PCR技術要素引物
引物: 引物是PCR特異性反應的關鍵,PCR 產物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增。......閱讀全文
PCR技術要素引物
引物: 引物是PCR特異性反應的關鍵,PCR 產物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增。
PCR技術要素引物設計原則
①引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。②引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現非特異條帶。ATGC最好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物內
PCR技術要素酶及其濃度
酶及其濃度 目前有兩種Taq DNA聚合酶供應, 一種是從棲熱水生桿菌中提純的天然酶,另一種為大腸菌合成的基因工程酶。催化一典型的PCR反應約需酶量2.5U(指總反應體積為100ul時),濃度過高可引起非特異性擴增,濃度過低則合成產物量減少。
兼并引物PCR技術的定義
1.概述:兼并引物是指代表編碼單個氨基酸所有不同堿基可能性的不同序列的混合物。兼并度越低,產物特異性越強。2.設計引物原則:盡量選擇兼并性小的氨基酸,并避免引物3’末端兼并,因為3'端最后3個堿基的退火足以在錯誤位點起始PCR;次黃嘌呤可以同所有的堿基配對,降低引物的退火溫度。
PCR實驗技術指南(引物設計)
所謂“工欲善其事,必先利其器”,這年頭手工設計引物的人似乎不多,還是用軟件方便些,防止你一不小心看走眼,丟一個堿基,同時計算起來也方便。設計軟件有很多,既可以在線設計(如Primer3 http://frodo.wi.mit.edu/cgi-bin/primer3/primer3_www.cgi),
PCR技術要素模板(靶基因)核酸
模板(靶基因)核酸 模板核酸的量與純化程度,是PCR成敗與否的關鍵環節之一,傳統的DNA純化方法通常采用SDS和蛋白酶K來消化處理標本。SDS的主要功能是: 溶解細胞膜上的脂類與蛋白質,因而溶解膜蛋白而破壞細胞膜,并解離細胞中的核蛋白,SDS 還能與蛋白質結合而沉淀; 蛋白酶K能水解消化蛋白質,特別
PCR技術反應五要素是什么?
1、引物PCR 反應成功擴增的一個關鍵條件是正確設計寡核苷酸引物。引物設計一般遵循以下原則:①引物長度:一般為15~30bp,常用為 20bp 左右,引物太短,就可能同非靶序列雜交,得到不需要的擴增產物。②引物擴增跨度:以200~500bp 為宜,特定條件下可擴增至10kb。③引物堿基:G+C 含量
PCR技術要素Mg2+濃度
Mg2+濃度 Mg2+對PCR擴增的特異性和產量有顯著的影響,在一般的PCR反應中,各種dNTP濃度為200umol/L時,Mg2+濃度為1.5~2.0mmol/L為宜。Mg2+濃度過高,反應特異性降低,出現非特異擴增,濃度過低會降低Taq DNA聚合酶的活性,使反應產物減少。
PCR引物
PCR Primer Design and Reaction Optimization?(Molecular Biology Techniques Manual)??PCR Primer Design?(Newman Lab)??PCR Primer Design?(Eppendorf)Detail
PCR引物
PCR?Primer Design and Reaction Optimization?(Molecular Biology Techniques Manual)??PCR Primer Design?(Newman Lab)??PCR Primer Design?(Eppendorf)Detail
PCR技術是如何合成引物的
目前引物合成基本采用固相亞磷酰胺三酯法。亞磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶聯以及起始反應物比較穩定的特點。亞磷酰胺三酯法是將DNA固定在固相載體上完成DNA鏈的合成的,合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端合成的,相鄰的核苷酸通過3′→5′磷酸二酯鍵連接。第一步是將預先連接在固相載體
PCR實驗技術指南之引物設計
PCR實驗技術指南之引物設計??????? 所謂“工欲善其事,必先利其器”,這年頭手工設計引物的人似乎不多,還是用軟件方便些,防止你一不小心看走眼,丟一個堿基,同時計算起來也方便。設計軟件有很多,既可以在線設計,也可以用Primer、Oligo等等。細心地進行引物設計是PCR 中zui重要的一步。理
PCR技術要素dNTP的質量與濃度
dNTP的質量與濃度 dNTP的質量與濃度和PCR擴增效率有密切關系,dNTP粉呈顆粒狀,如保存不當易變性失去生物學活性。dNTP溶液呈酸性,使用時應配成高濃度后,以1M NaOH或1M Tris。HCL的緩沖液將其PH調節到7.0~7.5,小量分裝, -20℃冰凍保存。多次凍融會使dNTP降解。在
PCR的引物
特異性的引物決定了所擴增的DNA片段,引物(primer)本質上是人工合成的小片段寡聚核苷酸片段,一般不超過50個堿基(通常18-25個),它們與所要擴增的DNA片段的正鏈與負鏈的末端完全互補。在“退火”時引物結合于DNA模板的起始和終止點,DNA聚合酶結合到這兩個位置,開始合成新的DNA鏈。
pcr反應五要素
參加PCR反應的物質主要有五種即: ①模板DNA, ②寡核苷酸引物, ③dNTP, ④反應緩沖液, ⑤TaqDNA聚合酶。
PCR擴增技術為什么要設計引物?
在PCR中DNA聚合酶不能從頭合成DNA,只能從3’端延伸DNA新鏈,DNA聚合酶只能將單個脫氧核苷酸連續結合到已有的核酸片段上,因此,DNA復制需要引物。
RTPCR技術簡介和RTPCR引物的選擇
RT-PCR簡介RT-PCR是將RNA的反轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先經反轉錄酶的作用從RNA合成 cDNA,再以cDNA為模板,擴增合成目的片段。RT-PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用于檢測細胞中基因表達水平,細胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cD
PCR引物是什么
聚合酶鏈式反應簡稱PCR(Polymerase Chain Reaction) (又稱:多聚酶鏈式反應) PCR是體外酶促合成特異DNA片段的一種方法,由高溫變性、低溫退火(復性)及適溫延伸等反應組成一個周期,循環進行,使目的DNA得以迅速擴增,具有特異性強、靈敏度高、操作簡便、省時等特點。它不僅可
PCR引物設計技巧
自從1985年美國PE—Cetus公司的人類遺傳研究室 Mullis等發明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應(PCP0 以來,PCR已經成為了分子生物學領域zui基本也是zui重要的技術手段之-[ I。然而能否找到一對合適的核苷酸片段作為引物,使其有效地擴增模板DNA序列,無疑決定著PCR的成敗。現在動
PCR引物設計原則
PCR引物設計的目的是為了找到一對合適的核苷酸片段,使其能有效地擴增模板DNA序列。因此,引物的優劣直接關系到PCR的特異性與成功與否。要設計引物首先要找到DNA序列的保守區。同時應預測將要擴增的片段單鏈是否形成二級結構。如這個區域單鏈能形成二級結構,就要避開它。如這一段不能形成二級結構,那就可以在
PCR引物設計技巧
自從1985年美國PE—Cetus公司的人類遺傳研究室 Mullis等發明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應(PCP0 以來,PCR已經成為了分子生物學領域最基本也是最重要的技術手段之-[ I。然而能否找到一對合適的核苷酸片段作為引物,使其有效地擴增模板DNA序列,無疑決定著PCR的成敗。現在動物遺傳育
PCR引物設計原則
實驗步驟首先引物與模板的序列要緊密互補,其次引物不能在模板的非目的位點引發DNA 聚合反應(即錯配) ,再次引物與引物之間避免形成穩定的二聚體或發夾結構。引物設計應注意如下要點:1.引物的長度一般為15-30 bp,常用的是18-27 bp。2.引物序列在模板內應當沒有相似性較高,尤其是3’端相似性
PCR引物設計原則
實驗概要PCR是目前研究DNA、RNA等核酸的非常有效和最主要的方法之一。本Protocol對于PCR引物設計中的一些基本原則給予闡述,希望能對廣大研究人員的研究工作帶來方便。實驗步驟首先引物與模板的序列要緊密互補,其次引物不能在模板的非目的位點引發DNA 聚合反應(即錯配) ,再次引物與引物之間避
PCR引物設計技巧
自從1985年美國PE-Cetus公司的人類遺傳研究室 Mullis等發明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應(PCP) 以來,PCR已經成為了分子生物學領域最基本也是最重要的技術手段之一 。然而能否找到一對合適的核苷酸片段作為引物,使其有效地擴增模板DNA序列,無疑決定著PCR的成敗。現在動物遺
PCR引物設計原則
? PCR引物設計的目的是為了找到一對合適的核苷酸片段,使其能有效地擴增模板DNA序列。因此,引物的優劣直接關系到PCR的特異性與成功與否。要設計引物首先要找到DNA序列的保守區。同時應預測將要擴增的片段單鏈是否形成二級結構。如這個區域單鏈能形成二級結構,就要避開它。如這一段不能形成二級結構,那就可
PCR引物設計原則
PCR引物設計的目的是為了找到一對合適的核苷酸片段,使其能有效地擴增模板DNA序列。因此,引物的優劣直接關系到PCR的特異性與成功與否。? 要設計引物首先要找到DNA序列的保守區。同時應預測將要擴增的片段單鏈是否形成二級結構。如這個區域單鏈能形成二級結構,就要避開它。如這一段不能形成二級結構,那
PCR儀基本要素
基本的PCR須具備1.要被復制的DNA模板 Template2.界定復制范圍兩端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料(四種脫氧核苷酸)及水。
普通pcr引物設計和熒光定量pcr引物設計的區別
一、方法不同1、普通pcr引物設計:引物的優劣直接關系到PCR的特異性與成功與否。2、熒光定量pcr引物設計:通過熒光染料或熒光標記的特異性探針,標記跟蹤PCR產物進行實時監測反應,利用與之相適應的軟件對產物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度二、原理不同1、普通pcr引物設計:為了找到一對合適的核
PCR技術中引物設計有哪些注意事項?
(1)堿基要隨機分布,且與模板內部序列沒有較高的相似性。(2)引物自身及兩引物之間不應存在互補序列(少于5個相同的堿基連續排列)。(3)引物長度一般在15-30個堿基之間。過長會導致延伸溫度大于74℃,不適于Taq酶進行反應。
引物篇:普通PCR-和-QPCR-引物異同點
Q問題: 普通PCR 和 QPCR 引物 是否一樣? A 回答: 二者的設計原則有相同也有不同; 相同處: ? 序列的查找是一致的; ? 序列選取應在基因的保守區段; ? 選取合適的擴增片段大小 ?