PCR產物的平末端克隆
常規采用的技術路線,實驗一般利用噬菌體 T4 DNA 聚合酶等補平擴增 DNA 片段的末端(Weiner 1993; Chuang et al. 1995)。Liu 與 Schwartz (1992) 發現在連接反應的溫育過程中,當反應液中存在過量的限制性內切核酸酶能顯著地增加重組質粒的產率。這種內切核酸酶的作用在于切割環狀的和線性的串聯體,而 這種內部的酶切位點是由質粒分子自連產生的。這種方法要求靶 DNA 分子與載體的連接消除其限制性酶切位點。在這個過程中還必須防止內切酶消化連接反應產生的重組子。在連接反應中,單位長度的線性載體分子不斷產生(或再 生)的凈效應將驅使連接反應的平衡態向有利于載體與插入片段連接產生重組子的方向進展。實驗材料 噬菌體 T4 DNA 連接酶噬菌體 T4 DNA 聚合酶限制性內切核酸酶閉環質粒 DNA靶基因 DNA試劑、試劑盒 ATPdNTP 溶液KGB 廣域緩沖液儀器、耗材 瓊脂......閱讀全文
如何提高PCR產物克隆的效率
把PCR產物克隆到載體上常見有3種做法:1.直接克隆到T載體(或者U載體上)2.引物設計時引入酶切位點,PCR產物酶切后直接克隆到目標載體上3.將平末端PCR產物直接克隆到平末端酶切載體上。??? 方法3主要是針對高保真的聚合酶比如Stratagene公司的Pfu酶,New England Biol
如何提高PCR產物克隆的效率
把PCR產物克隆到載體上常見有3種做法:1.直接克隆到T載體(或者U載體上)2.引物設計時引入酶切位點,PCR產物酶切后直接克隆到目標載體上3.將平末端PCR產物直接克隆到平末端酶切載體上。??? 方法3主要是針對高保真的聚合酶比如Stratagene公司的Pfu酶,New England Biol
在質粒載體中進行平末端片段的克隆實驗
實驗方法原理 克隆平末端的目的片段時,為最大量地獲得“正確”的連接產物,載體和目的 DNA 在連接反應中的比例必須適當。每一重組體中外源 DNA 的連接方向和插入數量都必須用限制酶酶切圖譜分析或其他方法加以鑒定。作為一般規律,如果連接反應中質粒和目的 DNA 摩爾數相等,而且 DNA 的
在質粒載體中進行平末端片段的克隆實驗
在質粒載體中進行平末端片段的克隆實驗 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 克隆平末端的目的片段時,為最大量地獲得“正確”的連接產物,載體和目的 DNA 在連接反應中的比例必須適當。
在質粒載體中進行平末端片段的克隆實驗
克隆平末端的目的片段時,為最大量地獲得“正確”的連接產物,載體和目的 DNA 在連接反應中的比例必須適當。每一重組體中外源 DNA 的連接方向和插入數量都必須用限制酶酶切圖譜分析或其他方法加以鑒定。作為一般規律,如果連接反應中質粒和目的 DNA 摩爾數相等,而且 DNA 的總濃度少于 100 μg/
克隆PCR產物的最優條件是什么?
最佳插入片段:載體比需實驗確定。1:1(插入片段:載體)常為最佳比,摩爾數比1:8或8:1也行。應測定比值范圍。連接用5ul 2X連接液, 50ng質粒DNA,1Weiss單位的T4連接酶,插入片段共10ul。室溫保溫1小時,或4℃過夜。在這2種溫度下,缺T-凸出端的載體會自連,產生藍斑。室溫保溫1
克隆PCR產物的最優條件是什么?
最佳插入片段:載體比需實驗確定。1:1(插入片段:載體)常為最佳比,摩爾數比1:8或8:1也行。應測定比值范圍。連接用5ul 2X連接液,50ng質粒DNA,1Weiss單位的T4連接酶,插入片段共10ul。室溫保溫1小時,或4℃過夜。在這2種溫度下,缺T-凸出端的載體會自連,產生藍斑。室溫保溫
PCR擴增產物克隆的實驗要點
引物設計主要是要注意以下幾個事項: (1)發夾結構; (2)反向配對; (3)GC含量(40-60%); (4)退火溫度(45-65度); (5)引物長度(18-27bp); (6)3' 端最好是C、G(提高結合度); (7)引物在序列中的錯配位點。 大致就這幾個方面,重要性
在質粒載體(plasmid-vector)中進行平末端片段的克隆
1、分別設立兩個反應,用適當的限制性內切核酸酶消化1-10μg質粒DNA和外源DNA片段,使它們能產生平末端。2、苯酚:氯仿抽提與乙醇沉淀法純化出已被消化的載體和外源DNA片段。3、分別用TE(pH 8.0)重新溶解純化出的兩種DNA沉淀,使終濃度為100 ng/ml。假設1 bp相當于660Da,
克隆化的PCR產物連入T載體
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 由 Taq DNA 聚合酶 PCR 擴增產生的帶 3' 突出端為 A 堿基的 DNA 片段能高效地克隆至 T 載體上,這種 T 載體有與 A 堿基互補的未配對 3' T 堿基(Holton and Graha
PCR擴增產物的克隆技術1
利用各種PCR技術擴增特異DNA是獲得目的基因和特異探針的一種最有效、最簡便的方法。但PCR擴增出的片斷如不經進一步克窿是無法變成可利用基因,因此PCR擴增產物的克窿技術是DNA重組技術中的一個最重要部分,該技術是目前分子生物學實驗中最重點內容,要綜合前面實驗中所介紹的各種技術,起著承上啟下的作用。
克隆化的PCR產物連入T載體
由 Taq DNA 聚合酶 PCR 擴增產生的帶 3' 突出端為 A 堿基的 DNA 片段能高效地克隆至 T 載體上,這種 T 載體有與 A 堿基互補的未配對 3' T 堿基(Holton and Graham 1991; Marchuk et al. 1991)。本實驗來源「分子克
iPCR或混合PCR產物的SLIC亞克隆
實驗概要SLIC(Sequence and Ligation Independent Cloning)是一種不依賴于基因序列和連接反應的高效基因克隆新方法,它可以實現體外同源重組反應中多個DNA片段在單一反應中的裝配和單鏈的退火。實驗步驟1. 用限制性內切酶處理2微克載體,使用QIAEX II凝膠提
克隆化的PCR產物連入T載體
實驗方法原理 由 Taq DNA 聚合酶 PCR 擴增產生的帶 3' 突出端為 A 堿基的 DNA 片段能高效地克隆至 T 載體上,這種 T 載體有與 A 堿基互補的未配對 3' T 堿基(Holton and Graham 1991; Marchuk et al. 1991
PCR擴增產物的克隆技術2
T-載體的構建一:儀器:同質粒DNA提取實驗、酶切實驗及RT-PCR實驗二:試劑:SmaI、其余同質粒DNA提取實驗、酶切實驗及RT-PCR實驗三:操作:1:提純載體DNA2:將1ug提純的PGEMDNA用SmaI1ul進行全酶切(為了切割徹底、甚至能破壞酶切位點周圍堿基序列而防止自連發生,酶可過量
關于克隆PCR產物的對照實驗相關介紹
A)涂布未轉化的感受態細胞。 如有菌落,表明氨芐失效,或污染上帶有氨芐抗型的質粒,或產生氨芐抗型的菌落。 B)轉化完整質粒,計算菌落生長數,測定轉化效率。 例如,將1ug/ul質粒1:100稀釋,1ul用于100ul感受態細胞轉化。用SOC稀釋到1000ul后,用100ul鋪板。培養過夜,
PCR產物的克隆(平頭連接和粘頭連接)
PCR產物克隆大致分為兩類,即平頭連接和粘頭連接。平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的PCR 產物直接進行連接。載體可用EcoR V或Sma I切成平頭;PCR 產物純化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min(利用該酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性)。如果要求
PCR克隆及相關產品選擇指南
PCR克隆概述?? 克隆技術是分子生物學實驗的核心技術之一。通過PCR擴增獲得的DNA片段通常需要克隆到質粒載體中,用于測序、亞克隆、表達等后續實驗。利用Taq DNA聚合酶在產物的3’-端添加一個突出A堿基的特點而設計的TA克隆技術,使得PCR產物克隆變得更加方便、高效:PCR引物不需要設計限制性
功能基因cDNA-5’末端的克隆
一.原理⑴ 5’-RACE法① 以目的mRNA 為模板,使用5’末端P 標記的RT 引物進行反轉錄反應,合成1ststrand cDNA。② 使用RNase H 分解 Hybrid DNA-RNA中的RNA鏈。③ 使用T4 RNA Ligase 使單鏈cDNA進行環化或形成首尾連接物。④ 進行PCR
功能基因-cDNA-3’末端的克隆
一.原理 (1) 以目的mRNA 為模板,使用Oligo dT-3sites Adaptor Primer 進行反轉錄反應,合成1st Strand cDNA。 (2) 使用含有KpnI、XbaI、BamH I 酶切位點的上游特異性引物和3sites Adaptor Primer進行PCR反應。 (
PCR擴增在擴增DNA產物末端引入限制性核酸內切酶酶切位點
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 實驗材料 噬菌體 T4 DNA 連接酶 限制性內切核酸酶 靶 DNA
PCR擴增在擴增DNA產物末端引入限制性核酸內切酶酶切位點
實驗方法原理實驗材料噬菌體 T4 DNA 連接酶限制性內切核酸酶靶 DNA試劑、試劑盒氯仿EDTA乙醇酚氯仿乙酸鈉TE儀器、耗材瓊脂糖凝膠水浴箱實驗步驟一、材料1. 緩沖液與溶液氯仿EDTA ( 0.5 mol/L, pH 8.0)乙醇酚:氯仿(1:1,V/V)乙酸鈉(3 mol/L, pH 5.2
【干貨】小談T載體
小談T載體 目前市場上TA克隆的種類繁多,各大廠家都推出自己各具特色的TA克隆試劑盒。對于科研工作者來說,這些TA克隆試劑盒之間有何區別?又該如何選擇適合自己的TA克隆? 今天,小編就帶著這兩個問題來和大家一起了解一下。 T載體的定義 T載體(T-Vector)是一種高效克隆 PCR 產
PCR技術(十六):PCR產物測序
PCR技術代替了為測序而反復進行的分子克隆和模板制備步驟。PCR技術與自動測 序技術相結合后,它將成為一種最快、最有效的測定核苷權序列的方法。本章主要綜 述各種測模板的制備以及如何完成PCR產物的直接測序。與傳統的將PCR片段克隆入質 粒或病毒基因組相比,直接序列分析有兩個主要的優點:1)由于它是一
聚合酶鏈式反應(PCR)擴增和擴增產物克隆(二)
二、PCR反應參數1、變性:在第一輪循環前,在94℃下變性5-10min非常重要,它可使模板DNA完全解鏈,然后加入Taq DNA聚合酶(hot start),這樣可減少聚合酶在低溫下仍有活性從而延伸非特異性配對的引物與模板復合物所造成的錯誤。變性不完全,往往使PCR失敗,因為未變性完全的DNA
通過PCR擴增在擴增DNA產物末端引入限制性核酸內切酶酶...
通過PCR擴增在擴增DNA產物末端引入限制性核酸內切酶酶切位點實驗方法原理 實驗材料?噬菌體 T4 DNA 連接酶限制性內切核酸酶靶 DNA試劑、試劑盒?氯仿EDTA乙醇酚氯仿乙酸鈉TE儀器、耗材?瓊脂糖凝膠水浴箱實驗步驟 一、材料1. 緩沖液與溶液氯仿EDTA ( 0.5 mol/L, pH 8.
PCR產物的電泳檢測
PCR產物的電泳檢測時間一般為48h以內,有些最好于當日電泳檢測,大于48h后帶型不規則甚致消失。常見問題如下:????一、假陰性,不出現擴增條帶????PCR反應的關鍵環節有①模板核酸的制備,②引物的質量與特異性,③酶的質量及,?④PCR循環條件。尋找原因亦應針對上述環節進行分析研究。????模板
PCR產物的直接純化
實驗概要本實驗介紹了PCR產物直接純化的原理及操作步驟。實驗原理PCR產物一般都含有過量的引物、Taq ? DNA酶及dNTP,這些成分的存在將直接影響到后續的酶切、雙脫氧PCR測序反應等過程,因此有必要除去。目前核酸純化的方法有很多,商用化試劑盒的出現使得DNA的純化過程變得更加簡便快捷。本實驗中
PCR產物的電泳鑒定
一、準備工作1、實驗器具與材料:(1)移液槍:10ul(2)吸頭:20ul(3)吸頭臺:放置200ul和20ul的吸頭一個(4)三角燒瓶:50ml一個(5)瓊脂糖2、實驗器具的處理與準備(1) 塑料制品:(包括吸頭等)送至高壓3次,試驗前將槍頭放入吸頭臺。(2)電泳板及電泳槽:用自來水沖洗干凈備用3
PCR產物的電泳鑒定
一、準備工作1、實驗器具與材料:(1)移液槍:10ul(2)吸頭:20ul(3)吸頭臺:放置200ul和20ul的吸頭一個(4)三角燒瓶:50ml一個(5)瓊脂糖2、實驗器具的處理與準備(1) 塑料制品:(包括吸頭等)送至高壓3次,試驗前將槍頭放入吸頭臺。(2)電泳板及電泳槽:用自來水沖洗干凈備用3