MIDASTM確證Biomarker(一)
生物標志物的發現是一個復雜而漫長的過程,AB公司結合QTRAP系列質譜系統的獨特功能與掃描模式,創造性地開發出MIDASTM(MRM Initiated Detection And Sequencing)工作流程,滿足了生物標志物驗證與確認的4S要點,可以準確、快速、簡便地完成大樣本量的生物標志物驗證與確認工作。本文結合實際的應用案例介紹了這一技術。 生物標志物(Biomarker)的發現是一個復雜而漫長的過程。在此研究過程中可能會面臨各種困難與挑戰。其一,蛋白質類生物標志物在體內變化不大,難于檢測。通常不是有和無的變化,而僅是體內濃度發生相應改變,這種變化量基本上都小于10倍,通常在5倍變化量之內;其二,個體之間,甚至于同一個體的不同批次樣本之間,存在本底差異,難于區分。實驗證明,臨床樣本之間的差別大于動物樣本,而動物樣本差異大于細胞培養樣本;其三,最有效的標志物通常濃度很低,而樣本量也有限,所以要求分析手段......閱讀全文
MIDASTM確證Biomarker(二)
鑒定過程共進行兩次實驗,約30多種蛋白質被鑒定出來,已鑒定的蛋白質如表1所示,其中紅色標注的蛋白又通過MIDASTM確認。兩次實驗結果相比較,重疊率低于75%。許多在第一次實驗中被鑒定但可信度較低的蛋白質,第二次實驗中并未產生更多的MS/MS圖譜,沒被再次鑒定出來,增加了鑒定與驗證確認的難度。
MIDASTM確證Biomarker(一)
生物標志物的發現是一個復雜而漫長的過程,AB公司結合QTRAP系列質譜系統的獨特功能與掃描模式,創造性地開發出MIDASTM(MRM Initiated Detection And Sequencing)工作流程,滿足了生物標志物驗證與確認的4S要點,可以準確、快速、簡便地完成大樣本量
快速發現Biomarker?
SELDI蛋白質芯片系統實現了來自小樣本的基于芯片的蛋白質和肽段圖譜與一個高通量分析平臺的一體化,可從大量復雜生物學樣品中快速獲得蛋白質分子量圖譜,發現Biomarker。ProteinChip SELDI系統用于從大量復雜生物學樣品中快速獲得蛋白質分子量圖譜,發現Biomarker。它使
tRF測序應用于Biomarker研究
南京醫科大學第一附屬醫院腫瘤科副主任醫師殷詠梅教授長期從事消化道腫瘤和乳腺腫瘤的內科治療,近來,其實驗室利用tRF&tiRNA測序,發現在曲妥單抗敏感和耐受的乳腺癌細胞中,tRNA來源的小非編碼RNA分子tRF&tiRNA表達差異顯著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-ZDX
Biomarker時代的結直腸癌精準治療
日前,2016屆CSCO學術年會在廈門圓滿完成,本屆年會以“精細管理、精準醫療”為主題,其中精準檢測作為實施精準醫學的第一步,成為本屆CSCO學術年會的熱點話題。 在艾德生物與默克聯合舉辦的結直腸癌專場衛星會中,來自臨床的劉云鵬教授、李進教授、王新教授和來自病理的丁彥青教授、閻曉初教授、邰艷紅
臨床研究之路:NGS上下求索,Biomarker潮流所向
“雖然這方面的臨床研究一直很少被關注”但哈佛大學醫學院醫學助理教授Eli Van Allen在今年美國芝加哥召開的美國臨床腫瘤學年會(ASCO)上告訴聽眾說:“讓測序的結果成為臨床決策的依據現在已經部分實現。” 事實上,首個相關的概念驗證試驗:試圖根據測序的結果選擇患者的治療手段并沒有取得成
康成tRF測序應用于Biomarker研究
南京醫科大學第一附屬醫院腫瘤科副主任醫師殷詠梅教授長期從事消化道腫瘤和乳腺腫瘤的內科治療,近來,其實驗室利用tRF&tiRNA測序,發現在曲妥單抗敏感和耐受的乳腺癌細胞中,tRNA來源的小非編碼RNA分子tRF&tiRNA表達差異顯著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-Z
生物標志物biomarker檢測技術進展(二)
生物標志物檢測的創始:免疫組織化學人類最早是在組織樣本中實現了生物標志物的檢測。組織特異性的標志物在現代醫療中被經常用來研究腫瘤等疾病中的病理變化。最經典的被轉化醫學成功應用于組織中標志物檢測的方法是免疫組織化學(Immunohistochemistry),特別是在肺炎中的早期應用。免疫組化技術在1
生物標志物biomarker檢測技術進展(五)
總結抗體依賴的檢測方法毫無疑問是目前最為有效的蛋白生物標志物檢測技術。通過數十年的努力,研發人員在靈敏度,多重檢測能力和檢測特異性方面取得了重要突破,使這類技術產生了長足的進步。以單分子檢測技術為代表的超高檢測靈敏度,以液相懸浮芯片為代表的多重指標檢測技術分別為生物標志物的應用在深度和廣度方面進行了
生物標志物biomarker檢測技術進展(三)
ELISA酶聯免疫分析ELISA(酶聯免疫分析)是很早被應用于體液樣本臨床蛋白標志物檢測的技術,因而也被當成“金標準”來使用,但事實上受制于較簡單的實驗范式和有限的優化措施,ELISA技術的靈敏度非常有限。而ELISA由于其使用抗體的不同,結果也會體現不同的檢測效力。粗制多克隆抗體,親和純化的多克隆
生物標志物biomarker檢測技術進展(四)
全新的SMC單分子檢測技術雖然現有多項生物標志物檢測技術已經豐富了人們對生物標志物的認識,獲取了大量數據和經驗,解決了很多生物學或醫學問題,但如前文所述的諸多瓶頸仍限制了生物標志物的應用。尤其是對于疾病,特別是腫瘤的早期診斷或預防而言,在疾病的潛伏期或是發生早期,就能在血清/血漿這樣容易獲得且遠離病
生物標志物biomarker檢測技術進展(一)
生物標志物的概念早在1983年被首次提出,它是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變的生化指標,具有非常廣泛的用途。由于生物標志物可用于疾病診斷、判斷疾病分期或用于評價新藥或新療法在目標人群中的安全性及有效性,展示出在藥物研發領域的重要作用。2010年10月,美國FDA出臺文件討論
生物標志物(Biomarker)的篩選與驗證
在與很多醫生和老師的交流過程中,經常會收到這樣的反饋:手上收集了很多臨床樣本,但是沒有具體方案,不知道怎么利用,樣本越收越多,冰箱越裝越滿,但最終這些樣本一直是在睡大覺,睡到死!針對于此,本期向大家推薦吉凱完整的Biomarker篩選方案。進一步可開發試劑盒,完成臨床轉化,造福于民;退一步可發表高分
生物標志物(Biomarker)的篩選與驗證方案
臨床樣本都是寶,別讓它們睡到死!!! 在與很多醫生和老師的交流過程中,經常會收到這樣的反饋:手上收集了很多臨床樣本,但是沒有具體方案,不知道怎么利用,樣本越收越多,冰箱越裝越滿,但最終這些樣本一直是在睡大覺,睡到死!針對于此,本期向大家推薦吉凱完整的Biomarker篩選方案。進一步可開發
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(一)
生物標志物的概念早在1983年被首次提出,它是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變的生化指標,具有非常廣泛的用途。由于生物標志物可用于疾病診斷、判斷疾病分期或用于評價新藥或新療法在目標人群中的安全性及有效性,展示出在藥物研發領域的重要作用。 2010年10月,美國F
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(三)
ELISA酶聯免疫分析 ELISA(酶聯免疫分析)是很早被應用于體液樣本臨床蛋白標志物檢測的技術,因而也被當成“金標準”來使用,但事實上受制于較簡單的實驗范式和有限的優化措施,ELISA技術的靈敏度非常有限。而ELISA由于其使用抗體的不同,結果也會體現不同的檢測效力。粗制多克隆抗體,親和
血清外泌體中的miRNA作為KD診斷biomarker
研究背景皮膚粘膜淋巴結綜合癥(muco-cuta-meous lymph node syndrome,MCLS)又稱川崎病(Kawasaki disease),是一種以全身血管炎變為主要病理的急性發熱性出疹性小兒疾病。雖然已有的研究已經發現一些血來源的蛋白分子或者miRNA有潛在的診斷能力,
血清外泌體中的miRNA作為KD診斷biomarker
皮膚粘膜淋巴結綜合癥(muco-cuta-meous lymph node syndrome,MCLS)又稱川崎病(Kawasaki disease),是一種以全身血管炎變為主要病理的急性發熱性出疹性小兒疾病。雖然已有的研究已經發現一些血來源的蛋白分子或者miRNA有潛在的診斷能力,但是,其有效
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(一)
生物標志物的概念早在1983年被首次提出,它是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變的生化指標,具有非常廣泛的用途。由于生物標志物可用于疾病診斷、判斷疾病分期或用于評價新藥或新療法在目標人群中的安全性及有效性,展示出在藥物研發領域的重要作用。 2010年10月,美國F
血清外泌體中的miRNA作為KD診斷biomarker
研究背景 皮膚粘膜淋巴結綜合癥(muco-cuta-meous lymph node syndrome,MCLS)又稱川崎病(Kawasaki disease),是一種以全身血管炎變為主要病理的急性發熱性出疹性小兒疾病。雖然已有的研究已經發現一些血來源的蛋白分子或者miRNA有潛在的診斷能
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(二)
生物標志物檢測的創始:免疫組織化學 人類最早是在組織樣本中實現了生物標志物的檢測。組織特異性的標志物在現代醫療中被經常用來研究腫瘤等疾病中的病理變化。最經典的被轉化醫學成功應用于組織中標志物檢測的方法是免疫組織化學(Immunohistochemistry),特別是在肺炎中的早期應用。免疫
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(二)
生物標志物檢測的創始:免疫組織化學 人類最早是在組織樣本中實現了生物標志物的檢測。組織特異性的標志物在現代醫療中被經常用來研究腫瘤等疾病中的病理變化。最經典的被轉化醫學成功應用于組織中標志物檢測的方法是免疫組織化學(Immunohistochemistry),特別是在肺炎中的早期應用。免疫
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(四)
全新的SMC單分子檢測技術 雖然現有多項生物標志物檢測技術已經豐富了人們對生物標志物的認識,獲取了大量數據和經驗,解決了很多生物學或醫學問題,但如前文所述的諸多瓶頸仍限制了生物標志物的應用。尤其是對于疾病,特別是腫瘤的早期診斷或預防而言,在疾病的潛伏期或是發生早期,就能在血清/血漿這樣容易
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(五)
總結 抗體依賴的檢測方法毫無疑問是目前最為有效的蛋白生物標志物檢測技術。通過數十年的努力,研發人員在靈敏度,多重檢測能力和檢測特異性方面取得了重要突破,使這類技術產生了長足的進步。以單分子檢測技術為代表的超高檢測靈敏度,以液相懸浮芯片為代表的多重指標檢測技術分別為生物標志物的應用在深度和
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(三)
ELISA酶聯免疫分析 ELISA(酶聯免疫分析)是很早被應用于體液樣本臨床蛋白標志物檢測的技術,因而也被當成“金標準”來使用,但事實上受制于較簡單的實驗范式和有限的優化措施,ELISA技術的靈敏度非常有限。而ELISA由于其使用抗體的不同,結果也會體現不同的檢測效力。粗制多克隆抗體,親和
最新生物標志物biomarker檢測技術進展(四)
全新的SMC單分子檢測技術 雖然現有多項生物標志物檢測技術已經豐富了人們對生物標志物的認識,獲取了大量數據和經驗,解決了很多生物學或醫學問題,但如前文所述的諸多瓶頸仍限制了生物標志物的應用。尤其是對于疾病,特別是腫瘤的早期診斷或預防而言,在疾病的潛伏期或是發生早期,就能在血清/血漿這樣容易
腫瘤干細胞代謝重編程Biomarker及信號通路研究(一)
生物標志物(Biomarker)創新藥物(Novel Agents)研發過程中需要一系列敏感的標志物進行藥物療效,作用機制,毒副作用等評價。 美國國家癌癥研究所(NCI)藥物調查指導委員會(IDSC)生物標記物團隊審查了生物標記試驗、同行評審的文獻、NCI和美國食品和藥物管理局(Fda)的指導文
腫瘤干細胞代謝重編程Biomarker及信號通路研究(二)
3)Imipridones reprogram the transcriptome of GBM cells and suppress glycolysis and oxidative phosphorylation4)Imipridones enhance serine-one carbon-gl
MIT發現的這款Biomarker,作用“一箭雙雕”
大約在10年前,生物標志物的發展還未起步。但現在,生物標志物已經開始了臨床前期的研究,從動物模型開始,再到臨床研發階段。隨著醫學發展更加個性化、更依賴于分子水平的研究,基因組和蛋白質組學研究已經證明,藥物研發和生物標志物(Biomarker)發展之間的重合也呈必然的增長趨勢 。 癌細胞如何邁出
Orbitrap質譜助醫院識別兒童急性闌尾炎的Biomarker
賽默飛世爾科技質譜技術幫助波士頓兒童醫院識別兒童急性闌尾炎的生物標志物 兒童醫院的研究團隊相信該發現將帶來更為準確和有效的診斷 圣何塞,加州 (2009年12月14日) – 世界領先的科學服務商賽默飛世爾科技公司今天宣布,波士頓兒童醫院的研究人員識別出一種稱作LRG的生物標志物,他們認為