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  • Cell:單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜

    最新發布在Cell上的一項研究表明,單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群,并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術對急性髓(細胞)性白血病(AML)小鼠的骨髓基質細胞進行研究。 新研究視角:骨髓基質 AML是一種高度致命的白血病類型,常常發生在骨髓細胞成長周期發生中斷時血液中未成熟細胞過度繁殖的情形下。一般情況下,被診斷為AML的成年人5年生存率最多只有30%。 本次研究中便針對這一“絕對致命”的血癌類型進行研究。通過AML小鼠模型研究發現,在病程發展過程中,骨髓基質細胞改變了骨髓微環境,導致骨髓干細胞和血液發育干細胞因子的生長被阻斷。 因此,探索骨髓基質細胞映射骨髓微環境或許成為白血病研究提供了新的視角。盡管基質細胞充斥在幾乎所有器官中......閱讀全文

    Cell:單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜

      最新發布在Cell上的一項研究表明,單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群,并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術

    Cell:利用單細胞測序描繪骨髓間質完整的細胞類群

      2019年5月23日,哈佛大學的研究人員在Cell上發表了題為“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者們從單細胞角度系統地對骨髓間質細胞進行了詳細的分類學研究,揭示了急性髓

    Cell:科學家利用單細胞測序描繪骨髓間質完整細胞類群

      哈佛大學的研究人員在Cell上發表了題為“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者們從單細胞角度系統地對骨髓間質細胞進行了詳細的分類學研究,揭示了急性髓系白血病對間質細胞群體

    單細胞測序技術(single-cell-sequencing)-綜述(一)

    單細胞生物學最近幾年是非常熱門的研究方向。在這一領域中,最前沿的則是單細胞測序技術。傳統測序方法一次處理成千上萬個細胞,得到的變異水平也是成千上萬個細胞的平均后水平。但是,就如同世界上沒有完全相同的兩片樹葉一樣,沒有兩個細胞是完全相同的。所以,單細胞測序對于研究單個細胞就顯得至關重要。單細胞測序可以

    單細胞測序技術(single-cell-sequencing)-綜述(二)

    DroNC-seq10月,Broad研究所張鋒教授團隊在Nature Methods上發表題為“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章,提出了一個新的測

    《Cell-Stem-Cell》巧用單細胞測序解析生發過程的調控機制

    單細胞轉錄組測序是這兩年來非常流行的高通量組學研究工具,然而,是不是所有的研究都適合用該方法?是不是所有的問題都可以通過該方法來解釋?這是一個值得探討的問題。從現有的研究報道來說,單細胞轉錄組學研究很好地解決了細胞圖譜,發育過程等重要的生物學問題。但是在相對比較傳統的研究方向,是否也能利用單細胞轉錄

    Cell:單細胞測序深度解析三陰乳腺癌

      美國MD安德森癌癥中心聯合瑞典卡羅林斯卡學院的研究人員利用單細胞測序對三陰乳腺癌展開分析,表明耐藥性是來源于現有的帶有基因突變的克隆。這些結果于周四發表在《Cell》雜志上,將對這種癌癥的診斷、預后和治療具有臨床意義。  三陰乳腺癌是指雌激素受體、孕激素受體和原癌基因Her-2均為陰性的乳腺癌。

    Cell-Stem-Cell巧用單細胞測序解析生發過程深層次調控機制

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    Cell-Res重點論文:單細胞表觀多組學測序技術最新突破

      2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

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    單細胞測序需要準備什么再去測序

    DNA測序的測序原理: DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)與鳥嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

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    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。

    Nature:單細胞測序(下)

      隨著技術的飛速發展,成本大大降低,使得基因組測序成為常規技術。然而,大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序,它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。   該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序,研究小

    如何-解讀-單細胞-測序

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    單細胞測序方法匯總

    單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整

    Nature:單細胞測序(上)

      Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年,冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織,一并將這些DNA進行測序,生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序

    Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序

    2018年11月,Namocell與CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞,并且將其進行單細胞測序,為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序(scRNA-s

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

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    Cell:機械敏感性基質影響

      細胞能感知周圍細胞微環境,并對此做出反應,這些微環境十分重要,會影響細胞的形態、蛋白質水平和定位、基因表達,乃至核完整性。組織微韌性(micro-stiffness)在很大程度上受到細胞外基質的影響,但有機體內基質變化很大,因此也許可以作為分析和組織許多細胞類型和分子進程的一個有用參數,比如用于

    骨髓基質肌樣細胞的純化方法介紹

    在血液細胞和骨髓細胞靜置培養時,常有許多肌樣細胞和骨髓基質細胞貼壁生長,但也有許多淋巴細胞、單核細胞、粒細胞粘附其上,種類混雜,鑒于粘附細胞貼壁不牢固,也可用酶消化法使粘附細胞脫壁分離,以達到骨髓基質細胞或血液中肌樣細胞與淋巴細胞分開和純化的目的。其方法如下:①待基質或肌樣細胞基本形成單層時,倒去舊

    靶向深度測序和單細胞基因測序的區別

    1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序,有效降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序

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    西安交大李磊Cell-Res用單細胞外顯子組測序研究腎細胞癌

      生物通報道:腎細胞癌(RCC)占成人惡性腫瘤的3%,和腎腫瘤的90%~95%。轉移性疾病通常會對放療和化療產生耐藥性。免疫治療表現出15%至20%的有限反應率。腫瘤干細胞(CSCs)是腎癌發生、發展以及耐藥性的關鍵參與因子。以前的研究已經表明,RCC是一種遺傳學明顯不同的成人癌癥,具有相對較低的

    Fluidigm推出單細胞TCR測序產品

      解析細胞表型是免疫學中一個共同的單細胞分析目標。然而,T細胞受體V(D)J基因區域的隨機重排帶來了T細胞群體的復雜變化。這形成了龐大的T細胞部隊,以便識別特定的外源蛋白,引發有效的免疫反應。  為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析,Fluidigm近日在C1?系統上推出了一個全新的免疫學應用 –

    !單細胞測序的”CPU-2.0”時代

      對單個人類細胞的基因組進行準確的變異檢測和大范圍單倍體型分析一直以來都是測序領域的巔峰挑戰。單細胞測序使我們能在更高的分辨率下研究生命的機制。一方面,在像癌癥這樣的組織樣本中存在大量具有不同基因組類型的單個細胞,因此需要分析單細胞水平基因組而不是大量細胞的平均值;另一方面,對于非常珍貴的細胞樣品

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