近日,中國科學院上海藥物研究所譚敏佳課題組、中科中山藥物創新研究院徐駿宇課題組,聯合中國科學院營養與健康研究所秦駿課題組、上海交通大學附屬仁濟醫院薛蔚和董柏君團隊、上海交通大學生命科學技術學院李婧課題組,在《自然-癌癥》(Nature Cancer)上發表了題為Integrative proteogenomic profiling of high-risk prostate cancer samples from Chinese patients indicates metabolic vulnerabilities and diagnostic biomarkers的研究論文。
該研究綜合基因組、轉錄組、蛋白質組和磷酸蛋白質組數據,揭示了基因組和轉錄組分析未完全闡明的前列腺癌分子機制和疾病亞型,加深了科學家對前列腺癌臨床特征的生物學認知。
前列腺癌呈現出東西方人群基因組層面的差異性,并反映在癌癥基因組和疾病進展的不同變化中。該研究對125例癌和癌旁配對的臨床原位高危前列腺癌樣本進行了蛋白基因組學的全景解析,以提升對于高危前列腺癌預后、診斷和治療的認知。科研人員致力于揭示不同預后特征的分子亞型、剖析關鍵的致癌磷酸化事件以及探索精準診斷和預后的生物標志物。研究基于蛋白質組學的分子分型發現,預后最差的S-III亞型中代謝信號和癌癥通路更顯著地被激活。進一步,機制解析顯示,支鏈氨基酸代謝途徑關鍵酶BCAT2的高表達提高了癌組織對支鏈氨基酸的利用效率,促進了前列腺癌的增殖。研究基于磷酸化組學的全景分析發現,FOXA1-S331磷酸化修飾能夠促進下游AR信號通路的活化過程,而抑制FOXA1-S331磷酸化修飾水平則能夠減緩前列腺癌的進展過程。同時,研究基于蛋白質組學和臨床數據的整合分析發現,GOLM1可以作為潛在生物標志物,用于診斷前列腺癌特異性抗原(PSA)“灰區”的前列腺癌患者。研究表明,在PSA“灰區”,血清GOLM1具有更高的特異性和靈敏度。
研究工作得到國家自然科學基金等的支持。

中國人群前列腺癌整合的蛋白質組學分子圖譜全景
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