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  • 基因缺失和重復揭示了我們基因變化的“故事情節”

    通過在數目極大的人口中仔細觀察拷貝數的差異,研究人員如今對選擇過程會如何影響全球各地人口的基因組有了較好的了解。拷貝數差異指的是基因組間的結構差異,它是在DNA的大塊部分被復制或刪除時發生的。它會涉及含有多個基因的基因組區域或重要的調節區域。由于這個原因,研究人員推測這些變化是受到選擇的,但對于在我們的基因組內消除這些變化或者維持這些變化的作用力仍然不甚了解。為了更好地理解全球范圍內的這些模式,Peter Sudmant和同事對來自125個人群的236個個體的基因組中的拷貝數變異進行了分析。通過這一分析,研究人員能夠確定祖先模式以及來自遠古人種的混合基因組的保持;大洋洲人群保留了大量的源自丹尼索瓦人世系的復制拷貝。正如研究人員所料想的那樣,與非-非洲人群相比,非洲人更可能顯示祖先基因組序列的證據,因為非-非洲人群經歷了更多的種群瓶頸,從而導致了較低的多元化水平。與非洲人群相比,這些非-非洲人群的瓶頸事件還導致了較少的基因缺失......閱讀全文

    首張非洲人全基因組圖譜問世

    據《自然》雜志報道,2月6日,美國加州Illumina生物技術公司宣布,他們首次對一位非洲男子進行了完整的基因組測序。?在此之前,科學家已經對兩位白人男性(James Watson和Craig Venter)和一位中國男性進行了全基因組測序,但從未對非洲人進行研究。因此,這位匿名的尼日利亞約魯巴人男

    首個古代非洲人基因組研究出現錯誤

       近日,論文作者發布了一份報告,就他們在去年10月發表于《科學》雜志的論文中出現的錯誤作出了解釋。該論文描述的是一名在4500年前來自埃塞俄比亞的男性的基因組。這也是來自非洲的首個完整的古代人類基因組。這名男性被命名為“莫塔洞穴”,即他的遺骸被發現的地方。  盡管最早的人類離開非洲是在約10萬年

    復旦等國際團隊發表非洲人群全基因組測序新成果

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495156.shtm 北京時間3月3日,國際頂尖期刊《細胞》(CELL)以“全基因組測序揭示非洲人群的復雜演化歷程與對環境的適應性進化(Whole-genome sequencing reveals

    科學家們在非洲人種基因組中找到了肥胖特異性基因

      在最近的一項研究中,來自美國NIH,國家人類基因組研究所的研究者們首次分析了非洲人以及非洲裔美國人的基因組序列,發現其中有百分之一的人群攜帶有患肥胖癥的基因在,這一結果能夠解釋為什么肥胖癥總是具有家族性的特征。相關結果發表在最近一期的《obesity》雜志上。  根據這一研究,攜帶SEMA4D基

    基因序列揭示非洲人早期歷史

      人類在非洲的早期歷史正日益成為人們關注的焦點。一項新的研究對源自這片大陸的十幾個族群的180個基因組進行了研究,其中一些基因組之前從未被分析過。  初步研究結果表明,在4萬多年前,其中兩個族群(桑人和巴卡人)的規模相當于當時其他族群的兩倍,并且這兩個族群生活在中東部非洲或南部非洲。  研究人員在

    基因缺失和重復揭示了我們基因變化的“故事情節”

      通過在數目極大的人口中仔細觀察拷貝數的差異,研究人員如今對選擇過程會如何影響全球各地人口的基因組有了較好的了解。拷貝數差異指的是基因組間的結構差異,它是在DNA的大塊部分被復制或刪除時發生的。它會涉及含有多個基因的基因組區域或重要的調節區域。由于這個原因,研究人員推測這些變化是受到選擇的,但對于

    非洲首個大型人類基因組學研究揭示高水平遺傳多樣性

      南非科技部資助的“南部非洲人類基因組計劃(SAHGP)”,順利完成了對24名來自不同民族語言個體的全基因組測序,證實非洲人群存在高水平的遺傳多樣性,研究結果發表在《自然-通訊》期刊上。   該計劃是非洲首個由政府資助開展的人類基因組學研究,旨在揭示南部非洲人群的獨特遺傳特征,全方位發掘各類人群

    非洲首個大型人類基因組學研究揭示高水平遺傳多樣性

       南非科技部資助的“南部非洲人類基因組計劃(SAHGP)”,順利完成了對24名來自不同民族語言個體的全基因組測序,證實非洲人群存在高水平的遺傳多樣性,研究結果發表在《自然-通訊》期刊上。   該計劃是非洲首個由政府資助開展的人類基因組學研究,旨在揭示南部非洲人群的獨特遺傳特征,全方位發掘各類人群

    七年磨劍,揭示非洲人群演化歷程與適應性進化

      現代人類起源于非洲,相比于其他大陸,現代人類在非洲居住時間最長,并且在遷徙,融合和對環境適應性進化過程中形成了超過3000個民族和2100種語言。目前非洲人群不僅具有世界上最豐富的遺傳多樣性和表型多樣性,且現代人類近1/3的語言都在非洲。  然而,目前的遺傳學和基因組學研究中,只有不到3%的樣本

    DNA測序揭示早期人類如何在非洲擴散

      關于古代人類DNA的研究并不是一項享有平等機會的努力。過去10年間,早期歐洲人和亞洲人的部分基因組被測序了上百次,歐亞歷史也在這個過程中得以改寫。然而,由于基因材料在溫暖、潮濕的氣候中衰變得非常迅速,因此時至今日,科學家僅測序了一種古代非洲人類的DNA。  近日,在美國得克薩斯州奧斯丁舉行的分子

    8月7日《科學》雜志精選

       富裕國家將來可能面臨更多洪災影響  現在,許多富裕國家能夠通過使脆弱性降低的投資在某種程度上減輕它們的三角洲洪災風險,但一個陳述基礎結構成本不斷高漲的模型表明,這一降低風險措施可能不具有長期的可持續性。最終,富裕國家在將來可能經受與發展中國家相似程度的洪災壓力。為了計算某特定三角洲人群遭受洪災

    非洲基因組學研究有助制定精準公共衛生政策

      過去5年,國際基金組織已經投資了超過1億美元的項目來推動非洲基因遺傳學研究,有望借此改善對非洲人以及在歐洲和美洲的非洲人后裔的治療手段。現在,第一輪7000萬美元資助發放完畢后,英美兩國共同發起的“非洲人類遺傳與健康計劃項目”第二輪6400萬美元項目資金正在接受申請。  雖然有人認為,這筆錢應該

    Cell:全基因組測序揭示人類遺傳多樣性

      遺傳的歷史就書寫在現代非洲人的DNA中,但還需要一些調查工作來對其進行注釋。在即將出現在8月3號《細胞》(Cell)雜志封面上的一篇報道中,賓夕法尼亞大學的遺傳學家們和他們的同事對分屬三個不同狩獵者(hunter-gatherer)群體的15個非洲人的完全測序基因組進行了分析,并破解了一些必定涉

    基因組研究揭示人類大遷移之謎

      《自然》日前發表的3篇論文報告了來自全球逾280個不同群體的個體高質量基因組。3項研究描述了通常研究覆蓋不足的區域的基因多樣性,共同為現代人類走出非洲的大遷移提供了新的認知。  人類種群由演化搖籃非洲向歐洲、亞洲和大洋洲擴張的時間和路線廣受熱議。一些模型顯示,現今所有非非洲人的祖先都可追溯至單一

    我科學家在人類個體基因組研究領域又取得一項重要成果

    我科學家采用新一代測序技術為人類基因組結構變異檢測提供新方法  我國科學家在人類個體基因組研究領域又取得一項重要成果。7月25日,由深圳華大基因研究院主導完成的“基于全基因組組裝數據檢測人類基因組結構變異(SVs)”的研究成果在國際著名學術雜志《自然·生物技術》上在線發表。   近年來,人類基因組

    誰在先?“雞基因組”和“雞蛋基因組”

    是先有雞還是先有雞蛋?這個問題相當惱人,恐怕很難說清楚。現在,研究人員回答了與這個問題一樣惱人的問題:是人類基因組中的成千上萬的長重復DNA片段中,那個是第一個產生的?那些被復制了? 這個答案發表在10月7日的《自然·遺傳學》雜志上。該研究給出了人類基因組中DNA重復片段復制的第一個進化證據,這種

    科學家發現阿爾泰尼安德特人含有早期現代人類基因

      日前,一個由德國、美國和中國等國家研究人員組成的國際研究小組利用幾種不同的遺傳分析方法,確定大約10萬年前尼安德特人和現代人之間發生了基因交流事件,早于先前記錄的其它此類事件。相關研究于2月17日發表在《自然》雜志。中國科學院古脊椎動物與古人類研究所研究員付巧妹也是取得這一研究成果的國際科學家團

    Cell封面:非洲狩獵者的全基因組

      在非洲人類的多樣性遠勝過世界上任何其他的地方。不同的食物來源、地理、疾病和氣候為自然選擇提供了許多的目標,對非洲人施加強大的壓力以改變和適應當地的環境。適應最好的個體最有可能復制和傳遞他們的基因組給后代。   遺傳的歷史就書寫在現代非洲人的DNA中,但還需要一些調查工作來對其進行注釋。在即將出

    在西非人基因組中發現了神秘古人類的“幽靈”

      據研究人員報告,現代西非人的祖先曾與一種還有待發現的古人類雜交,這與古歐洲人曾與尼安德特人發生交配的方式相似。他們的研究有助于了解古人類如何增添了當今非洲人的基因變異,而人們對后者知之甚少,其部分原因是因為非洲的化石記錄稀缺以及要獲取古人類的DNA頗為困難。作者的計算機建模技術克服了這些挑戰,從

    基因組測序

    如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的

    葉綠體基因組

    葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能的重要細胞器,葉綠體中進行的光合作用是嚴格地受到遺傳控制的。早在20世紀初,人們就已知葉綠體的某些性狀是呈非孟德爾式遺傳的,但直到60年代才發現了葉綠體DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。葉綠體基因組是一個裸露的環狀雙鏈DNA分子,其大小在1

    GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組

    多倫多大學的科學家們發現,作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白(C2H2-ZF)實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究,有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員,是規模最大的一種人類蛋白。然而,人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-

    全基因組的比較基因組雜交技術介紹

    Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a

    澳大利亞土著是地球上基因最獨特的群體

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514548.shtm根據12月13日發表于《自然》上的兩項研究,澳大利亞北部和中部地區的土著是地球上基因最獨特的群體,他們的基因變異率很高,僅次于非洲人。 ???澳大利亞土著在觀看足球比賽 圖片

    《基因組研究》:首張貓基因組草圖繪就

    貓是研究人類失明和艾滋病模型之一,因此測序結果大有用處 一只名為“肉桂”(Cinnamon)的4歲雌性阿比西尼亞貓有幸成為第一只完成基因組測序草圖的貓。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在內的基因組“俱樂部”。相關論文11月1日在線發表于《基因組研究》(Genome Research)雜

    中國新生兒基因組、胚胎基因組計劃啟動

      為從根本上實現新生兒遺傳病的早發現、早診斷、早干預,7日,中國遺傳學會遺傳咨詢分會聯合復旦大學附屬兒科醫院在上海發起中國新生兒基因組計劃。  中國新生兒基因組計劃將在未來的5年內開展10萬例樣本的新生兒基因檢測,旨在構建中國新生兒基因組數據庫,建立新生兒遺傳病基因檢測標準,促進新生兒遺傳病基因檢

    200年前被“解救”的非洲奴隸或來自中非西部

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508351.shtm200多年前,數千名被英國皇家海軍從奴隸船上“解救”出來的非洲奴隸,被帶到了南大西洋的圣赫勒拿島。但他們的生活在歷史書中或其他方面記錄甚少。現在,古代DNA分析報告,為這些人的起源提供

    煙草基因組計劃

    生物技術和生命科學將成為21世紀引發新科技革命的重要推動力量。實施基因組計劃可以獲得一批具有自主知識產權的煙草重要性狀功能基因,全面揭示種質資源的遺傳背景,確立我國在煙草基因組研究上的核心優勢,對提升煙草育種工作整體水平、實現煙草品種的根本性突破、培育煙草新興產業、更好地發揮煙草模式作物的基礎研究作

    基因組的定義

    在分子生物學和遺傳學領域,基因組是指生物體所有遺傳物質的總和。這些遺傳物質包括DNA或RNA(病毒RNA)。基因組包括編碼DNA和非編碼DNA、線粒體DNA和葉綠體DNA。研究基因組的科學稱為基因組學。

    基因組的分類

    病毒基因組病毒基因組可以由RNA或DNA組成。 RNA病毒的基因組包含單鏈或雙鏈RNA,也包含一種或多種單獨的RNA分子。 DNA病毒基因組可以是單鏈或雙鏈DNA。大多數DNA病毒基因組由單個線性DNA分子組成,但有些由DNA病毒基因組由環狀DNA分子組成? 。原核基因組原核生物和真核生物基因組由D

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