你必須知道的質譜鑒定中10條FAQ
質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用,應用前景十分廣泛。那么,有問題了怎么解決呢? 問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(peptide-mass mapping, PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定,二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF的結果從而實現蛋白質的鑒定。二級質譜能夠得到部分肽短的序列,具有更高的可靠性。隨著現在雜志對數據的要求越來越嚴格,二級質譜鑒定是蛋白鑒定的大趨勢,而且即使目前做一級質譜鑒定的結果,也需要挑選部分PMF結果做二級質譜驗證。 問題2. 研究的物種不是模式生物怎么辦? 答:可以參考親緣關系最近的模式生物做比對而實現蛋白質的成功鑒定,如果質譜圖很好而沒有鑒定結果說明這是一個全新的蛋白,可以采用d......閱讀全文
蛋白鑒定方法之質譜相關技術
質譜已成為連接蛋白質與基因的重要技術,開啟了大規模自動化的蛋白質鑒定之門。 用來分析蛋白質或多肽的質譜有兩個主要的部分,1)樣品入機的離子源,2)測量被介入離子的分子量的裝置。 首先是基質輔助激光解吸附電離飛行時間質譜(MALDI-TOF)為一脈沖式的離子化技術。 它從固相標本中產生離子,并在飛
質譜鑒定,常見疑問解答
問題1、一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級?答:一級質譜鑒定的方式主要為胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定;二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF的
蛋白質質譜鑒定技術概述及常見問題
蛋白質(Protein)是生物體中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物細胞,作為生命的物質基礎之一,蛋白質在催化生命體內各種反應進行、調節代謝、抵御外來物質入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關重要的作用,因此蛋白質也是生命科學中極為重要的研究對象。現代研究結果發現越來越多的多肽同蛋白質一樣
蛋白質凝膠電泳后或者質譜后怎么鑒定
看你的目的.如果你只是檢測目標蛋白大小的話,加上蛋白質marker,考染觀察條帶大小即可.你要是想知道蛋白質的氨基酸序列的話就去打質譜.話說蛋白質的質譜就是序列分析.
如何判定蛋白質的質譜鑒定結果的差異
1 單個蛋白鑒定1. 用于鑒定純化的單個蛋白的溶液或粉末,或經過SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)的單個條帶或二維電泳的單個點。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分離多肽,離子化的多肽進入質譜,母離子檢
如何判定蛋白質的質譜鑒定結果的差異
1 單個蛋白鑒定1. 用于鑒定純化的單個蛋白的溶液或粉末,或經過SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)的單個條帶或二維電泳的單個點。2. 蛋白酶解成多肽。3. 液相分離多肽,離子化的多肽進入質譜,母離子檢
暨大研發另類質譜鑒定算法,大幅提高蛋白質組鑒定能力
暨南大學的研究人員利用翻譯組測序(RNC-seq)數據作為穩態細胞內蛋白質的“標準答案”,并另辟蹊徑,提出了蛋白水平上的一種簡單有效的多算法結果整合策略,不用做額外的實驗,零成本輕松提高蛋白質組鑒定數量,同時有效降低假陽性率。 鳥槍法質譜(shotgun mass spectrometry)是
質譜鑒定微生物的原理
在應用MALDI-TOF MS時,通常將微生物樣本與一種飽和的低分子量無機化合物溶液(稱為基質)進行混合加在靶板上,待干后樣本與基質共結晶后形成了以基質包裹構架的樣本固體沉淀。樣本基質結晶體經激光輻射,基質從激光中吸收能量使樣品吸附,基質與樣品之間發生電荷轉移使得樣品分子電離,離子在加速電場下獲
暨大另類質譜鑒定算法策略大幅提高蛋白質組鑒定能力
鳥槍法質譜(shotgun mass spectrometry)是蛋白質組研究的標準研究方法。從質譜譜圖中鑒定蛋白質需要依賴搜庫算法,現有許多算法被開發出來,常見的如Andromeda(Maxquant), Mascot, COMPASS, X!Tandem, pFind, InsPecT, P
利用納升級液相色譜-串聯質譜進行蛋白質鑒定實驗
實驗材料修飾胰蛋白酶試劑、試劑盒消化緩沖液萃取液清洗液脫色液儀器、耗材多通道移液槍Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管實驗步驟3.1 膠內蛋白的水解和多肽的提取(一天的實驗方案)對于從 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 電泳(經考馬斯亮藍 G-250
利用納升級液相色譜-串聯質譜進行蛋白質鑒定實驗
實驗材料:修飾胰蛋白酶試劑、試劑盒:消化緩沖液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? 萃取液 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
利用納升級液相色譜--串聯質譜進行蛋白質鑒定實驗
實驗材料 修飾胰蛋白酶試劑、試劑盒 消化緩沖液萃取液清洗液脫色液儀器、耗材 多通道移液槍Eppendorf Repeater 分液器Combitips 分液管實驗步驟 3.1 膠內蛋白的水解和多肽的提取(一天的實驗方案)對于從 SDS-PAGE,2D-PAGE,BN-PAGE 電泳(經考馬斯亮藍
質譜鑒定常見問題解答
1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定,二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合
質譜鑒定常見問題解答
1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量并搜庫比較實現蛋白質的鑒定,二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎并對碎片進行深入分析和比較,鑒定出該肽段的序列并結合PMF
蛋白質質譜測序
蛋白質譜一般來講是用來對某個蛋白質進行鑒定的方法而蛋白質測序實際上就是檢測蛋白質的多肽鏈數目,不一定要用到質譜技術簡單說,蛋白質測序的方法有很多,一般是在構建完成后,通過測序來對比之前的預測的序列是否正確。而質譜檢測一般是用在蛋白質表達純化完成后,用來鑒定是否是最初設計的那個蛋白。
蛋白質化學交聯結合質譜鑒定技術取得新進展
3月8日,國際著名期刊《eLife》在線發表了北京協和醫學院、北京生命科學研究所(NIBS)、北京大學和清華大學等處的一項最新成果,題為 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks an
蛋白質質譜鑒定技術概述及常見問題解決方法
蛋白質(Protein)是生物體中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物細胞,作為生命的物質基礎之一,蛋白質在催化生命體內各種反應進行、調節代謝、抵御外來物質入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關重要的作用,因此蛋白質也是生命科學中極為重要的研究對象。 現代研究結果發現越來越多的多肽
細菌鑒定讓MALDITOF質譜煥發青春
? ? ? MALDI,即基質輔助激光解析電離(Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization),是指離子源,也就是激發部分。這就好像是槍支的子彈,有圓形單頭和尖形單頭,有的善于穿甲、有的善于爆破。MALDI離子源屬于軟電離,相比之下還有其他離子源,其電離方
蛋白、測序、質譜全方位布局,達瑞生物參展臨床質譜論壇
2023年4月14-15日,“第四屆北京臨床質譜會”成功舉辦。廣州市達瑞生物技術股份有限公司(以下簡稱“達瑞生物”) 在本次論壇帶來了其標志性的串聯質譜平臺和飛行時間質譜平臺產品。分析測試百科網邀請到達瑞生物華北大區銷售總監賈廣鋒,為觀眾詳細介紹產品。 關于達瑞生物: 廣州市達瑞生物技術股份
好消息-美研究人員開源了脂質質譜鑒定軟件LIQUID
分析測試百科網訊 近日,一份基于LC-MS/MS ,針對脂質鑒定的開源軟件被發布出來。 脂多糖在許多代謝疾病中起關鍵作用,包括高血壓,糖尿病和中風。因此,身體的脂質-其“脂質體”的完整概況非常重要。 脂質體研究通常基于與串聯質譜聯用的液相色譜(LC-MS / MS)。但是研究人員很難快速處理
奧美拉唑藥物雜質高分辨質譜快速鑒定(二)
II. Mass Frontier 用于未知物的結構鑒定采用Mass Frontier 的“碎片離子搜索”(FISh)功能處理HRAM 全掃描和 MS/MS 數據,見圖 3-a。 FISh 能輕易識別出與母體化合物具有相同碎片離子的化合物,見圖 3-b,并根據碎片推斷出可能的雜質結構,見圖
你必須知道的質譜鑒定中10條FAQ
質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用,應用前景十分廣泛。那么,有問題了怎么解決呢? 問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式主要指胎指紋圖譜(peptide-mass mapping, PMF),即利用質譜儀精確測量酶解片段的分
你必須知道的質譜鑒定中14條FAQ
質譜技術在蛋白鑒定等實驗中具有不可忽視的作用,不過,目前的應用還不是特別廣泛。那么,有問題了怎么解決呢?本文收集了相關的新手對于這項技術的常見問題與解決方法。希望能更好地幫助大家了解這項技術。 問題1. 一級質譜和二級質譜有什么區別?什么時候做一級,什么時候做二級? 答:一級質譜鑒定的方式
奧美拉唑藥物雜質高分辨質譜快速鑒定(一)
前言雜質分析對于藥物的研發至關重要 1。在研究過程中,雜質譜信息能幫助藥物化學家優化合成路線和避免潛在的有毒雜質。在開發過程中,當大量母體化合物存在時,鑒定和表征痕量雜質至關重要,從而促進了高分辨率、高靈敏度和高掃描速度的 HR-MS 儀器和智能化結構鑒定軟件的發展。為了展示 HR-MS
質譜及質譜的目的
質譜,是一種分析方法,原理就是讓帶電原子、分子或分子碎片按質荷比的大小順序排列,打出相應的譜線。待分析的樣品分子在離子源中離化成具有不同質量的單電行分子離子和碎片離子,這些單電荷離子在加速電場中獲得相同的動能并形成一束離子,進入由電場和磁場組成的分析器中;其中離子束中速度較慢的離子通過電場后編轉大,
氣體分析質譜質譜原理
? ? 質譜儀配備QuaderaTM 分析軟件, 操作簡單, 功能強大, 有128 個檢測通道,可生成用戶特殊應用軟件界面. 在參數設置, 多種實測方式, 譜庫, 數據統計, 譜圖放大, 光標, 輸入輸出模塊等性能的支持下, 可以更方便地進行定性定量分析以及在線離線分析.? ? ?Omnistar/
質譜檢測法與蛋白質分析
? ? 質譜分析法是蛋白質研究領域和生物大分子研究領域中最重要的分析技術。由于我們對蛋白質鑒定、定量和分析的要求越來越高,希望檢測技術的靈敏度也越來越高,同時能夠對更為復雜的樣品進行分析處理,因此推動了質譜檢測技術的發展,出現了一大批新興的質譜分析方法和儀器。? ? 在生命科學研究工作中有一個重要問
質譜檢測法與蛋白質分析
在生命科學研究工作中有一個重要問題,就是發現、鑒定蛋白質并弄清楚它們的一級結構。知道了蛋白質的氨基酸序列信息,我們就可以通過遺傳密碼將其與編碼序列對應起來,從原則上來說,也就將細胞的生理學與遺傳學聯系起來了。發現、鑒定出了一個蛋白質就好像給我們打開了一扇窗,透過這個窗口,我們就能夠對復雜的細胞調控網
質譜
不同質荷比的離子經質量分析器分離,而后被檢測并記錄下來的譜圖叫作質譜圖。簡稱質譜。質譜圖的橫坐標是質荷比(m/z) ,縱坐標是離子強度;質譜法(Mass Spectrometry) 即質譜分析法, 一般亦簡稱為質譜;質譜計(Mass Spectrometer): 采用順次記錄各種質荷比離子的強度的方
利用MALDI質譜進行高級微生物鑒定以精簡治療
引起人類疾病的病原微生物種類繁多。不同微生物菌株會導致不同程度的疾病,從普通感冒到可能危及生命的感染,如結核病(TB)。類似地,不同菌株對抗菌藥物的敏感性不同,有些菌株對多種藥物完全耐藥,有些菌株具有中等敏感性,有些菌株則對治療完全敏感。 抗生素耐藥性對全球健康構成了嚴重威脅,并給全球醫療體系