啟動子與轉錄因子／基因表達調控蛋白

目的基因的表達調控

生命活動豐富多彩、千變萬化。但是萬變不離其宗，不管如何變化都圍繞著中心法則展開。核酸作為遺傳物質指導蛋白質的表達，表達產生的一些特殊蛋白（如轉錄因子、調控蛋白）反過來又對DNA指導合成蛋白質的過程進行調控。對基因表達調控的研究一直是生物學研究熱點，涉及到生命活動的各個過程，也是各類信號通路研究無法繞過的部分。

當面對某個基因表達調控研究時，第一個想到的研究對象是什么？沒錯，就是基因的啟動子。

通過啟動子區域對基因表達進行調控是最直接有效的手段，所以也是研究基因表達調控的重點。現在的基因數據庫信息豐富，拿到基因及其啟動子序列非常簡單。那么問題又來了，拿到啟動子序列以后，下一步怎么找相關的調控蛋白/轉錄因子呢？

生物信息學方法預測？你會得到很多可能的目標調控蛋白/轉錄因子，還要做實驗一個一個驗證。凝膠遷移（EMSA），染色質免疫共沉淀（ChIP）？只能針對已知能與啟動子結合的調控蛋白/轉錄因子，而且還需要相應探針/抗體，對于大量篩選無能為力。

美國Signosis的轉錄因子(結合啟動子)微孔板芯片檢測試劑可以方便、高效地解決這一問題。該方法專門用于篩查與特定DNA序列（通常是含有轉錄因子結合位點的啟動子序列）相互作用的調控蛋白/轉錄因子，獲得目的基因的啟動子序列后，使用該方法可以篩查48/96種常見的調控蛋白/轉錄因子與啟動子序列結合情況。

該方法利用轉錄因子與特定DNA序列結合的特點，針對每一種轉錄因子設計相應的生物素標記探針；當混合探針與核蛋白樣本共同孵育時，探針與相應的轉錄因子結合形成轉錄因子/探針復合物；除去游離的探針，收集轉錄因子/探針復合物；分離復合物中的DNA探針，探針的量與轉錄因子含量呈正相關。

在探針混合物中同時加入啟動子片段，如果DNA序列中含有轉錄因子結合位點，就會與生物素標記的探針競爭性結合轉錄因子，轉錄因子與相應探針形成的復合物減少。通過比較有無目的基因啟動子片段中轉錄因子探針檢測差異，可以分析出與無目的基因啟動子片段相互作用的轉錄因子種類。

這種方法可以簡單、快速地在48/96種常見轉錄因子篩選出與目的啟動子片段相互作用的調控蛋白/轉錄因子，從而進一步探索目的基因的表達調控。待篩選的調控蛋白/轉錄因子都是在生命活動中起重要通的調控蛋白/轉錄因子，大大方便了后續的基因表調控、信號通路及其它方面的研究。