何川教授Nature發布表觀遺傳學重要發現
幾十年前研究人員就已經知道,對遺傳信息流動至關重要的信使核糖核酸(mRNA)上存在著一種化學修飾。然而直到最近,芝加哥大學的研究人員才通過實驗證實,這種修飾的一個主要功能是控制RNA的壽命和降解,這一過程對于健康細胞發育極為重要。相關研究成果發表在2014年1月2日紙質版的《自然》(Nature)雜志上。 他們所討論的這種mRNA化學修飾被稱之為N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)。芝加哥大學的科學家們在研究中揭示了,mRNA上的m6A修飾如何影響mRNA的半衰期轉而調控細胞蛋白質數量的機制。這一研究發現提供了關于健康功能和諸如肥胖、糖尿病和不孕不育等疾病的一些基礎認識。 領導這一研究的是國際著名的華人化學生物學家、芝加哥大學何川(Chuan He)教授。其主要從事化學生物學、核酸化學和生物學、遺傳學等方面的研究。近年來在甲基化修飾,尤其是5hmC修飾等方面獲得了許多重要的發......閱讀全文
組蛋白甲基化修飾研究再獲突破
日前,復旦大學徐彥輝課題組在組蛋白甲基化修飾研究領域獲得新進展,相關成果發布在《分子細胞》上,該項研究得到了國家自然科學基金面上項目的資助。 組蛋白甲基化修飾是一種非常重要的表觀遺傳修飾,參與調節異染色質形成、X染色體失活、基因印記及DNA的損傷修復等多種生命過程。關于組蛋白去甲基化酶的研究是
組蛋白修飾與DNA甲基化之間的關系
在引起基因沉默的過程中,沉默信號(DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質重新裝配)是如何進行的?誰先誰后?這是一個“雞和蛋”的問題,目前仍處于研究階段,還沒有定論。研究發現DNA甲基化和組蛋白乙酰化是一個相互促進、加強的過程,如許多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG結合蛋白—
最新進展:RNA的甲基化與去甲基化修飾
德國慕尼黑的路德維希-馬克西米利安大學(LMU)研究人員發現了細菌RNA中一種新型的化學修飾形式。顯然,只有當細胞處于應激狀態時,這種修飾才會附著在分子上,并且在恢復過程中會迅速去除。 核糖核酸(RNA)在化學形式上與DNA密切相關,而DNA是所有細胞中遺傳信息的載體。實際上,RNA本身在將遺
亞硫酸氫鹽修飾后測序法檢測甲基化——DNA甲基化
亞硫酸氫鹽修飾后測序法主要可用來檢測甲基化。基化實驗方法原理重亞硫酸鹽使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不變,用PCR擴增(引物設計時盡量避免有CpG,以免受甲基化因素的影響)所需片段,則尿嘧啶全部轉化成胸腺嘧啶。最后對PCR產物進行測序,并且與未經處理的序列比較
生物物理所等在組蛋白甲基化修飾識別方面取得新進展
10月17日,《美國國家科學院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)在線發表了生物大分子國家重點實驗室許瑞明、饒子和課題組和北京生命科學研究所(NIBS)朱冰課題組合作的最新研究成果Distinct mode of
擬南芥RNA核糖甲基化修飾研究方面獲進展
3月30日,中國科學院生物物理研究所研究員葉克窮課題組、北京大學現代農學院博士王玉秋和中科院遺傳與發育研究所研究員李家洋課題組合作在Nucleic Acids Research上發表了題為Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
修飾性甲基化酶的基本信息
中文名稱修飾性甲基化酶英文名稱modification methylase定 義編號:EC 2.1.1.72;EC 2.1.1.37。催化DNA甲基化作用的一種修飾酶。通常甲基化發生在限制性酶切位點的一兩個堿基上,從而保護該酶切位點,使其不被相應的限制性內切酶所切割。應用學科生物化學與分子生物學(
修飾性甲基化酶的基本信息
中文名稱修飾性甲基化酶英文名稱modification methylase定 義編號:EC 2.1.1.72;EC 2.1.1.37。催化DNA甲基化作用的一種修飾酶。通常甲基化發生在限制性酶切位點的一兩個堿基上,從而保護該酶切位點,使其不被相應的限制性內切酶所切割。應用學科生物化學與分子生物學(
組蛋白修飾的意義
通過影響組蛋白與DNA雙鏈的親和性,從而改變染色質的疏松或凝集狀態,或通過轉錄因子與結構基因啟動子的親和性來發揮基因調控作用。這些修飾之間存在協同和級聯效應,更為靈活地影響染色質的結構與功能,通過多種修飾方式的組合發揮其調控功能。
2019年云序RNA甲基化修飾領域文章匯總
感恩有你,一路同行!2019年末,云序生物攜全體員工對一直以來關心和支持公司發展的廣大新老客戶致以最誠摯的問候!光陰如梭,一年轉瞬又將成為歷史,新的一年意味著新的起點、新的機遇、新的挑戰,決心再接再厲,更上一層樓。回首即將過去的2019,云序生物不斷創新,碩果累累;展望2020,任重道遠卻信心倍
表觀新修飾6mA甲基化助力IF飆升(一)
DNA甲基化修飾是表觀遺傳研究的熱點之一,我們通常認為DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),卻不知道隨著測序技術的快速發展,科研者們已經在真核生物中(果蠅 、真菌、萊茵衣藻、秀麗隱桿線蟲等)發現了一種新的DNA甲基化修飾—DNA-6mA甲基化,且DNA-
表觀新修飾6mA甲基化助力IF飆升(二)
3、數據分析標準分析:(1)DNA甲基化富集峰的識別通過高通量測序和生物信息分析,識別甲基化富集的基因組區域,默認p
DNA甲基化——表現遺傳學中DNA的修飾
DNA甲基化是哺乳動物DNA最常見的復制后調節方式之一,是正常發育、分化所必需的,具有重要的生物學意義。在DNA甲基轉移酶 (DNAmethyltransferase,DNMT)的作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(SAM)為甲基供體,可以將甲基基團轉移到基因組DNA胞嘧啶第 5位碳原子(C5)
α微管蛋白三甲基化修飾在神經系統發育過程中作用機制
7月5日,Nature Communications在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心(生物化學與細胞生物學研究所)研究員鮑嵐課題組的最新研究進展——α-TubK40me3 is required for neuronal polarization and migration by p
缺血修飾白蛋白(IMA)簡述
心肌缺血心肌缺血是指心臟的血液灌注減少,導致心臟的供氧減少,心肌能量代謝不正常,不能支持心臟正常工作的一種病理狀態。血壓降低、主動脈供血減少、冠狀動脈阻塞,可直接導致心臟供血減少;心瓣膜病、血粘度變化、心肌本身病變也會使心臟供血減少。另外,心臟氧需求量增加,則引起心臟相對缺血。資料顯示,冠心病是引起
亞硫酸氫鹽修飾后測序法甲基化檢測
第一部分 基因組DNA的提取這一步沒有懸念,完全可以購買供細胞或組織使用的DNA提取試劑盒,如果實驗室條件成熟,自己配試劑提取完全可以。DNA比較穩定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因組DNA應該是完整的。此步重點在于DNA的純度,即減少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取過程中需使用蛋白
亞硫酸氫鹽修飾后測序法檢測甲基化
實驗方法原理重亞硫酸鹽使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不變,用PCR擴增(引物設計時盡量避免有CpG,以免受甲基化因素的影響)所需片段,則尿嘧啶全部轉化成胸腺嘧啶。最后對PCR產物進行測序,并且與未經處理的序列比較,判斷是否CpG位點的甲基化狀態。實驗材料DNA
小小甲基化修飾讓小菜蛾“百毒不侵”
小菜蛾作為一種世界性為害的重大農業害蟲,也是世界上第一個被報道在田間對Bt生物殺蟲劑產生高抗性的農業害蟲。 小菜蛾能在不影響其自身生長發育的前提下對Bt殺蟲劑進化出完美的高抗性。 近日,中國農業科學院蔬菜花卉研究所(以下簡稱蔬菜所)研究員張友軍團隊解析了小菜蛾Bt抗性的適合度代價補償機制,首
亞硫酸氫鹽修飾后測序法檢測甲基化
實驗材料?DNA試劑、試劑盒?NaOH苯二酚(氫醌)亞硫酸氫鈉石蠟油儀器、耗材?離心管恒溫水浴鍋鋁箔紙實驗步驟?1.將約2ugDNA于1.5mlEP管中使用DDW稀釋至50ul;?2.加5.5ul新鮮配制的3M NaOH; ?3. 42℃水浴30min;?水浴期間配制:?4.10mM對苯二酚(氫醌)
RNA-m6A甲基化修飾研究相關研究的應用
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行對我們有任何啟發的話,那么要數對RNA修飾的研究了,此時研究病毒RNA以及其甲基化修飾等功能,顯得比以往任何時候都更加重要。 而這是否意味著要研究病毒RNA本身不同的各種突變體或者表觀遺傳變化如何使這些病毒更靈活和感染力?還是研究從細胞和組織中收集的R
亞硫酸氫鹽修飾后測序法檢測甲基化
DNA甲基化 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 重亞硫酸鹽使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不變,用PCR擴增(引物設計時盡量避免有CpG,以
看表觀新修飾6mA甲基化如何助力IF飆升!
DNA甲基化修飾是表觀遺傳研究的熱點之一,我們通常認為DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),卻不知道隨著測序技術的快速發展,科研者們已經在真核生物中(果蠅 、真菌、萊茵衣藻、秀麗隱桿線蟲等)發現了一種新的DNA甲基化修飾—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m
揭秘神經發育過程中m6ARNA甲基化與組蛋白修飾間的關系1
文章導讀表觀轉錄組學的研究在生物發育和疾病相關性等方面正越來越引起人們的關注。其中m6A修飾的研究是表觀轉錄組學研究的一大熱點。研究表明,m6A標簽在mRNA和lncRNA中超過10,000種,并且m6A參與mRNA的轉錄后修飾也成為基因表達中的一種重要的調控機制。m6A的在基因表達調控方面功能作用
揭秘神經發育過程中m6ARNA甲基化與組蛋白修飾間的關系2
(3)Mettl14缺失導致晚期出生神經元數量減少在P0小鼠中,作者通過特定標記識別相應的神經元亞型,在六個不同的皮層中發現了RGCs分化的神經元。其中,Cux1在晚期出生的神經元中表達,是II-IV的標記物,對標記信號進行定量結果表明相比于CK小鼠而言Mettl14-cKO小鼠中Cux1+的信號值
Nature突破性研究—RNA甲基化新修飾-m1A
說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。日益增多的發表文章、特別是高分文章說明,這個領域現在正在迅速成為大家關注的焦點。RNA甲基化修飾類型很多,目前最熱門的有三種,分別是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN
甲基化檢測方法(亞硫酸氫鹽修飾后測序法)
甲基化是目前的研究熱點,就我所做的一點工作并其中一點心得,與大家分享。希望能夠對大家有所幫助。 第一部分 基因組DNA的提取。 這一步沒有懸念,完全可以購買供細胞或組織使用的DNA提取試劑盒,如果實驗室條件成熟,自己配試劑提取完全可以。DNA比較穩定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因組DNA應
多肽穩定標同位素記技術與甲基化修飾技術
1. 多肽穩定標同位素記技術? ? ?隨著多肽在生物醫藥領域越來越廣泛和深入的應用,標記和修飾性的多肽種類的需求越來越多,質量需求也越來越高。穩定同位素標記(同位素示蹤法)就是其中典型的一種。穩定同位素標記多肽是指用穩定同位素標記的氨基酸合成的多肽。與標準氨基酸相比,同位素標記是指用2H,13C或1
研究發現DNA甲基化修飾精準調控植物生物鐘周期
生物鐘通過協調細胞內代謝和生理活動的節律性以適應由地球自轉而產生的晝夜光溫周期性變化,為植物生長發育提供適應性優勢。在多種真核生物中均已發現組蛋白修飾可參與調控生物鐘周期,但DNA甲基化作為表觀修飾的另一重要類型,是否參與以及如何調控真核生物的生物鐘尚不清楚。 中國科學院植物研究所研究員王雷研
不同RNA-m5C甲基化修飾存在巨大差異
導讀近年來,RNA修飾的研究已成為當今生命科學領域最前沿最熱門的研究方向之一,不斷有CNS的文章問世,m5C RNA修飾的分子機理研究越來越清晰,也不斷有學者探尋如何更全面的獲得貼近真實的m5C修飾的原貌。近期,來自德國的Frank Lyko和Mark Helm團隊在GENOME RESEA
Nature突破性研究—RNA甲基化新修飾-m1A
說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。日益增多的發表文章、特別是高分文章說明,這個領域現在正在迅速成為大家關注的焦點。RNA甲基化修飾類型很多,目前最熱門的有三種,分別是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN