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  • RNA干涉實驗

    實驗方法原理 當確定了靶基因上的 siRNA 分子作用位點以后,根據靶位點的序列可以很方便地推導得到相應的 siRNA 分子的正義與反義 RNA 鏈序列。它們包含 19 bp 的互補雙鏈區和兩側的不配對區(每側為 2 個 U 成 2 個 T ),在合成時用 T 替代 U 可以降低成本并可以提高 siRNA 分子的穩定性,利用 DNA/RNA 合成儀首先分別合成長為 21 nt 的 siRNA 分子的正義鏈和反義鏈,然后在體外將它們退火形成雙鏈 siRNA 分子。實驗材料 RNA 單鏈分子試劑、試劑盒 退火緩沖液核酸轉染試劑DEPC處理水儀器、耗材 NuSieve GTG 瓊脂糖凝膠實驗步驟 一、材料與設備1. 化學合成的正義與反義 RNA 單鏈分子。2. 2X 退火緩沖液(200 nmol/L KAc,4 mmol/L MgAc2,60 mmoI/L Hepes-KOH pH 7.4)。3. NuSieve GT......閱讀全文

    RNA干涉實驗

    RNA 干涉(RNA1) 是指在真核細胞中引入雙鏈 RNA ( doubt-stranded RNA,dsRNA ) 分子從而導致具有序列同源性的基因產生特異件基內沉默(gene silencing ) 的現象。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理當確定了靶基因上的 siRN

    RNA干涉實驗

    化學合成siRNA分子實驗 體外轉錄合成siRNA分子實驗 采用RNA聚合酶Ⅲ啟動子表達siRNA分子 采用RNaseⅢ制備siRNA分子實驗 ? ? ? ? ? ? 實驗方法

    RNA干涉實驗

    實驗方法原理 當確定了靶基因上的 siRNA 分子作用位點以后,根據靶位點的序列可以很方便地推導得到相應的 siRNA 分子的正義與反義 RNA 鏈序列。它們包含 19 bp 的互補雙鏈區和兩側的不配對區(每側為 2 個 U 成 2 個 T ),在合成時用 T 替代 U 可以降低成本并可以提

    RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)

    早期的 RNAi 技術可用在研究與胚胎發育相關基因的功能上,但是由于細胞分裂造成 dsRNA 的稀釋,使得這種方法在研究成體的基因功能時有一定的局限性。為彌補早期 RNAi 技術的不足,Tavernarakis 等將 RNAi 技術做了一些改進及更動,將目的基因之標的序列以反向重復的方式,由

    RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)

    基因沉默(gene silencing)是生物體內特定基因由于種種原因不表達的遺傳現象。一方面,基因沉默是生物遺傳操作創造新的遺傳修飾生物(genetically modified organisms)的障礙,另一方面,它又是植物抵抗外來核酸入侵(如病毒)的一種反應,為植物抗病毒的遺傳育

    RNA干涉實驗——采用RNaseⅢ制備siRNA分子實驗

    實驗方法原理首先在體外以長為 200~1000 bp 的 cDNA 為模板轉錄合成正義與反義的單鏈 RNA 分子,然后通過退火形成長的 dsRNA 分子,再用Diccr 核酸酶進行切割得到 siRNA 分子的混合物,通過純化去除沒有被切割的雙鏈 RNA 分子和 DNA 模板以后,siRNA 分子就可

    RNA干涉實驗——體外轉錄合成siRNA分子實驗

    實驗方法原理采用噬菌體 RNA 聚合酶(T7、T3 或 SP6 RNA 聚合酶)可以很方便地在體外合成 siRNA 分子的正義與反義 RNA 鏈,然后再通過退火形成雙鏈的 siRNA 分子。體外轉錄合成 siRNA 分子與化學合成雙鏈 RNA 分子相比,其成本相對要低得多,而且有研究報道前者對靶基因

    RNA干涉實驗——采用RNA聚合酶Ⅲ啟動子表達siRNA分子

    實驗方法原理因為哺乳動物細胞不具備低等真核生物細胞所具有的擴增 RNAi 信號的機制,因此人工合成或體外轉錄的 siRNA 分子在細胞內的作用是瞬時性的,不適合用于進行靶基因的表達受到抑制后細胞表型的長期變化觀察,也不適于進行文庫的篩選。此外,體外制備 siRNA 分子的成本比較高,而且 siRNA

    Nature子刊:增強RNA干涉的效力

      人們可以通過納米顆粒將短鏈RNA運輸到目標細胞,關閉功能發生異常的基因,從而治療癌癥和其他疾病。不過迄今為止,科學家們還不完全了解,納米顆粒進入細胞后發生的情況。   現在,麻省理工MIT的一項新研究展現了這些納米顆粒的命運,這一發現能幫助人們大大提高siRNA的運輸效率。文章于六月二十三日發

    RNA干涉殺蟲劑需要特別的安全測試

      用于開發殺蟲劑和抗蟲害作物的一種新技術可能對有益物種產生影響,而當前的毒性測試可能測不出這種影響。   發表在8月號的《生物科學》(BioScience)雜志的一篇論壇文章說,標準的毒性測試不足以評估有潛力制造殺蟲劑和基因修飾農作物的一種新技術的安全性。該文章的作者、美國農業部農業研究局的Jo

    羅氏制藥公司宣布退出RNA干涉研究領域

    新藥研發陷入困境羅氏退出RNA干涉研究領域  羅氏公司總部位于瑞士巴塞爾,是全球最大的醫藥公司之一。據最新出版的《科學》雜志報道,11月下旬,羅氏宣布退出RNA干涉(RNAi)研究領域,這一決定是該公司計劃裁減6%的人力即4800人的計劃的一部分。  RNA干涉是一種分子生物學上由雙

    純化RNA實驗

    從培養的細胞中純化總RNA 從組織中純化總RNA ? ? ? ? ? ? 實驗材料 細胞

    RNA分離與分析實驗_分離RNA

    實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60

    水稻金屬耐受蛋白及編碼基因、RNA干涉片段獲發明ZL

      6月17日,由中科院華南植物園張美博士等科研人員完成的“水稻金屬耐受蛋白OsMPT1及其編碼基因和其RNA干涉片段”獲得國家發明ZL授權(ZL號:ZL 201110249200.7)。   水稻是世界上最重要的糧食作物之一,是我國第一大糧食作物。工業“三廢”的排放造成巨大的環境污染,特別是

    干涉實驗條紋間距公式的推導方法

    因為等厚干涉現象的兩任意相鄰條紋之間的厚度差等于λ/2,即薄膜層介質中光的波長的一半,而條紋間距△X*sinΘ=λ/2因為角度小的時候可以認為sinΘ=Θ,所以推出:△X=λ/2Θ?

    RNA干擾回復實驗

    RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce

    RNA干擾主體實驗

    siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準

    病毒RNA提取實驗

    實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料 TMV病毒液試劑、試劑盒 TE-飽和酚:氯仿氯仿NaAc乙醇TE緩沖液雙菌水儀器、耗材 冷凍臺式離心機低溫真空干燥儀電泳儀電泳槽實驗步驟 一、實驗

    動物RNA提取實驗

    實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA 純化系統)可在1小時內從組織、培養細胞和白細胞中提取純化完整總RNA,方法簡單、快速。該系統以膜為基礎,根據組織類型的不同,每次最多可純化60 mg 組織。系統包含DNase 處理步驟,直接在小離

    總RNA提取實驗

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 一些公司推出的總RNA 提取試劑盒,可以用來制備高質量的可用于建庫的RNA 。該總RNA 純化系統采用兩種著名的RNA 酶抑制劑,異硫氰酸弧(GTC)和β-巰基乙醇,加上整個操作都在冰浴下進行,這樣就能顯著降低RNA 的

    動物RNA提取實驗

    SV總RNA試劑盒提取法 Trizol試劑提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA

    病毒RNA提取實驗

    TE-飽和酚/氯仿提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲

    RNA實驗方法

    Solublization of RNA in Formamidecontributed by James McCaughern-Carucci, Yale UniversityResuspending RNA in Formamide (as reported by Chomczynski et

    病毒RNA提取實驗

    病毒RNA提取可以:(1)用于RNA病毒復制機制研究;(2)用于反向遺傳學研究;(3)用于分子病毒學其他研究。實驗方法原理大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料TMV病毒液試劑、試劑盒TE-飽和酚:氯

    RNA干擾主體實驗

    siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準

    RNA干擾回復實驗

    RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce

    真菌RNA提取實驗

    實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成水相層和有機層,這樣RNA與仍留在有機相中的蛋白質和DNA分離開。?實驗材料 菌絲體試劑、試劑盒 NaCl蒸餾水SDSTr

    總RNA提取實驗

    實驗方法原理 GTC和N-十二烷基肌氨酸鈉的聯合使用,將促使核蛋白復合體的解離,使RNA 與蛋白質分離,并將RNA 釋放到溶液中。而進一步從復合體中純化RNA ,則根據Chomc zynski和Sacchi的一步快速抽提法進行,采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚將使RNA 進入水相

    植物RNA提取實驗

    直接研磨法 液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過裂解液β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,植物RNA助提劑PLANTaid幫助結合多糖多酚并通過離

    植物RNA提取實驗

    實驗方法原理 獨特的裂解液/β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,植物RNA助提劑PLANTaid幫助結合多糖多酚并通過離心去除,然后用乙醇調節結合條件后,RNA在高離序鹽狀態下選擇性吸附于離心柱內硅基質膜,再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟,去蛋白液和漂洗液將細胞代謝物,蛋白等雜質去除,

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