轉座因子驅動癌基因在人類癌癥中廣泛表達

　　近日，華盛頓大學醫學院等科研人員在Nature Genetics上發表了題為“Transposable elements drive widespread expression of oncogenes in human cancers”的文章，發現轉座因子驅動癌基因在人類癌癥中的廣泛表達。

　　轉座因子是一種數量豐富的調控序列遺傳資源。在癌癥中，轉座因子中的隱蔽調節單元可以通過表觀遺傳被重新激活從而影響腫瘤發生，這一過程稱為onco-exaptation。但是，轉座因子onco-exaptation過程的發生及其影響在不同癌癥類型之間的區別仍不清楚。在本研究中，科研人員對15種癌癥類型的7769個腫瘤和625個正常數據集進行了分析，確定了129個轉座因子中的啟動子激活事件，涉及3864個腫瘤的106個致癌基因。此外，科研人員還對AluJb-LIN28B候選基因進行了研究。Alu是人類基因組中大量存在的轉座因子，AluJb是Alu序列的亞科，當Alu插入到基因組中時，產生替代的啟動子來激活致癌基因LIN28B。在癌細胞中敲除AluJb可以抑制癌基因的表達，而動態DNA甲基化調節了啟動子的活性，說明了轉座因子對癌基因的激活的必要性和充分性。這一研究揭示了多種癌癥類型中存在轉座因子onco-exaptation過程，并說明這一過程與癌基因激活以及最終導致腫瘤發生的復雜機制有關。