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第一部分 基因組DNA的提取這一步沒有懸念，完全可以購買供細胞或組織使用的DNA提取試劑盒，如果實驗室條件成熟，自己配試劑提取完全可以。DNA比較穩定，只要在操作中不要使用暴力，提出的基因組DNA應該是完整的。此步重點在于DNA的純度，即減少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取過程中需使用蛋白酶K及RNA酶以去除兩者。使用兩者的細節：1、蛋白酶K可以使用滅菌雙蒸水配制成20mg/ml；2、RNA酶必須要配制成不含DNA酶的RNA酶，即在購買市售RNA酶后進行再處理，配制成10mg/ml。否則可能的后果是不僅沒有RNA，連 DNA也被消化了。兩者均于-20℃保存。驗證提取DNA的純度的方法有二：1、紫外分光光度計計算OD比值；2、1%-1.5%的瓊脂糖凝膠電泳。第二種方法優于第一種方法，這種方法完全可以明確所提基因組DNA的純度，并根據Marker的上樣量估計其濃度，以用于下一步的修飾。第二部分 亞硫酸氫鈉修飾基因組DNA如......閱讀全文
近年來涌現出不少DNA甲基化的檢測技術，少說也有十幾種。大致可以分為兩類：特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析，后者也稱為甲基化圖譜分析(methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。一、特異位點的甲基化檢測1. 甲基化特異性PCR(MS-PCR)這種方法經濟實用，
近年來涌現出不少 DNA 甲基化的檢測技術，少說也有十幾種。大致可以分為兩類：特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析，后者也稱為甲基化圖譜分析 (methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。 特異位點的甲基化檢測 甲基化特異性 PCR (MS-PCR)
近年來涌現出不少DNA甲基化的檢測技術，少說也有十幾種。大致可以分為兩類：特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析，后者也稱為甲基化圖譜分析(methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。一、特異位點的甲基化檢測1. 甲基化特異性PCR(MS-PCR)這種方法經濟實用，
主要應用:應用實時熒光PCR技術進行快速準確的DNA甲基化分析DNA甲基化是表觀遺傳學的重要研究內容之一，它可以在轉錄水平抑制基因的表達。具體的過程是在胞嘧啶－鳥嘧啶（CpG二核苷酸）的5位碳原子上添加了一個額外的甲基團，形成5－甲基胞嘧啶。CpG二核苷酸密度較高的區域在人體基因組中呈非隨機分布于，
【1】Nature：開發基于DNA包裝的新型血檢可檢測多種癌癥 doi：10.1038/s41586-019-1272-6 近日，來自約翰霍普金斯大學Kimmel癌癥中心的研究人員開發了一種簡單的新型血液檢測方法，通過發現癌細胞脫落的DNA碎片在血液中循環的獨特模式，可以檢測七種不同類型癌癥
本文中，小編整理了多篇研究報道，共同聚焦科學家們在測序研究領域取得的新成就，與大家一起學習！圖片來源：Nature 【1】Nature：中國科學家使用單細胞測序來揭示人類胚胎植入的秘密 doi：10.1038/s41586-019-1500-0 近日，中國多家機構的一個研究團隊利用單細胞測
DNA甲基化是基因組DNA的一種主要表觀遺傳修飾形式。近年來，大量研究表明DNA甲基化修飾對于維持正常細胞功能、傳遞基因組遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生，起著至關重要的作用，由此甲基化研究成為表觀遺傳學，乃至生命科學研究的熱點領域。那么如何檢測單個基因或者全基因組的甲基化水平或者甲基化位點呢？當
亞硫酸氫鹽修飾后測序法主要可用來檢測甲基化。基化實驗方法原理重亞硫酸鹽使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，用PCR擴增（引物設計時盡量避免有CpG，以免受甲基化因素的影響）所需片段，則尿嘧啶全部轉化成胸腺嘧啶。最后對PCR產物進行測序，并且與未經處理的序列比較