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  • 上海設施質譜分析系統助力剪接體三維結構重要發現

    8月21日,國家蛋白質科學研究(上海)設施(簡稱“上海設施”)質譜分析系統用戶清華大學施一公課題組在國際頂級期刊《科學》(Science)上在線發表了題為Structure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom Resolution 的研究論文。該文章中解析了酵母剪接體近原子分辨率的三維結構。上海設施質譜分析系統負責人黃超蘭和她的團隊成員黃敏參與了此項課題的研究,同時也是這篇論文的作者。 文中通過單顆粒冷凍電子顯微技術(冷凍電鏡)進行蛋白復合物三維結構解析。上海設施的質譜分析系統黃超蘭研究組參與了這一研究,利用高分辨質譜技術對剪接體復合物的成分進行了準確鑒定,并利用交聯質譜技術對剪接體復合物組成蛋白的分子間相互作用進行分析。質譜數據為蛋白復合物的結構搭建提供分子基礎,更為酵母剪接體結構提供了電鏡之外的最有效證據。 這一研究成果具有極為重大的意義。自上世紀70年代后期RNA剪接的發現......閱讀全文

    基因組的三維結構

      摘要: 闡明染色質復雜結構的技術有染色質構象捕獲(chromatin conformation capture, 3C)及更高通量的衍生技術4C、5C,這些提供了長距離的染色質相互作用,但不能擴展到整個染色質相互反應組。在2009年末,兩種新方法的迸發,有望繪出全基因組范圍的相互作用圖譜。  

    破解整合酶的三維結構

    英國和研究人員在1月31日的《》雜志上報告說,他們合作進行的一項最新研究模擬出的。整合酶在包括艾滋病等逆轉錄酶病毒中可以找到,并且充當了艾滋病病毒在人體內復制時的“幫兇”。這項重大突破有助于家解決困擾了艾滋病研究領域長達20年的一個難題,從而找到更好的治療艾滋病的方法。 當艾滋病病毒感染人體時,

    重要癌癥靶標三維結構獲解析

      上海科技大學iHuman研究所徐菲課題組與復旦大學、美國南加州大學和斯克瑞普斯研究所等單位合作,解析了重要癌癥靶標人源Smoothened受體的多結構域晶體結構,分辨率達到2.9埃(1埃=10-10米),相關成果日前在線發表于《自然—通訊》。  Smoothened受體是Hedgehog信號通路

    三維離子阱的結構特點及介紹

    三維離子阱,由一對環形電極(ring electrod)和兩個呈雙曲面形的端蓋電極(end cap electrode)組成。在環形電極上加射頻電壓或再加直流電壓,上下兩個端蓋電極接地。逐漸增大射頻電壓的最高值,離子進入不穩定區,由端蓋極上的小孔排出。因此,當射頻電壓的最高值逐漸增高時,質荷比從小到

    研究測定血栓形成關鍵因子三維結構

      記者日前從中科院上海藥物所獲悉,該所科學家在嘌呤能受體P2Y1R結構生物學領域再次取得突破性進展,首次測定了該受體蛋白的高分辨率三維結構,并揭示了P2Y1R抑制劑分子的作用機理,為研究治療血栓性疾病新藥提供了重要依據,同時將開啟G蛋白偶聯受體(GPCR)藥物研發的新方向。相關成果以長文形式在線發

    血栓形成關鍵受體三維結構被揭示

      中科院上海藥物所趙強研究組與美國國立衛生研究院等機構合作,揭示了血栓形成過程中關鍵受體——嘌呤能受體P2Y12R的三維結構。5月1日,兩篇獨立的研究論文同時發表于《自然》雜志。據悉,這是中國科研人員極其罕見地在頂級學術期刊上“背靠背”同期發表科研論文,第一作者為藥物所的張凱華和張進。  據介紹,

    科學家破解整合酶的三維結構

      英國和美國研究人員在1月31日的《自然》雜志上報告說,他們合作進行的一項最新研究模擬出整合酶的三維結構。整合酶在包括艾滋病病毒等逆轉錄酶病毒中可以找到,并且充當了艾滋病病毒在人體內復制時的“幫兇”。這項重大突破有助于科學家解決困擾了艾滋病研究領域長達20年的一個難題,從而找到更好的治療艾滋病的方

    Cell:重磅!首次破解人cGAS的三維結構

      人體是為生存而建造的。人體中的每一個細胞都受到一組免疫蛋白的嚴密保護,而且這些免疫蛋白裝備了幾乎萬無一失的雷達來檢測外來的或受損的DNA。  人細胞中的一個最為關鍵的哨兵是一種被稱作cGAS的“第一響應者”蛋白,它檢測外來的和發生癌變的DNA的存在,并啟動一種信號級聯反應,從而觸發身體防御。  

    美院士首次揭示DNA超螺旋的三維結構

      最近,美國貝勒醫學院的研究人員,使用一種多學科的方法,以前所未有的細節,揭示了超螺旋DNA的三維結構影像圖,從而發現它的形狀比著名的雙螺旋更加動態。相關研究結果發表在最近的《Nature Communications》。  分子病毒學和微生物學系的Lynn Zechiedrich教授和美國科學院

    中國科學家首次揭示病毒內部三維結構

      9月18日,國際頂級學術期刊《Science》雜志發表了一篇題為“冷凍電鏡揭示雙鏈RNA病毒內部聚合酶和病毒基因組的非線軸結構”的論文。論文中,兩位中國科學家首次將病毒的觀察視角從“衣殼”深入到內部,改變了過去認為該類型病毒的內部基因組應呈線軸狀排列的主流觀點,亦用一種全新方法,開啟幫助人類認知

    哺乳動物基因組三維結構首次確定

      英國醫學研究理事會網站日前報道稱,英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構,顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。  很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉,但事實上,染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。

    中國科大等首次揭示ATM激酶精細三維結構

      中國科學技術大學蔡剛課題組與南京農業大學王偉武課題組、中國科大劉海燕課題組合作,首次揭示了毛細血管擴張共濟失調癥突變蛋白——ATM激酶的精細三維結構,為理解ATM激酶活性嚴謹調控的分子機制以及研發新型腫瘤放療的增敏劑提供了重要線索,該研究成果發表于5月27日的《自然·通訊》上。論文第一作者為蔡剛

    哺乳動物基因組三維結構首次確定

      英國醫學研究理事會網站日前報道稱,英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構,顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。  很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉,但事實上,染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。

    Nature:鑒定出核孔復合物的三維結構

    核孔復合物(Nuclear Pore Complex, NPC)是細胞中最大的通道,跨越核膜的雙層膜。這個非凡的通道為細胞核和細胞質之間來回運輸大分子提供通道。迄今為止,由于它的大尺寸和動態性,從結構和功能上全面理解它一直受到阻礙。 在一項新的研究中,美國研究人員首次獲得酵母NPC的近乎完整的三維結

    Nature:史上最詳細轉錄因子TFIID三維結構出爐

      你的DNA不只是控制你眼睛的顏色和你是否卷舌。你的基因含有制造你身體所有蛋白的指令,而這些指令是你的細胞讓你存活所持續需要的。但是在此之前,基因表達在分子水平上如何運行的一些關鍵細節一直有點神秘。  在一項新的研究中,來自美國加州大學伯克利分校、勞倫斯伯克利國家實驗室和西班牙國家研究委員會(CS

    Nature:首次!葉綠素合成關鍵酶三維結構被解析

      10月23日,《自然》(Nature)在線發表葉綠素生物合成關鍵酶三維結構解析論文,該成果由中國農業科學院生物技術研究所微生物功能基因組創新團隊聯合國內外相關單位共同完成。該研究首次解析了葉綠素生物合成關鍵酶——光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶(LPOR)的三維晶體結構,揭開了光合作用終極能量來源

    《自然》:科學家破解整合酶的三維結構

      英國和美國研究人員在1月31日的《自然》雜志上報告說,他們合作進行的一項最新研究模擬出整合酶的三維結構。整合酶在包括艾滋病病毒等逆轉錄酶病毒中可以找到,并且充當了艾滋病病毒在人體內復制時的“幫兇”。這項重大突破有助于科學家解決困擾了艾滋病研究領域長達20年的一個難題,從而找到更好的治療艾滋病的方

    澳研究確定一個抗癌“剎車”分子三維結構

      澳大利亞研究人員近日宣布,他們確認了免疫系統中一個抗癌“剎車”分子CD96的三維結構。這將有利于研發癌癥免疫療法相關的靶向藥物,更好地控制腫瘤擴散。  主持這項研究的澳大利亞莫納什大學生物化學與分子生物學研究員理查德·貝里介紹,人體免疫系統“剎車”的作用是防止免疫系統攻擊健康組織。很多腫瘤就利用

    南海珊瑚島礁三維地質結構研究獲重要進展

      近日,中國科學院南海海洋研究所邊緣海與大洋地質重點實驗室研究員夏少紅團隊以突破珊瑚島礁本體淺表三維精細成像為目標,利用海洋環境噪聲透視珊瑚島礁三維地質結構取得重要進展。相關研究近日發表于《工程學》(Engineering)。  珊瑚島礁作為海洋中寶貴的國土資源,不僅是海洋資源開發和海洋權益保護的

    中美研究人員開發出三維納米“剪紙”結構

    新華社華盛頓7月7日中國和美國研究人員從中國傳統藝術“拉花剪紙”中得到靈感,制備出形貌特異的三維納米結構,有望在生物分子識別和光通信等領域獲得應用。 發表在最新一期美國《科學進展》雜志上的研究顯示,研究人員采用高劑量“聚焦離子束”作為“剪裁”手段,使厚度只有幾十納米的金膜從二維平面彎折成復

    《自然》:研究揭示端粒酶關鍵部位三維結構

    美國科學家近日利用X射線結晶學方法,揭示了控制細胞衰老定時機制的端粒酶(Telomerase)的關鍵部位。這一成果有望為絕大部分的人類癌癥提供安全的治療手段。相關論文8月31日在線發表于《自然》(Nature)雜志上。 端粒酶維持著端粒的長度,它在胚胎干細胞中高度表達,使得胚胎干細胞不斷進行分

    Cell:基因組三維結構存在細胞異質性

      美國國家癌癥研究所、哈佛大學、馬薩諸塞大學和麻省理工學院聯合開展的一項研究發現,不同細胞和不同等位基因之間的基因組組織結構存在很大差異。這項研究成果于本周發表在《Cell》雜志上。  研究人員利用高通量的染色質構象捕獲(Hi-C)和高通量的熒光原位雜交(hiFISH)光學圖譜繪制來分析人包皮成纖

    我國冷凍電鏡再發Nature-三維結構解析免疫機制

    10月2日,《自然》雜志在線發表了我國科學家的一項關于免疫系統如何發揮作用的重要成果。通過海量的實驗與計算,來自中國科學院物理所、中國醫學科學院等單位的研究人員,成功解析與原核短Ago系統相關的高分辨率三維蛋白結構,同時徹底弄清楚了原核短Ago系統在病毒入侵前后所發生的結構變化。原核短Ago中輔酶I

    學者發布RNA三維結構預測評估研究成果

    近日,廣州醫科大學-中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院聯合生命科學學院特聘教授、廣州實驗室研究員苗智超團隊與合作者,對來自全球18個團隊的預測進行了大規模評估,涉及23個RNA結構,包括RNA元件、適配體、病毒元件、核酶和核開關等多種類型RNA結構。相關研究發表于《自然-方法》(Nature Met

    我國科學家解析乙肝表面抗原三維結構

    ·這一研究不僅解決了結構生物學和病毒學領域的長期謎題,還為疫苗的優化、中和性抗體構效關系的理解提供了重要依據,特別是有望加速直接靶向病毒表面蛋白和囊膜組裝的小分子藥物以及引導表面蛋白降解的PROTAC(蛋白降解靶向嵌合體)的研發。乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染是全球嚴

    冷凍電鏡三維重構解析揭示絲狀病毒IKe結構

      清華大學醫學院向燁研究組與以色列特拉維夫大學Amir Goldbourt組合作于2019年2月28日在《美國科學院院報》(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, PNAS)雜

    利用多視角觀測揭示日珥氣泡的三維磁場結構

      暗條/日珥是懸浮于太陽高溫稀薄大氣中冷而密的等離子體云。當其位于日面上時,在Hα波段上表現為暗的吸收結構,被稱為“暗條”(Filament);而當其位于日面邊緣時,則表現為亮的發射結構,被稱作“日珥”(Prominence)。最近的日面邊緣觀測發現,在明亮日珥的下部常出現一些半圓形的空缺區域,并

    中美研究人員開發出三維納米“剪紙”結構

      中國和美國研究人員從中國傳統藝術“拉花剪紙”中得到靈感,制備出形貌特異的三維納米結構,有望在生物分子識別和光通信等領域獲得應用。  發表在最新一期美國《科學進展》雜志上的研究顯示,研究人員采用高劑量“聚焦離子束”作為“剪裁”手段,使厚度只有幾十納米的金膜從二維平面彎折成復雜的三維立體結構,加工出

    冷凍電鏡解析了哪種蛋白的三維結構

      近日,中國科學技術大學微尺度物質科學國家研究中心和生命科學與醫學部教授陳宇星和周叢照課題組與孫林峰課題組合作,利用冷凍電鏡技術首次解析了人類溶酶體維生素B12外排蛋白ABCD4的近原子分辨率三維結構,為深入理解該類膜蛋白轉運的分子機制以及其突變引發疾病的致病機理提供了基礎。該研究成果以Cryo-

    上海有機所等解析首個Piezo復合物三維結構

    Piezo家族離子通道感知機械力環境變化,將機械力信號轉化為下游電化學信號,介導多種重要的生理活動,包括觸覺、痛覺的感知、淋巴管發育、血壓調節、神經軸突再生等。它的功能的異常會導致觸覺超敏痛、淋巴管發育不良、神經退行性疾病等。而圍繞Piezo家族蛋白功能機制的研究,仍存在諸多未解之謎。例如,Piez

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