轉錄組的重編寫：RNA編輯
基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外， DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用，且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此，對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾正，成為了科學界的新一大熱點。特別是前2個月，北京大學和MIT分別在Nature Biotechnology與Science上發文，提出了名為“LEAPER”的A-to-I RNA編輯工具[1]和名為“RESCUE”的C-to-U RNA編輯器[2]，被Nature Reviews Genetics和Nature Reviews Drug Discovery兩篇雜志分別點評是“拓寬了RNA單堿基編輯器的選擇”[3]和“拓展了RNA編輯的工具箱”[4]，在業內引起了廣泛的關注與討論，進一步打開了我們深入認識RNA的大門。 那么，RNA編輯是......閱讀全文
轉錄組的重編寫：RNA編輯
基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外， DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用，且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此，對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾正，成為了
轉錄組的重編寫：RNA編輯
前 言 基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外， DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用，且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此，對RNA進行功能研究和錯誤RNA
轉錄組的重編寫：RNA編輯
前 言基因的功能探索是生命科學研究的永恒主題。近幾年以CRISPR-Cas9技術的發展讓直接在高等生物體內進行基因的功能研究成為可能。但除了DNA之外， DNA的轉錄產物--RNA在生命活動中也發揮著極其重要的作用，且與癌癥等多種疾病的發生密切相關。因此，對RNA進行功能研究和錯誤RNA的糾
“泛轉錄組”首次用于RNA測序分析
近日發表在《自然·方法》雜志上的一篇新論文中，美國加利福尼亞大學圣克魯斯分校（UCSC）的研究人員介紹了有史以來第一種使用“泛轉錄組”分析全基因組RNA測序數據的方法。 分析一個人的基因表達需要將他的RNA圖譜映射到一個標準參照物，以深入了解基因在多大程度上“開啟”并在體內發揮功能。但當參照物不
RNA測序解析白血病轉錄組
巴塞羅那基因組調控中心Dr. Roderic Guigó領導研究團隊，對慢性淋巴細胞白血病進行了轉錄組分析，獲得了CLL相關基因和突變的功能圖譜。這項工作發表在Genome Research雜志上。 這一項目是西班牙慢性淋巴細胞白血病基因組聯盟的最新成果，該聯盟曾鑒定了涉及CLL發展的
“泛轉錄組”首次用于RNA測序分析
近日發表在《自然·方法》雜志上的一篇新論文中，美國加利福尼亞大學圣克魯斯分校（UCSC）的研究人員介紹了有史以來第一種使用“泛轉錄組”分析全基因組RNA測序數據的方法。 分析一個人的基因表達需要將他的RNA圖譜映射到一個標準參照物，以深入了解基因在多大程度上“開啟”并在體內發揮功能。但當參照物
類轉錄化學藥物誘導型基因組編輯和轉錄激活系統
生物學變化多受到高度動態的分子事件調控，為了更精確的理解并研究這些過程，應用條件性可誘導的技術手段是十分必要的。此前，得到廣泛應用的藥物誘導技術之一是通過配體結合激發雌激素受體蛋白（ER）從細胞質到細胞核的轉運。在沒有激素配體的情況下，ER與熱激蛋白（hsp90）結合定位于細胞質中；一旦與配體結
RNA的轉錄和逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
RNA－反轉錄
? ? ? ? ? ? 實驗材料 poly(A)+RNA 反轉錄酶 鼠源反轉酶 ?或禽源反轉錄酶 試劑、試劑盒 oligo
RNA－反轉錄
?實驗材料 poly(A)+RNA反轉錄酶鼠源反轉酶 或禽源反轉錄酶試劑、試劑盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin實驗步驟 一材料與設備1)p
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
轉錄組測序和全轉錄組測序的區別
全轉錄組廣義上是指細胞在特定狀態下所能轉錄出來的?所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA?。借助高通量測序技術，可以全面獲取樣本中轉錄產物信息，結合競爭性內源RNA ( ceRNA)機制， 進行聯合分析，深入挖掘轉錄水平調控網絡。轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有
RNA復制、轉錄與逆轉錄
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程，經過轉錄DNA分子中的貯存信息傳遞到RNA分子中，再由mRNA做為模板合成蛋白質分子。逆轉錄也是從RNA的一個特定位置開始的，以RNA分子中的一條鏈為模板，在逆轉錄酶的作用下，以四種脫氧核苷酸為原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
于軍研究組：首次利用RNAseq解析小鼠乳腺轉錄組學
乳腺是哺乳動物特有的器官, 90%的發育過程集中在出生之后。近期來自中科院北京基因組研究所，中國科學院大學等處的研究人員首次利用RNA-seq技術對小鼠乳腺發育進行轉錄組學研究, 包括懷孕期、哺乳期和退化期小鼠乳腺的基因表達情況，并解析了懷孕哺乳周期乳腺的關鍵調控基因。 作為哺乳動
信使RNA轉錄的調控
一、遺傳信息的表達有時序調控和適應調控，轉錄水平的調控是關鍵環節，因為這是表達的第一步。轉錄調控主要發生在起始和終止階段。 二、操縱子是細菌基因表達和調控的單位，有正調節和負調節因子。阻遏蛋白的作用屬于負調控。環腺苷酸通過其受體蛋白（CRP）促進轉錄，可促進許多誘導酶的合成。操縱子可構成綜合性
RNA轉錄的技術特點
轉錄時，細胞通過堿基互補的原則來生成一條帶有互補堿基的mRNA，通過它攜帶密碼子到核糖體中可以實現蛋白質的合成。與DNA的復制相比，轉錄有很多相同或相似之處，亦有其自己的特點。轉錄中，一個基因會被讀取并復制為mRNA。就是說，以特定的DNA片段作為模板，以DNA依賴的RNA聚合酶作為催化劑，合成前體
概述RNA編輯的現象
RNA編輯（RNA editing）是新發現的在mRNA水平上遺傳信息改變的過程。由于RNA編輯使mRNA中的編碼序列與它的基因中的編碼序列不一致。研究證明，mRNA中個別堿基的取代和加減，造成mRNA的堿基序列與它的基因的堿基序列不一致，使其仍能參與翻譯，所有這一系列的改變不是發生在基因水平上
簡述RNA編輯的機制
編輯一般發生在mRNA的3’端而不在5’端，1988年Kenneth等首次報道了編輯在3'端的現象。他們合成了2種編輯引物和2種未編輯引物。完全編輯的成熟RNA僅能同編輯引物雜交，用PCR檢測到了雜交帶，它不能雜交到未編輯mRNA上。相反，未編輯RNA僅能同未編輯引物反應。如果編輯是從轉
簡述RNA編輯的意義
RNA編輯的生物學意義主要有： ①校正作用，因4個核苷酸的插入移碼，使其肽鏈的序列和其他生物的相似； ②調控翻譯，通過編輯可以引入或去除起始密碼子或終止密碼子； ③擴充遺傳信息，經編輯后增加了肽鏈的編碼信息量
RNA－大量轉錄合成
實驗材料 模板 DNA 或質粒試劑、試劑盒 TE TE 飽和酚 氯仿異內醇 3mol LNaAc 無水乙醇 5X 轉錄緩沖液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 異戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸銨 無水乙醇 乙醇實驗
3.5－RNA－反轉錄
利用 RNA 模板通過反轉錄獲得 DNA,進而復制和感染細胞實驗材料poly(A)+RNA反轉錄酶鼠源反轉酶 或禽源反轉錄酶試劑、試劑盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT
RNA－標準轉錄反應
? ? ? ? ? ? 實驗材料 模板 DNA 或質粒 試劑、試劑盒 TE 異丙醇 3mol LNaAc
RNA－大量轉錄合成
? ? ? ? ? ? 實驗材料 模板 DNA 或質粒 試劑、試劑盒 TE ? TE 飽和酚 ? 氯仿
RNA－標準轉錄反應
實驗材料 模板 DNA 或質粒試劑、試劑盒 TE 異丙醇 3mol LNaAc 無水乙醇 5×轉錄緩沖液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-飽和的酚氯仿異戊醇 DN
什么是RNA編輯？
RNA編輯（RNA editing）是指轉錄后的RNA在編碼區發生堿基的加入、丟失或轉換等現象。RNA編輯產生的“基因”可稱為隱蔽基因（ cryptogene），其產物的結構不能從基因組DNA序列中推導獲得。早在1986年發現錐蟲線粒體mRNA轉錄加工后，其mRNA的多個編碼位置上加入或丟失尿苷酸。
RNA編輯主要類型
①簡單編輯，單堿基轉變的轉錄后調節；②插入編輯，插入單個核苷酸或少量核苷酸的丟失，其機制是轉錄鏈的跳格；③泛編輯，插入或缺失多個尿嘧啶核苷酸或轉錄后插入多個胞嘧啶，其機制是編輯序列由外源反義引導RNA（ gRNA）提供，gRNA在編輯體（editosome）核蛋白顆粒中與前編輯mRNA配對，鑒別作為
常興研究組發現RNA剪接基因編輯的新方法
2018年10月5日，國際知名學術期刊《分子細胞》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院（營養與健康研究院）常興研究組題為“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。證明可
真核生物RNA的轉錄與原核生物RNA的轉錄的區別
真核生物RNA的轉錄與原核生物RNA的轉錄過程在總體上基本相同，但是，其過程要復雜得多，主要有以下幾點不同： 1、真核生物RNA的轉錄有的是在細胞核內進行的，而蛋白質的合成則是在細胞質內進行的。且真核生物線粒體和葉綠體的遺傳信息系統被稱為真核細胞的第二遺傳信息系統，或核外基因及其表達體系。這是
直接RNA測序、串聯質譜法揭示新冠轉錄組和蛋白質組特征
此前，南開大學高山、阮吉壽等在中國預印本ChinaXiv網站發表論文，稱新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位點。近日，發表在預印本網站bioRxiv上的一篇論文使用直接RNA測序和串聯質譜法表明了SARS-CoV-2的轉錄組和蛋白質組的特征，揭示了細胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位點的
基因組所等RNA甲基化表觀轉錄組學研究獲進展
2014年1月，中國科學院北京基因組研究所基因組變異與精準生物醫學實驗室“百人計劃”研究員楊運桂研究組，與中國科學院動物研究所“百人計劃”研究員劉峰研究組合作開展的“m6A甲基轉移酶復合物鑒定”研究，發現了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)