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    亞硫酸氫鹽修飾后測序法甲基化檢測

    第一部分 基因組DNA的提取這一步沒有懸念,完全可以購買供細胞或組織使用的DNA提取試劑盒,如果實驗室條件成熟,自己配試劑提取完全可以。DNA比較穩定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因組DNA應該是完整的。此步重點在于DNA的純度,即減少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取過程中需使用蛋白酶K及RNA酶以去除兩者。使用兩者的細節:1、蛋白酶K可以使用滅菌雙蒸水配制成20mg/ml;2、RNA酶必須要配制成不含DNA酶的RNA酶,即在購買市售RNA酶后進行再處理,配制成10mg/ml。否則可能的后果是不僅沒有RNA,連 DNA也被消化了。兩者均于-20℃保存。驗證提取DNA的純度的方法有二:1、紫外分光光度計計算OD比值;2、1%-1.5%的瓊脂糖凝膠電泳。第二種方法優于第一種方法,這種方法完全可以明確所提基因組DNA的純度,并根據Marker的上樣量估計其濃度,以用于下一步的修飾。第二部分 亞硫酸氫鈉修飾基因組DNA如......閱讀全文

    亞硫酸氫鹽修飾后測序法甲基化檢測

    第一部分 基因組DNA的提取這一步沒有懸念,完全可以購買供細胞或組織使用的DNA提取試劑盒,如果實驗室條件成熟,自己配試劑提取完全可以。DNA比較穩定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因組DNA應該是完整的。此步重點在于DNA的純度,即減少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取過程中需使用蛋白

    亞硫酸氫鹽修飾后測序法檢測甲基化

    DNA甲基化             實驗方法原理 重亞硫酸鹽使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶,而甲基化的

    亞硫酸氫鹽修飾后測序法檢測甲基化

    實驗材料 DNA試劑、試劑盒 NaOH苯二酚(氫醌)亞硫酸氫鈉石蠟油儀器、耗材 離心管恒溫水浴鍋鋁箔紙實驗步驟 1.將約2ugDNA于1.5mlEP管中使用DDW稀釋至50ul; 2.加5.5ul新鮮配制的3M NaOH;  3. 42℃水

    甲基化檢測方法(亞硫酸氫鹽修飾后測序法)

    甲基化是目前的研究熱點,就我所做的一點工作并其中一點心得,與大家分享。希望能夠對大家有所幫助。 第一部分 基因組DNA的提取。 這一步沒有懸念,完全可以購買供細胞或組織使用的DNA提取試劑盒,如果實驗室條件成熟,自己配試劑提取完全可以。DNA比較穩定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因組DNA應

    甲基化檢測方法(亞硫酸氫鹽修飾后測序法)-2

    此步細節:1:在使用注射器時,一定要用力均勻且輕,如使用暴力,會將小柱內的薄膜擠破,失去作用。2:乙酸銨、糖原不需新鮮配制,糖原配好后放在-20度保存,乙酸銨室溫即可,因為這樣濃度的乙酸銨非常難溶,一旦放在4度,取出用時也會有很多溶質析出。3:異丙醇、70%乙醇都不需要新鮮配制,但如果用量大,現場配

    甲基化檢測方法(亞硫酸氫鹽修飾后測序法)(2)

    第三部分 修飾后DNA純化回收EP管如無特別說明均為高壓蒸汽滅菌的。1. 將移液器槍頭伸入石蠟油層下,先輕輕加壓使其中一小段石蠟油排出,然后吸取混合液至一潔凈1.5mlEP管中。2:以下使用Promega Wizard Cleanup DNA純化回收系統(Promega,A7280)1)70℃水浴預

    甲基化檢測方法(亞硫酸氫鹽修飾后測序法)-1

    第一部分 基因組DNA的提取。這一步沒有懸念,完全可以購買供細胞或組織使用的DNA提取試劑盒,如果實驗室條件成熟,自己配試劑提取完全可以。DNA比較穩定,只要在操作中不要使用暴力,提出的基因組DNA應該是完整的。此步重點在于DNA的純度,即減少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取過程中需使用蛋

    快速可靠的甲基化分析,無需亞硫酸氫鹽轉化

      在甲基化分析中,亞硫酸氫鹽轉化通常是必經之路。它將未甲基化的胞嘧啶轉化成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不變,之后再結合PCR、測序等技術分析甲基化狀態。聽上去似乎很簡單,但要想獲得漂亮的結果,卻并非那么容易。轉化效率如何?回收率如何?這都是需要考量和優化的因素。   最近,QIAGEN

    亞硫酸鹽或亞硫酸氫鹽鑒別實驗

    (1) 取供試品,加鹽酸,即發生二氧化硫的氣體,有刺激性特臭,并能使硝酸亞汞試液濕潤的濾紙顯黑色。(2) 取供試品溶液,滴加碘試液,碘的顏色即消退。 亞錫鹽 取供試品的水溶液1滴,點于磷鉬酸銨試紙上,試紙應顯藍色。 托烷生物堿類 取供試品約10mg,加發煙硝酸5滴,置水浴上蒸干,得黃色的殘渣,放

    DNA甲基化檢測技術全攻略

    近年來涌現出不少 DNA 甲基化的檢測技術,少說也有十幾種。大致可以分為兩類:特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析,后者也稱為甲基化圖譜分析 (methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。 特異位點的甲基化檢測 甲基化特異性 PCR (MS-PCR)

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