水稻地方品種農藝性狀相關基因的全基因組關聯分析獲進展
水稻地方品種重要農藝性狀相關基因的全基因組關聯分析取得進展 近日，中國科學院北京基因組研究所/中科院上海生科院植生生態所韓斌研究員課題組，通過與中國水稻所、中科院遺傳與發育研究所、美國密歇根州立大學、華中農業大學和美國康奈爾大學等單位的研究人員合作，結合第二代測序技術和自主開發的基因型分析方法，對517份中國水稻地方品種材料進行測序，構建了高密度的水稻單體型圖譜（HapMap），并對秈稻品種的14個重要農藝性狀進行全基因組關聯分析，確定了這些農藝性狀相關的候選基因位點。相關研究成果于10月24日以全文形式發表在Nature Genetics上。（doi:10.1038/ng.695） 水稻是重要的糧食作物，也是植物基因組學研究的模式作物。水稻的株型（包括分蘗數，株高等），產量（包括小穗數，籽粒大小，千粒重等），籽粒品質（糊化溫度，淀粉含量等）和一些生理特征（包括抗逆性，抽穗期，落粒性等）都是水稻生產上重要的......閱讀全文
水稻地方品種農藝性狀相關基因的全基因組關聯分析獲進展
水稻地方品種重要農藝性狀相關基因的全基因組關聯分析取得進展 近日，中國科學院北京基因組研究所/中科院上海生科院植生生態所韓斌研究員課題組，通過與中國水稻所、中科院遺傳與發育研究所、美國密歇根州立大學、華中農業大學和美國康奈爾大學等單位的研究人員合作，結合第二代測序技術和自主開發的基因
表觀遺傳調控水稻重要農藝性狀研究獲進展
轉座子(transposon)是一段自身能夠插入到基因組上的DNA片段，上世紀40年代，芭芭拉·麥克林托克(Barbara McClintock)首先在玉米中發現了轉座子。從簡單的細菌到復雜的人類，轉座子廣泛存在。轉座子隨機插入到重要基因中，會引發疾病、癌癥和其他生理缺陷。DNA甲基化、組蛋
水稻重要農藝性狀蛋白功能活性的梯度獲調節
廣東省農業科學院水稻研究所副研究員譚健韜/研究員劉琦團隊與華南農業大學教授祝欽瀧團隊合作，研究開發出植物精準堿基編輯器實現水稻重要農藝性狀蛋白功能活性的梯度調節。近日，相關成果發表于《先進科學》（Advanced Science）。基于精準堿基編輯的植物內源蛋白功能梯度調節。研究團隊供圖該研究在國家
Science－Advance|?農科院揭示lncRNAs調控水稻農藝性狀變異機制
2019年12月18日，Science Advances雜志在線發表了來自中國農業科學院作物科學研究所楊慶文團隊、劉君團隊和華盛頓圣路易斯大學的Ken Olsen團隊完成了水稻（亞洲栽培稻）及其祖先種（普通野生稻）非編碼區lncRNA的注釋，結合多重組學方法研究了水稻lncRNA的進化歷史，從全
吃了一輩子的水稻，為何如此多樣？
近日，中國農業科學院作物科學研究所水稻優異種質資源發掘與創新利用創新團隊、作物基因組選擇育種創新團隊和華盛頓圣路易斯大學的肯·奧爾森團隊合作完成了水稻（亞洲栽培稻）及其祖先種（普通野生稻）非編碼區長鏈非編碼RNA（lncRNA）的注釋，研究了水稻lncRNA的進化歷史，并從全基因組水平揭示了ln
《自然—遺傳學》發表我國科學家水稻研究成果引關注
由中科院上海生命科學研究院、北京基因組研究所、中國水稻研究所等單位合作的研究成果《水稻地方品種重要農藝性狀相關基因的全基因組關聯分析》，日前在線發表在《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上。 該研究報道了中國水稻地方品種的全基因組的遺傳多態性和單倍體型圖譜，并對秈稻
馬鈴薯基因組完成圖揭示復雜區域存在重要農藝性狀相關
中國農業科學院蔬菜花卉研究所馬鈴薯遺傳育種與栽培創新團隊和蔬菜分子設計育種創新團隊，對馬鈴薯單倍型DM的基因組進行了全序列組裝，獲得了包含24個端粒和12個著絲粒完整序列的馬鈴薯單倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因組完成圖（DM8.1），并在之前馬鈴薯基因組未能完整組裝的高度重復序列區域中，發
水稻功能基因組研究：我國要繼續保持領先優勢
以“水稻功能基因組研究的現狀和未來”為主題的第520次香山科學會議學術討論會近日在北京召開。與會專家就水稻基因組測序及注釋、水稻重要性狀的調控網絡、水稻多組學（表觀組、蛋白組、代謝組、表型組等）研究，以及水稻基因組解析等方面展開了深入的討論。 此次會議由中國科學院院士、華中農業大學教授張啟發
“水稻等主要農作物功能基因組研究”重大項目取得進展
3月24-25日，“十二五”國家863計劃現代農業技術領域“水稻等主要農作物功能基因組研究”重大項目交流會在海南陵水召開。來自中國科學院、中國農業科學院、華中農業大學、中國農業大學、浙江大學、上海交通大學等全國18所大專院校、科研院所的課題骨干和專家共計40余人參加此次交流會。農村中心相關人員參
研究揭示水稻基因組－“垃圾－DNA”－的真相
對于動植物的 DNA 來說，僅有不到 5% 能夠翻譯成蛋白質，進行生命活動。而大部分 DNA 轉錄成 RNA 之后，便不再繼續翻譯，這些非編碼 RNA 一度被認為是轉錄中的 “噪音”“暗物質”， 甚至有人認為這是 “垃圾 DNA”。 近十年來，隨著探索未知的技術的進步，這些所謂 “垃圾 DNA
研究揭示水稻基因組“垃圾DNA”的真相
對于動植物的DNA來說，僅有不到5%能夠翻譯成蛋白質，進行生命活動。而大部分DNA轉錄成RNA之后，便不再繼續翻譯，這些非編碼RNA一度被認為是轉錄中的“噪音”“暗物質”， 甚至有人認為這是“垃圾DNA”。 近十年來，隨著探索未知的技術的進步，這些所謂“垃圾DNA”的重要性才開始為人們所了解。
華中農大張啟發院士PNAS發布水稻研究重要成果
來自華中農業大學的研究人員報告稱，他們通過分析1479個水稻品種繪制出基因組變異圖譜，揭示出了水稻改良的育種標簽。這一重要的研究成果發布在9月10日的《美國國家科學院》（PNAS）雜志上。 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室主任張啟發(Qifa Zhang)院士及練興明(Xingming
華中農大張啟發院士PNAS發布水稻研究重要成果
來自華中農業大學的研究人員報告稱，他們通過分析1479個水稻品種繪制出基因組變異圖譜，揭示出了水稻改良的育種印跡。這一重要的研究成果發布在9月10日的《美國國家科學院》（PNAS）雜志上。 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室主任張啟發(Qifa Zhang)院士及練興明(Xingming
多重基因編輯改善野生稻農藝性狀
近日，中國農業科學院農業基因組研究所超級稻種質創新團隊利用多重基因編輯成功改善了野生稻農藝性狀，為現代育種工作提供了新策略。相關研究成果發表在《植物學報（英文版）》（Journal of Integrative Plant Biology）上。水稻的栽培品種起源于野生稻。在長期的馴化過程中，野生稻中
中國誕生全球首張水稻全基因組育種芯片
中國中化集團公司下屬中國種子集團有限公司聯合華中農業大學、北京大學近日共同研制出全球首張水稻全基因組育種芯片，將大幅提高種子真實性檢測準確性，有助提高育種效率，杜絕假種子危害。 中種公司生命科技中心喻輝輝博士表示，目前業內判斷水稻種子真實性通常采用國標推薦的24個SSR標記檢測結果，
PNAS：下一代測序助力張啟發研究“轉基因水稻”
水稻是世界上最重要的糧食作物之一，與玉米、小麥、土豆被稱為“世界四大主糧”。在過去的50年里水稻尤其是秈稻（indica ）的改良取得了一些里程碑式的成果。其中一項重大的突破是在上世紀的五六十年代中國及國際水稻研究所（IRRI）開發出了一系列半矮桿水稻品種，促成了水稻的“綠色革命”。 此后，半
美國科學家開發全基因組測序水稻變體
水稻不僅是全球一半人口的主食，也為研究能源作物提供了模型。為優化生物燃料作物，科學家正尋找決定水稻產量、抗病性和灌溉效率等性狀的基因。 最近在《植物細胞》雜志刊登的一篇論文中，美國加州大學戴維斯分校的研究團隊與來自能源部聯合基因組研究所的合作者，宣布開發出粳稻Kitaake的第一個全基因組測
遺傳發育所等在亞洲稻群體結構和演化研究中取得進展
亞洲栽培稻是世界上最重要也是最古老的糧食作物之一，在亞洲文明和日常生活中扮演著舉足輕重的角色。水稻起源問題也引起了廣泛的研究興趣。經過一個多世紀不同學科研究者的不斷探索，已經積累了大量水稻馴化起源知識。但水稻馴化是單次起源還是多次起源尚沒有統一結論。 美國農業部（USDA）種質資源庫在過去10
谷子單倍體型圖譜及全基因組關聯分析研究出爐
由中國農科院作物所、中科院上海生科院植生生態所國家基因中心、中科院遺傳發育所等8家單位合作，在國際上率先完成了谷子單倍體型圖譜的構建和大量農藝性狀的全基因組關聯分析，該成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遺傳學)發表，標志著我國在谷子遺傳學研究領域取得了重要的突破。
植物表型研究文章TOP10（三）
TOP 4●?高通量表型和全基因組關聯分析：研究揭示水稻的自然遺傳變異(Nat Commun,2014)通過使用高通量測序技術對植物基因組學的研究迅速發展，傳統的植物表型測試已遠遠落后。此文的作者開發了一個高通量水稻表型測定設施（HRPF），用于監測水稻生育期的13個傳統農藝性狀和2個新定義的性狀。
解析雜交水稻粒型和堊白性狀的遺傳基礎
近日，中國水稻研究所楊仕華課題組聯合中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所韓斌課題組和上海師范大學黃學輝課題組合作完成的“應用多套群體解析雜交稻粒型和堊白性狀的遺傳基礎”的研究論文在線發表在《分子植物（Molecular Plant）》上。該研究解析了我國當前雜交水稻外觀品質性狀的遺傳學
水稻多器官單細胞多組學圖譜問世
記者楊舒從中國農業科學院生物技術研究所獲悉，該所作物耐逆性調控與改良創新團隊日前聯合國內外研究機構，構建了首個水稻的多器官單細胞多組學圖譜，系統解析了水稻不同細胞類型的功能及其對復雜性狀的調控作用，有力助力水稻設計育種。相關研究成果近日發表在國際學術期刊《自然》上。 單細胞組學是近年來生命科學
韓斌院士：破譯水稻“基因密碼”
從率領團隊完成水稻第4號染色體的精確測序，到發現幾百個與水稻性狀有關的遺傳位點，2013年新當選中國科學院院士、中國科學院上海生科院副院長、中國科學院國家基因研究中心主任韓斌，通過破譯水稻“遺傳密碼”為全球育種專家提供了培育優良水稻品種的“金鑰匙”。 水稻第4號染色體的精確測序圖 1
新研究可大幅提高雜交水稻全基因組選擇預測精度
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505572.shtm水稻是人類重要的糧食作物之一，水稻雜交種的產量高于常規自交系品種，但由于雜交稻存在顯性等非加性效應，稻米品質的遺傳改良比自交稻更具挑戰性。湖南農業大學植物保護學院副教授李蘭芝團隊聯合美
研究證實無融合生殖雜交水稻的遺傳穩定性
近日，中國水稻研究所基因組編輯及無融合生殖創新團隊將無融合生殖雜交水稻材料繁殖至第4代，從植株表型、基因組、甲基化、轉錄組和亞基因組轉錄等層面比較了不同世代克隆材料，證實了無融合生殖雜交稻在不同世代間的遺傳穩定性，為未來人工無融合生殖體系在作物中應用奠定了理論基礎。相關研究成果在線發表在《植物通
研究揭示木薯重要農藝性狀形成的遺傳機制
近日，中國熱科院生物所、品資所和三亞研究院聯合福建農林大學、伊利諾伊大學、華中科技大學、中國農業科學院等單位在《基因組生物學》（Genome Biology）上發表研究論文，繪制了388份木薯種質的全基因組變異圖譜，揭示了木薯群體水平雜合性變異影響木薯重要農藝性狀的遺傳機制，為木薯及其它高雜合作物遺
研究揭示木薯重要農藝性狀形成的遺傳機制
近日，中國熱科院生物所、品資所和三亞研究院聯合福建農林大學、伊利諾伊大學、華中科技大學、中國農業科學院等單位在《基因組生物學》（Genome Biology）上發表研究論文，繪制了388份木薯種質的全基因組變異圖譜，揭示了木薯群體水平雜合性變異影響木薯重要農藝性狀的遺傳機制，為木薯及其它高雜合作
研究揭示西瓜3個重要農藝性狀遺傳機制
西瓜果皮顏色性狀相關基因的定位及分析 劉文革供圖 近日，中國農業科學院鄭州果樹研究所劉文革團隊對西瓜果皮顏色、種皮顏色和節間長短3個性狀的重要功能基因進行了挖掘和功能分析，闡述了其遺傳和分子機理。相關研究成果分別在線發表于國際期刊《理論與應用遺傳學》《植物科學前沿》和《國際分子科學雜志》。 論文
華中農大連發兩項水稻重要成果
近期，華中農業大學水稻研究團隊在水稻基因組研究中接連取得重要進展，相關研究結果接連發表在國際著名學術期刊《PNAS》、《Genome Biology》。 九月十日，張啟發教授和練興明教授作為共同通訊作者，在《PNAS》發表題為“Breeding signatures of rice impro
上海生科院揭示水稻籽粒大小調控機制
中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所國家基因研究中心團隊在水稻控制籽粒大小的分子機制研究方面取得重要進展。他們經過多年的努力成功克隆和鑒定了一個控制水稻粒長與千粒重的關鍵基因GLW7，并深入研究了其分子機理及在水稻遺傳改良中的作用，相關研究論文于3月7日在線發表在Nature Gene