環狀RNAs帽獨立的翻譯蛋白及其在癌中的作用
環狀RNA是一種共價封閉RNA，在真核生物中廣泛表達。circRNA參與多種生理和病理過程，但其調控機制尚不完全清楚。隨著RNA深度測序技術的發展和算法的改進，發現了一些circRNA通過cap-independent機制編碼蛋白質，參與腫瘤發生發展的重要過程。本文在概述CircRNAs的基礎上，總結了其翻譯機制和研究方法，并回顧了近年來CircRNAs翻譯在腫瘤學領域的研究進展。 此外，本文旨在通過CircRNAs的翻譯為腫瘤的診斷和治療提供新的思路。 根據世界衛生組織國際癌癥研究機構2020年發布的最新全球癌癥數據，2020年全球新增癌癥病例1929萬，死亡996萬人。惡性腫瘤嚴重威脅著人們的健康。近年來生物技術的進步加深了人們對單個腫瘤中復雜的遺傳和非遺傳異質性的理解。蛋白質組學和基因組學的結合可能揭示單個基因活性狀態的最準確信息。分子診斷和治療有助于改善惡性腫瘤不良預后。因此，需要深入探討惡性腫瘤發生發展的分子機制......閱讀全文
基因的翻譯表達2
方法 ? 1：重組載體構建同前面實驗 2：誘導表達：提取帶重組片斷的質粒DNA轉化BL21（DE3）受體菌37℃活化過夜，轉入新鮮培養基搖菌至對數生長期（約2－3小時），加入IPTG至終濃度0.4mM，繼續培養6小時 3：表達產物提取及鑒定見實驗十九
基因的翻譯表達1
1體外TNTRT7 轉錄/翻譯系統表達重組基因體外翻譯是研究基因表達、基因調控的一類重要技術，該技術可廣泛用于基因表達量、啟動序列等調控因子的確立，并結合PTT實驗篩選天然突變或人工誘變的基因片段，還可用來進行蛋白和DNA結合方面的研究。早期的體外翻譯研究大多是提取mRNA然后通過網織紅細胞或麥胚系
上海生科院等揭示環裝RNA編碼蛋白的重要機制
3月10日，中國科學院－馬普學會計算生物學伙伴研究所研究員王澤峰在《細胞研究》（Cell Research）上在線發表了題為Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine 的研究論文，該研究發現了大量的環形R
基因表達的翻譯調控的介紹
翻譯調控的效果不如轉錄調控或調控mRNA的穩定性,但也偶爾得到使用。抑制蛋白質翻譯是毒素和抗生素的主要作用目標,因此它們可以通過超越其正常的基因表達控制來殺死細胞。蛋白質合成抑制劑包括抗生素新霉素和毒素蓖麻毒素。
基因表達的翻譯后調控的簡介
翻譯后修飾（PTM）是對蛋白質的共價修飾。像RNA剪接一樣,它們有助于使蛋白質組更加豐富多樣。這些修飾通常由酶催化。此外,諸如氨基酸側鏈殘基的共價添加這樣的修飾過程通常可以被其它酶逆轉。但蛋白水解酶對蛋白質骨架的水解切割是不可逆轉的。PTM在細胞中發揮著許多重要作用。例如,磷酸化主要涉及激活和失
關于基因表達的翻譯機制的介紹
成熟RNA是非編碼RNA的最終基因表達產物 。但信使RNA（mRNA）則不同,它們是編碼一種或多種蛋白質合成的遺傳信息的載體。 每個mRNA由三部分組成：5'非翻譯區（5'UTR）,蛋白質編碼區或開放閱讀框（ORF）和3'非翻譯區（3'UTR）。編碼區攜帶由遺傳密
人類“垃圾RNA”有重要作用——促進翻譯
過去十年的基因組研究中，最大的驚喜之一是科學家們發現，與以前的信念相反，大多數的基因組并不用于生產蛋白質。最初，許多科學家認為這些長非編碼RNAs是非功能的“噪音”，但在最近的研究中，有越來越多的研究發現，這些lncRNAs具有調節功能。延伸閱讀：上海生科院發現調控乙酰膽堿酯酶表達的自然存在的反
lncRNA表達與RNA的延伸
LncRNA的火熱研究已經有幾年的時間了，關于lncRNA總歸是有說不完的話題。目前對lncRNA的基礎分析都已形成了一定的模式。然后，今年來lncRNA的相關文章依然如雨后春筍。 長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RN
Tornado表達系統實現RNA高水平表達和功能活性
RNA適配體是一種短RNA，可通過結合細胞內的分子或蛋白質調節細胞內進程。盡管RNA適配體具有潛在的應用價值，但它并沒有其他RNA技術廣泛應用，主要問題是它們不能高濃度表達，從而不能有效調節蛋白質功能，同時也阻礙了RNA裝置，例如RNA代謝物生物傳感器在哺乳動物細胞中的應用。通常，基于RNA的生
健康所在RNA結合蛋白調節信使RNA翻譯研究中取得新進展
近日，國際學術期刊Molecular and Cellular Biology在線發表了中科院上海生命科學研究院/上海交通大學醫學院健康所核酸與分子醫學研究組的最新研究進展：AU-Rich Element-Dependent Translation Repression Requires the
基因表達RNA加工的機制介紹
原核蛋白編碼基因的轉錄產生的是可以翻譯成蛋白質的信使RNA（mRNA）,但真核基因的轉錄會產生RNA的初級轉錄本（pre-mRNA）,必須經過一系列加工才能成為成熟RNA（mRNA）。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物細胞核帶來的進化優勢。在原核生物中
體內表達shRNA（短發夾RNA）的設計
1.克隆到shRNA表達載體中的shRNA包括兩個短反向重復序列，中間由一莖環（loop）序列分隔的，組成發夾結構，由polⅢ啟動子控制。隨后在連上5-6個T作為RNA聚合酶Ⅲ的轉錄終止子。?2.兩個互補的寡核苷酸兩端須帶有限制性酶切位點。?3.Stratagene發現29個寡核苷酸較之原先推薦的2
RNA翻譯與蛋白質折疊之間的微妙舞蹈
在蛋白質的合成過程中，RNA翻譯會影響蛋白質的折疊，而蛋白質折疊也會影響RNA的翻譯。 在過去的十年里，我們對細胞內蛋白質合成方式的認知取得了快速的增長，其中包括蛋白質合成的各個基本步驟：轉運RNA（transfer RNA， tRNA）是如何高保真、高速率地對信使RNA（messenger
反義RNA調控細菌基因的表達功能介紹
反義RNA對編碼CAP的基因的調控作用已如前述。這里再介紹一下micF RNA對ompF基因的表達的調控。ompF蛋白質是大腸桿菌的外膜蛋白的主要成分這一。micF RNA是從另一基因(ompC基因)附近的DNA序列轉錄而來，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互補，因此在體外m
反義RNA的調控細菌基因的表達功能
反義RNA對編碼CAP的基因的調控作用已如前述。這里再介紹一下micF RNA對ompF基因的表達的調控。ompF蛋白質是大腸桿菌的外膜蛋白的主要成分這一。micF RNA是從另一基因(ompC基因)附近的DNA序列轉錄而來，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互補，因此在體外mic
RNA干涉實驗——采用RNA聚合酶Ⅲ啟動子表達siRNA分子
實驗方法原理因為哺乳動物細胞不具備低等真核生物細胞所具有的擴增 RNAi 信號的機制，因此人工合成或體外轉錄的 siRNA 分子在細胞內的作用是瞬時性的，不適合用于進行靶基因的表達受到抑制后細胞表型的長期變化觀察，也不適于進行文庫的篩選。此外，體外制備 siRNA 分子的成本比較高，而且 siRNA
為什么水環真空泵機組前裝冷凝器？
機組前裝冷凝器 為了放量使機組的體積小些，可變法兒使待抽的蒸汽在進入泵機組之前冷凝，那樣剩下來的就差錯可凝性氣體和微量殘余蒸汽。氣體降溫后在相反壓力下身積也減小。因而冷凝后所需抽器量減小，相應地泵也能夠選得小一些。 采納哪種形式較經濟？應視其具體狀況而定，舉例注明如次： 冷凝蒸汽有兩種形式
嬰兒鼻、肺細胞的RNA表達模式顯著相似
根據羅切斯特大學醫學中心(URMC)最新的研究發現嬰兒鼻細胞與肺部細胞非常類似,這一發現可使呼吸道合胞體病毒(RSV)和其他嬰兒肺部疾病的診斷更精確。 患呼吸道疾病的嬰兒十分脆弱，因此試圖獲取肺部樣本是不安全的，該研究發表在科學報告上，為多年來受到挑戰的醫生提供了一條潛在診斷途徑。
過表達質粒與RNA干擾質粒有什么不同
本質上是一樣的，都是讓外源性的基因序列在細胞內得到表達。但是由于目的不同，技術細節上也會有不同。過表達的質粒如果是一過性表達，不需要整合到細胞染色體組，只要有強的啟動子就可以了。穩定表達的，需要有篩選基因的表達來選出整合的細胞。而干擾質粒一般都需要是穩定的表達，現在都是通過慢病毒來實現，質粒基本都棄
與結直腸癌相關的基因突變類型MIR2181基因
micrornas（micrornas）是短的（20-24nt）非編碼RNAs，通過影響mRNas的穩定性和翻譯，參與多細胞生物中基因表達的轉錄后調控。小RNA被RNA聚合酶II轉錄，作為可編碼蛋白質或不編碼的有帽和多聚腺苷酸化的初級轉錄物（pri-mirnas）的一部分。初級轉錄物被Drosha核
micrornas基因的結構及作用
micrornas（micrornas）是短的（20-24nt）非編碼RNAs，通過影響mRNas的穩定性和翻譯，參與多細胞生物中基因表達的轉錄后調控。小RNA被RNA聚合酶II轉錄，作為可編碼蛋白質或不編碼的有帽和多聚腺苷酸化的初級轉錄物（pri-mirnas）的一部分。初級轉錄物被Drosha核
關于體外翻譯翻譯系統的選擇介紹
雖然不是必須，但一般說，選用真核系統來翻譯真核序列，選用原核系統來翻譯原核序列。 如果一個系統存在功能上或抗原的交叉反應，就得選擇另一個系統。使用微粒體膜進行翻譯后修飾或加工一般只與兔網織紅細胞系統兼容。僅在某些特定條件下麥胚芽翻譯系統才與微粒體膜兼容。
T7RNA聚合酶系統基因表達實驗
實驗方法原理 含有 pT7 控制的外源基因（「痘苗病毒系統基因表達實驗」中「重組痘苗病毒（VTF7-3）感染后的脂質體轉染」）的重組質粒，通過同源重組可整合到痘苗病毒中,并制備重組病毒儲液。將此病毒儲液與 vTF7-3 共同感染貼壁或懸浮細胞，在培養過程中，外源基因被高效的 T7 RNA
T7RNA聚合酶系統基因表達實驗
兩種重組痘苗病毒共感染細胞 單病毒感染OST7-1細胞 利用VOTE系統 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 含有 pT7 控制的外源基因（「痘苗病毒系統基
環狀RNA（circRNA）功能研究又一利器——過表達載體
circRNAs 環狀 RNA（circular RNAs,circRNA）是一類具有閉合環狀結構的 RNA 分子，早在 20 世紀八十年代即有研究報道，但由于其表達豐度低，文獻報道較少，一直被認為是 RNA 轉錄剪切的罕見錯誤而被忽視。直到 2012 年開始有研究者開始大批量鑒定 circRN
翻譯后修飾
中文名翻譯后修飾外文名Post-translational modification定義翻譯后修飾是指蛋白質在翻譯后的化學修飾。對于大部分的蛋白質來說，這是蛋白質生物合成的較后步驟。
翻譯的起始
（一）原核細胞原核細胞的翻譯起始過程大概可以分為以下幾個過程：（1）翻譯起始因子IF3結合到小亞基的E位點，同時也橫跨至P位點；（這一過程在起始之初就已經完成）起始因子IF1結合至A位點；（2）起始因子IF2·GTP被IF3和IF1招募至P位點；（3）起始fMet·tRNA一方面被mRNA起始密碼子
上海生科院揭示反向剪接RNA成環與RNA轉錄的偶聯機制
4月19日，國際學術期刊Cell Reports 發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組與計算生物學研究所楊力研究組最新合作研究論文。此工作深入研究了環形RNA生成與RNA轉錄的偶聯機制，揭示了環形RNA在神經分化過程中表達上調原理。 環形RNA是一類通過反向
RNAseq綜述（八）
使用核糖體分析方法檢測活躍的翻譯RNA-seq的主要用途在于研究樣本中的mRNA的種類與數量，但是mRNAs的存在與否并不直接關系到蛋白質的合成。現在有兩種方法可以研究轉錄以外的翻譯情況，可以讓研究者們更好的理解翻譯組(translatome)：一種是多核糖體表達譜(polysomal pr
發現線粒體翻譯與細胞質翻譯協調機制
中科院生物物理所與中科院動物所、軍事醫學科學院以及天津科技大學等機構合作，揭示了線粒體翻譯與細胞質翻譯之間的“協調”機制。研究還揭示了一種全新的男性不育發病途徑，對男性不育臨床干預具有重要借鑒意義。相關成果4月11日在線發表于《自然—結構域分子生物學》期刊。生物物理所研究員秦燕為通訊作者，該所