如何在SoftMaxPro7軟件中選擇最佳權重因子?(一)
前言選擇合適的權重因子對于獲得最佳的曲線擬合至關重要, 獲得曲線擬合參數值使得曲線擬合模型盡可能接近真實的測量數據點。加權將會影響到每個濃度下數據點的影響程度和發揮的作用,或特定數據點或曲線某一部權重是對數據中誤差進行建模的一種方式,并且已經用于處理不同曲線的不同數據點的絕對誤差的差異,如四參數和五參數濃度效應學曲線擬合。當濃度增加時,導致擬合曲線頂部的絕對誤差通常大于曲線底部,增加了復孔的變異性。在擬合曲線頂部較大的標準偏差會影響曲線擬合度和曲線參數的預估值。選擇合適的加權因子將允許你更好的調整曲線擬合度,使之無論是最小方差和更大的方差均能適用。重要的是要了解如何在分布數據集來選擇和應用正確的權重因子。如果對其變異加權不是很了解,這篇應用中將介紹如何使用各種加權功能。優勢- 可選擇多達 21 曲線擬合方式- 在一張曲線擬合圖表中,多個曲線在同一個表格用戶可自定義使用標和準加法- 可以通過 softmaxpro.com官網直......閱讀全文
如何在SoftMax-Pro-7軟件中選擇最佳權重因子?(一)
前言選擇合適的權重因子對于獲得最佳的曲線擬合至關重要, 獲得曲線擬合參數值使得曲線擬合模型盡可能接近真實的測量數據點。加權將會影響到每個濃度下數據點的影響程度和發揮的作用,或特定數據點或曲線某一部權重是對數據中誤差進行建模的一種方式,并且已經用于處理不同曲線的不同數據點的絕對誤差的差異,如四參數
如何在SoftMax-Pro-7軟件中選擇最佳權重因子
前言 選擇合適的權重因子對于獲得最佳的曲線擬合至關重要, 獲得曲線擬合參數值使得曲線擬合模型盡可能接近真實的測量數據點。加權將會影響到每個濃度下數據點的影響程度和發揮的作用,或特定數據點或曲線某一部權重是對數據中誤差進行建模的一種方式,并且已經用于處理不同曲線的不同數據點的
如何在SoftMax-Pro-7軟件中選擇最佳權重因子?(二)
結論利用 SSE 和 AIC 方法開發了檢測模板,在SoftMax Pro7 軟件中選擇的曲線擬合模型測試最常見的加權因子。這些統計測試有助于比較適用于不同加權因子的擬合度優化,可以自信選擇最適當的加權方式。然而,必須確保有足夠的數據點支撐來解釋其變化。參考文獻1. Gottschalk, P.,
使用SoftMax-Pro-7軟件選擇最佳的曲線擬合方式(一)
引言當需要定義一個數據的特征時,如變化的比例、曲線上下邊的漸近線或者 EC50/IC50值時,選擇正確的曲線擬合方式是十分關鍵的。選擇的曲線擬合方式應該是能夠最準確的反映兩個已知變量 (x,y) 的關系。因此,曲線擬合的目的就是為了尋找最佳的公式和參數來匹配數據。SoftMax Pro 7軟
使用SoftMax-Pro-7軟件選擇最佳的曲線擬合方式(二)
SSE 方法使用下面的公式進行分析:SSE= Σ wi (yi - yi)2。假設數據誤差是不相關的且符合正態分布,使 SSE 盡可能的最小能夠最大近似的估算數據模型的曲線公式參數。換句話說,最佳的曲線擬合方式是其參數能夠得到最小的 SSE。如果兩種擬合方式都能符合數據,那么哪個殘差圖給出了最小的
SoftMax-Pro軟件驗證方案
對于在GLP或GMP實驗室工作的科研人員,SoftMax Pro軟件驗證方案提供了最為全面的記錄文檔和可用于驗證GxP管理員功能,軟件運行和分析能力的工具。驗證時間從6個月縮短至三天對于您實驗最重要的莫過于結果的重復性,可靠性和完整性,但要做到這些可能需要多達6個月的時間進行充足的實驗步驟的認證和記
使用MD-SoftMax-Pro-7軟件進行平行線分析和相對活性..(一)
使用MD SoftMax Pro 7軟件進行平行線分析和相對活性評價介紹在生物實驗中要經常要使用到的平行線分析(PLA)方法,當無法直接檢測一個生物制品的活性而只能通過檢測其產生的效果時,PLA方法通常會被用來進行效應曲線的比較來獲得此制品的效果(Figure1)。如果對于兩種物質其生物響應相似或者
使用MD-SoftMax-Pro-7軟件進行平行線分析和相對活性..(二)
噪聲和權重噪聲是指檢測響應的隨機變化,當進行平行線評價時這是需要考慮的重要因素,因為它會影響檢測平行性的能力。在高噪聲的情況下,平行性計算值由于由于受噪聲的影響過大,因此無法再正確的反應非平行性的程度。對于 F- 檢驗和卡方檢驗法這兩種方法,在計算各自的概率值的過程中對于不同噪聲水平的處理能力是不同
利用SoftMax-Pro軟件分析心肌細胞球收縮
前言基于細胞的化合物篩選模型已變的越來越復雜,以展示生物系統的復雜性。活細胞成像和三維模型為活細胞的結構和細胞過程提供了有價值的見解。最近在開發代表人類不同種類組織的復雜類器官模型方面有了很大的進展,其中包括肝臟、胰腺、神經和心肌組織。心肌細胞球能夠在體外環境下收縮并且可對不同調控因子的影響作出反應
利用SoftMax-Pro軟件分析心肌細胞球收縮
基于細胞的化合物篩選模型已變的越來越復雜,以展示生物系統的復雜性。活細胞成像和三維模型為活細胞的結構和細胞過程提供了有價值的見解。最近在開發代表人類不同種類組織的復雜類器官模型方面有了很大的進展,其中包括肝臟、胰腺、神經和心肌組織。心肌細胞球能夠在體外環境下收縮并且可對不同調控因子的影響作出反應
SoftMax-Pro-7.1-GxP企業版數據獲取和分析軟件說明書
SoftMax Pro 7.1 GxP企業版數據獲取和分析軟件 在GMP/GLP實驗條件下符合FDA指導方針的完整驗證工具及手段 優勢: ? 通過系統審計追蹤功能可以輕松跟蹤和記錄所有的改變 ? Microsoft SQL 數據庫能夠使軟件具有企業級別文檔共享能力
使用酶標儀的細胞成像系統檢測標簽蛋白的表達
優勢:?? 帶細胞成像系統的功能模塊擴展了微孔讀板機的檢測應用2.?? 方便檢測每個細胞或每孔的標簽蛋白的表達水平3.?? 按照一般微孔讀板機的簡單流程4.?? 細胞可視化數據輸出,增加了數據可信性某些細胞蛋白存在或不存在,可代表著細胞對某些刺激的反應、某種分化的狀態或特定細胞類型的獨特特征或者基因
微孔板讀板機和SimpleStep-ELISA試劑盒定量白細胞介素8
前言THP-1 是人外周血的單核細胞系,最初來源于急性單核細胞性白血病患者,常被用來體外研究巨噬細胞功能。 它通常屬于懸浮細胞,當用 PMA 處理后可分化為貼壁生長的巨噬細胞。THP-1 能釋放許多細胞因子,其中包括白細胞介素 -8(IL-8),一種能被許多類型細胞分泌的、在調節急性炎癥反應
ABS-Plus微孔板讀板機SimpleStepELISA試劑盒定量白細胞介素8
THP-1 是人外周血的單核細胞系,最初來源于急性單核細胞性白血病患者,常被用來體外研究巨噬細胞功能。 它通常屬于懸浮細胞,當用 PMA 處理后可分化為貼壁生長的巨噬細胞。THP-1 能釋放許多細胞因子,其中包括白細胞介素 -8(IL-8),一種能被許多類型細胞分泌的、在調節急性炎癥反應中發揮作
用SpectraMax多功能微孔板讀板機進行cAMP-HiRange檢測(二)
Z’ 因子由陰性(無cAMP,無cAMP-d2)和陽性質控(無cAMP)計算得到2。利用SoftMax? Pro軟件生成和分析數據,包含一些預設的HTRF實驗模板以簡化檢測和分析。結果使用SoftMax Pro軟件的4-參數曲線擬合如上所述進行數據分析和做圖。依據表2的讀板機參數設置獲得最佳結果
利用細胞計數儀檢測細胞周期
前言球體是小型的3D細胞培養微環境,可以用于諸如低吸附微孔板等特殊的方法進行細胞培養。這種體外3D細胞培養模型具有高度的臨床及生物可靠性,并且已經被廣泛應用于高通量篩選(HTS)和高級細胞培養,從而方便對諸如化合物毒性和癌癥等重大疾病進行研究。Multicellular tumor sphe
利用-SpectraMax-iD3-微孔板讀板機檢測內源色氨酸熒光
介紹蛋白質的內源熒光主要來源于芳香族氨基酸如色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸。在水中,色氨酸的最大激發光波長在270-280nm左右而其發射光波長峰值接近350nm。蛋白的發射光譜對溶劑的極性和外界環境十分敏感。當蛋白質變性時,色氨酸殘基會暴露在水中而其發射波長會變長。這種發射波長峰值的改變可以用來檢測蛋白
SpectraMax-M系列微孔板讀板機應用集錦(一)
引領微孔板檢測系統的行業標準歷經13年發展,SpectraMax? M系列多功能微孔板讀板機由于其優異的檢測表現、可靠的性能、深受廣大科研工作者的信賴,已然成為行業標準的引領者。可以根據應用需求輕松升級滿足您的檢測。儀器設置和數據處理都可借助于專業的SoftMax? Pro軟件完成,所有
使用SpectraMax微孔板讀板機檢測QuantiT-PicoGreen-dsDNA實驗--一
簡介雙鏈DNA通常使用微孔板讀板機通過測量DNA溶液的260nm吸收光進行定量。然而,這種方法通常在微孔板讀板機上只能檢測到最低250ng/mL的濃度。對于生物學應用涉及到小體積樣品,如新一代測序和擴增產物定量時,更靈敏的方法才能滿足需求。Life Technologies公司的Quant-iT
使用SpectraMax微孔板讀板機檢測QuantiT-PicoGreen-dsDNA實驗-二
- 高濃度范圍標曲可以濃度從1 ng/mL制備到1 μg/mL,低濃度范圍標曲可以從25 pg/mL制備到25 ng/mL。對于高濃度范圍標曲,按Table 2中稀釋方案稀釋;對于低濃度范圍標曲,40倍稀釋2μg/mL溶液制備50 ng/mL溶液,參考Table 3中的稀釋方案。 注意:此篇
細胞周期的四種檢測方法詳解(二)
2 數據分析MiniMax 細胞計數儀的透射光模塊可以從自動聚焦得到更好的圖像效果。SoftMax Pro 軟件中的“Field Analysis”能進行自定義分析從而鑒別細胞重疊的部分。我們應用一種特殊的鑒別方法來區分目標球體和其余物體,如殘渣和個體細胞,從而在后續的分析中予以去除 (
如何在Western-Blot中選擇一抗?
說到免疫印跡最重要的就是抗體的選擇了。在免疫印跡中我們會用到一抗和二抗等抗體,本文著重給大家介紹一下一抗的選擇。一抗就是能和特異性抗原特異性結合的蛋白。種類包括單克隆抗體和多克隆抗體。抗體因其種屬來源不同可以分為多種類型,如鼠抗,兔抗,羊抗等等,那么在使用時我們應該怎么選擇呢?檢測任何一種目的蛋白都
SoftMax?Pro7.1.1GxP應用于更全地獲得并分析數據
SoftMax?Pro7.1.1GxP是MolecularDevices最近更新、最安全的一款軟件,符合全新的FDA21CFRPart11的工作流程,以確保您獲得數據的完整性。每個步驟都經過優化,其目的是簡化分析流程和報告生成時間,以便于支持我們的微孔讀板機更快獲得完整、可靠的數據。為了確保您的微孔
如何使用M5-多功能微孔板讀板機和IMAP?-熒光偏振...(二)
結合反應步驟1.將75%的結合緩沖液A與25%的結合緩沖液B混合,制備結合緩沖液;步驟2.將結合試劑以1:600倍稀釋成結合緩沖液,得到結合反應液;步驟3.移出60ul結合反應液到每個檢測孔和校正標準孔中(包括背景孔樣本)步驟4.室溫避光孵育1小時 在SoftMax Pro軟件上設置模板,并在Spe
如何利用微孔讀板機進行微量DNA和蛋白的高通量檢測?
介紹在遺傳學和分子生物學中,對核酸和蛋白進行定量是許多復雜實驗必要的上游檢測。雖然已有多種檢測方法,但是最常用的仍然是紫外分光光度法。紫外分光光度法的原理是利用分子在固定波長范圍吸收光和散射光,在朗伯比爾定律(方程式1)的基礎上計算待測物質的濃度。這種方法還需要提前知道樣品的摩爾消光系數和通路長度。
SpectraMax-M系列微孔板讀板機應用集錦(四)
使用NanoOrange蛋白試劑盒傳統的比色方法,如280吸光,BCA,Bradford或Lowry法,當使用微孔板格式時靈敏度不佳。來自Life Technologies公司的NanoOrange? 蛋白定量試劑盒在多孔板格式的動態區間可達 10 ng/mL到10 μg/mL。此應用文章展
微孔讀板機符合-GMP/GLP-實驗的合規之路
符合 GMP/GLP 實驗的合規之路 SoftMax? Pro 7.1 GxP 是 Molecular Devices 最新、最安全的一款軟件,符合全新的 FDA 21 CFR Part 11 的工作流程,以確保您獲得數據的完整性。每個步驟都經過優化,其目的 是簡化分析流程和報
利用SpectraMax-i3x多功能微孔板讀板機檢測功能對...(二)
ATP標準曲線既可以驗證試驗條件也可以用來計算細胞內ATP的含量。因此ATP標準品濃度范圍從1nM至10uM產生的化學發光信號范圍可覆蓋整個不同細胞數目孔中產生的信號值(圖二),檢測的線性范圍大于四個數量級。??經十字孢堿(staurosporine)和茴香霉素 (anisomycin)等化合物
SpectraMax-M系列微孔板讀板機應用集錦(三)
應用原代細胞進行高通量復雜炎癥分析炎癥反應的一個重要步驟是細胞表面抗原與血管中免疫細胞的特異性結合。因此,對這些分子變化的及時監控,如VCAM, E-selectin,以及內皮細胞上的HLADR等等,我們用多通道熒光讀取人原代細胞表面的炎癥標記,并在此基礎上評估不同介質對炎癥反應的調節作用。
如何選擇最佳實驗
原子吸收光譜分析中影響測量條件的可變因素多,在測量同種樣品的各種測量條件不同時,對測定結果的準確度和靈敏度影響很大。選擇最適的工作條件,能有效地消除干擾因素,可得到最好的測量結果和靈敏度。 1、吸收波長(分析線)的選擇:通常選用共振吸收線為分析線,測量高含量元素時,可選用靈敏度較低的非共振線為分