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    單分子測序推動復雜動植物的研究

    Pacific Biosciences公司近日風光無限,發布了新系統,帶動股價大漲。同時,它的單分子實時(SMRT)測序技術也助力了多個植物和動物基因組的研究。這些成果近期發表在多個期刊上,展現了SMRT測序的獨特魅力。 最新一期的《Nature》雜志發表了Oropetium thomaeum近乎完整的基因組草圖。Oropetium thomaeum是一種耐旱草類,在遭受極端干旱后,獲得水分時可再度生長。Donald Danforth植物科學中心的研究人員及合作者利用PacBio RS II測序系統,以72倍的覆蓋度分析了其245 Mb的基因組。 據介紹,整個測序時間不到1周,試劑成本低于1萬美元。所獲得的組裝結果覆蓋了基因組的99%,包含端粒和著絲粒序列、長末端重復反轉錄轉座子、串聯重復基因,以及其他難以接近的基因組元件。準確性超過99.999%。這一植物是通過PacBio的“世界上最有趣的基因組”資助項目測序的,以幫......閱讀全文

    一文看全!史上59家測序儀公司的“爭霸戰”

      公司:DNAe (DNA Electronics)  網站:https://www.dnae.com  簡介:2003年成立,英國。  核心技術:基于電微流體半導體(CMOS)的合成法測序技術  是否屬于單分子測序技術:否  公司產品:LiDia測序平臺  描述:使用離子敏感場效應晶體管(ISF

    單分子測序在腫瘤基因檢測中的6大應用

      腫瘤是當今導致人類主要死亡的主要疾病之。由于其發病隱匿、治療方法局限、多數預后不良,且分子生物學特征復雜多變,因而腫瘤的預防、早期篩查與診斷、臨床治療、預后評估一直是臨床醫生致力于解決的關鍵問題。隨著現代醫學技術的發展,腫瘤已經進人了個體化治療階段。腫瘤的基因組轉錄組和表觀遺傳特征在探究腫瘤的發

    一文看全!史上59家測序儀公司的“爭霸戰”

      公司:Quantum Biosystems  網站:https://quantumbiosystems.com  簡介:2013年成立,日本。  核心技術:基于電信號的納米孔單分子測序技術  是否屬于單分子測序技術:是  公司產品:暫無推出  描述:采用亞納米間隙和兆分之一安培級電流來直接檢測單

    基因測序技術大升級

      DNA就像是漆黑的夜里螢火蟲發的光,第二代測序技術無法辨別每一只螢火蟲,所以就把上千只螢火蟲放在同一個袋子里,才能收集到它們的光。但第三代技術卻可以辨別每一只螢火蟲,而且可以同時測量很多個DNA片斷。 日前,南方科技大學生物系副教授賀建奎與另外幾名中美科學家聯合在生物醫學雜志Bio

    單分子測序:基因測序不再遙不可及

      如果說二代測序的使命是使成本降低到1000美元/基因組的話,那么三代測序的使命就是使成本降低到100美元/基因組,進一步促進測序發展為臨床的常規檢測技術,在臨床診療上發揮更大的作用。  在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上,美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail

    單分子測序:基因測序不再遙不可及

      在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上,美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail,致力于開發一種不超過1000美元的血液檢測,用于多類型癌癥的早期篩查。這種腫瘤DNA測序的主要目的是在無癥狀的個體中診斷各種各樣的癌癥,從而實現提前預防或治療。  隨著技術的不斷進步,

    關于三代基因測序,你所需要知道的都在這兒!

      一、導讀:  在大部分投資者對“二代測序”(NGS)還沒有搞清技術細節的情況下,“三代測序”(3GS)又火了。  6月17日,醫藥板塊中基因測序相關標的在“三代測序技術獲得重大突破”的新聞影響上出現明顯漲幅,我們也接到較多投資者對相關新聞的背景及觀點的詢問。為此,我們結合各方面資料歸納總結了三代

    謝曉亮院士:單分子技術透視生命之謎

      2012和2013年,由北京大學多個研究團隊合作完成的世界首個高精度人類男性和女性個人遺傳圖譜相關論文相繼發表于《科學》和《細胞》雜志。這一工作采用的單細胞DNA擴增技術MALBAC,與以前的技術相比,該技術將單細胞全基因組測序的精確度大幅度提高,以至于能夠發現個別細胞之間的遺傳差異。  MAL

    北大謝曉亮教授:單分子技術透視生命之謎

    2012和2013年,由北京大學多個研究團隊合作完成的世界首個高精度人類男性和女性個人遺傳圖譜相關論文相繼發表于《科學》和《細胞》雜志。這一工作采用的單細胞DNA擴增技術MALBAC,與以前的技術相比,該技術將單細胞全基因組測序的精確度大幅度提高,以至于能夠發現個別細胞之間的遺傳差

    一文看全!史上59家測序儀公司的“爭霸戰”

      要談測序,首先要向華人生物學家、DNA測序技術的奠基人吳瑞先生致敬。大家大多都聽過桑格,但很少有人知道吳瑞。其實吳瑞早在1968年就發表第一篇論文測定了DNA的堿基組成,1970年的新文章既測定DNA堿基組成又測定出順序,是真正的DNA測序第一人。而在吳瑞先生工作的啟發下,Sanger深入研究,

    【回顧】一代、二代、三代測序技術

      第一代測序技術-Sanger鏈終止法  一代測序技術是20世紀70年代中期由Fred Sanger及其同事首先發明。其基本原理是,聚丙烯酰胺凝膠電泳能夠把長度只差一個核苷酸的單鏈DNA分子區分開來。一代測序實驗的起始材料是均一的單鏈DNA分子。第一步是短寡聚核苷酸在每個分子的相同位置上退火,然后

    基因測序“摩爾定律”初現,“三代測序”要革“二代”的命?

      在“二代測序”(NGS)尚未迎來投資熱潮的情況下,技術突破捷報連連的“三代測序”(3GS)又進入到了投資人的視野中。1986年,第一臺商用基因測序設備正式出現,到第二代測序設備出現,期間間隔了19年時間。而第二代設備問世,到第三代設備的誕生,僅僅用了5年,基因測序設備的更新換代速度正在不斷加快。

    Nature子刊:單分子測序揭示鸚鵡模仿能力

      研究團隊通過單分子測序揭示了鸚鵡基因組的特殊區域,并采用第二代測序技術對單分子測序數據進行了修正。文章發表在7月1日Nature Biotechnology雜志網站上。   如今單分子測序技術炙手可熱,這一新技術能生成超長的測序讀段,“能更容易拼裝基因組的復雜部分,”文章的共同作者Duke

    PacBio單分子測序最新科研動態

      DNA基因測序技術從上世紀70年代起,歷經三代技術后,目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域,并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計,2012年全球基因測序市場的產值已超過百億,按最近幾年增長

    高通量測序技術的原理及各平臺優勢和實踐應用的分析

      隨著人類基因組計劃(human genome project )在2003年順利完成,基因組測序技術取得了長足的進步,這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚,這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以

    高通量測序技術的原理及各平臺優勢和實踐應用的分析

      隨著人類基因組計劃(human genome project )在2003年順利完成,基因組測序技術取得了長足的進步,這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚,這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以

    PNAS、Nature共造基因測序新方法,不“放過”任何堿基

      日前,來自哥倫比亞大學、哈弗大學及美國國家標準技術局的研究人員報道了使用蛋白納米孔陣列實現了單堿基分辨率的實時單分子電子DNA測序,相關結果以《Real-Time Single Molecule Electronic DNA Sequencing by Synthesis Using Polym

    基因檢測市場已紅海第四代技術在前打破上游壁壘是關鍵

      “我們沒有接受他們的收購。原因是他們給出的價格遠遠低估了Illumina的市場份額和自身價值,” Illumina全球副總兼首席官Tristan Orpin在羅氏開價67億美元、第二次對其邀約收購時表示。   羅氏和Illumina 分別是各自領域的老大,前者占據體外診斷市場的三分之一,后者占

    三代基因測序融資頻爆錯誤率、成本高制約商用

      二代測序還未唱罷,三代測序就已登臺。  上周,北京希望組宣布完成由經緯中國和賽富投資領投、清科創投跟投的近億元人民幣A輪融資。12月12日,英國公司Oxford Nanopore Technologies宣布在最近一輪融資中獲得了1億英鎊(合計1.26億美元)融資。  12月13日,第三代基因測

    《自然—生物技術》長文報道中國企業單分子測序系統

      編者按:去年10月,位于深圳的瀚海基因發布了一款應用于臨床檢測的高性價比測序儀原理樣機GenoCare,完全無需擴增,可在單分子水平上直接讀取未經修飾的原始DNA片段,具有廣泛的臨床應用前景。近日,Nature Biotechnology就此撰文進行報道,文章如下: 瀚海基因董事長兼CEO賀建奎

    第三代測序技術:PacBio單分子測序最新科研動態

      DNA基因測序技術從上世紀70年代起,歷經三代技術后,目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域,并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計,2012年全球基因測序市場的產值已超過百億,按最近幾年增長

    PacBio單分子測序最新科研動態

    DNA基因測序技術從上世紀70年代起,歷經三代技術后,目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域,并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計,2012年全球基因測序市場的產值已超過百億,按最近幾年增長速度

    PacBio測序有望掀起下一場遺傳診斷的革命

      從一代到二代再到三代,近年來測序技術的發展勢不可擋。單分子測序也逐漸表現出它的優勢,在測序舞臺上發揮著舉足輕重的作用。近日,比利時魯汶大學和瑞典烏普薩拉大學的研究人員在《Nucleic Acids Research》發表綜述文章,介紹了PacBio SMRT測序技術在臨床中的應用。  文章簡單回

    兩大牛人攜手發布新測序技術

      經濟高效的單分子測序平臺能為人們提供很大的幫助,比如破解完整基因組序列、確定單倍型和鑒定mRNA可變剪接。為此,哥倫比亞大學的車靖岳(Jingyue Ju)和哈佛大學的George Church教授合作開發了基于納米孔的單分子邊合成邊測序(SBS)系統。  他們給四種核苷酸分別標記上不同的聚合物

    解鎖超級細菌耐藥的傳播機制

       細菌耐藥性主要是由于耐藥基因的廣泛傳播引起的,而多重耐藥質粒融合傳播,更使耐藥基因的傳播如魚得水。  “多重耐藥質粒可以攜帶多個耐藥基因,通過接合轉移在不同細菌之間傳播,從而造成耐藥基因的傳播。進一步解析耐藥基因及其傳播機制的關鍵是要獲得完整的質粒圖譜。”揚州大學教授李瑞超與香港城市大學合作,

    第三代基因組測序儀實現單分子速讀

    第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出,第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(脫氧核糖核酸)分子

    第三代基因組測序儀實現單分子速讀

    第三代基因組測序儀實現單分子速讀在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出,第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(脫氧核糖核酸)分子

    謝曉亮:從單細胞研究到高通量測序

      2011年7月第八期《自然—方法學》刊登了Monya Baker撰寫的一篇人物特寫,詳細介紹了在當期發表的論文 “Fluorogenic DNA sequencing in PDMS microreactors”的主要作者哈佛大學謝曉亮教授的高通量測序技術。全文翻譯如下:  在科學界,

    第三代基因組測序儀問世 實現單分子速讀

      據《自然》雜志網站2月8日報道,在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。  研究人員指出,第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(

    第三代基因組測序儀實現單分子速讀

    在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與技術進展大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的太平洋生物科技公司介紹了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個分子式的單分子速讀。研究人員指出,第三代測序儀的關鍵優勢是能夠對單個DNA(脫氧核糖核酸)分子進行測序,而目前市場上的主流測序

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