10月13日,內分泌領域權威期刊Molecular Endocrinology雜志在線發表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所張永蓮研究組取得的最新研究成果:雄激素受體在小鼠附睪基因組結合位點的鑒定。
附睪結構和功能的維持以及基因表達均高度依賴于雄激素,雄激素的作用是由雄激素受體(AR)結合于雄激素應答元件完成的。附睪是體內雄激素受體表達量最高的幾個器官之一。通過cDNA芯片研究已經鑒定到很多附睪表達的基因受雄激素調控,但目前為止,AR在附睪內的直接靶基因仍然所知甚少。
博士研究生胡雙綱等人在張永蓮院士和劉強副研究員指導下,利用ChIP-seq的方法檢測了小鼠頭部附睪(AR高表達)中的基因組水平的AR結合位點。該方法總共鑒定了19377個AR結合位點,其中絕大部分位于基因間區域和內含子區域,只有7%的結合位點位于轉錄起始位點上游5kb的區域內。這些AR結合位點共關聯了8190個靶基因,參與了廣泛的生理過程。Motif分析顯示,多達94%的AR結合位點含有保守的雄激素應答元件,一些潛在的協同因子結合的motifs也在雄激素應答元件附近得到了顯著富集,其中包括了之前已經報道過的NF1位點和新發現的AP-2位點,暗示了NF1,AP-2和AR之間的協同調控。令人驚訝的是,這些結合位點在物種間保守性不高。該研究也在單基因水平闡明了雄激素受體對某些附睪基因表達調控的新機制。
本工作首次揭示了雄激素受體在生理條件下的基因組結合位點的圖譜,使我們對AR在生理狀態下在頭部附睪內的調控網絡有了一個更深刻的認識。同時,該研究也是對之前在前列腺癌細胞系和原代肌細胞等非生理條件下AR結合位點研究數據的一個有力補充和擴展。
該研究工作得到國家科技部、國家自然科學基金委,中國科學院和美國NIH的經費資助。
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