北大魏文勝課題組：提高基因敲除效率的新方法
基因組編輯技術，可讓科學家們能夠在各種哺乳動物細胞系中實現基因敲除。然而，用一種典型的方法，以一種及時的方式，完全破壞一個靶基因，在技術上是具有挑戰性的。為了提高產生可靠基因組修飾的效率，北京大學生命科學學院魏文勝課題組，設計了一種方法，其使用一個線性供體片段，該片段包含一個報告系統。結合一種不依賴于同源重組（HR）的敲入策略，研究人員成功地富集了特異性攜帶靶基因突變的細胞克隆。相關研究結果發表在11月1日的《FEBS Letter》雜志。基因組編輯技術徹底改變了基因功能的實驗性研究。三大主要技術：ZFN（鋅指核酸酶）、TALENs（轉錄激活因子樣效應物核酸酶）和CRISPR / CAS系統，采用不同的機制來產生序列特異性雙鏈斷裂（DSB），隨后觸發本地修復系統來完成序列特異性的修飾。這些強大的技術在功能基因研究、染色體位點的動態和實時成像、疾病突變的糾正、基因療法中有著廣泛的應用。CRISPR / Cas系統由于其效率高、易操......閱讀全文
上海生科院開發出腫瘤基因組等位基因特異性表達新算法
7月13日，國際學術期刊Bioinformatics在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所李亦學研究組的最新研究論文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec
上海生科院開發出腫瘤基因組等位基因特異性表達新算法
7月13日，國際學術期刊Bioinformatics在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所李亦學研究組的最新研究論文cisASE: A likelihood-based method for detecting putative cis-regulated allele-spec
等位基因特異性PCR的功能
等位基因特異性PCR（ allele specific PCR，AS-PCR ），是指利用引物與模板之間的堿基錯配可以有效地抑制PCR反應，進而達到模板區分（等位基因區分）的目的。
等位基因特異性PCR的應用
由于PCR過程中引物延伸是3'端開始的，所以3'末端的堿基對引物的延伸來說處于至關重要的位置。如果這個堿基與模板互補，則引物能從不間斷延伸，PCR可以正常進行，得到特定長度擴增帶。反之，則不能延伸。所以只要將與正常等位基因所不同的那個突變堿基安排在引物3'最末端，當用某一含突
等位基因特異性PCR的原理
等位基因特異性PCR（ allele specific PCR，AS-PCR ），是指利用引物與模板之間的堿基錯配可以有效地抑制PCR反應，進而達到模板區分（等位基因區分）的目的。
等位基因特異性擴增法簡介
等位基因特異性擴增法（allele -specific amplificarion,ASA) 是基于PCR技術的一種單核苷酸突變檢測法，是分析已知堿基替代或微小片段缺失和插入型突變的常規技術。在PCR 的引物設計中，根據已知突變位點性質在引物3 ' 端或中間設計一錯配堿基，使之僅能與突變
組織特異性基因敲除的定義
中文名稱組織特異性基因敲除英文名稱tissue-specific gene knockout定 義在特定組織細胞類型中使基因功能完全喪失的實驗技術。應用學科遺傳學（一級學科），發育遺傳學（二級學科）
等位基因特異性PCR近期改進方法
1. 在3‘末端附近引入額外錯配2. 腺苷三磷酸雙磷酸酶介導的等位基因特異PCR法(apyrase-mediated allelespecific extension, AMASE)3. 焦磷酸解激活的聚合反應法(Pyrophosphorolysis-activated polymerization
等位基因特異性PCR技術的原理
由于PCR過程中引物延伸是3'端開始的，所以3'末端的堿基對引物的延伸來說處于至關重要的位置。如果這個堿基與模板互補，則引物能從不間斷延伸，PCR可以正常進行，得到特定長度擴增帶。反之，則不能延伸。所以只要將與正常等位基因所不同的那個突變堿基安排在引物3'最末端，當用某一含突
等位基因特異性PCR的工作原理
由于PCR過程中引物延伸是3'端開始的，所以3'末端的堿基對引物的延伸來說處于至關重要的位置。如果這個堿基與模板互補，則引物能從不間斷延伸，PCR可以正常進行，得到特定長度擴增帶。反之，則不能延伸。所以只要將與正常等位基因所不同的那個突變堿基安排在引物3'最末端，當用某一含突
等位基因特異性PCR的技術特點
等位基因特異性PCR（ allele specific PCR，AS-PCR ），是指利用引物與模板之間的堿基錯配可以有效地抑制PCR反應，進而達到模板區分（等位基因區分）的目的。
北大魏文勝課題組：提高基因敲除效率的新方法
基因組編輯技術，可讓科學家們能夠在各種哺乳動物細胞系中實現基因敲除。然而，用一種典型的方法，以一種及時的方式，完全破壞一個靶基因，在技術上是具有挑戰性的。為了提高產生可靠基因組修飾的效率，北京大學生命科學學院魏文勝課題組，設計了一種方法，其使用一個線性供體片段，該片段包含一個報告系統。結合一種不
北大魏文勝課題組：提高基因敲除效率的新方法
基因組編輯技術，可讓科學家們能夠在各種哺乳動物細胞系中實現基因敲除。然而，用一種典型的方法，以一種及時的方式，完全破壞一個靶基因，在技術上是具有挑戰性的。為了提高產生可靠基因組修飾的效率，北京大學生命科學學院魏文勝課題組，設計了一種方法，其使用一個線性供體片段，該片段包含一個報告系統。結合一種不依賴
等位基因特異性PCR技術的研究發展
ASPCR的發展，主要是圍繞提高3’末端堿基錯配分辨率來進行的。為了提高ASPCR對末端堿基錯配的分辨力，人們嘗試了許多方法。比如：改換另一條鏈進行分析以規避這些錯配延伸率高的堿基組合；把控制PCR反應的關鍵成分稀釋到接近極限的濃度；在檢測用引物的3'末端附近人為引入新的錯配；截短Taq D
等位基因特異性PCR早期的改進方法
Bottema 等（1993）提出兩個解決方案：一是設計引物時，如果引物3'末端可能與樣品模板形成延伸率高的堿基錯配，那么可以考慮以其互補鏈作為模板，從而避開這些高延伸率的錯配。二是把控制PCR反應的關鍵成分稀釋到接近極限的濃度。由于錯配延伸效率畢竟比正配延伸要差，在擴增資源極低的情況下，錯
基因組分析揭示等位基因特異RNA編輯現象
核糖核酸（RNA）編輯是RNA水平一種常見的修飾，是增加基因轉錄和功能多樣性的重要形式。17日，來自中科院昆明動物研究所的消息，由張亞平院士領導的、多個研究機構加盟的團隊，在等位基因特異的RNA編輯研究上取得了重要進展。 中科院昆明動物研究所周中銀博士介紹，對二倍體生物來說，雖然兩個等位基
基因組分析揭示等位基因特異RNA編輯現象
核糖核酸（RNA）編輯是RNA水平一種常見的修飾，是增加基因轉錄和功能多樣性的重要形式。17日，來自中科院昆明動物研究所的消息，由張亞平院士領導的、多個研究機構加盟的團隊，在等位基因特異的RNA編輯研究上取得了重要進展。 中科院昆明動物研究所周中銀博士介紹，對二倍體生物來說，雖然兩個等位基因的
基因敲除（KO）在驗證抗體特異性的應用
抗體作為基礎科學研究和臨床試驗常用的工具之一，主要通過抗原-抗體的反應揭示蛋白質在生命活動中的變化。盡管它們被廣泛的使用，但是沒有相關標準以確保商業抗體特異性和質量上的一致性。這使得科學界一直存在“重現危機”，浪費了科學家們大量的時間和金錢，妨礙生命科學研究的快速發展。因此，對抗體進行敏感性和特異性
豬等位基因特異性表達的時空特異性首獲系統研究
近日，我國學者首次系統研究了豬等位基因特異性表達（ASE）的時空特異性，揭示了在不同發育時期、不同組織中的親本決定型和等位基因型決定型兩種ASE類型。相關成果在線發表于《自然-通訊》雜志。現代養豬產業普遍采用專門化品系選育和配套系雜交，其目的是充分利用雜種優勢。基因表達調控是將基因型轉化為表型的關鍵
Nat－Med：等位基因特異性基因編輯有望治療遺傳性耳聾
在一項新的研究中，來自美國哈佛醫學院和波士頓兒童醫院的研究人員利用一種新的基因編輯方法挽救了患有遺傳性聽力喪失的小鼠的聽力，而且在成功地做到這一點的同時沒有產生任何明顯的脫靶效應。這些被稱為貝多芬小鼠（Beethoven mice）的動物因為具有相同的導致人類進行性聽力喪失（progressiv
等位基因特異性寡核苷酸印跡的功能作用
一種測定基因突變的方法。即應用等位基因特異性寡核苷酸(ASO)僅與完全互補的序列結合，故1個堿基錯配即足以阻止ASO探針與目的基因片段雜交；將ASO探針連接dT多聚尾巴，結合于固相支持物上，受檢基因在雜交液中，生物素標記的DNA可結合辣根過氧化物酶，借助抗生物素系統使無色基質變成有色沉淀，從而進行測
等位基因特異性寡核苷酸印跡的方法介紹
中文名稱等位基因特異性寡核苷酸印跡英文名稱allele specific oligonucleotide blot定 義一種測定基因突變的方法。即應用等位基因特異性寡核苷酸(ASO)僅與完全互補的序列結合，故1個堿基錯配即足以阻止ASO探針與目的基因片段雜交；將ASO探針連接dT多聚尾巴，結合于固
等位基因特異性寡核苷酸印跡的方法特點
中文名稱等位基因特異性寡核苷酸印跡英文名稱allele specific oligonucleotide blot定 義一種測定基因突變的方法。即應用等位基因特異性寡核苷酸(ASO)僅與完全互補的序列結合，故1個堿基錯配即足以阻止ASO探針與目的基因片段雜交；將ASO探針連接dT多聚尾巴，結合于固
哺乳動物中制備基因組DNA實驗
制備DNA ? ? ? ? ? ? 實驗材料 動物組織 試劑、試劑盒
哺乳動物中制備基因組DNA實驗
實驗材料 動物組織試劑、試劑盒 PBS乙酸銨乙醇酚氯仿異戊醇TE儀器、耗材 離心機搖床研缽實驗步驟 1. ?切下組織并立即剪成小塊，置于液氮中凍結。?2. ?將200 mg~1 g 的組織用預冷的研缽和研杵研碎，或用錘子將其搗為細粉末，每100 mg 組織用1. 2 ml 消化緩沖液懸浮。?3. ?
哺乳動物“共同祖先”基因組重建完成
從鴨嘴獸到藍鯨，每一種現代哺乳動物都是生活在大約1.8億年前的“共同祖先”的后裔。人們對“共同祖先”知之甚少，現在，一個國際研究小組通過計算重建了其基因組。該成果將發表在《美國國家科學院院刊》上，對理解哺乳動物的進化和保護工作具有重要意義。 研究人員利用了來自32個活物種的高質量基因組序列，這
大腸桿菌基因組基因無痕敲除的優化方法
近幾十年來， 大腸桿菌是基因工程、 代謝工程和合成生物學等領域的重要工具菌株，是生產重組蛋白、氨基酸、有機酸、能源物質和一些重要化工產品的主力微生物之一。為使大腸桿菌獲得新的性狀和生產能力， 基因敲除及基因敲入是構建新型大腸桿菌的重要手段。 近幾十年來， 大腸桿菌是基因工程、 代謝工程和合成
研究揭示蘋果轉座子調控等位基因特異性表達機制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484573.shtm ?蘋果花瓣顏色與MYB10和MYB110a的表達量相關。中國農科院果樹所供圖 近日，中國農業科學院果樹研究所蘋果資源與育種創新團隊聯合國內外科研機構，從全基因組層面上闡
等位基因特異性寡核苷酸印跡的定義和方法
中文名稱等位基因特異性寡核苷酸印跡英文名稱allele specific oligonucleotide blot定 義一種測定基因突變的方法。即應用等位基因特異性寡核苷酸(ASO)僅與完全互補的序列結合，故1個堿基錯配即足以阻止ASO探針與目的基因片段雜交；將ASO探針連接dT多聚尾巴，結合于固
等位基因的概念
在同源染色體上占據相同座位的不同形態的基因都稱為等位基因。