中醫科學院中藥所等完成菊花基因組測序

　　近日，中國中醫科學院中藥研究所和安利植物研發中心宣布，利用納米孔測序技術突破復雜基因組測序，該團隊在世界首次完成了菊屬植物菊花的全基因組測序，并完成了重要的藥用菊花品種——杭白菊的全長轉錄組遺傳信息發掘。相關研究成果和基因組數據已在中國中醫科學院中藥研究所官網及安利植物研發中心學術研究網站公布，并向全世界研究菊花的學術團隊和非營利組織免費開放。

　　菊屬植物染色體結構復雜，包含從2n=18到8n=72之間的各種染色體組結構。生產上作為菊花茶使用的菊花（以著名的杭白菊為例）是一個復雜的多倍體物種，由多套二倍體亞基組成。菊屬是一個非常大的植物分類單位，包括菊組和苞葉組兩大分支。面對菊花復雜的染色體遺傳結構以及豐富的種質資源多樣性，進行菊花基因組測序對于揭示菊屬物種的起源進化及物種多樣性具有重要意義。

　　聯合團隊利用納米孔測序結合二代高通量測序技術，對分布于江蘇南京的野菊花品種進行全基因測序、組裝、注釋及相關分析，共組裝出了約3Gb基因組總長，鑒定出了101745個編碼蛋白基因。通過比較研究發現，整個基因組中存在大量的重復序列，這可能是整個菊屬植物基因組較為復雜的原因。同時研究人員對多倍體菊花品種杭白菊進行了全長轉錄組比較分析，闡明野菊花和杭白菊直接存在極大的遺傳上的親緣關系。