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  • 基因組DNA文庫構建必備實驗技巧

    基因組DNA文庫用途十分廣泛,如用于人類及動植物基因組學研究,基因表達調控研究,分析、分離特定的基因片段等。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為四大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。一、分離基因組DNA(gDNA) 毫無疑問,高質量的基因組DNA對于基因組文庫構建是至關重要的。需要通過經驗來選擇合適的基因組DNA 分離方法,在分離 過程中保證DNA不被過度剪切或降解,同時也要盡量保證DNA的純度。二、處理基因組 DNA 根據研究目的,研究者需要選擇合適的載體。不同的載體對基因組DNA的長度有不同的要求,必須選擇合適長度的基因組DNA來構建基因組文庫。比如,對于黏粒載體,合適的片段長度大約為40kb;對于BAC載體,合適的片段長度平均為120kb-300kb。構建黏粒基因組DNA文庫,需要將基因組DNA用注射器抽打來隨機剪切DNA;接著用末端......閱讀全文

    基因組DNA文庫構建必備實驗技巧

    基因組DNA文庫用途十分廣泛,如用于人類及動植物基因組學研究,基因表達調控研究,分析、分離特定的基因片段等。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為四大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。一、分離基因組DNA(gDNA) 毫無

    基因組DNA文庫構建必備實驗技巧2

    技術支持資料:材料緩沖液和溶液- 堿裂解液I , 4°C50 mM 葡萄糖25 mM Tris-Cl (pH 8.0)10 mM EDTA (pH 8.0)配制堿裂解液I 約100ml,滅菌,保存在四度。- 堿裂解液II,新鮮配置,室溫保存0.2 N NaOH (從10N的NaOH新鮮制備)1% (

    基因組DNA文庫構建必備實驗技巧1

    基因組DNA文庫用途十分廣泛,如用于人類及動植物基因組學研究,基因表達調控研究,分析、分離特定的基因片段等。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為四大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。一、分離基因組DNA(gDNA) 毫無

    基因組DNA文庫構建的基本流程

    基因組 ?DNA文庫有十分廣泛的用途,如用于分析、分離特定的基因片段,用以基因表達調控、人類及動植物基因組工程的研究。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為4大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。 一、分離基因組DN

    應用黏粒載體構建基因組DNA文庫

    實驗方法原理 在 λ 噬菌體中構建基因組 DNA 文庫的步驟與在黏粒載體中的步驟基本一致。在這兩種系統中,真核 DNA 在體外與載體 DNA 連接,形成能包裝到 λ 噬菌體顆粒中的多聯體。構建在 λ 噬菌體中的文庫以具有感染性的重組噬菌體形式貯存和增殖。實驗材料 T4 噬菌體 DNA 連接酶牛小腸堿

    應用黏粒載體構建基因組DNA文庫

    在 λ 噬菌體中構建基因組 DNA 文庫的步驟與在黏粒載體中的步驟基本一致。在這兩種系統中,真核 DNA 在體外與載體 DNA 連接,形成能包裝到 λ 噬菌體顆粒中的多聯體。構建在 λ 噬菌體中的文庫以具有感染性的重組噬菌體形式貯存和增殖。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理

    應用黏粒載體構建基因組DNA文庫

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 在 λ 噬菌體中構建基因組 DNA 文庫的步驟與在黏粒載體中的步驟基本一致。在這兩種系統中,真核 DNA 在體外與載體 DNA 連接,形成能包裝到 λ 噬菌體顆粒中的多聯體。構建在 λ 噬菌體中的文庫以具有感染性的重組噬菌體

    BAC文庫構建方法與技巧

    基因組DNA文庫有十分廣泛的用途,如用于分析、分離特定的基因片段,用以基因表達調控、人類及動植物基因組工程的研究。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為4大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。一、分離基因組DNA(gDNA)

    BAC文庫構建方法與技巧

      基因組DNA文庫有十分廣泛的用途,如用于分析、分離特定的基因片段,用以基因表達調控、人類及動植物基因組工程的研究。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為4大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。   一、分離基因組DNA

    BAC文庫構建方法與技巧

      基因組DNA文庫有十分廣泛的用途,如用于分析、分離特定的基因片段,用以基因表達調控、人類及動植物基因組工程的研究。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為4大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。   一、分離基因組DNA

    DNA文庫的構建及其篩選

    實驗材料?DNA試劑、試劑盒?升汞MS培養基瓊脂糖EcoR IHind IIIBamH IBg lII Pst I儀器、耗材?電泳儀尼龍膜實驗步驟 1.水稻 DNA 的提取水稻 DNA 的提取參照 Dellaporta, Wood 和 Hicks (1983) 法分離總基因組DNA并略有修改。 通過

    DNA文庫的構建及其篩選

    ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 高等植物基因組的一個顯著特征是其內含有大量的 DNA 重復序列, 重復序列常位于異染色質區, 因此可能與染色體的結構有關 . 季靜等根據國際上 對基因組、染色體、結構蛋白的研究前沿, 提出染色體 DNA 平均每隔 30 kb

    DNA文庫的構建及其篩選

    DNA文庫的構建和篩選可以用于:(1)將某生物的全部基因組DNA用限制性內切酶或機械力量切割成一定長度的DNA片段,再與適合的載體在體外重組并轉化相應的宿主細胞獲得的所有陽性菌落。 (2)采用“化整為零”策略,將龐大的基因分解成一段段,每段包含一個或幾個基因。實驗方法原理高等植物基因組的一個顯著特征

    基因組文庫和cDNA文庫的構建及篩選

    劉芝華 中國醫學科學院腫瘤研究所??分子腫瘤學國家重點實驗室?概念:?基因組文庫是含有某種生物體全部基因的隨機片段的重組DNA克隆群體;cDNA文庫是指含有所有重組cDNA的克隆群體。???基因組文庫:來源于基因組DNA,反映基因組的全部信息,用于基因組物理圖譜的構建,基因組序列分析,基因在染色體上

    YAC實驗——YAC文庫構建

    YAC帶有天然染色體所有的功能元件,包括一個著絲粒,一個DNA復制起點,兩個端粒。YAC能夠容納長達幾百kb的外源DNA,這是質粒和黏粒辦不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色體步移中每次允許更大的步移距離,同時能夠減少完整基因組文庫所需的克隆數目。實驗步驟1. ?盡管當插入片段大于10

    DNA文庫構建和Illumina測序化學原理

    單細胞測序方法和原理系列:所謂DNA文庫,實際上是許多個DNA片段,在兩端接上了特定的DNA接頭,形成的DNA混合物。文庫有2個特點:1. 當中這一段插入的DNA,它的序列是各種各樣的。2. 它的兩頭的街頭序列,是人工特異加上去的,是已知的。要構建文庫,首先需要把基因組DNA用超聲波打斷,之后把兩端

    用-PCR-控制基因組-DNA-文庫的質量實驗

    ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 ddH20 Vent 緩沖液 Vent DNA 聚合酶 dNTP 質粒 DNA PCR 引物

    消減-cDNA-或基因組-DNA-文庫的制備實驗

    試劑、試劑盒 緩沖液、溶液和試劑酶和酶緩沖液核酸和寡核苷酸放射性化合物酚儀器、耗材 熱循環儀水浴箱瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑與設備實驗步驟 第1階段:RNA和DNA的分離一次雙向消減,需要總量為2ug的基因組DNA或cDNA。大多數分離RNA和基因組DNA的方法都適用于本實驗(Sambrooketal

    用-PCR-控制基因組-DNA-文庫的質量實驗

    在該方案中,用限制性內切酶的混合物處理人類基因組 DNA(內切酶混合物的識別位點為 4bp),產生大概 50?500bp 的片段。最終使用這一類型的表達文庫,是通過利用表型的和生化的篩選方法,分離編碼功能多肽或蛋白片段的基因片段。用KlenowDNA 聚合酶處理后,基因組 DNA 片段成為平末端,然

    消減-cDNA-或基因組-DNA-文庫的制備實驗

    ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 緩沖液、溶液和試劑 酶和酶緩沖液 核酸和寡核苷酸 放射性化合物 酚 儀器、耗材

    用-PCR-控制基因組-DNA-文庫的質量實驗

    試劑、試劑盒?ddH20Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶 dNTP質粒 DNAPCR 引物儀器、耗材?瓊脂糖凝膠電泳所需的試劑和設備熱循環儀實驗步驟?一、材料1. 緩沖液、溶液和試劑ddH202. 酶和酶緩沖液10X Vent 緩沖液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP,各

    消減-cDNA-或基因組-DNA-文庫的制備實驗

    一次雙向消減,需要總量為 2ug 的基因組 DNA 或 cDNA。大多數分離 RNA 和基因組DNA 的方法都適用于本實驗(Sambrooketal.1989;ChomczynskiandSacchi1987;Farrell1993)。本實驗來源于 PCR 實驗指南(第二版),作者:種康,瞿禮嘉。試

    構建小鼠基因組CRISPR導向RNAs文庫

      研究人員開發出一種方法,構建出了一個可誘導小鼠基因組全基因靶向突變的CRISPR導向RNA(gRNAs)綜合文庫。人們可利用這一文庫來調查不同細胞類型中每個基因的作用。這一突破性的研究成果在線發表在12月23日的《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上。   CR

    全自動化DNA文庫構建技術簡介

    在二代測序中,基因文庫的構建是一項十分耗時耗力的工作,需要熟練的科研技術人員在整個操作過程中保持需高度注意力,花費大量時間和精力才能完成建庫工作。因此,大多數實驗室有將文庫構建工作自動化的需求,以節省人力。應文庫構建自動化的需求,派瑪.迪格(PrimaDiag)公司研發了ACSIA NGSLib

    cDNA文庫構建

    cDNA文庫構建 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 cDNA 文庫是指某生物某發育時期所轉錄的全部 mRNA 經反轉錄形成的 cDNA 片段與某種載體連接而形成的克隆的集合。

    cDNA文庫構建

    cDNA文庫構建可以:(1)用于分離全長基因進而開展基因功能研究;(2)篩選目的基因并直接用于表達;(3)提供構建分子標記連鎖圖譜的所用探針。實驗方法原理cDNA 文庫是指某生物某發育時期所轉錄的全部 mRNA 經反轉錄形成的 cDNA 片段與某種載體連接而形成的克隆的集合。經典 cDNA 文庫構建

    cDNA文庫構建

    cDNA文庫[原理]:cDNA文庫不同于基因組文庫,被克隆DNA是從mRNA反轉錄來源的DNA。CDNA組成特點是其中不含有內含子和其他調控序列。從而做cDNA克隆時應是先從獲得mRNA開始,在此基礎上,通過反轉錄酶作用產生一條與mRNA相互補的DNA鏈,然后除掉mRNA,以第一條DNA鏈為模板復制

    cDNA文庫構建

    實驗方法原理 cDNA 文庫是指某生物某發育時期所轉錄的全部 mRNA 經反轉錄形成的 cDNA 片段與某種載體連接而形成的克隆的集合。經典 cDNA 文庫構建的基本原理是用 Oligo(dT) 作逆轉錄引物,或者用隨機引物,給所合成的 cDNA 加上適當的連接接頭,連接到適當的載體中獲得文庫。其基

    篩選質粒載體構建表達文庫實驗

    試劑、試劑盒 封閉緩沖液氯仿裂解緩沖液檢測抗原-抗體復合物所用試劑SMTNT 緩沖液洗滌緩沖液 125I 標記的蛋白質 A 或 125I 標記的免疫球蛋白放射性碘化第二抗體第一抗體LB 或 SOB 瓊脂平板儀器、耗材 空氣培養箱平頭鑷子 裝有防水黑墨水(印度墨水)并帶有 18 號針頭的注射器硝酸纖維

    篩選質粒載體構建表達文庫實驗

    ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 封閉緩沖液 氯仿 裂解緩沖液 檢測抗原-抗體復合物所用試劑 SM TNT 緩沖液 洗滌緩沖液

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