單分子測序與表觀遺傳檢測研究取得進展
生物體的遺傳信息主要由脫氧核糖核酸（DNA）上腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）和鳥嘌呤（G）四種堿基的排列順序所承載和傳遞。DNA堿基突變與表觀遺傳學異常的精準識別，對于腫瘤早篩、遺傳病診斷至關重要。 近日，中國科學院蘇州生物醫學工程技術研究所在單分子測序與表觀遺傳檢測領域取得進展。團隊開發出基于三苯胺共價有機框架納米片（TPA CONs）新型單分子堿基傳感技術，實現堿基精準分辨與DNA甲基化定量分析。 團隊通過分子模擬和實驗聯合證實，該納米片對四種堿基的吸附親和力遵循T>G>A>C的規律，靜電相互作用貢獻約70%的吸附能，成為選擇性識別的核心驅動力。結合光誘導電子轉移熒光淬滅效應，T富集序列可觸發顯著熒光淬滅，而C富集序列則保持強熒光信號，構建出無需復雜修飾、無需高端測序儀的單堿基分辨熒光傳感平臺。 研究團隊進而創新性地將這一發現應用于DNA甲基化定量檢測。通過亞硫酸氫鹽轉化與PCR，將甲......閱讀全文
單分子測序與表觀遺傳檢測研究取得進展
生物體的遺傳信息主要由脫氧核糖核酸（DNA）上腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）和鳥嘌呤（G）四種堿基的排列順序所承載和傳遞。DNA堿基突變與表觀遺傳學異常的精準識別，對于腫瘤早篩、遺傳病診斷至關重要。 近日，中國科學院蘇州生物醫學工程技術研究所在單分子測序與表觀遺傳檢測領域取得進展。
PacBio三代單分子測序獲表觀遺傳研究新發現
來自福建農林大學海峽聯合研究院林學中心等處的研究人員發表了題為“Comprehensive profiling of rhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in moso bamboo (P
測序牛人發布蛋白單分子測序技術
人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋白質是幾乎所有生命過程的主要執行者。 現在，美國亞利桑納州立大學Biodesign研究所的Stuart Lindsay及其同事，在納米孔DNA測序技術的基礎上，開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用
全新測序技術利弊比較之單分子測序
在去年召開的美國微生物學會上，來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言，這場疫情首先在德國北部地區爆發，感染了至少4000人，奪去了超過50人的生命(德國范圍內)，在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。 Harmsen教授在這場疫情
單分子測序：基因測序不再遙不可及
在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上，美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail，致力于開發一種不超過1000美元的血液檢測，用于多類型癌癥的早期篩查。這種腫瘤DNA測序的主要目的是在無癥狀的個體中診斷各種各樣的癌癥，從而實現提前預防或治療。 隨著技術的不斷進步，
單分子測序：基因測序不再遙不可及
如果說二代測序的使命是使成本降低到1000美元/基因組的話，那么三代測序的使命就是使成本降低到100美元/基因組，進一步促進測序發展為臨床的常規檢測技術，在臨床診療上發揮更大的作用。在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上，美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail，致力于
單分子測序：基因測序不再遙不可及
如果說二代測序的使命是使成本降低到1000美元/基因組的話，那么三代測序的使命就是使成本降低到100美元/基因組，進一步促進測序發展為臨床的常規檢測技術，在臨床診療上發揮更大的作用。 在年初的J.P.Morgan健康醫療大會上，美國基因測序公司Illumina宣布將創建一個新公司——Grail
－遺傳學大牛Nature發表新技術：單分子互作測序
??? George M. Church 隨著技術的發現，大規模并行DNA測序得到了廣泛的應用，為許多研究領域帶來了一場革命。然而，高通量的蛋白質分析仍然困難重重，現在亟需高質量低成本的蛋白分析技術。 為此，遺傳學界的大牛George M. Church領導哈佛醫學院的團隊，開發了一種單分子
Pacific－Biosciences－單分子實時測序
Pacific Biosciences單分子實時測序 Pacific Biosciences單分子實時（SMRT）測序使用特殊的環接頭，通過鏈置換擴增（SDA）或多置換擴增（MDA）從dsDNA片段中生成ssDNA，其基于滾動環擴增（RCA）。然后通過DNA聚合酶加入具有熒光磷酸基團（而不是熒光含氮
帶您了解單分子測序技術
單分子測序技術，也被稱為納米測序技術，是通過納米孔只允許一條鏈進入的方式，根據堿基的熒光或者電流阻斷來識別堿基序列的一種新型測序技術。這種技術包括PacBio技術和Nanopore技術兩種主要方法。 PacBio技術主要是利用熒光標記不同的堿基與待測序列、DNA聚合酶一起放入納米孔底部。當DN
解析小麥多倍化的表觀遺傳調控分子機制
近日，南京農業大學農學院教授宋慶鑫課題組在《基因組生物學》（Genome Biology）上發表了研究論文。該研究利用OCEAN-C技術繪制了不同倍性小麥的開放染色質互作圖譜，并整合了染色質可及性、組蛋白修飾和轉錄組，深入解析了六倍體小麥多倍化過程中開放元件遠距離互作調控基因表達的分子機制。
PacBio單分子測序最新科研動態
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長
PacBio單分子測序最新科研動態
DNA基因測序技術從上世紀70年代起，歷經三代技術后，目前已發展成為一項相對成熟的生物產業。測序技術的應用也擴展到了生物、醫學、制藥、健康、農林、園藝、花卉、環保、法醫等許多領域，并成為一項與我們衣食住行密切相關的高技術產業。據最新統計，2012年全球基因測序市場的產值已超過百億，按最近幾年增長速度
分子遺傳學詞匯單鏈DNA
中文名稱：單鏈DNA外文名稱：single－stranded DNA定義：大部分DNA以雙螺旋結構存在，但一經熱或堿處理就會變為單鏈狀態。
新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快捷測序
新華社布魯塞爾５月９日電（記者潘革平）比利時校際微電子中心（ＩＭＥＣ）９日發表公報說，該中心成功開發出一種能直接讀取單分子ＤＮＡ（脫氧核糖核酸）堿基的新型光學納米孔器件，有望用于遺傳學研究快捷測序。 據介紹，新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術，能以超高分辨率，實現無標記檢測ＤＮ
新型納米孔器件有望用于表觀遺傳學快捷測序
比利時校際微電子中心（ＩＭＥＣ）９日發表公報說，該中心成功開發出一種能直接讀取單分子ＤＮＡ（脫氧核糖核酸）堿基的新型光學納米孔器件，有望用于遺傳學研究快捷測序。 據介紹，新型器件結合了表面增強拉曼光譜和納米孔流體技術，能以超高分辨率，實現無標記檢測ＤＮＡ中的遺傳編碼以及表觀遺傳變異。研究近期發
單分子測序推動復雜動植物的研究
Pacific Biosciences公司近日風光無限，發布了新系統，帶動股價大漲。同時，它的單分子實時（SMRT）測序技術也助力了多個植物和動物基因組的研究。這些成果近期發表在多個期刊上，展現了SMRT測序的獨特魅力。 最新一期的《Nature》雜志發表了Oropetium thomaeum
單分子測序公司Nabsys被曝已關門
據美國媒體GoLocalProv報道，單分子DNA測序公司Nabsys已關門，它位于普羅維登斯的工廠已關閉。據其他媒體透露，Nabsys的電話無人接聽，發給公司各個官員的電子郵件也無人回復。 Nabsys的平臺使用固態納米檢測儀來分析單個DNA分子，揭示長距離內DNA序列的位置和身份，適合基因
Nature子刊：蛋白單分子測序技術問世
最近，美國學者在納米孔DNA測序技術的基礎上，開發了能夠精確鑒定氨基酸的蛋白單分子測序技術。這一技術不僅可以用來在臨床上測序蛋白質和檢測新生物指標，還有望給醫療領域帶來徹底的改變，在單分子水平上精確監控患者對治療的應答情況??????? 人類生命的藍圖是三十億堿基對組成的人類基因組。而DNA編碼的蛋
什么是表觀遺傳？
表觀遺傳學是研究基因的核苷酸序列不發生改變的情況下，基因表達的可遺傳的變化的一門遺傳學分支學科。表觀遺傳的現象很多，已知的有DNA甲基化（DNA methylation），基因組印記（genomic imprinting），母體效應（maternal effects），基因沉默（gene silen
甲基化測序捕捉三陰性乳腺癌表觀遺傳特性
近日，一篇刊登在國際雜志Nature Communications上的研究報告中，來自澳大利亞悉尼加文醫學研究所（Garvan Institute of Medical Research）的科學家們通過將乳腺癌患者機體的乳腺癌甲基化組同健康個體進行比較從而繪制出了一種新型的基因組圖譜，其可以幫助
全新表觀遺傳分子助力口頜面自身免疫疾病診治
近日，上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院（以下簡稱“九院”）口腔外科鄭凌艷課題組聯合口腔微生態與系統性疾病實驗室，原創性地挖掘了介導免疫細胞糖代謝重編程的全新表觀遺傳分子，為口頜面自身免疫疾病診治提供了新思路，相關研究發表于《細胞代謝》。自身免疫疾病是由免疫細胞自發性激活導致的一大類疾病，部分典型的
全新表觀遺傳分子助力口頜面自身免疫疾病診治
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516734.shtm近日，上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院（以下簡稱“九院”）口腔外科鄭凌艷課題組聯合口腔微生態與系統性疾病實驗室，原創性地挖掘了介導免疫細胞糖代謝重編程的全新表觀遺傳分子，為口頜面自身
Nature子刊：單分子測序揭示鸚鵡模仿能力
研究團隊通過單分子測序揭示了鸚鵡基因組的特殊區域，并采用第二代測序技術對單分子測序數據進行了修正。文章發表在7月1日Nature Biotechnology雜志網站上。 如今單分子測序技術炙手可熱，這一新技術能生成超長的測序讀段，“能更容易拼裝基因組的復雜部分，”文章的共同作者Duke
單分子測序輕松升級參考基因組
現代基因組學的最大需求之一，就是得到人類和模式生物的高質量完成基因組。目前，人們利用二代測序技術對越來越多的物種(從原核生物到真核生物)進行了基因組測序，取得了許多重要的研究成果。 不過大部分物種的基因組還中存在有大量的缺口gap，就目前的數據來說，各種已測序物種的基因組中缺口gap所占的
5000bp！單分子測序讀長再次升級
PacBio RS單分子測序在發布時就以其超長的讀長引起研究者的極大興趣。在不到一年的時間里，隨著年初C2試劑的升級，Pacbio RS的平均讀長達到了3000bp，并迅速在測序的各個領域，特別是De novo中發揮了巨大的讀長優勢。Pacific Biosciences公司在11月6日
單分子實時測序技術的三大優勢
Biosciences的單分子實時測序技術(SMRT)因其出色的讀長而引人注目。然而，因通量較低，且一直被錯誤率高的流言所困擾，SMRT技術似乎有些被忽視。近日，幾位著名科學家在《Genome Biology》雜志上發表文章，試圖消除這些誤解，為SMRT正名。 這篇文章的通訊
表觀遺傳學測序技術助力三陰性乳腺癌患者分層
一組澳大利亞的研究員使用甲基化特異性測序技術發現了三陰性乳腺癌中某些甲基化的差異，這些差異可能具有預后價值。 如果患者缺乏雌激素、孕激素受體，并且HER2基因沒有過表達或者擴增，則認為乳腺癌是“三陰性”的。具有三陰性乳腺癌（或TNBC）的患者，可以分成兩部分，即癌癥進展非常迅速或者進展非常緩慢
表觀遺傳研究指南（二）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
表觀遺傳學修飾
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節，這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映，這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因