DNA聚合酶,以已有的核酸序列作為模板,將4種脫氧核苷酸(A、T、G、C)按照模板的堿基排列順序,以“堿基互補原則”依次連接,聚合成為一條新的DNA鏈。 DNA連接酶,是將DNA片段上的缺刻連接起來的酶。
一、DNA聚合酶
(一)DNA聚合酶I
DNA聚合酶I(DNA polymerase
I)是從大腸桿菌中發現的第一個DNA聚合酶,分子量為109KD。它能以DNA為模板,以4種脫氧核苷酸為底物,在Mg2+的參與下,從游離3′端羥基,以5′→3′核酸聚合酶活性使DNA鏈延伸。此外由于它具有5′→3′核酸外切酶活性,常用于標記DNA探針(切口平移法)。
用枯草桿菌蛋白酶可將DNA聚合酶I裂解為大小兩個片段,大片段分子量為76KD,這個片段也稱為Klenow片段(Klenow
fragment)。它具有5′→3′聚合酶活性及3′→5′外切酶活性,而失去了5′→3′外切酶活性。Klenow片段的3′→5′外切酶活性能保證DNA復制的準確性,把DNA合成過程中錯配的核苷酸去除,再把正確的核苷酸接上去。Klenow片段主要用途有:①補齊雙鏈DNA的3′末端,使3′末端標記;②在cDNA克隆中,第二股鏈的合成;③DNA序列分析。
(二)Taq DNA聚合酶
Taq DNA聚合酶是一種耐熱的依賴于DNA的DNA聚合酶,最佳反應溫度為75~80℃。可用于通過聚合酶鏈式反應(PCR)對DNA分子的特定序列進行體外合成擴增,也可用于DNA測序。
(三)逆轉錄酶
逆轉錄酶(reverse
transcriptase)是多功能酶,它能催化以RNA為模板的DNA聚合反應;具有3′→5′RNA外切酶活性(又稱RNA酶H活性),能特異降解RNA-DNA雜交分子中的RNA部分;它還具有DNA指導的DNA聚合酶(DDDP)功能。逆轉錄酶以mRNA為模板,催化合成出互補的DNA稱為cDNA(complementary
DNA)。由此可構建cDNA文庫,篩選特異的結構基因。逆轉錄酶沒有3′→5′DNA外切酶活性,因此無校對功能,錯配率較高,約每2萬個核苷酸鏈會出現一個錯誤。
(四)末端轉移酶
在二價陽離子存在下,末端轉移酶(terminal
transferase,TdT)催化dNTP加到DNA分子的3′-OH,以帶3′突出的DNA為最佳受體。此酶常用于給載體或cDNA加上互補的多聚體尾,造成便于重組的人工粘性末端;其次也可用于DNA片段3′末端標記。
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