擬南芥轉錄抑制子AL5提高植物對非生物脅迫耐受能力研究
Alfin是一類植物所特有的PHD鋅指蛋白,中國科學院遺傳與發育生物學研究所基因組生物學研究中心陳受宜和張勁松實驗室從擬南芥中鑒定出7個Alfin類PHD鋅指蛋白。研究發現它們能結合G-rich DNA元件并具有轉錄抑制活性。通過比較野生型、突變體和過表達轉基因植株在逆境脅迫時的表型,發現過量表達AL5能提高擬南芥耐鹽、耐旱和耐寒的能力。使用ChIP-Seq等方法,鑒定了8個被AL5直接調節的下游基因,這些下游基因的缺失突變體具有一定的耐逆能力。該研究表明,AL5直接調控的下游基因可能是逆境脅迫的負調控因子,通過結合下游基因啟動子中的G-rich元件,AL5抑制多個負調控因子的表達,從而提高植物耐逆能力。 該研究揭示了具有轉錄抑制活性的蛋白如何調控植物耐逆反應,為改善作物耐逆性提供了理論依據。該研究于1月25日在線發表于Plant journal (doi: 10.1111/tpj.12773.)。韋偉為該論文第一作者。該......閱讀全文
基因調節蛋白
中文名稱基因調節蛋白英文名稱gene regulatory protein定 義與基因的DNA序列相互作用調控轉錄的蛋白質。即反式作用因子。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
Fas基因蛋白的檢測
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Fas基因蛋白的檢測
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載脂蛋白基因結構
載脂蛋白基因的分離是通過用相應的cDNA作為探針篩選基因文庫而完成的。比較基因的核苷酸序列與cDNA的核苷酸序列得以鑒定基因的內含子與外顯子數目以及它們的分界線。大部分真核細胞的基因含有內含子,內含子不編碼氨基酸,但有些內含子參與基因表達的調控。外顯子通常占據基因內的三個區域:第一個區域不編碼氨
骨橋蛋白的基因結構
OPN人的OPN基因定位在染色體4q13,是單一編碼基因,8kb大小,具有7個外顯子和6個內含子組成。小鼠位于5號染色體上,基因長約7Kb,包括7個外顯子,其5’端有啟動子序列,該啟動子中IKb長度也被測序并用GCG程序分析了轉錄因子的可能識別部位,這些轉錄因子包括API-5、PEA-3、PEA
組蛋白修飾基因通路HDAC2基因
該基因產物屬于組蛋白脫乙酰基酶家族。組蛋白脫乙酰基酶通過形成大的多蛋白復合物起作用,并負責核心組蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端賴氨酸殘基的脫乙酰化。這種蛋白通過與許多不同的蛋白質結合形成轉錄抑制復合物,包括哺乳動物鋅指轉錄因子YY1。因此,它在轉錄調控、細胞周期進展和發育事件中起著重要作用。
組蛋白修飾基因通路MEN1基因
這個基因編碼腦膜,一種與多發性內分泌腫瘤1型綜合征相關的假定的腫瘤抑制因子。體外研究表明,腦膜定位于細胞核,具有兩種功能性核定位信號,并通過JUND抑制轉錄激活,但這種蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上檢測到兩條信息,但未對較大的信息進行描述。選擇性剪接導致多個轉錄變體。
組蛋白修飾基因通路MEN1-基因
這個基因編碼腦膜,一種與多發性內分泌腫瘤1型綜合征相關的假定的腫瘤抑制因子。體外研究表明,腦膜定位于細胞核,具有兩種功能性核定位信號,并通過JUND抑制轉錄激活,但這種蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上檢測到兩條信息,但未對較大的信息進行描述。選擇性剪接導致多個轉錄變體。
組蛋白修飾基因通路KMT2A基因
該基因編碼一個轉錄輔激活子,在早期發育和造血過程中起到調節基因表達的重要作用。編碼蛋白包含多個保守功能域。其中一個域,即集合域,負責其組蛋白H3賴氨酸4(H3K4)甲基轉移酶活性,介導與表觀遺傳轉錄激活相關的染色質修飾。這種蛋白由酶Taspase 1加工成兩個片段,MLL-C和MLL-N。這些片段重
組蛋白修飾基因通路KDM6A基因
該基因位于X染色體上,是編碼四肽重復序列(TPR)蛋白的Y連鎖基因的相應位點。該基因的編碼蛋白包含一個JMJC結構域,并催化三/二甲基化組蛋白H3的去甲基化。已發現該基因的多個選擇性剪接轉錄變體。
組蛋白修飾基因通路HDAC1基因
多亞基復合物催化的組蛋白乙酰化和脫乙酰化在調節真核基因表達中起關鍵作用。 該基因編碼的蛋白質屬于組蛋白脫乙酰基酶/ acuc / apha家族,是組蛋白脫乙酰基酶復合物的組成部分。 它還與視網膜母細胞瘤腫瘤抑制蛋白相互作用,這種復合物是控制細胞增殖和分化的關鍵因素。 它與轉移相關蛋白2一起使p53脫
組蛋白修飾基因通路KDM5A基因
該基因編碼Jumonji,富含AT的相互作用域1(JARID1)組蛋白脫甲基酶蛋白家族的成員。 編碼的蛋白質通過組蛋白編碼使組蛋白H3的賴氨酸4脫甲基,從而在基因調控中發揮作用。 編碼的蛋白質與許多其他蛋白質(包括成視網膜細胞瘤蛋白質)相互作用,并與Hox基因和細胞因子的轉錄調控有關。 該基因可能在
組蛋白修飾基因通路BRD4基因
該基因編碼的蛋白質與小鼠蛋白MCAP(有絲分裂過程中與染色體相關)和人類Ring3蛋白(絲氨酸/蘇氨酸激酶)同源。每一種蛋白質都包含兩個溴域,一個保守的序列基序,可能參與染色質靶向。該基因被認為是T(15;19)易位的19號染色體靶基因(q13;p13.1),它定義了年輕人的上呼吸道癌。已經描述了兩
組蛋白修飾基因通路EP300基因
該基因編碼腺病毒E1A相關的細胞p300轉錄輔激活蛋白。作為組蛋白乙酰轉移酶,通過染色質重塑調節轉錄,在細胞增殖和分化過程中起重要作用。通過與磷酸化CREB蛋白特異性結合來介導cAMP基因調控。該基因也被鑒定為HIF1A(缺氧誘導因子1α)的共激活物,因此在缺氧誘導基因如VEGF的刺激中起到作用。這
組蛋白修飾基因通路CHD4基因
該基因的產物屬于SNF2 / RAD54解旋酶家族。 它代表核小體重塑和脫乙酰基酶復合物的主要成分,并且在表觀遺傳轉錄抑制中起重要作用。 皮肌炎患者會產生針對這種蛋白質的抗體。 該基因的體細胞突變與漿膜性子宮內膜腫瘤有關。 選擇性剪接導致編碼不同同工型的多個轉錄變體。
組蛋白修飾基因通路HDAC2基因
該基因產物屬于組蛋白脫乙酰基酶家族。組蛋白脫乙酰基酶通過形成大的多蛋白復合物起作用,并負責核心組蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端賴氨酸殘基的脫乙酰化。這種蛋白通過與許多不同的蛋白質結合形成轉錄抑制復合物,包括哺乳動物鋅指轉錄因子YY1。因此,它在轉錄調控、細胞周期進展和發育事件中起著重要作用。
組蛋白修飾基因通路TAF1基因
rna聚合酶ii啟動轉錄需要70多種多肽的活性。協調這些活動的蛋白質是基礎轉錄因子tfiid,它與核心啟動子結合以正確定位聚合酶,充當組裝其余轉錄復合物的支架,并充當調控信號的通道。tfiid由tata結合蛋白(tbp)和一組進化上保守的蛋白質(tbp相關因子或taf)組成。tafs可能參與基礎轉錄
組蛋白修飾基因通路KAT6A基因
該基因編碼組蛋白乙酰基轉移酶的MOZ,YBFR2,SAS2,TIP60家族的成員。 該蛋白質由核定位域,與乙酰化組蛋白尾巴結合的雙C2H2鋅指結構域,組蛋白乙酰轉移酶域,富含谷氨酸/天冬氨酸的區域以及富含絲氨酸和蛋氨酸的反式激活域組成。 它是乙酰化組蛋白3中賴氨酸9殘基的復合物的一部分,此外,它還充
組蛋白修飾基因通路EP300基因
該基因編碼腺病毒E1A相關的細胞p300轉錄輔激活蛋白。作為組蛋白乙酰轉移酶,通過染色質重塑調節轉錄,在細胞增殖和分化過程中起重要作用。通過與磷酸化CREB蛋白特異性結合來介導cAMP基因調控。該基因也被鑒定為HIF1A(缺氧誘導因子1α)的共激活物,因此在缺氧誘導基因如VEGF的刺激中起到作用。這
綠色熒光蛋白基因與紅色熒光蛋白基因是同源的嗎
綠色熒光蛋白基因與紅色熒光蛋白基因是同源的(1)在該實驗中,綠色熒光蛋白基因是目的基因.(2)③是將目的基因導入受體細胞的過程,當受體細胞是動物細胞時,采用最多也最有效的方法是顯微注射技術.(3)GFP基因可以作為標記基因,標記基因的作用是鑒定受體細胞中是否含有目的基因.(4)動物細胞培養時,其培養
調整基因編碼蛋白的檢測
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調整基因編碼蛋白的檢測
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基因置換實驗——構建融合蛋白
實驗材料菌株BY4741質粒PDB118試劑、試劑盒磷酸鹽緩沖液儀器、耗材YPD 平板YPD 液體培養基血球計數板SC-his平板實驗步驟YPD 平板 第 1 天將菌株 7-3 在 YPD 平板上劃單克隆,30°C 下培養兩天。第 3 天挑取單克隆,在 5 mlYPD 液體培養基中培養,30°C 過
關于組蛋白基因的簡介
組蛋白基因(histone gene) 組蛋白基因是已知的重復基因中唯一具有蛋白質編碼機能的基因。它們在DNA合成開始前短暫地表達,因而它的活動與細胞周期密切相關。 基因組中存在大量重復序列用以編碼組蛋白是有其重要意義的。DNA復制時,組蛋白也要成倍增加,而且往往在DNA合成一小段后,組蛋白馬
黏蛋白的基因的介紹
至少有20人黏蛋白基因已經被區別在于基因的克隆-MUC1,MUC2,MUC3A,MUC3B,MUC4,MUC5AC,MUC5B,MUC6,MUC7,MUC8,MUC12,MUC13,MUC15,MUC16,MUC17,MUC19,MUC20,MUC21和MUC22。 主要的分泌呼吸道粘蛋白是M
調整基因編碼蛋白的檢測
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組蛋白修飾基因通路KMT2D基因
這個基因編碼的蛋白質是組蛋白甲基轉移酶,它甲基化組蛋白H3的Lys-4位置。編碼蛋白是一種叫做抗壞血酸的大蛋白復合物的一部分,它被證明是β-珠蛋白和雌激素受體基因的轉錄調節器。這種基因的突變被證明是導致歌舞伎綜合征的原因。
組蛋白修飾基因通路KMT2C基因
該基因是髓系/淋巴系或混合系白血病(MLL)家族的成員,編碼核蛋白,具有AT-Hook DNA結合域、DHHC型鋅指、六個PhD型鋅指、一個集合域、一個后集合域和一個環狀鋅指。該蛋白是ASC-2/NCOA6復合物(ASCOM)的成員,具有組蛋白甲基化活性,參與轉錄協同激活。
組蛋白修飾基因通路KDM5C基因
該基因是smcy同系物家族的成員,編碼一個干旱區、一個jmjc區、一個jmjn區和兩個phd型鋅指蛋白。DNA結合基序表明該蛋白參與轉錄和染色質重塑的調節。這種基因的突變與X連鎖精神發育遲滯有關。選擇性剪接導致多個轉錄變體。