Science發表基因組研究重要成果
科學家們日前發現，人類基因組的遺傳學差異主要來自于拷貝數變異（CNV）。在此之前人們對CNV的了解并不多，因為CNV一直是基因組測序的一大挑戰。 華盛頓大學的遺傳學家Evan Eichler領導研究團隊克服了這一困難。他們對來自全球125個族群的人進行了深度基因組測序，全面分析了基因組中的SNV和CNV。這項研究發表在八月六日的Science雜志上。 拷貝數變異（CNV）是指基因拷貝數出現異常，主要分為CNV缺失和CNV重復。CNV是基因組結構變異的重要組成部分，會影響蛋白編碼基因和非編碼基因的表達以及各種信號通路的活性。 CNV往往位于高度重復的基因組區域，難以進行測序分析。迄今為止，大部分人類基因組分析（包括人類基因組計劃和千人基因組計劃）都是針對SNV和CNV缺失。技術上的限制使CNV重復長期受到忽視。 項研究的測序深度比千人基因組計劃高10倍，是基因組數據生成的一大突破。研究顯示，人類基因組中的CNV平均為7......閱讀全文
細胞核基因組——重復順序
高度重復順序其長度可能2、4、6、8等幾個bp，較長的順序可達200bp，但是重復拷貝數可達106次以上，例如染色體著絲粒、端粒和Y染色體長臂上的異染區就是由高度重復順序的衛星DNA構成的，高度重復順序不能轉錄，它們參與染色體結構的維持，形成結構基因間隔，可能與減數分裂時同源染色體的聯會配對有關
分子的重復機制全基因組復制
又稱多倍性，是減數分裂不分離導致整個基因組復制的現象。多倍體在植物中很常見，但動物上也發生過?[3]??。全基因組復制會使得許多其它基因最終丟失，返回到單一狀態。然而，許多基因的保留導致了適應性創新。多倍體也是眾所周知的物種形成的一個來源，因為具有與親本物種不同染色體數目的后代通常不能與非多倍體生物
關于真核基因組的中度重復順序簡介
真核基因組的中度重復順序簡介：中度重復序列大致指在真核基因組中重復數十至數萬（＜105）次的重復順序。其復性速度快于單拷貝順序，但慢于高度重復順序。少數在基因組中成串排列在一個區域，大多數與單拷貝基因間隔排列。依據重復順序的長度，中度重復順序可分為兩種類型。 短分散片段：（short inte
新算法TRFill解決生物基因組重復序列組裝難題
近日，中國農業科學院農業基因組研究所農業基因組學技術研發與應用創新團隊開發出了一種新算法——TRFill，解決了現有工具無法完全填補基因組間隙的難題，顯著提升了基因組質量。相關研究成果發表在《基因組生物學》（Genome Biology）上。 動植物基因組的許多區域存在大量高度重復的DNA片段
北京生科院提出基因組重復區域組裝新算法
2016年12月，國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）發表了中國科學院北京生命科學研究院計算基因組學實驗室趙方慶團隊題為The combination of direct and paired link graphs can boost repetitive
關于真核基因組的高度重復序列的介紹
1、真核基因組的高度重復序列— 簡介 高度重復序列在基因組中重復頻率高，可達10^3以上，因此復性速度很快。在基因組中所占比例隨種屬而異，約占10-60%，在人基因組中約占20%。高度重復順序又按其結構特點分為三種。 2、真核基因組的高度重復序列—倒位重復序列 這種重復順序復性速度極快，即
Nat－Biotechnol：基因組中的“黑物質——DNA重復片段”
基因組的大部分區域由重復片段組成。這些“ DNA重復序列”在錯誤位置的擴增可能會產生嚴重后果。然而，DNA重復序列的擴增非常難以分析。柏林馬克斯·普朗克分子遺傳學研究所的研究人員最近開發的一種方法可以詳細查看這些以前無法進入的基因組區域。它結合了納米孔測序，干細胞和CRISPR-Cas技術。該方
研究揭示多態性重復基因的基因組演化機制
近百年來，進化遺傳學工作致力于探索重復基因的起源機制和功能演化過程。經典觀點認為，基因重復后產生兩個完全等同的拷貝，其中一個冗余拷貝在自然選擇作用下獲得新功能。也有觀點認為，劑量效應和不完整基因重復等因素使重復基因并非是等同的冗余拷貝。劑量敏感基因（滿足劑量平衡效應的蛋白復合體成員基因或X染色體
ASHG－2017－|－基因組中的大片段重復讓人類與眾不同
美國人類遺傳學協會（ASHG）2017年會于本周在佛羅里達州奧蘭多舉行。這是遺傳學界的一大盛事，每年吸引數千名科學家參加。在會議上，他們介紹遺傳學各個方面的研究進展。 10月17日，加州大學戴維斯分校的Paulina Carmona-Mora介紹稱，人類基因組中的大片段非編碼DNA的重復可能造
真核基因組的中度重復順序—KpnⅠ家族的基本介紹
KpnⅠ家族是中度重復順序中僅次于Alu家族的第二大家族。用限制性內切酶KpnⅠ消化人類及其它靈長類動物的DNA，在電泳譜上可以看到4個不同長度的片段，分別為1.2,1.5,1.8和1.9kb，這就是所謂的KpnⅠ家族。KpnⅠ家族成員順序比Alu家族更長（如人KpnⅠ順序長6.4kb），而且更
真核基因組的中度重復順序—Alu家族的基本介紹
Alu家族是哺乳動物包括人基因組中含量最豐富的一種中度重復順序家族，在單倍體人基因組中重復達30萬-50萬次，約占人基因組的3-6%。Alu家族每個成員的長度約300bp，由于每個單位長度中有一個限制性內切酶Alu的切點（AG↓CT）從而將其切成長130和170bp的兩段，因而定名為Alu序列（
真核基因組的中度重復順序—rRNA基因的基本介紹
在原核生物如大腸桿菌基因組中，rRNA基因一共是七套；在真核生物中rRNA基因的重復次數更多。在真核生物基因組中18S和28S,rRNA基因是在同一轉錄單位中，低等的真核生物如酵母中，5SrRNA也和18S,28SrRNA在同一轉錄單位中；而在高等生物中，5SrRNA是單獨轉錄的，而且其在基因組
真核基因組的中度重復順序—組蛋白基因的基本介紹
組蛋白基因在各種生物體內重復的次數不一樣，但都在中度重復的范圍內。通常每種組蛋白的基因在同一種生物中拷貝數是相同的。雞的基因組中組蛋白基因有10個拷貝，在哺乳動物中為20拷貝，非洲爪蟾為40拷貝，而海膽的每種組蛋白的基因達300-600拷貝。不同生物中組蛋白基因在基因組中的排列不一樣，組蛋白基因
真骨魚類全基因組加倍后重復基因進化研究引起關注
基因和基因組加倍在進化過程中起了重要作用。1970年，Ohno提出脊椎動物進化早期的兩次基因組加倍導致了脊椎動物基因組大小和復雜性的增加，同時也為脊椎動物的進化多樣性提供了基礎。大量的比較基因組學研究顯示，真骨魚類還經歷了第三次基因組加倍，這一加倍被稱為魚類特有的基因組加倍。然而，在物種形成過程
真核基因組的中度重復順序—多聚家族的基本介紹
多聚家族的基本單位是dT－dG雙核苷酸，多個dT－dG雙核苷酸串聯重復在一起，分散于人體基因組中。已經發現，這個家族的一個成員位于人類δ和β珠蛋白基因之間，含有17個dT－dG雙核苷酸組成的串聯重復順序。在人基因組中，dT－dG交替順序達106拷貝，這些順序的平均長度為40bp。人們推測，這樣一
真核基因組的中度重復順序的長分散片段介紹
（Long interspersed repeated segments, LINES）這類重復順序的長度大于1000bp，平均長度為3500-5000bp，它們與平均長度為13000bp（個別長幾萬bp）的單拷貝順序間隔排列。也有的實驗顯示人基因組中所有LINES之間的平均距離為2.2kb,拷
揭示重復序列對三維基因組區隔化的調控作用
Cell Research | 沈曉驊/孫育杰課題組合作揭示重復序列對三維基因組區隔化的調控作用 哺乳動物基因組DNA全長近2 m，經過多層有序組織與折疊后分布于直徑5-10 μm的細胞核中。染色質高級結構對基因表達，細胞分化和胚胎發育起著至關重要的作用。其中，基因組A/B區隔化（A/B c
生物物理所揭示基因組重復序列Alu調控轉錄新機制
7月12日，中國科學院生物物理研究所薛愿超團隊在《自然》（Nature）上，在線發表了題為Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究論文。 轉錄調控在維持細胞功能和正常發育過程中起著關鍵作用。其中，增
基因組內簡單重復序列在對蝦適應性進化中的作用
近日，由中國科學院海洋研究所李富花課題組主導完成的科研論文Simple sequence repeats drive genome plasticity and promote adaptive evolution in penaeid shrimp，在Communications Biolog
研究揭示棉花異源四倍體重復基因組的進化分歧
棉田豐收? ? ? 中國農科院棉花所供圖 近日，中國農業科學院棉花研究所/棉花生物學國家重點實驗室研究員劉方團隊聯合國內外多家研究單位在全基因組水平探討了四倍體棉種的多倍化、適應性進化與馴化，揭示了棉花多倍化及人工馴化過程的遺傳變異基礎，為其他農作物多倍化研究提供了理論基礎，為棉花育種創新提供了
研究揭示棉花異源四倍體重復基因組的進化分歧
近日，中國農業科學院棉花研究所/棉花生物學國家重點實驗室研究員劉方團隊聯合國內外多家研究單位在全基因組水平探討了四倍體棉種的多倍化、適應性進化與馴化，揭示了棉花多倍化及人工馴化過程的遺傳變異基礎，為其他農作物多倍化研究提供了理論基礎，為棉花育種創新提供了重要的種質資源。相關成果在線發表于《美國國
生物學重復和技術重復的區別
生物學重復是指不同生物個體或者不同生物群體的樣品之間進行地相同處理而進行的實驗，而技術重復是指同一樣品進行的多次相同實驗。舉例：對來自三只健康小鼠A、B、C的血清樣品分別各進行一次雙向電泳，這三次雙向電泳就是生物學重復；而取其中一只小鼠的血清樣品進行三次雙向電泳，或者將三只小鼠的血清混合后的樣品進行
基因組所重復序列與哺乳動物內含子擴張關系研究獲進展
近日，在中國科學院北京基因組研究所副所長、基因組科學與信息重點實驗室主任于軍研究員和“百人計劃”雷紅星研究員的指導下，基因組所王大鵬博士、博士研究生蘇堯等科研人員在哺乳動物基因組內含子擴張與基因功能關系研究，以及突變和自然選擇在基因組進化中的作用研究中取得新進展。相關學術論文在Ev
重復感染的特點
重復感染（superinfection）是指感染尚在進行中，同一種病原體再度侵襲而又感染。
重復基因的概念
重復基因指染色體上存在多數拷貝基因，重復基因往往是生命活動最基本，最重要的功能相關的基因。
重復基因的分類
重復基因經常被分為兩種類型：（1）：中等重復DNA序列（moderately repetitive DNA）。由相對較短的序列組成。在基因組中，其重復次數一般在10~1000次。這些序列遍布整個基因組，并負責mRNA前體剪接時二級結構的形成（這是內含子中的反向重復序列配對形成雙鏈體區域）。（2）：高
基因重復的概念
基因重復（英語：Geneduplication）是指含有基因的DNA片段發生重復，可能因同源重組作用出錯而發生，或是因為反轉錄轉座（retrotransposition）與整個染色體發生重復所導致。這些基因的復制品通常可幸免于選擇壓力，也就是說，這類突變在生物體中一般無負面的影響。也因此突變的速度高
如何診斷重復腎？
1.如無異位開口及并發癥，常無癥狀，不易發現。 2.如女性患者有正常排尿，兼有尿失禁，應考慮輸尿管異位開口而作進一步檢查。 3.膀胱鏡檢查在完全型者常可看到患側多一個輸尿管口，位于外上方的常是低位腎盂來的輸尿管。 4.靜脈尿路造影，如重復腎有功能，造影時可顯示兩個腎盂腎盞；如無功能，則僅顯
細胞化學詞匯重復DNA
中文名稱：重復DNA英文名稱：repetitive DNA定 義：真核生物染色體基因組中含有不同拷貝數的核苷酸序列。這些序列一般不編碼多肽，在基因組內可成簇排布，也可散布于基因組。按序列的重復程度和特點可分為低度重復DNA、中度重復DNA和高度重復DNA。應用學科：生物化學與分子生物學（一級學科）
什么是重復子？
中文名稱重復子英文名稱duplicon定 義發生重復性畸變的染色體所具有的最小重復單位。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與基因（二級學科）