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  • 在基因組范圍定位DNA甲基化

    DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定,但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來,科學家們開發出多種新方法,試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說,全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組,但它還是面臨技術以及費用上的問題。測序覆蓋通常對GC含量非常高和非常低的區域有偏見,即使是在20-40倍覆蓋度,全基因組亞硫酸氫鹽測序仍不能檢測出低密度CpG島的某些甲基化差異。對于此,Broad研究院的 Christoph Bock認為,盡管更深度測序是解決方案,但費用是主要問題。在全基因組亞硫酸氫鹽測序變得更實惠之前,研究人員只能采取代表性較低的亞硫酸氫鹽測序,來選擇性掃描甲基化組。 有些研究人員采用甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP)或通過親和純化的甲基化DNA捕獲(MethylCap),再加上測序,來研究感興趣的甲基化區域。Bo......閱讀全文

    基因組DNA甲基化分析方法

    早期的基因組DNA甲基化分析技術,如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等,已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化,它是在擴增片段長度多態性技術的基

    在基因組范圍定位DNA甲基化

      DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定,但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來,科學家們開發出多種新方法,試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。   盡管從理論上來說,全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組,但它還是面臨技

    線蟲基因組中存在DNA甲基化現象

      2012年10月18日,吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史,同時也使以DN

    基因組直接測序法檢測DNA的甲基化

    基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解反應

    人類基因組DNA甲基化數據分析

      近期來自電子科技大學,清華大學等處的研究人員從CpG島等基本定義出發,闡述了高通量DNA甲基化的檢測技術以及針對芯片技術與下一代測序技術的低水平數據處理方法,并重點對比了基于機器學習理論對CpG位點及CpG島甲基化水平的預測算法,以及所利用的特征對預測效果的影響與發展趨勢。  DNA甲基化是表觀

    DNA甲基化分析

    The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive

    DNA甲基化預測

    實驗概要本實驗分別對DNA片段、基因、啟動子和外顯子進行了甲基化的計算預測,并且隨機選擇了1000甲基化的和1000未甲基化的個體進行預測。用于甲基化預測的特征有:GC相關特征、四聯體頻率、轉錄因子結合位點(TFBSs)。所有預測方法均采用Weka提供的軟件進行。實驗步驟1. DNA甲基化數據本研究

    揭示全基因組DNA甲基化、半甲基化與遺傳突變的新方法

      5月31日,中國科學院北京生命科學研究院研究員孫中生團隊與北京大學腫瘤醫院合作,在Briefings in Bioinformatics上,發表了題為A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl

    中國科學家首次發現線蟲基因組存在DNA甲基化現象

    中國科學家最新研究成果首次證實在旋毛蟲基因組中發現了甲基轉移酶并證實了DNA甲基化的存在,改寫了長期以來認為線蟲中沒有該種表觀遺傳修飾的歷史。同時也使以DNA甲基化序列做靶標進行抗寄生蟲藥物研發成為可能,為抗旋毛形線蟲病的藥物開發提供了全新思路。 吉林大學人獸共患病研究所和華大基因研究院合作完成的

    Nature-Genetics:單細胞全基因組DNA甲基化組新發現

      北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心,北大生命科學學院與第三醫院等處的研究人員發表了題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用單細胞DNA甲基化組高通量測序方法,首次在單細胞分辨

    什么是DNA甲基化?

    DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性

    DNA甲基化技術介紹

    DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分,在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用,是目前新的研究熱點之一。介紹DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶(DN

    DNA甲基化的原理

    DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作為甲基供體,通過共價鍵結合的

    什么是DNA甲基化?

    DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性

    dna甲基化與rna甲基化的區別

    DNA甲基化和組蛋白修飾的相同點:都有包含甲基化修飾;不同點:修飾對象不同,一個是對DNA修飾,一個是對蛋白:組蛋白修飾。而RNA干擾是對RNA的降解,與前兩者差異較大。

    北京基因組所開發完成DNA甲基化重編程數據庫

      DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記,在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用,不同物種所采用的機制亦各不相同。因而,整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析,可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異,并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。   

    DNA甲基化反應類型

    DNA甲基化反應分為2種類型。一種是2條鏈均未甲基化的DNA被甲基化,稱為從頭甲基化(denovo methylation);另一種是雙鏈DNA的其中一條鏈已存在甲基化,另一條未甲基化的鏈被甲基化,這種類型稱為保留甲基化(maintenance methylation)。

    細胞化學詞匯DNA甲基化

    中文名稱:DNA甲基化外文名稱:DNA methylation影????響:控制基因表達甲基酶分類:DNM T1、DNM T3a、DNM T3b作????用:修飾DNA序列

    DNA的誘變和甲基化

    ·?????????In Vitro Mutagenesis Using Altered Sites?(Bowtell Lab)?In vitro Mutagenesis with dut ung single stranded DNA?(Hahn Lab)·?????????Site-direct

    簡述DNA甲基化的原理

      DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作為甲基供體,通過共價鍵結

    概述DNA甲基化的機制

      由于Dnmtl和Dnmt3基因家族沒有針對CpG二核苷酸序列的特異性,人們因此提出了DNA甲基化轉移酶發現靶位點的機制。首先,甲基化轉移酶并不是同等地接近所有染色體區域。具有染色體重構和DNA螺旋酶活性的蛋白質能調節哺乳動物細胞內DNA甲基化,如SNF2家族2個成員ATRX和Lsh;其次,附件因

    DNA甲基化的作用原理

    DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作為甲基供體,通過共價鍵結合的

    DNA甲基化的作用特點

    DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性

    關于DNA甲基化的簡介

      DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩

    DNA的去甲基化過程

    DNA的去甲基化由基因內部的片段及與其結合的因子所調控。有兩種假說可以解釋DNA去甲基化的分子機制。一種假說與DNA半保留復制聯系在一起,為被動去甲基化。如果甲基化的DNA經半保留復制后不被甲基化,其DNA則處于半甲基化狀態,半甲基化的DNA如再次發生DNA半保留復制,而DNA甲基化活性仍被抑制,則

    吸煙可以改變-DNA-甲基化

      近日,英國 Nature 出版社子刊《Scientific Reports》在線發表了浙江大學醫學院附屬第一醫院李明定教授和他的學生馬云龍博士最新研究成果——首次利用系統生物學的方法探討吸煙如何導致癌癥發生的表觀遺傳學機制,證明了吸煙可以通過改變 DNA 甲基化而導致癌癥的發生,為預防和治療由吸

    DNA甲基化有什么作用

    DNA甲基化作用主要是DNA甲基轉移酶以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)為甲基供體,將甲基轉移至堿基特定結構上的過程。哺乳動物中90%的DNA甲基化修飾是由DNA甲基轉移酶識別DNA的5'CG-3'序列(CpG),并將SAM的甲基轉移至胞嘧啶C-5位上。DNA 甲基化可引起基因組中相應區域

    DNA甲基化的類型介紹

    DNA甲基化反應分為2種類型。一種是2條鏈均未甲基化的DNA被甲基化,稱為從頭甲基化(denovo methylation);另一種是雙鏈DNA的其中一條鏈已存在甲基化,另一條未甲基化的鏈被甲基化,這種類型稱為保留甲基化(maintenance methylation)。

    DNA甲基化的過程介紹

    由于Dnmtl和Dnmt3基因家族沒有針對CpG二核苷酸序列的特異性,人們因此提出了DNA甲基化轉移酶發現靶位點的機制。首先,甲基化轉移酶并不是同等地接近所有染色體區域。具有染色體重構和DNA螺旋酶活性的蛋白質能調節哺乳動物細胞內DNA甲基化,如SNF2家族2個成員ATRX和Lsh;其次,附件因子(

    DNA甲基化的原理機制

    DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作為甲基供體,通過共價鍵結合的

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