肖銳教授揭示RNA結合蛋白與轉錄因子具有廣泛的關聯作用
越來越多的證據表明，轉錄控制和染色質活性在很大程度上涉及調節類的RNA，這可能會產生特定的RNA結合蛋白（RBPs）。盡管多個RBP與轉錄控制有關，但目前尚不清楚RBP如何直接作用于染色質。 2019年6月27日，加州大學圣地亞哥分校付向東及武漢大學醫學研究院肖銳共同通訊在Cell 在線發表題為“Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-Based Regulation of Transcription”的研究論文，該研究進行大規模RBP ChIP-seq分析，揭示了人類基因組中活躍染色質區域中廣泛的RBP存在。與轉錄因子（TFs）一樣，RBP也顯示出對基因組中熱點的強烈偏好，特別是基因啟動子，其中它們的關聯通常與轉錄輸出相關。 通過分析揭示了TF和RBP之間廣泛的共同關聯，例如YY1（已知的RNA依賴性TF）和RBM25（參與剪接調節......閱讀全文
肖銳教授揭示RNA結合蛋白與轉錄因子具有廣泛的關聯作用
越來越多的證據表明，轉錄控制和染色質活性在很大程度上涉及調節類的RNA，這可能會產生特定的RNA結合蛋白（RBPs）。盡管多個RBP與轉錄控制有關，但目前尚不清楚RBP如何直接作用于染色質。 2019年6月27日，加州大學圣地亞哥分校付向東及武漢大學醫學研究院肖銳共同通訊在Cell 在線發表題
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。 實驗材料 N-表達質粒 E.coi
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編：鄭曉飛。實驗方法原理一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒儲
抑制細菌轉錄終止檢測技術篩選RNA結合蛋白實驗
實驗方法原理 一種通過篩選重組 cDNA 文庫研究多肽與 RNA 相互作用的細菌抗轉錄終止檢測系統。實驗材料 N-表達質粒E.coil N567 感受態細菌試劑、試劑盒 儲存液緩沖液儀器、耗材 蛋白胨培養基蛋白胨平板N-表達質粒組合文庫培養板實驗步驟 ―、材料與設備1. 通過比較 β-半乳糖苷酶表達
精確轉錄因子結合位點繪圖
“掌握轉錄因子活動控制高等生物發育的基本原理非常有用，”紐約大學生物學系教授Stephen Small說。“更具體地講，這項機理的發現為由于轉錄因子受到干擾的突變基因導致胚胎發育深層破壞和一系列疾病提供了一個潛在的治療途徑。” 這項研究發表于《Genes & Development》，參與研究
轉錄因子定義和結合位點
定義人類金屬巰基因調節區轉錄因子(transcription factor)是一群能與基因5`端上游特定序列專一性結合，從而保證目的基因以特定的強度在特定的時間與空間表達的蛋白質分子。結合位點轉錄因子的結合位點（transcription factor binding site，TFBS）是轉錄因子
環狀RNA結合功能蛋白
環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子，不同于對其豐富的表達譜研究，環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制，部分circRNA可競爭性結合miRNA，解除miRNA對靶基因的抑制作用，上調靶基因的表達。其實，環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白，分別在轉錄前
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子轉錄因子分子量(kD)功能TBP30與TATA盒結合TFⅡ-B33介導RNA聚合酶Ⅱ的結合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35穩定TFⅡ-D的結合TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結合
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子轉錄因子分子量（kD）功能TBP30與TATA盒結合TFⅡ-B33介導RNA聚合酶Ⅱ的結合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35穩定TFⅡ-D的結合TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結合
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本轉錄因子轉錄因子分子量(kD)功能TBP30與TATA盒結合TFⅡ-B33介導RNA聚合酶Ⅱ的結合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35穩定TFⅡ-D的結合TFⅡ-I120促進TFⅡ-D的結合
人轉錄因子GATA結合蛋白3(GATA3)ELISA試劑盒
人轉錄因子GATA結合蛋白3(GATA-3)ELISA試劑盒?(用于血清、血漿、細胞培養上清液和其它生物體液內)?原理本實驗采用雙抗體夾心?ABC-ELISA法。用抗人?GATA-3?單抗包被于酶標板上，標準品和樣品中的?GATA-3與單抗結合，加入生物素化的抗人GATA-3，形成免疫復合物連接在板
轉錄因子的結合位點的相關介紹
轉錄因子的結合位點（transcription factor binding site，TFBS）是轉錄因子調節基因表達時，與基因模板鏈結合的區域。按照常識，轉錄因子（transcription factor）的結合位點一般應該分布在基因的前端，但是，新的研究發現，人21和22號染色體上，只有2
誘騙RNA結合蛋白不與癌細胞中的天然RNA分子結合
科學家也開始變得“狡猾”，開始用欺騙來對抗癌癥。希伯萊大學的研究人員發明了一種誘餌，可以阻止癌癥用于轉移的RNA結合蛋白。 近年來，RNA結合蛋白在腫瘤生長中起著重要作用已經成為不爭的事實。這些蛋白在所有細胞中都很活躍，尤其是在癌細胞中，它們與RNA分子結合，加速癌細胞的生長。不幸的是，目前還
信使RNA的啟動子和轉錄因子
一定義：酶識別、結合、開始轉錄的一段DNA序列。強啟動子2秒鐘啟動一次轉錄，弱啟動子10分鐘一次。 二原核生物：大腸桿菌在起點上游約－10堿基對處有保守序列TATAAT，稱為pribnow box，有助于局部解鏈。在其上游還有TTGACA，稱為－35序列，提供RNA聚合酶識別的信號。 三真核
推動癌癥發展的RNA結合蛋白
最近，一項關于白血病細胞基因表達的研究，發現了一種RNA結合蛋白，在推動癌癥的發展過程中起著重要的作用。該蛋白通常活躍在胎兒組織，在成年人體內是關閉的，但它在一些癌細胞中被再度活化。這種表達模式使它成為抗癌藥物的一個有吸引力的靶標，因為阻斷它的活動，不太可能造成嚴重的副作用。 這項新的研究，發
我國學者發現轉錄因子Sox2可與RNA結合調控體細胞重編程
國際學術期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）在線發表了中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院鮑習琛課題組、香港大學Ralf Jauch課題組和中山大學醫學院（深圳）侯琳琳團隊共同合作的成果“Concurrent binding to DNA and RNA facilit
RIP技術（RNA結合蛋白免疫沉淀）
RIP技術（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA結合蛋白免疫沉淀），是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具，能幫助我們發現miRNA的調節靶點。RIP這種新興的技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合
RNA－反轉錄
? ? ? ? ? ? 實驗材料 poly(A)+RNA 反轉錄酶 鼠源反轉酶 ?或禽源反轉錄酶 試劑、試劑盒 oligo
RNA－反轉錄
?實驗材料 poly(A)+RNA反轉錄酶鼠源反轉酶 或禽源反轉錄酶試劑、試劑盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin實驗步驟 一材料與設備1)p
人轉錄因子GATA結合蛋白3(GATA3)ELISA試劑盒使用說明
原理本實驗采用雙抗體夾心 ABC-ELISA法。用抗人 GATA-3 單抗包被于酶標板上，標準品和樣品中的 GATA-3與單抗結合，加入生物素化的抗人GATA-3，形成免疫復合物連接在板上，辣根過氧化物酶標記的Streptavidin與生物素結合，加入底物工作液顯藍色，最后加終止液硫酸，在450
RNA的轉錄和逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
RNA復制、轉錄與逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
玉米轉錄因子和籽粒重要轉錄因子互作協同調控醇溶蛋白
玉米（Zea mays）原產于墨西哥和中美洲地區，是一種由古印第安人（Indians）在數千年前利用野生墨西哥類蜀黍（Euchlaenamexicana）（現存在于墨西哥和尼加拉瓜）雜交而來的品種。但是，作為一類重要的糧食作物，天然玉米籽粒在其營養價值上卻有著重要的缺陷。根據已有的文獻報道，玉米籽粒
玉米轉錄因子ZmMADS47和籽粒轉錄因子Opaque2－調控醇溶蛋白
玉米（Zea mays）原產于墨西哥和中美洲地區，是一種由古印第安人（Indians）在數千年前利用野生墨西哥類蜀黍（Euchlaenamexicana）（現存在于墨西哥和尼加拉瓜）雜交而來的品種。但是，作為一類重要的糧食作物，天然玉米籽粒在其營養價值上卻有著重要的缺陷。根據已有
RNA－大量轉錄合成
? ? ? ? ? ? 實驗材料 模板 DNA 或質粒 試劑、試劑盒 TE ? TE 飽和酚 ? 氯仿
RNA－大量轉錄合成
實驗材料 模板 DNA 或質粒試劑、試劑盒 TE TE 飽和酚 氯仿異內醇 3mol LNaAc 無水乙醇 5X 轉錄緩沖液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 異戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸銨 無水乙醇 乙醇實驗
3.5－RNA－反轉錄
利用 RNA 模板通過反轉錄獲得 DNA,進而復制和感染細胞實驗材料poly(A)+RNA反轉錄酶鼠源反轉酶 或禽源反轉錄酶試劑、試劑盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT
RNA－標準轉錄反應
實驗材料 模板 DNA 或質粒試劑、試劑盒 TE 異丙醇 3mol LNaAc 無水乙醇 5×轉錄緩沖液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-飽和的酚氯仿異戊醇 DN
RNA－標準轉錄反應
? ? ? ? ? ? 實驗材料 模板 DNA 或質粒 試劑、試劑盒 TE 異丙醇 3mol LNaAc
Cell：弱結合的轉錄因子在協同作用時效果更好
生物工程學家可以定制細胞基因組，從而構建出抗擊疾病的“細胞療法”，但他們發現很難設計出能夠激活經過生物工程改造的基因而不會偶爾激活細胞中的某些天然基因的專門激活蛋白：轉錄因子（transcription factor）。 在一項新的研究中，來自美國萊斯大學、波士頓大學、哈佛醫學院、達特茅斯學院