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  • 發布時間:2013-09-29 10:18 原文鏈接: Cell:海量數據分析出復雜疾病遺傳圖譜

      對于“復雜疾病”,比如孤獨癥,糖尿病和心臟疾病等的具體遺傳病因,雖然之前科學家們已經做了大量的研究,但是由于錯綜復雜的遺傳和環境相互作用因素,因此可以說在很大程度上還是一個未知領域。

      近期來自芝加哥大學的科學家們利用已知遺傳因素的疾病,完成了迄今為止關于復雜疾病中遺傳因素影響的最大擴展研究分析,他們分析了超過1.2億位患者記錄,從中找到了上百種疾病的共影響因子,構建出了能用于指導研究人員基礎研究,臨床診斷應用的一副獨特的遺傳圖譜。

      這一研究成果公布在9月26日的Cell雜志上,將有助于未來破解復雜疾病的奧秘。

      領導這一研究的是芝加哥大學遺傳醫學和人類遺傳學教授Andrey Rzhetsky,他表示,“這是第一次我們發現幾乎每一種復雜疾病,都具有與單一基因疾病有關的一套系統,這可以說給了我們識別特定基因位點的‘條形碼',這樣我們就能破解復雜疾病的復雜成因了。”

      大部分人類疾病都是復雜的,由多種遺傳環境和生活方式因素引起的,當然也有一些孟德爾遺傳疾病,如囊性纖維化和鐮狀細胞性貧血,這些疾病是由一個單一的基因異常引發的。還有某些孟德爾遺傳疾病也會導致病患患上復雜疾病,但對于這些共影響因素,此前還只是在一個小規模上進行過研究。

      為了揭示這些疾病所共有的遺傳結構,Rzhetsky和他的團隊開發出了新型計算算法,收集了來自美國和幾乎整個丹麥人口的超過1.2億位患者的記錄,從中尋找合并癥趨勢,或同一位患者出現的復雜疾病和孟德爾疾病。他們分析了65種影響幾乎機體每個系統的復雜疾病中的這種相關性,包括關節炎,抑郁癥和肺癌,此外還有95組孟德爾疾病(比如213失序癥)。

      由此這一研究小組發現了2,909個統計上意義重大的相關性,以及每一種疾病對之間相對風險的對應水平。其中一些相關性已經被科學家們證實,如脂蛋白不足和心臟病發作之間的密切聯系,但還有絕大多數是以前未知的,例如,馬凡氏綜合征(一種結締組織疾病),與神經精神疾病,如自閉癥,躁郁癥和抑郁癥之間存在重大關聯;脆性X綜合征(一種智障疾病)與哮喘,牛皮癬和病毒感染之間存在關聯,這表明這些患者出現了一個潛在的免疫系統功能障礙。

      “由于孟德爾疾病都與已知基因位點有關,因此這項研究實際上通過孟德爾疾病作為標記,為復雜疾病構建了一個遺傳圖譜”,文章第一作者,芝加哥大學David Blair說,“這些位點代表了揭示微妙遺傳變異的可能候選因子,其中一些可能不會直接導致孟德爾疾病,但仍影響復雜疾病的患病風險。”

      遺傳學家和臨床醫生目前就可以利用這一遺傳圖譜,衡量患有孟德爾疾病患者出現復雜疾病的風險,并且這也為科學家提供了大量新數據,以及一種獨特的方法,用于更好地理解和開發針對復雜疾病的治療方法。

      這一研究小組還發現孟德爾疾病相關的遺傳缺陷并不是獨立于復雜疾病,而是可能通過組合的方式,最終導致疾病。

      “患有多個孟德爾疾病遺傳變異的個體出現復雜疾病的風險比之前我們預期變異單獨作用的要高得多,”Blair說。

      這一研究團隊還希望未來能擴大他們的研究,針對更多疾病,比較全基因組數據。“我們的工作將為復雜疾病未來的研究開啟一扇新的窗口”,Rzhetsky說。

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