基因組學推動生命科學大步向前
2010年下旬,河南安陽曹操墓真偽之辯正酣。而一則來自上海的重磅消息更是引發了多方關注。復旦大學現代人類學教育部重點實驗室宣布,向全國征集曹姓男性DNA樣本,擬用基因組科學的手段驗證出土的頭骨是否為曹操本人。 一下子,基因組科學成為熱門,這一話題“落入尋常百姓家”。 事實上,伴隨著2000年人類基因組框架圖和2003年人類基因組完成圖的發表,近十年來,DNA測序技術繼續高速發展,基因組科學極大地推動了生命科學的發展,并一直受到各國政府和學術組織高度重視。 2010年,基因組科學研究更是取得了重大進展。在美國《科學》雜志評出的當年十大科學進展中,涉及基因組科學的共有3項——尼安德特人基因組、外顯子組測序、下一世代的基因組學。這也從一個側面反映了該項科學在2010年的蓬勃發展。 多個重要物種基因組圖譜完成 2010年,期待已久的大豆基因組序列終于測通。 當年1月,來自美國農業部、美國能源部聯合......閱讀全文
解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎,徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天,65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983
基因組學推動生命科學大步向前
2010年下旬,河南安陽曹操墓真偽之辯正酣。而一則來自上海的重磅消息更是引發了多方關注。復旦大學現代人類學教育部重點實驗室宣布,向全國征集曹姓男性DNA樣本,擬用基因組科學的手段驗證出土的頭骨是否為曹操本人。 一下子,基因組科學成為熱門,這一話題“落入尋常百姓家”。 事實上,伴隨著2
Science:宏基因組學測序技術
宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。 長期以來,對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua
測序技術發展過快?基因組學千萬大獎告吹
X獎基金會近日決定取消了獎金高達1000萬美元的基因組學Archon X獎(Archon Genomics X Prize),因為基因組測序成本的直線下降已使得競爭毫無意義。 X獎基金會的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了關閉競賽的決定。他表示,這是因為如今
測序巨頭公司 15億美元建生命科學園
近日,BioMed房產信托公司宣布:世界測序巨頭Illumina公司簽署協議,在福斯特市租下360000平方英尺的場地,創建最先進的生命科學園區,租期為15年。這項租地協議是過去十年里,生命科學領域最大的一筆租賃交易。有媒體透露該園區建設將耗資15億美元。 新園區將包括:實驗室大樓區和辦公樓區
新一代測序將如何改變法醫基因組學
Bruce Budowle博士是北德克薩斯大學健康科學中心(UNTHSC)應用遺傳學研究所的執行主任。自2009年成立以來,該研究所集中了一大批致力于完善遺傳學方法的知名科學家,以增強幾個研究領域,包括法醫DNA。在UNTHSC的法醫科學項目(全美只有14個)
宏基因組學技術測序木乃伊的肺結核基因組
來自華威大學的研究者使用宏基因組學技術發現215年之久的木乃伊的肺結核基因組。 由Mark Pallen帶領的研究團隊試圖用技術來發現組織學標本中的肺結核的DNA。 宏基因組學是一種從樣本中檢測DNA序列的技術,并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或DNA擴增
采用新一代測序法的宏基因組學研究
直到不久之前,宏基因組學研究還因為高費用、低流通量以及在應用Sanger-方法克隆步驟中出現的結果不準確而受到限制。而今借助于新一代序列測定方法即可獲得宏基因組樣品全面的圖像。宏基因組學研究(metagenomics)是指研究一種復雜微生物群體在其生命空間的全部基因信息。研究的主要目的在于刻畫
三代測序的DNA提取和宏基因組學分析(一)
改進的人類腸道微生物組的高分子量DNA提取,納米孔測序和宏基因組學裝配Improved high-molecular-weight DNA extraction,nanopore sequencing and metagenomicassembly from the human gut microb
三代測序的DNA提取和宏基因組學分析(二)
優勢與局限這種DNA提取方法已被優化用于從人類糞便樣本中提取高分子量(HMW)DNA,但也已在模擬微生物群落和細菌分離株上得到驗證。我們希望該方案可以適用于其他樣品類型,盡管可能需要對裂解前和裂解后步驟進行修改以解釋特定于樣品的制備和污染物清除的問題是必要的。機械裂解方法(如珠子擊打)仍然是連續裂解