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  • 郭天南:全景式組學研究為新冠重癥早診斷提供決策依據

    分析測試百科網訊 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之際,PCR技術在快速篩查中已大顯神威,但進入臨床后如何更早地區分輕癥和重癥患者,從而更準確地治療和用藥?5月27日中國研究人員在《Cell》發表文章,利用蛋白質組學和代謝組學的全景式分析,發現了重癥患者體內應對病毒進攻特征性的分子改變,并結合機器學習篩選出COVID-19重癥患者特征性的22個蛋白質和7個代謝物,有望為臨床醫生提供有指導意義的診斷和治療線索。這項研究的一位主要參與者是西湖大學生命科學學院的特聘研究員郭天南博士。分析測試百科網小編近日采訪到郭天南博士,他將分享一個蛋白質組學研究者對于COVID-19及各類挑戰性難題的探索,追溯蛋白質組學發展的歷程,展望蛋白質組學的未來,期望為組學研究者、為正在攻克新冠病毒、腫瘤等人類科學和臨床難題的讀者們帶來啟示。西湖大學 郭天南特聘研究員《Cell》:COVID-19重癥患者血清特征性分子改變 目前,臨床上評估COV......閱讀全文

    郭天南:全景式組學研究為新冠重癥早診斷提供決策依據

      分析測試百科網訊 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之際,PCR技術在快速篩查中已大顯神威,但進入臨床后如何更早地區分輕癥和重癥患者,從而更準確地治療和用藥?5月27日中國研究人員在《Cell》發表文章,利用蛋白質組學和代謝組學的全景式分析,發現了重癥患者體內應對病毒進攻特征性的分子改變,并

    郭天南:藏在尿液中的新冠肺炎病情“密碼”

      團隊從尿液中篩選出20個蛋白質標志物并建立模型,成功實現了對輕、重型新冠肺炎患者進行分類預測。該研究表明,從新冠肺炎患者尿液中獲取的蛋白分子可以靈敏地反映機體的病理狀態。  近日,西湖大學生命科學學院郭天南實驗室與合作團隊在《細胞》子刊《細胞報告》發表最新研究成果:聯合團隊從尿液中篩選出20個蛋

    一文讀懂|西湖大學郭天南:多組學對新冠的研究與挑戰

      編譯 | 陸恬,錢麗琴  作者 | 陸恬,王瑛睿 ,郭天南  COVID-19 仍在全球肆虐,且似乎不會從地球消失。近日,西湖大學郭天南團隊在 Cell Reports Medicine 發表評述,在這篇評述中,郭天南等人討論了多組學技術在揭示 COVID-19 發病、進展和傳播背后的分子機制中

    西湖大學郭天南團隊發現新冠患者生物標志物

      北京時間5月28日12時左右,Cell雜志在線發表了西湖大學生命科學學院蛋白質組大數據實驗室同合作團隊的新冠肺炎研究論文,揭示了重癥患者的血清中存在多種獨特的分子變化,并找出了重癥患者一系列特征性的重要生物標志物,將有望為預測輕癥患者向重癥發展提供導向。  這是繼周強實驗室之后,西湖大學在新冠病

    西湖大學郭天南團隊發現新冠重癥生物標志物

       繼周強實驗室之后,西湖大學生命科學學院PI郭天南帶領的蛋白質組大數據實驗室,近日在新冠病毒研究方面又有重要發現。   他們和合作團隊一起對新冠肺炎患者血液中的蛋白質和代謝物分子進行系統檢測,發現重癥患者的血清中存在多種獨特的分子變化,并找到了一系列生物標志物,有望為預測輕癥患者向重癥發展提供導

    西湖大學郭天南:蛋白質組大數據和人工智能的臨床應用

      高通量蛋白質組技術的進步驅動了大隊列級別的臨床蛋白質組研究的深度不斷拓展。2020年1月10日上午,SCIEX特邀西湖大學特聘研究員郭天南進行網絡講座,為大家介紹《蛋白質組大數據和人工智能的臨床應用》,將具體探討蛋白質組大數據的方法學進展,以及其結合人工智能在醫學中的應用。敬請期待!  →點擊此

    Cell提出一個新“組學”:蛋白質代謝小分子互動組學

      科學家們提出了一個新的“組學”——一個處理蛋白質和小分子之間相互作用的互動組學(protein-metabolite interactomics)。此前系統生物學家專注于基因組學或蛋白質組學,現在他們日益發現了蛋白質-代謝小分子之間相互作用的重要性。  基因組學針對的是生物體基因的系統分析,而蛋

    西湖實驗室郭天南團隊利用膨脹水凝膠助力組學分析

      蛋白質作為疾病生物標志物和藥物靶點在現代生物醫學中具有舉足輕重的作用,蛋白質組學是分析生物體內所有蛋白質的組成與定量的有效手段。傳統的蛋白質組檢測的是整塊組織或分離后的細胞中的蛋白表達水平,失去了空間位置信息。然而,由于組織異質性,組織中不同細胞表達的蛋白種類和數量可能存在顯著性差異,獲得組織空

    新冠肺炎患者器官損傷背后分子層面的“面紗”逐步揭開

    ??科學家針對新冠病毒及致病機理的研究在持續深入,關于新冠肺炎患者器官損傷背后分子層面的“面紗”也在逐漸揭開。 北京時間1月9日,頂級學術期刊《細胞》(Cell)在線發表了由西湖大學生命科學學院和華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院的研究人員共同完成的一項研究,題為“Multi-organ Pro

    Nature:蛋白質組學揭示新冠治療靶標-抑制病毒復制!

      新冠肺炎已迅速在全球蔓延,對全球公共衛生造成嚴重威脅并對全球經濟造成嚴重影響。目前針對新冠主要是一些支持性和對癥治療,因此迫切需要開發抑制SARS-CoV-2感染或復制的療法。盡管SARS-CoV-2與其他冠狀病毒有相似之處。但目前仍然缺乏對SARS-CoV-2感染機制的理解以及針對新冠的潛在治

    尿液蛋白質組學為新冠肺炎快速診斷提供新思路

      2020年由SARS-CoV-2引起的非典型肺炎(COVID-19)對全球公共衛生造成嚴重威脅。在短短四個月內,在全球范圍內已報告的確診病例共379萬例,死亡人數累計超27萬人,并且目前仍在持續發展中,并對全球經濟造成嚴重影響。由于目前尚無可用于高度傳染性SARS-CoV-2的特效藥物或疫苗,因

    總裁專訪-|-蛋白質組學新里程

      2020年是蛋白質組學發展關鍵的一年,全球新冠疫情突顯了蛋白質組學在應對公共衛生危機中的臨床應用。人類可以從這次新冠疫情中汲取許多經驗,毫無疑問地,這些將在未來幾年內影響蛋白質組學發展。近日,Technology Networks與布魯克·道爾頓生命科學質譜執行副總裁Rohan Thakur博士

    AI賦能甲狀腺結節良惡性診斷-大幅提升準確率

    術后檢測?穿刺活檢?在手術前,甲狀腺結節的良性惡性難分辨。西湖大學教授郭天南團隊將高通量蛋白質組學與Al技術結合,診斷準確率提高到85%以上。 9月6日,西湖大學郭天南研究員團隊、李子青教授團隊及臨床合作者在學術期刊《細胞發現》(Cell Discovery)雜志上發表論文“Artificial

    蛋白質組學牛人Cell發表病毒研究新工具

      科學家們在質譜分析的基礎上,開發了一種全新的蛋白質組學技術——QTV(quantitative temporal viromics)。這一技術能夠在病毒感染的過程中,對宿主和病毒蛋白的實時動態進行系統性定量分析,展現病毒與宿主的具體互作過程。這一技術發表在六月五日的Cell雜志上。  在QTV技

    第二屆西湖臨床質譜研討會-探討臨床蛋白質組學

      Progresses and Perspectives of?Mass Spectrometry-based?Clinical Proteomics  基于質譜的臨床蛋白質組學的研究進展與展望聯合主席:Steve Pennington 賀福初 郭天南主辦單位:西湖大學 CNHUPO HUPO會議

    西湖大學等繪制世界首張“新冠患者分子全景圖”

    ??1月9日,西湖大學生命科學學院郭天南課題組與合作團隊(華中科技大學同濟醫學院附屬協和醫院胡豫、夏家紅、聶秀團隊)在《細胞》在線發表了題為《新冠肺炎死亡患者多器官蛋白質組全景圖》的論文,報道了2020年初因新冠肺炎去世的患者體內多器官組織樣本中蛋白質分子病理全景圖。相當于他們將醫生在顯微鏡下看到的

    新冠治療新希望?2天新冠病毒減少5000倍!

      隨著近期印度疫情再次加劇,當地大面積應用伊維菌素的消息引發關注,還有研究顯示,伊維菌素能在 48 小時內將新冠病毒 RNA 減少 5000 倍。  一個不少人關心的問題:伊維菌素要成為新冠治療的新希望嗎?  伊維菌素能治新冠嗎?  伊維菌素(Ivermectin)是上世紀七十年代發現的一種抗生素

    直接RNA測序、串聯質譜法揭示新冠轉錄組和蛋白質組特征

    此前,南開大學高山、阮吉壽等在中國預印本ChinaXiv網站發表論文,稱新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位點。近日,發表在預印本網站bioRxiv上的一篇論文使用直接RNA測序和串聯質譜法表明了SARS-CoV-2的轉錄組和蛋白質組的特征,揭示了細胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位點的

    新蛋白質組學方法引領蛋白功能研究革命

    人類細胞是通過成千上萬個蛋白質的協同作用來控制它們生長和分化的。但是,到目前為止,大多數人類蛋白質的特定功能還不清楚。 疾病的發生常常是由于冠軍細胞蛋白質功能的失常。目前,世界各地已經啟動了大量大規模的研究計劃以了解所有人類蛋白質的功能。 現在,來自IRCM(Instiut de recherc

    天美任命原華測檢測郭冰為新執行董事

      分析測試百科網訊 2015年7月2日,天美控股已經任命新的執行董事,而已達到退休年齡的徐國平先生將辭職。  郭冰,今年1月加入天美,目前是天美(大中國區)的行政總裁,他是華測檢測的聯合創始人及前首席執行董事,2003年起擔任執行董事直到去年七月。在此之前,他與人合作創辦了GREEM咨詢

    蛋白質組與蛋白質組學簡介2

    3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白

    蛋白質組與蛋白質組學簡介1

    一、蛋白質組概念:一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表

    華測郭冰、郭勇低調入股天美-天美或被并購

      一度鬧得沸沸揚揚的華測檢測(300012)董事會內部分歧,如今又有了新的劇情。兩大創始股東郭冰和郭勇在淡出華測檢測之后,最近低調入股了一家同處于第三方檢測行業的香港上市公司天美控股(01298.HK)。  據天美控股此前發布的公告,郭冰及郭勇以每股2.4港元的價格認購了天美控股3487

    利用轉錄組學方法揭示南荻群體遺傳

      南荻是中國特有的畝產生物量最大的芒屬能源植物。南荻原產于河濱地帶,但其遺傳變異豐富,生態適應強,移栽到黃土高原等半干旱地區后,生長良好;由于其根系較淺,種植后不會過度利用深層土壤水分,可以有效減少地表徑流,有助于水土保持,發揮重要的生態修復功能。  近日,中國科學院武漢植物園閆娟博士在李建強和桑

    蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線

    基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類

    蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線

    基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類

    蛋白質新冠疫苗-有望開啟新冠免疫新時代

    與mRNA和病毒載體新冠疫苗屬于新興事物不同,蛋白質疫苗可謂人類的老朋友了。數十年來,蛋白質疫苗一直被用于保護人們免受肝炎、帶狀皰疹和其他病毒感染。圖片來源:視覺中國  對于渴望接種新冠疫苗的部分人員來說,由于容易出現急性免疫反應和血液循環問題,他們對一些基于信使RNA(mRNA)和病毒載體技術的疫

    當蛋白質組遇上AI,加速的是什么

    臨床質譜局部圖 ?西湖歐米供圖使用壓力循環技術處理微量組織樣品。 ?西湖歐米供圖西湖歐米愿景圖 ?西湖歐米供圖一個普通人做一次血液全蛋白質組的質譜檢測,能獲得哪些有意義或有趣的信息?誰會成為蛋白組領域的23andMe(DNA鑒定公司)?去年7月人類蛋白質組98.5%的蛋白質結構被AlphaFold破

    蛋白質組學研究技術

    可以說,蛋白質組學的發展既是技術所推動的也是受技術限制的。蛋白質組學研究成功與否,很大程度上取決于其技術方法水平的高低。蛋白質研究技術遠比基因技術復雜和困難。不僅氨基酸殘基種類遠多于核苷酸殘基(20/ 4), 而且蛋白質有著復雜的翻譯后修飾,如磷酸化和糖基化等,給分離和分析蛋白質帶來很多困難。此外,

    蛋白質組學+AI技術

    人們在吞咽的時候,頸部有個器官會隨著吞咽動作上下活動,它就是甲狀腺。西湖歐米有望實現臨床轉化的第一個項目,就是基于蛋白質標志物的甲狀腺結節的良惡性診斷。甲狀腺很小,但它影響到五臟六腑。數據顯示,每5個成年人中就可能有1人患有甲狀腺結節。其中,約60%的甲狀腺結節都是良性的。但有10%的結節是惡性的,

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