上海藥物所靶標發現技術取得突破

中科院上海藥物所蔣華良研究員與大連理工大學力學系王希誠教授合作，針對尋找藥物作用新靶標的需求，帶領博士后李洪林和高振霆等，發展了以活性小分子為探針、搜尋潛在結合蛋白質的“反向分子對接”方法，相關結果發表在Nucl. Acids Res. (2006, 34, W219-224)，并建立了相應的公共網絡服務器(http://www.dddc.ac.cn/tarfisdock)。目前已有來自50多個國家480多個用戶使用該服務器，反饋信息統計，用戶已經用該方法發現的10多個候選靶標被實驗證實。蔣華良與沈旭和岳建民等合作，用該方法發現了一個抗幽門螺旋桿菌天然產物的作用靶標－PDF蛋白，并測定了天然產物與PDF蛋白復合物的晶體結構，其結果發表在Protein Sci. (2006, 2071-2081)上。

最近他們又進一步發展了潛在藥物靶標庫(PDTD)，包含僅1000個重要靶標的信息和三維結構，為用反向對接方法尋找化合物的藥物作用靶標提供了技術支撐。結果發表了BMC Bioinformatics (2008, 9:104)后，連續4個月被BioMed Central選為高閱讀率文章(Highly accessed article)，發表僅4個月來的總閱讀次數已達1953次。PDTD已經建立了網絡服務器(http://www.dddc.ac.cn/pdtd/)，得到了廣泛的應用，用戶數也已經超過400。