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  • 九大測序平臺對比(五)

    7.The PacBio RS system企業: Pacific Biosciences推出時間: 2010年2月開始早期試用主流型號: PacBio RS樣品要求: 1kb以下500ng,純化的基因組 DNA, BACs, cDNA 文庫 或PCR 產物測序原理: 邊合成邊測序,single molecule, real-time, or SMRT?, technology這項技術的核心在于使用了Zero-Mode Waveguide(ZMW)(零波段邊界)。測序的平臺上有幾萬個小井,單個DNA聚合酶和要測序的DNA鏈固定在每一個小井里。帶有熒光標記的脫氧核苷酸(A,T,C,G)被加入到每個小井里。每一種脫氧核苷酸在激化后分別能放出不同波長的熒光。小井的底部開了一個非常小的孔,小到比探測激光的單個波長還要短。根據我們的常識,這個孔太小了,激光無法從井的底部穿過去,從而無法激發脫氧核苷酸上的熒光物質。應此,底部的顯微鏡檢測......閱讀全文

    九大測序平臺對比(二)

    2.454企業: Roche推出時間: 2005年主流型號: Genome Sequencer FLX Titanium(2008年推出)樣品要求: 5 μg of DNA,濃度≥300 ng/μL測序原理:焦磷酸測序在測序時,使用了一種叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它

    九大測序平臺對比(一)

    1.sanger企業:Life Technology推出時間:1977年發明,1986年第一臺商業化測序儀主流型號:3730XL樣品要求:PCR產物:濃度≥50ng/ul 體積≥10ul;質粒:含量≥5ug;菌液:體積≥1ml。測序原理:雙脫氧鏈終止法:Sanger法測序的原理就是,每個反應含有所有

    九大測序平臺對比(三)

    4.HiSeq2000企業: Illumina推出時間: 2010/1/1主流型號: Illumina HiSeq2000樣品要求: 6ug/sample,無RNA、蛋白污染,無降解,OD260/OD280=1.8-2.0測序原理: 邊合成邊測序這種測序技術通過將基因組DNA的隨機片斷附著到光學透明

    九大測序平臺對比(六)

    8.PGM企業: Ion Torrent推出時間: 2010年主流型號: Ion Personal Genome Machine?(2010年)樣品要求: 5 μg DNA,起始DNA體積不超過130μL測序原理: 半導體芯片測序該測序儀使用了一種高密度半導體小孔芯片。該芯片置于一個離子敏感層和離子

    九大測序平臺對比(四)

    5.Helicos企業: Helicos Biosciences推出時間: 2008年主流型號: HeliScope? Single Molecule Sequencer(2008年推出)樣品要求: 1-3 μg,起始DNA體積不超過100 μL.測序原理: 邊合成邊測序,可逆阻斷測序待測DNA被隨

    九大測序平臺對比(五)

    7.The PacBio RS system企業: Pacific Biosciences推出時間: 2010年2月開始早期試用主流型號: PacBio RS樣品要求: 1kb以下500ng,純化的基因組 DNA, BACs, cDNA 文庫 或PCR 產物測序原理: 邊合成邊測序,single m

    九大測序平臺對比(一)

    1.Sanger2.4543.Solid 4.HiSeq20005.Helicos6.DNA Nanoball array7.The PacBio RS system8.PGM9.MiSeq??sanger企業:Life Technology推出時間:1977年發明,1986年第一臺商業化測序儀主流

    九大測序平臺對比(二)

    Helicos企業: Helicos Biosciences推出時間: 2008年主流型號: HeliScope? Single Molecule Sequencer(2008年推出)樣品要求: 1-3 μg,起始DNA體積不超過100 μL.測序原理: 邊合成邊測序,可逆阻斷測序待測DNA被隨機打

    基因測序的云計算平臺

    ?? 自二代測序的技術問世以來,就一直是研究和臨床領域關注的重點。隨著整個行業的技術發展,二代測序也帶動了整個基因研究的產業鏈。在二代測序的產業鏈中,上游做檢測,中游做分析,下游做應用。在測序價格持續下降的情況下,中游測序數據的生物信息學分析成為了提高效率最大的瓶頸。  傳統的測序數據分析依賴于本地

    llumina高通量測序平臺的應用

      Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收

    llumina高通量測序平臺的應用

      Illumina公司的新一代測序儀Genome Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收

    測序平臺多樣化成為發展障礙

    2016年1月12日,奧巴馬提出了癌癥“登月計劃”,將精準醫療、個性化醫學或癌癥醫學推向了另一高度。事實上,精準醫療是一個美好的愿景:即能詳細讀取腫瘤患者的缺陷,并開發出靶向缺陷的新一代藥物,醫生給患者最有效的治療方案。使用新型靶向藥物如厄洛替尼(erlotinib)和西妥昔單抗(cetuximab

    llumina高通量測序平臺的應用(二)

    3、可逆化學阻斷技術測序??????? 利用邊合成邊測序(Sequencing?by?synthesis)的原理,加入改造過的DNA聚合酶和帶有4種熒光標記的dNTP。這些核苷酸是“可逆終止子”,因為3’羥基末端帶有可化學切割的部分,每個循環它只容許摻入單個堿基。去除其他多余的dNTP后,用激光掃描

    llumina高通量測序平臺的應用(一)

    Illumina公司的新一代測序儀Genome?Analyzer最早由Solexa公司研發,利用其ZL核心技術“DNA簇”和“可逆性末端終結(reversible?terminator)”,實現自動化樣本制備及基因組數百萬個堿基大規模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收購了

    不同平臺的二代測序技術

      二代測序技術基于大規模平行測序技術(massive parallel analysis,MPS),它能同時完成測序模板互補鏈的合成和序列數據的獲取。主要可以分成Roche 454焦磷酸測序、Illumina Solexa合成測序和ABI SOLiD連接法測序。  (1)Roche 454焦磷酸測

    法國擬建高速基因組測序分析平臺

      法國總理菲利普17日在巴黎宣布,法國在法蘭西島大區(又稱“巴黎大區”)和中部奧弗涅—羅訥—阿爾卑斯大區啟動建設兩個高速基因組測序分析平臺,以推動法國基因組相關研究的發展。  法國政府去年6月提出“法國基因組醫學2025”計劃,這兩個基因組測序分析平臺的建設就隸屬該計劃,預計將于2018年正式開始

    北京希望組新購5臺Sequel測序平臺

       北京希望組生物科技有限公司(GrandOmics Biosciences, Co., Ltd., 以下簡稱“希望組”)與美國太平洋生物公司(Pacific Biosciences of California, Inc.,以下簡稱稱“PacBio”)今日宣布達成戰略合作,希望組與旗下科技服務公司

    單細胞多組學高通量測序平臺(一)

    一單細胞多組學高通量測序技術簡介通過測序手段檢測細胞多層次信息,如基因組、表觀組、轉錄組甚至蛋白組已經成為生物學研究的重要手段。幾乎一切生命體的活動都圍繞著DNA->RNA->蛋白質的過程,而現有的組學技術也圍繞這一過程獲取信息(如DNA層面的基因序列),從而解讀生物體運行機制,應用于疾病的診斷和治

    單細胞多組學高通量測序平臺(二)

    雖然single-cell sequencing的方法仍在不斷推出,但是目前使用最為廣泛、商業化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系統。1.2以RNA-seq為例介紹高通量單細胞測序技術單細胞測序的最主要難點是如何在短時間內分離得到最可能多的單個細胞,早期的技術代表F

    高通量測序平臺及其性能參數介紹

      Roche 454、Illumina、Solexa和ABI SOLiD為主的三個測序平臺,目前最主流的二代測序平臺是 Illumina 所生產的測序儀,包括 MiSeq 系列、 HiSeq 系列、 NextSeq系列等。另外的還包括羅氏公司的 454 測序儀(目前已關閉)、華大基因的 BGI-C

    測序平臺的讀長真的很重要嗎?

      在EdgeBio,我們一直關注如何提高效率,降低成本,并為我們的客戶提供整體上更優質的服務。隨之而來的是大量的R&D和新技術開發(NTD)費用。一個很好的例子是我們近期發布的一系列技術白皮書(共五篇),是關于定向重測序應用的,包括外顯子組。您可以在這里找到。今天我將與大家分享一些使用Illumi

    測序黑馬10X-Genomics正式發售GemCode平臺

      2015年7月3日,10X Genomics公司于本周宣布正式發售GemCode測序平臺。這家堪稱測序黑馬的公司在2月份的AGBT 2015大會上推出這款儀器,引起業界關注。GemCode平臺能夠與現有的短讀取測序儀互補,產生長片段信息(10-100 kb),實現結構變異和單體型等分析。GemC

    ABI-3730XL測序平臺的原理及特點

      Applied Biosystems 3730XL測序儀是高質量的長片段讀取和序列分析的測序平臺,應用靈活而廣泛。3730XL可同時分析96個樣品,該儀器采用4色熒光同時檢測,可不間斷24小時運行,自動灌膠,上樣,電泳分離,檢測及數據分析。本儀器除了能夠完成新基因測序工作或比較測序工作外,還可進

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    DNA三代測序技術原理、平臺、特點介紹

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    測序技術再現新進展,已開發基于單分子測序平臺的單細胞多組學測序技術

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    Paragon-Genomics-推出與華大智造測序平臺兼容產品

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