蛋白質一級結構的測定方法(二)
2)末端分析 其方法較多,這里我們只介紹較常用的幾種。 (1)N-末端測定 A.二硝基氟苯法(FDNB,DNFB):1945年Sanger提出此方法,是他的重要貢獻之一。 DNP-氨基酸用有機溶劑抽提后,通過層析位置可鑒定它是何種氨基酸。Sanger用此方法測定了胰島素的N末端分別為甘氨酸及苯丙氨酸。 B.氰酸鹽法:1963年Stank及Smyth介紹了一種測定N末端的新方法,步驟如下: 由于乙內酰脲氨基酸不帶電荷,因此可用離子交換層析法將它與游離氨基酸分開,分離所得的乙內酰脲氨基酸再被鹽酸水解,重新生成游離的氨基酸,鑒別此氨基酸即可了解N-末端是何種氨基酸。 C.二甲基氨基萘磺酰氯法:1956年Hartley等報告了一種測定N-末端的靈敏方法,采用1-二甲基氨基萘-5-磺酰氯,簡稱丹磺酰氯。它與游離氨基末端作用,方法類似于Sanger的DNFB法,產物是磺酰胺衍生物。 丹磺酰鏈酸具有......閱讀全文
關于蛋白質結構的一級結構介紹
蛋白質的一級結構(primary structure)就是蛋白質多肽鏈中氨基酸殘基的排列順序(sequence),也是蛋白質最基本的結構。它是由基因上遺傳密碼的排列順序所決定的。各種氨基酸按遺傳密碼的順序,通過肽鍵連接起來,成為多肽鏈,故肽鍵是蛋白質結構中的主鍵。 迄今已有約一千種左右蛋白質的
蛋白質一級結構介紹臨床生化
蛋白質一級結構介紹:蛋白質的一級結構就是蛋白質多肽鏈中氨基酸殘基的排列順序,也是蛋白質最基本的結構。它是由基因上遺傳密碼的排列順序所決定的。各種氨基酸按遺傳密碼的順序,通過肽鍵連接起來,成為多肽鏈,故肽鍵是蛋白質結構中的主鍵。迄今已有約一千種左右蛋白質的一級結構被研究確定,如胰島素,胰核糖核酸酶、胰
蛋白質一級結構介紹生化檢驗
蛋白質一級結構介紹:蛋白質的一級結構就是蛋白質多肽鏈中氨基酸殘基的排列順序,也是蛋白質最基本的結構。它是由基因上遺傳密碼的排列順序所決定的。各種氨基酸按遺傳密碼的順序,通過肽鍵連接起來,成為多肽鏈,故肽鍵是蛋白質結構中的主鍵。迄今已有約一千種左右蛋白質的一級結構被研究確定,如胰島素,胰核糖核酸酶、胰
蛋白質的一級結構的特點
一級結構是指蛋白質肽鏈中氨基酸的排列順序,也稱為蛋白質的化學結構。它決定了蛋白質的二、三、四級結構。
蛋白質一級結構的測定方法(二)
?? 2)末端分析 其方法較多,這里我們只介紹較常用的幾種。 (1)N-末端測定 A.二硝基氟苯法(FDNB,DNFB):1945年Sanger提出此方法,是他的重要貢獻之一。 DNP-氨基酸用有機溶劑抽提后,通過層析位置可鑒定它是何種氨基酸。Sanger用此方法測定了胰島素的N末端分別為甘
蛋白質一級結構的測定方法(一)
?? 研究蛋白質的一級結構從確定組成蛋白質的單元結構棗氨基酸算起,已有150年的悠久歷史,直到1955年,Sanger首次闡明胰島素的氨基酸排列順序,為研究蛋白質的一級結構開辟了道路。這在分子生物學的發展進程中是一個重要突破。目前關于核酸的一級結構研究,由于Sanger等發明了加減法,可以得到了突
蛋白質一級結構的測定方法(三)
?? 2)酶解法 酶水解法較化學法具有更多的優越性,使用也更廣泛。因其具有較高專一性,而且水解產率較高,所以可以選擇各種不同專一性的酶進行專一性的斷裂。 常用的酶有胰蛋白酶、糜蛋白酶、胃蛋白酶和嗜熱菌蛋白酶。 胰蛋白酶專一斷裂Lys,Arg的羧基側肽鍵,如果對Lys,Arg,CysH進行化學修
cDNA-法推斷蛋白質的一級結構實驗
實驗方法原理 將 SDS-PAGE 上的蛋白質樣品從凝膠上分離出來是很困難的,目前流行的方法是將蛋白質電印跡(electrobloting) 至 PVDF 膜上,直接進行序列分析或直接在膜上進行酶解,后者稱為原位分析。實驗材料 蛋白質樣品試劑、試劑盒 PVP-40HAC酶解緩沖液蒸餾水儀器、耗材 E
cDNA-法推斷蛋白質的一級結構實驗
一、蛋白質的純化和肽段氨基酸序列分析 二、引物的設計 三、用 PCR 擴增目的 cDNA 片段 四、cDNA 的克隆及測序 五、cDNA 序列的分析及蛋白質一級結構的確定 ? ? ? ?
蛋白質的一級結構及空間結構主要取決于結構基
一、氨基酸是構成蛋白質的基本化學成分 有20種由遺傳密碼所決定的標準氨基酸,根據側鏈的化學性質,可分為疏水氨基酸〔Ala(A),Val(V),Le u(),lie(互),Phe(F),Pro(P)和Met(M)」、帶電氨基酸[Asp(D),Gin(E),Lys(K)和Arg(R)]、極性氨基酸[
cDNA-法推斷蛋白質的一級結構實驗1
蛋白質和多肽是由 20 種氨基酸按照一定的順序通過肽鍵連接成一長鏈。再通過鏈內、鏈間的離子鍵、疏水作用等多種作用力進行折疊卷曲形成一定構象而產生其特異性的活性作用。蛋白質的一級結構即氨基酸的排列順序,決定了蛋白質的高級結構及功能。因此。測定蛋白質的一級結構是進行蛋白質結構與功能研究中不可缺少的部分。
cDNA-法推斷蛋白質的一級結構實驗2
二、引物的設計實驗步驟在得到蛋白質部分氨基酸序列的基礎上通常采用設計簡并性或偏性引物,用錨定 PCR 的方法來獲得該蛋白質的 cDNA 部分或全長序列。現在許多公司推出的 RACE(rapidly amplication cDNA ends)系統的技術核心便是如此。簡并性引物的設計一般遵循以下幾個原
cDNA-法推斷蛋白質的一級結構實驗3
實驗方法原理PCR(polymerase chain reaction)作為一種常用的分子生物學實驗手段,已非常成熟。各個公司推出了各種高保真和高效率的聚合酶及成套的 PCR 試劑盒,使得 PCR 技術簡便而且有效。實驗步驟1. 方法的選擇:對于兩端序列已知的情況,可根據兩端序列設計引物,選用普通的
cDNA-法推斷蛋白質的一級結構實驗4
實驗材料cDNA試劑、試劑盒載體感受態細菌儀器、耗材核酸自動測序儀實驗步驟1. cDNA 片段與載體進行聯接反應(多在 4℃下進行低溫聯接);2. 使用兩次 CaCl2?沉淀法制成的感受態細菌(如 DH5a 或 Jm 109 等菌株),進行轉化;3. 結合載體抗生素抗性特點,進行菌落的藍白斑篩選;4
cDNA-法推斷蛋白質的一級結構實驗5
實驗材料cDNA實驗步驟1. 首先是對所得 cDNA 進行同源性的比較。通常是在 NCBl 的 GenBank 數據庫中來完成,利用 Blast 程序,比較其與已知基因的同源性。2. 判斷是否為完整的 cDNA 序列:如有無 polyA,有無起始和終止密碼尋找開放性閱讀框架(ORF,open rea
什么是DNA的一級結構?
DNA的一級結構,是指4種核苷酸的連接及其排列順序,表示了該DNA分子的化學構成。DNA的一級結構決定其高級結構,如B-DNA中多G-C區易形成左手螺旋DNA(Z-DNA),而反向重復的DNA片段易出現發夾結構等。這些高級結構又決定和影響著一級結構的功能。
轉運RNA的一級結構的介紹
自1965年R.W.霍利等首次測出酵母丙氨酸tRNA的一級結構即核苷酸排列順序到1983年已有200多個tRNA(包括不同生物來源、不同器官、細胞器的同功受體tRNA以及校正tRNA)的一級結構被闡明。按照A-U、G-C以及G-U堿基配對原則,除個別例外。
轉移核糖核酸的一級結構介紹
自1965年R.W.霍利等首次測出酵母丙氨酸tRNA的一級結構即核苷酸排列順序到1983年已有200多個tRNA(包括不同生物來源、不同器官、細胞器的同功受體tRNA以及校正tRNA)的一級結構被闡明。按照A-U、G-C以及G-U堿基配對原則,除個別例外。
簡述轉移核糖核酸的一級結構和二級結構
一級結構 自1965年R.W.霍利等首次測出酵母丙氨酸tRNA的一級結構即核苷酸排列順序到1983年已有200多個tRNA(包括不同生物來源、不同器官、細胞器的同功受體tRNA以及校正tRNA)的一級結構被闡明。按照A-U、G-C以及G-U堿基配對原則,除個別例外, 二級結構 tRNA分子
脫氧核糖核酸的分子結構一級結構的介紹
是指構成核酸的四種基本組成單位——脫氧核糖核苷酸(核苷酸),通過3',5'-磷酸二酯鍵彼此連接起來的線形多聚體,以及其基本單位-脫氧核糖核苷酸的排列順序。 每一種脫氧核糖核苷酸由三個部分所組成:一分子含氮堿基+一分子五碳糖(脫氧核糖)+一分子磷酸根。核酸的含氮堿基又可分為四類:
絲裂原活化蛋白激酶的一級結構介紹
MKK都是通過雙位點,即蘇氨酸(T)和酪氨酸(Y)同時磷酸化激活MAPK。這兩個磷酸化位點中間被一氨基酸隔開,構成三肽基TXY。不同的MAPK亞族成員,其雙磷酸化位點之間的X殘基不同,但是其各個亞族都具有標準的12個保守亞區,這些亞區是區分真核細胞蛋白激酶超家族的標志之一。MAPK家族成員之間具
關于多順反子一級結構與功能的關系介紹
原核生物mRNA一般5'端有一段不翻譯區,稱前導順序,3'端有一段不翻譯區,中間是蛋白質的編碼區,一般編碼幾種蛋白質。如大腸桿菌乳糖操縱子mRNA編碼3條多肽鏈;色氨酸操縱子mRNA編碼5條多肽鏈。也有單順反子形式的細菌mRNA,如大腸桿菌脂蛋白mRNA。原核生物mRNA分子中一
原核生物mRNA一級結構與功能的關系
原核生物mRNA一級結構與功能的關系:原核生物mRNA一般5'端有一段不翻譯區,稱前導順序,3'端有一段不翻譯區,中間是蛋白質的編碼區,一般編碼幾種蛋白質。如大腸桿菌乳糖操縱子mRNA編碼3條多肽鏈;色氨酸操縱子mRNA編碼5條多肽鏈。也有單順反子形式的細菌mRNA,如大腸桿菌脂蛋白
關于多肽鏈的一級結構加工修飾介紹
⑴N端甲酰蛋氨酸或蛋氨酸的切除:N端甲酰蛋氨酸是多肽鏈合成的起始氨基酸,必須在多肽鏈折迭成一定的空間結構之前被切除。 其過程是: ① 去甲酰化; ② 去蛋氨酰基。 ⑵氨基酸的修飾:由專一性的酶催化進行修飾,包括糖基化、羥基化、磷酸化、甲酰化等。 ⑶二硫鍵的形成:由專一性的氧化酶催化,將
關于蛋白質結構的結構種類概述
蛋白質分子是由氨基酸首尾相連縮合而成的共價多肽鏈,但是天然蛋白質分子并不是走向隨機的松散多肽鏈。每一種天然蛋白質都有自己特有的空間結構或稱三維結構,這種三維結構通常被稱為蛋白質的構象,即蛋白質的結構。 蛋白質的分子結構可劃分為四級,以描述其不同的方面: 一級結構:組成蛋白質多肽鏈的線性氨基酸
關于蛋白質結構的結構測定介紹
專門存儲蛋白質和核酸分子結構的蛋白質數據庫中,接近90%的蛋白質結構是用X射線晶體學的方法測定的。X射線晶體學可以通過測定蛋白質分子在晶體中電子密度的空間分布,在一定分辨率下解析蛋白質中所有原子的三維坐標。大約9%的已知蛋白結構是通過核磁共振技術來測定的。該技術還可用于測定蛋白質的二級結構。除了
關于蛋白質結構的結構預測介紹
測定蛋白質序列比測定蛋白質結構容易得多,而蛋白質結構可以給出比序列多得多的關于其功能機制的信息。因此,許多方法被用于從序列預測結構。 一、二級結構預測 二、三級結構預測 同源建模:需要有同源的蛋白三級結構為基礎進行預測。 Threading法。“從頭開始”(Ab initio):只需要蛋
蛋白質根據蛋白質結構進行分類
纖維蛋白(fibrous protein):一類主要的不溶于水的蛋白質,通常都含有呈現相同二級結構的多肽鏈許多纖維蛋白結合緊密,并為單個細胞或整個生物體提供機械強度,起著保護或結構上的作用。球蛋白(globular protein):緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的一類蛋白質,許多都溶于水
蛋白質立體結構原則
1.由于C=O雙鍵中的π電子云與N原子上的未共用電子對發生“電子共振”,使肽鍵具有部 分雙鍵的性質,不能自由旋轉。 ? 2.與肽鍵相連的六個原子構成剛性平面結構,稱為肽單元或肽鍵平面。但由于α-碳原子與其他原子之間均形成單鍵,因此兩相鄰的肽鍵平面可以作相對旋轉。此單鍵的旋
蛋白質整體的結構
蛋白質是以氨基酸為基本單位構成的生物大分子。蛋白質分子上氨基酸的序列和由此形成的立體結構構成了蛋白質結構的多樣性。蛋白質具有一級、二級、三級、四級結構,蛋白質分子的結構決定了它的功能。 一級結構:蛋白質多肽鏈中氨基酸的排列順序,以及二硫鍵的位置。 二級結構:蛋白質分子局區域內,多肽