探索蛋白質組學的“第四維度”分析
就在幾年前,蛋白質組學研究人員成功在單個或少量樣本中識別出蛋白質、肽段和蛋白質的翻譯修飾。十年過去了,這個領域已經發生了翻天覆地的變化。 如今,科學家們希望對蛋白質進行更大范圍的分析,使樣本數量從數百個擴展到數千個。然而,考慮到蛋白質組學在個性化醫學和生物標志物檢測領域的應用,這種分析必須具有高效、高質量,高靈敏度和高特異性。因此,作為高精度、高靈敏度分析的質譜(MS)借著這股東風正以驚人的規模發展 。目前,液相色譜-質譜(LC-MS)是用于蛋白質高通量表征的“金標準”技術,但該領域的科學家仍在不斷尋求新的方法來對樣品進行更深入的分析。 近年來,一項質譜技術的快速發展已使四維分析成為可能——離子淌度分離技術,人們已經創建了 “4D蛋白質組學”這個術語來描述包含質譜所有四個方面的分析。 額外的第四維分析 在經典的自下而上(bottom up)蛋白質LC-MS分析中,當肽段從色譜柱洗脫時被分解,此時溶質在注入后通過色譜柱......閱讀全文
探索蛋白質組學的“第四維度”分析
就在幾年前,蛋白質組學研究人員成功在單個或少量樣本中識別出蛋白質、肽段和蛋白質的翻譯修飾。十年過去了,這個領域已經發生了翻天覆地的變化。 如今,科學家們希望對蛋白質進行更大范圍的分析,使樣本數量從數百個擴展到數千個。然而,考慮到蛋白質組學在個性化醫學和生物標志物檢測領域的應用,這種分析必須具有
博普特植物表型組學多維度解決方案介紹(二)
1、Videometer Portable 多光譜表型成像系統對小植株的生理脅迫研究通過植被指數可評估不同狀態下植被的生理結構和功能特性,包括生物量、冠層結構、葉面積指數、葉綠素含量以及植物冠層的光利用效率等。研究表明,Videometer 可用于擬南芥中葉綠素(NDVI)和葉黃素(PRI)
博普特植物表型組學多維度解決方案介紹(一)
未來幾十年中,由于人口暴增、氣候變化、耕地限制、環境資源短缺等因素的影響,人類面臨巨大的糧食挑戰。需要從兩方面考慮來提高作物生產力:改良育種和栽培管理。對作物功能的描述和深入理解是高效改良育種和優良栽培管理的基礎。將作物功能性狀與基因組關聯起來,將加速針對特定環境和管理方式的設計育種過程,以及加速遺
蛋白質組與蛋白質組學簡介-2
3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白
蛋白質組與蛋白質組學簡介-1
一、蛋白質組概念:一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表
蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線
基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類
蛋白質組學研究技術
可以說,蛋白質組學的發展既是技術所推動的也是受技術限制的。蛋白質組學研究成功與否,很大程度上取決于其技術方法水平的高低。蛋白質研究技術遠比基因技術復雜和困難。不僅氨基酸殘基種類遠多于核苷酸殘基(20/ 4), 而且蛋白質有著復雜的翻譯后修飾,如磷酸化和糖基化等,給分離和分析蛋白質帶來很多困難。此外,
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的,它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前,在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
蛋白質組學+AI技術
人們在吞咽的時候,頸部有個器官會隨著吞咽動作上下活動,它就是甲狀腺。西湖歐米有望實現臨床轉化的第一個項目,就是基于蛋白質標志物的甲狀腺結節的良惡性診斷。甲狀腺很小,但它影響到五臟六腑。數據顯示,每5個成年人中就可能有1人患有甲狀腺結節。其中,約60%的甲狀腺結節都是良性的。但有10%的結節是惡性的,