PNAS：研究人員開發癌癥基因表達分析新技術

　　密歇根大學綜合癌癥中心的研究人員開發了一項新技術，可更好地了解癌細胞與正常細胞中RNA有可能存在差異的原因，并將推動更深入地了解腫瘤全基因組測序檢測。研究人員將這一成果發布在《美國科學院院刊》(PNAS)雜志上。

　　當研究人員測序癌細胞的RNA時，他們可以將之與正常細胞進行比較，看看哪里存在更多的RNA。這有助于他們找到有可能引發癌癥的基因和蛋白質。

　　然而除確定一些已知的誘發因子之外，它還有什么意義呢?存在更多的RNA是因為它合成過快還是因為它的降解太慢所致?生物平衡的哪部分發生了背離?

　　經過十多年的研究工作，密歇根大學綜合癌癥中心的研究人員開發了一種新技術來幫助解答這些問題。

　　這一技術涉及到一種叫做溴尿核苷(bromouridine)的化合物，可用它來標記新生RNA。在利用溴尿核苷標記30分鐘后，研究人員分離出了RNA，然后觀測新生RNA生成位點。他們將這一過程稱作Bru-Seq。

　　另一方面，研究人員可以用帶有化學尿苷的清洗劑在不同的時間追蹤溴尿核苷標記 ，他們將之稱為BruChase-Seq，是因為尿苷可以除去新生RNA。這樣他們就能夠在隨后的1小時，2小時或6小時時間里觀察RNA的老化。換句話說，就是看看RNA是否如猜想中那樣發生降解?

　　“我們可以看到所有合成RNA，以及穩定RNA對比降解RNA的整體模式。我們可以根據合成和穩定性將之分類，看看是否存在相比正常細胞在癌細胞中更為穩定，或是在癌細胞中降解時間更長的特殊的RNA，”研究作者、密歇根大學醫學院放射腫瘤學副教授Mats Ljungman博士說。

　　“利用我們的技術，我們將基因表達圖像的深度增加了10多倍，”他補充說。

　　Ljungman是癌癥中心新轉化腫瘤學項目的成員。這一項目匯集了整個密歇根大學的癌癥研究人員，旨在加速將基礎科學轉化為臨床實驗，為患者提供新治療機會。

　　該癌癥中心當前正利用基因測序技術，基于晚期癌癥患者的腫瘤組成，幫助向他們提供潛在臨床實驗機會。

　　除了幫助癌癥測序，Ljungman還看到這項新技術在幫助鑒別糖尿病、炎癥等疾病方面的潛力。在新論文中，研究人員還描述了他們是如何利用這項技術來了解細胞中的一種炎癥反應的。研究人員還利用這一技術檢測了血液樣本。

　　隨著更多的研究展開，Ljungman設想有一天有可能能夠向就診患者提供這種測試，使之成為一種檢測RNA改變的方法。

　　“如果一次測試與另一次測試之間發生了顯著的變化，它有可能是疾病的一個早期預警信號。這項技術將會具有最廣泛的應用，” Ljungman說。