單細胞mRNA測序揭示早熟樹突狀細胞在炎癥反應中的作用
單細胞mRNA測序揭示早熟樹突狀細胞在炎癥反應中的作用 ——研究表明單細胞測序在發現通常隱藏在海量細胞樣本中的稀有細胞群的重要性波士頓和南舊金山,加州,2014年6月30——在本月Nature上發表的一篇文章中,Broad 研究所和FLUIDIGM的科學家使用C1TM單細胞自動制備系統制備細胞用于單細胞測序,發現在受到相同抗原刺激的樹突狀細胞群體中有一個亞群的早熟細胞更早地表達抗病毒基因。 由于通常情況下是在海量細胞中進行平均的檢測,這些早熟的細胞是無法被發現的。基于FLUIDIGM和Broad研究所在單細胞基因組學的貢獻,這一發現將使研究者可以探索機體在受到外源攻擊時,這些早熟的細胞如何調控機體的免疫反應。Nature的文章同樣也著重指出細胞異質性的作用及其在免疫反應中的胞間通訊的重要性。在通常的實驗中,細胞在一個環境中被一起研究,允許......閱讀全文
Nature:如何利用單細胞mRNA測序發現罕見細胞類型?
近日,來自荷蘭的科學家在著名國際學術期刊nature上發表了一項最新研究進展,他們利用一種新的計算方法結合轉錄組測序發現了小腸中一些罕見的細胞類型,這對于深入了解器官的細胞組成,探究健康和疾病狀態下的組織生物學具有重要意義。 理解一個器官的發育和功能需要對組成該器官的所有細胞類型的特性有一個清
單細胞mRNA差異顯示實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 ##流程圖 試劑、試劑盒 溶液和緩沖液 儀器、耗材
單細胞mRNA差異顯示實驗
實驗方法原理 ##流程圖試劑、試劑盒 溶液和緩沖液儀器、耗材 水浴槽PCR熱循環儀微量離心機塑料制品和濾器實驗步驟 一、RNA 的分離收集對照組和實驗組細胞,放入含 45ul2 mmol/L DTT 的 1.5 ml 微量離心管中。95℃ 水浴熱解 2 min。每管加入以下物質:37℃ 溫育 30
單細胞mRNA差異顯示實驗
目前有幾種方法可以顯示生理刺激下組織樣本中未知基因的表達水平變化。然而, 很多組織內的細胞又存在形態和功能上的異質性,因此常常需要從單個細胞水平研究基因表達的差異。現在,我們介紹一種新方法,它常規用來在單細胞水平考察未知基因的差異性表達。現代神經科學研究技術作者:U.Windhorst?&?H. J
單細胞mRNA測序揭示早熟樹突狀細胞在炎癥反應中的作用
單細胞mRNA測序揭示早熟樹突狀細胞在炎癥反應中的作用??????? ——研究表明單細胞測序在發現通常隱藏在海量細胞樣本中的稀有細胞群的重要性波士頓和南舊金山,加州,2014年6月30——在本月Nature上發表的一篇文章中,Broad 研究所和FLUIDIGM的科學家使用C1TM單細胞自動制備系統
單細胞測序需要準備什么再去測序
DNA測序的測序原理: DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)與鳥嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
Nature:單細胞測序(上)
Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年,冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織,一并將這些DNA進行測序,生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序
Nature:單細胞測序(下)
隨著技術的飛速發展,成本大大降低,使得基因組測序成為常規技術。然而,大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序,它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。 該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序,研究小
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。
如何-解讀-單細胞-測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
單細胞測序方法匯總
單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整
Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序
2018年11月,Namocell與CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞,并且將其進行單細胞測序,為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序(scRNA-s
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序,有效降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序,有效降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
如何讓單細胞測序變得簡單?
單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且最前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整
Fluidigm推出單細胞TCR測序產品
解析細胞表型是免疫學中一個共同的單細胞分析目標。然而,T細胞受體V(D)J基因區域的隨機重排帶來了T細胞群體的復雜變化。這形成了龐大的T細胞部隊,以便識別特定的外源蛋白,引發有效的免疫反應。 為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析,Fluidigm近日在C1?系統上推出了一個全新的免疫學應用 –
!單細胞測序的”CPU-2.0”時代
對單個人類細胞的基因組進行準確的變異檢測和大范圍單倍體型分析一直以來都是測序領域的巔峰挑戰。單細胞測序使我們能在更高的分辨率下研究生命的機制。一方面,在像癌癥這樣的組織樣本中存在大量具有不同基因組類型的單個細胞,因此需要分析單細胞水平基因組而不是大量細胞的平均值;另一方面,對于非常珍貴的細胞樣品
漫談單細胞測序及其臨床應用
一、概述隨著現代生物學的發展,細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題,為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。單細胞測序正在成為科研熱點。二、單細胞測序倍受青睞的原因人們最初以為一個細胞類群是均質的(即各細胞都是
Namocell單細胞分離儀在單細胞測序領域的應用
9月26至27日2019年細胞產業大會暨2019第四屆(上海)細胞與腫瘤醫療高峰論壇在上海新南雅酒店舉行。本屆會議,邀請了全國30位專家學者、人物演講、40家企業參展,400余人報名參會,逾500人參加了會議,就細胞儲存、細胞治療、細胞培養、細胞工程、細胞銀行、細胞能量與代謝、細胞免疫學、細胞生理學
單細胞分離對單細胞測序領域有著很大的幫助
單細胞分離可以采用特制的毛細管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來,然后移到合適的培養基進行培養,分離法對操作技術有比較高的要求,多限于高度專業化的科學研究中采用。 它不僅僅可以用于分離單細胞,還可以用于nl級別試劑的分配和磁珠的分選,對于單細胞測序領域有著很大的幫助。快速高效接種單個活細胞
單細胞分離儀在單細胞測序領域有著很大的幫助
???單細胞分離儀可以實現從微孔芯片轉移單細胞到細胞收集管中。單細胞轉移分離系統集單細胞成像,單細胞隔離,單細胞選擇功能于一體,自動聚焦成像。? ? 轉移單細胞到微管,PCR微孔板或其它反應微管中,在隔離單細胞后,它可以對選定收集的細胞進行掃描并成像,采用倒置熒光顯微鏡,配備自動掃描顯微鏡載物臺,自
Nature-methods發布單細胞測序新技術
來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術,可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。 資深作者Ri
《自然—方法學》年度方法:單細胞測序
2014年1月《自然—方法學》(Nature Methods)上發表年度特別報道,將“單細胞測序”(Singled out for sequencing)的應用列為2013年度最重要的方法學進展。 近幾年來,基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展,其成果有望為一些重
Science:單細胞分析?并行測序技術可以
近日,一項發表于國際雜志Science上的研究論文中,來自美國的研究者描述了一種新型的大規模并行技術,通過利用新一代測序技術來在單細胞水平上實現對基因表達的監測;研究者表示,單細胞分析對于理解人類造血系統的必要性及重要性不斷凸顯,如果沒有這種分析的話,來自少許細胞的大量表達改變就和來自許多細胞的