征的95個結腸和直腸腫瘤的蛋白質組進行了分析。蛋白質組數據與原始基因組數據的整合顯示，蛋白豐度無法從DNA或RNA水平的測定結果得到可靠預測，mRNA水平和蛋白水平的關聯程度也不大。蛋白質組研究識別出5個結腸直腸癌亞型，它們反映了已知的生物學特點，但也捕捉到了在轉錄組層面上并不明顯的差別。這種類型的整合“蛋白基因組分析”，在癌癥生物學中可以為解釋基因組異常提供功能背景。

　　人類“后期促進復合物”的結構

　　“后期促進復合物/細胞周期體”（APC/C）是一種大型E3連接酶，介導細胞周期調控蛋白的依賴于泛素的蛋白水解，以在復制和細胞分裂過程中控制各種事件。在這項研究中，David Barford及同事利用低溫電子顯微鏡方法，以7.4的分辨率確定了人類APC/C在與其輔活化因子CDH1和基質HSL1所形成的復合物中的二次結構架構。該結構信息使研究人員能夠對APC/C全部20個亞單元的位置和架構予以確定，同時也可幫助認識CDH1是怎樣刺激APC/C的泛素化活性的。

　　超小星系擁有超大質量黑洞

　　天體M60-UCD1 是目前已知最亮的“超小型矮星系”（UCD），也是質量最大的UCD之一（大約為2億個太陽質量）。Anil Seth等人利用自適應光學光譜對M60-UCD1的動力學問題進行了研究。他們在其中心探測到一個超大質量黑洞，大小為2100萬個太陽質量。M60-UCD1因而是擁有一個超大質量黑洞的已知質量最低的系統。作者提出，它可能曾經處在另一個更大星系的中心，后者之后被一個質量巨大的相鄰星系通過潮汐作用分裂了。他們的分析還表明，M60-UCD1的恒星質量與其亮度一致。

　　撒哈拉沙漠比人們所想老得多

　　大多數證據證明，現代撒哈拉沙漠最初是在距今300萬到200萬年前形成的，這個時間與北半球大規模冰川化的開始時間相一致。這項研究表明，撒哈拉沙漠的形成時間要早得多。Zhongshi Zhang等人發現，特提斯海（現代地中海、黑海和里海的前身）的萎縮減弱了非洲季風的向北延伸，導致撒哈拉沙漠在距今大約700萬年前形成。對之前判斷如此巨大的修正，可能會導致地質學、演化生物學和氣候學等不同領域對撒哈拉進行新的研究。

　　黑猩猩天生有攻擊性

　　對我們現存親緣關系最近的動物黑猩猩和倭黑猩猩所作的研究，在試圖了解人類本身攻擊行為之演化的工作中一直很有影響。然而近年來，這些研究的可靠性受到“人類影響假說”支持者的質疑，后者認為，黑猩猩暴力的出現主要是人類活動的結果。現在，對有關非洲各地的黑猩猩和倭黑猩猩的研究工作所作的一項元分析顯示，黑猩猩之間的攻擊，是為獲得資源或交配對象而采取的適應性策略的正常的和預期的產物，與人類的存在或不存在沒有關系。