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  • Qiagen收購IBS進軍測序市場

    Qiagen公司在周一收市后宣布,它已經收購了新一代測序公司Intelligent Bio-Systems(IBS),并推出一項舉措,旨在將測序技術推向分子診斷和臨床研究市場。 私人持有的IBS公司在今年3月召開的“Association of Biomolecular Resource Facilities annual meeting”上發布了一款邊合成邊測序的儀器Mini-20。該儀器的價格約為12萬美元,預計在今年第二季度提供給早期試用用戶。 IBS的技術是基于2006年獲得的發明人Jingyue Ju和哥倫比亞大學的獨家授權的four-color reversible terminatorsequencing chemistry技術。 據Qiagen介紹,它目前正處于新系統開發的后期階段,此系統將基于以往IBS的設計元素以及Qiagen的技術。第一個sample-to-result的新一代測序方案有......閱讀全文

    分子診斷技術、PCR技術、基因測序技術的區別、原理(二)

      二、核酸序列測定  測序反應是直接獲得核酸序列信息的唯一技術手段,是分子診斷技術的一項重要分支。雖然分子雜交、分子構象變異或定量PCR技術在近幾年已得到了長足的發展,但其對于核酸的鑒定都僅僅停留在間接推斷的假設上,因此對基于特定基因序列檢測的分子診斷,核酸測序仍是技術上的金標準。  (一)第1代

    一文讀懂分子診斷技術、PCR技術、基因測序技術

      四、定量PCR(quantitative PCR,qPCR)  相比于其他分子診斷檢測技術,qPCR具有2項優勢,即核酸擴增和檢測在同一個封閉體系中通過熒光信號進行,杜絕了PCR后開蓋處理所帶來擴增產物的污染;同時通過動態監測熒光信號,可對低拷貝模板進行定量。正是由于上述技術優勢,qPCR已經成

    分子診斷技術、PCR技術、基因測序技術的區別、原理(一)

    分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料,用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常,從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。其基本原理是檢測DNA或RNA的結構是否變化、量的多少及表達功能是否異常,以確定受檢者有無基因水平的異常變化,對疾病的預防、預測、診斷、治療和預后具有重要意義。通俗簡單

    測序牛人發布蛋白單分子測序技術

      人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋白質是幾乎所有生命過程的主要執行者。   現在,美國亞利桑納州立大學Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事,在納米孔DNA測序技術的基礎上,開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用

    全新測序技術利弊比較之單分子測序

      在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過50人的生命(德國范圍內),在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。   Harmsen教授在這場疫情

    高通量測序平臺發展及在臨床分子診斷中的應用

    自2000年人類基因組計劃完成,測序技術得到了快速的發展。在美國ABI公司基于末端終止法的第一代測序基礎上,各大公司相繼推出了不同的NGS測序平臺。核酸(DNA和RNA)測序技術的發展推動了醫學對遺傳病分子特征的認識。以揭示疾病分子特征為目的的高通量測序,即下一代測序(next generati

    帶您了解單分子測序技術

      單分子測序技術,也被稱為納米測序技術,是通過納米孔只允許一條鏈進入的方式,根據堿基的熒光或者電流阻斷來識別堿基序列的一種新型測序技術。這種技術包括PacBio技術和Nanopore技術兩種主要方法。  PacBio技術主要是利用熒光標記不同的堿基與待測序列、DNA聚合酶一起放入納米孔底部。當DN

    分子診斷常用技術(二)

    ( 五) 生物芯片1991 年Affymetrix 公司的Fordor利用其所研發的光蝕刻技術制備了首個以玻片為載體的微陣列,標志著生物芯片正式成為可實際應用的分子生物學技術。時至今日,芯片技術已經得到了長足的發展,如果按結構對其進行分類,基本可分為基于微陣列( microarray) 的雜交芯片與

    CRISPR分子診斷技術(二)

    6 ?? Sherlock和Mammoth兩家公司的技術并非橫空出世,而是源于張鋒和Doudna兩家實驗室于2015-2018年期間在知名期刊上發表的一系列科研成果。這場學術上的比拼猶如兩個武林高手過招,精彩紛呈,讓人目不暇接。兩個團隊互相競爭,也互相學習,開拓了CRISPR分子診斷這一全新

    CRISPR分子診斷技術(三)

    13 ???或許是因為LbuC2c2的特異性和非特異性剪切活性遠遠高于LshC2c2的相應活性, Doudna團隊意識到LbuC2c2可以被用來構建高特異性、高靈敏度的RNA檢測方法。若想檢測出某一特定序列的RNA分子,先將與其互補的crRNA和LbuC2c2蛋白組裝,再加上一些報告RNA分

    CRISPR分子診斷技術(六)

    34 ???不是所有的塞卡病毒都一樣。2017年9月, 中科院遺傳所的許執恒團隊和軍事醫學科學院的秦成峰團隊在Science上報導,prM蛋白的一個突變(S139N)增加了塞卡病毒的傳染性,并引起更嚴重的小頭癥和更高的致死率。在該論文發表后一周內,Sabeti團隊和張鋒團隊就設計、開發出幾個能區分出

    CRISPR分子診斷技術(四)

    19 ???由于其高靈敏度和特異性,CRISPR診斷技術或CRISPR-Dx可以有很多用途:病毒檢測和病毒亞型區分,病菌識別和耐藥性基因確認,即時檢測(POCT), 患者基因分型,以及癌癥突變分析和液體活檢。這篇論文也初步展示了CRISPR-Dx在這些方面的應用前景。圖片來源:參考資料320???比

    CRISPR分子診斷技術(七)

    39 ??加上Cas9,它們為分子診斷和基因編輯提供了多樣靈活的工具。圖片來源:參考資料240??? CRISPR分子診斷技術并不是只有Doudna和張鋒兩家在開發。2019年3月,在Keck Graduate Institute任職的Kiana Aran博士與合作者在Nature Biomedic

    分子診斷常用技術(一)

    分子診斷技術即是利用分子生物學方法對人類及病原體的各類遺傳物質進行檢測,以幫助對疾病進行診斷。以技術原理出發對分子診斷技術進行歸類與評價,以對目前臨床常用技術的沿革進行回顧。1961 年Hall 建立的液相分子雜交法標志著人類掌握分子生物學技術對特定核酸序列進行檢測,開啟了對疾病分子診斷的大門。19

    分子診斷常用技術(三)

    二、核酸序列測定測序反應是直接獲得核酸序列信息的唯一技術手段,是分子診斷技術的一項重要分支。雖然分子雜交、分子構象變異或定量PCR 技術在近幾年已得到了長足的發展,但其對于核酸的鑒定都僅僅停留在間接推斷的假設上,因此對基于特定基因序列檢測的分子診斷,核酸測序仍是技術上的金標準。( 一) 第1 代測序

    CRISPR分子診斷技術(一)

    本篇為“連環畫”系列中的第二篇。“連環畫”中的每一篇都會介紹一個最新生物醫藥技術或趨勢。以圖畫為主,文字為輔。雖然無法做到系統全面,但希望能給讀者帶來一些啟發。每篇文章只代表作者個人的觀點或解讀,與禮來亞洲基金的投資決定無關。1 ???脊椎動物的免疫系統分為先天免疫(或非特異性免疫),和獲得性免疫(

    分子診斷技術大盤點

    分子診斷技術盤點分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料,用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常,從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。分子診斷技術為疾病的預測、診斷、預防、治療和轉歸提供了信息和決策依據,已廣泛應用于傳染病的診斷、流行病的調查、食品衛生檢查、腫瘤和遺傳病的早期診斷及法醫

    CRISPR分子診斷技術(五)

    25 ? DETECTR達到了aM水平的靈敏度和≤7個堿基的特異性。例如,它能準確地檢測出受試者攜帶的是哪種亞型的HPV。圖片來源:參考資料2和1026 ??在同期Science論文中,張鋒團隊從三個方面著手完善SHERLOCK:多重化、定量化和去熒光。先說多重化:他們挑選了來自兩個不同菌株的Cas

    分子診斷3大技術分析:qPCR、二代測序NGS和數字PCR

    分子診斷是將分子生物學技術應用于疾病診斷的醫學分支學科,利用分子生物學技術研究人體內源性或外源性生物分子的存在、結構或表達調控變化,為疾病的預防、預測、診斷、治療、預后和轉歸提供信息和決策依據。精準醫療的發展,將持續推動分子診斷的進步。目前常見核酸分子診斷技術涉及三個技術:熒光定量PCR技術(qPC

    核酸分子診斷三大技術:qPCR、二代測序NGS和數字PCR

    分子診斷是將分子生物學技術應用于疾病診斷的醫學分支學科,利用分子生物學技術研究人體內源性或外源性生物分子的存在、結構或表達調控變化,為疾病的預防、預測、診斷、治療、預后和轉歸提供信息和決策依據。精準醫療的發展,將持續推動分子診斷的進步。目前常見核酸分子診斷技術涉及三個技術:熒光定量PCR技術(qPC

    為提高臨床測序的診斷率,研究人員各出奇招

      許多遺傳性疾病的臨床外顯子組測序僅有25%的診斷率,這意味著四分之三的患者無法得到分子診斷。在美國醫學遺傳學和基因組學學會(ACMG)年會上,貝勒醫學院和約翰霍普金斯大學醫學院報道了一些策略,通過再次分析外顯子組數據,并利用配對工具尋找相似病例,可提高診斷率。  據貝勒醫學院的Pengfei L

    基因測序技術:診斷發育遲緩患兒

      最新研究顯示廣泛的遺傳分析可能對發育遲緩的兒童有所幫助,有希望能幫助他們找到殘障的原因。圖片來源于網絡  加拿大的研究人員對10名不明原因發育遲緩的兒童進行了精確遺傳原因分析,發現了其中7名兒童發育遲緩的原因。  很多情況下,遺傳分析都會有突破性發現。研究人員發現了11個新的與發育遲緩有關的致病

    NGS技術落地病理科,加速分子診斷臨床應用發展

    當前,腫瘤個體化治療已從美好的愿景逐漸步入臨床實踐。基于分子分型的靶向治療、免疫治療等精準治療手段使腫瘤患者生存期及生活質量得到顯著提高。在這一趨勢下,以新一代測序(NGS)技術為代表的靶向精準檢測方法逐漸從科研實驗室走向臨床病理科的實際應用中。2019中國病理年會期間,在羅氏診斷主辦的“NGS助力

    漫談分子診斷常用技術沿革

    一、基于分子雜交的分子診斷技術  上世紀60年代至80年代是分子雜交技術發展最為迅猛的20年,由于當時尚無法對樣本中靶基因進行人為擴增,人們只能通過已知基因序列的探針對靶序列進行捕獲檢測。其中液相和固相雜交基礎理論、探針固定包被技術與cDNA探針人工合成的出現,為基于分子雜交的體外診斷方法進行了最初

    現有分子診斷技術大盤點

    感染性疾病如今出現了很多新的變化,舊的疾病有了新的特點,也出現了諸如埃博拉病毒之類新的疾病。傳統的病原學檢測以分離、培養、染色、生物化學鑒定為主,但是有操作復雜、檢測周期長、干擾因素多、敏感性與特異性有限等缺點。雖然自動化技術縮短了檢測時間,但并沒有解決根本性問題,臨床應用中急需一種新的,更有效的診

    盤點:分子診斷常用技術(二)

    (?五 )?生物芯片1991年Affymetrix公司的Fordor利用其所研發的光蝕刻技術制備了首個以玻片為載體的微陣列,標志著生物芯片正式成為可實際應用的分子生物學技術。時至今日,芯片技術已經得到了長足的發展,如果按結構對其進行分類,基本可分為基于微陣列( microarray)?的雜交芯片

    盤點:分子診斷常用技術(一)

    分子診斷技術即是利用分子生物學方法對人類及病原體的各類遺傳物質進行檢測,以幫助對疾病進行診斷。以技術原理出發對分子診斷技術進行歸類與評價,以對目前臨床常用技術的沿革進行回顧。1961年Hall 建立的液相分子雜交法標志著人類掌握分子生物學技術對特定核酸序列進行檢測,開啟了對疾病分子診斷的大門。1

    單分子測序推動復雜動植物的研究

      Pacific Biosciences公司近日風光無限,發布了新系統,帶動股價大漲。同時,它的單分子實時(SMRT)測序技術也助力了多個植物和動物基因組的研究。這些成果近期發表在多個期刊上,展現了SMRT測序的獨特魅力。  最新一期的《Nature》雜志發表了Oropetium thomaeum

    澳發明新基因測序技術“捕獲測序”有助快速診斷血癌

      澳大利亞科學家發明了一種新的基因測序技術,其精度大大高于現有方法。它就像一臺倍數更高的顯微鏡,可用于對基因組進行精細研究,并幫助快速診斷血癌(即白血病)。  這項技術被稱為“捕獲測序”,由新南威爾士大學和加文醫學研究所的科研人員開發,發表在新一期英國《自然·方法學》雜志上。  新南威爾士大學日前

    澳發明新基因測序技術“捕獲測序”有助快速診斷血癌

      澳大利亞科學家發明了一種新的基因測序技術,其精度大大高于現有方法。它就像一臺倍數更高的顯微鏡,可用于對基因組進行精細研究,并幫助快速診斷血癌(即白血病)。  這項技術被稱為“捕獲測序”,由新南威爾士大學和加文醫學研究所的科研人員開發,發表在新一期英國《自然·方法學》雜志上。  新南威爾士大學日前

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